MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012580	GCG	2	6	1003833	1003838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812641
16002	NC_012580	AACC	2	8	1003853	1003860	50 %	0 %	0 %	50 %	227812641
16003	NC_012580	A	6	6	1003876	1003881	100 %	0 %	0 %	0 %	227812641
16004	NC_012580	TGAT	2	8	1003882	1003889	25 %	50 %	25 %	0 %	227812641
16005	NC_012580	CAG	2	6	1004031	1004036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812641
16006	NC_012580	CAA	2	6	1004064	1004069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812641
16007	NC_012580	GC	3	6	1004078	1004083	0 %	0 %	50 %	50 %	227812641
16008	NC_012580	GAG	2	6	1004103	1004108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227812641
16009	NC_012580	TG	3	6	1004147	1004152	0 %	50 %	50 %	0 %	227812641
16010	NC_012580	GACAT	2	10	1004160	1004169	40 %	20 %	20 %	20 %	227812641
16011	NC_012580	CAAA	2	8	1004183	1004190	75 %	0 %	0 %	25 %	227812641
16012	NC_012580	GCA	3	9	1004468	1004476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812641
16013	NC_012580	AAG	2	6	1004479	1004484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812641
16014	NC_012580	TGG	2	6	1004540	1004545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812641
16015	NC_012580	TGC	2	6	1004578	1004583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812641
16016	NC_012580	AAG	2	6	1004638	1004643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812641
16017	NC_012580	AAAGT	2	10	1004734	1004743	60 %	20 %	20 %	0 %	227812641
16018	NC_012580	GCC	2	6	1004799	1004804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812641
16019	NC_012580	TGAA	2	8	1004932	1004939	50 %	25 %	25 %	0 %	227812641
16020	NC_012580	TG	3	6	1005011	1005016	0 %	50 %	50 %	0 %	227812641
16021	NC_012580	ATG	2	6	1005028	1005033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812641
16022	NC_012580	GAA	2	6	1005093	1005098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812641
16023	NC_012580	CGC	2	6	1005110	1005115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812641
16024	NC_012580	GCAG	2	8	1005120	1005127	25 %	0 %	50 %	25 %	227812641
16025	NC_012580	TGG	2	6	1005141	1005146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812641
16026	NC_012580	GGTA	2	8	1005263	1005270	25 %	25 %	50 %	0 %	227812641
16027	NC_012580	CG	3	6	1005295	1005300	0 %	0 %	50 %	50 %	227812641
16028	NC_012580	TTG	2	6	1005364	1005369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812641
16029	NC_012580	CAA	2	6	1005373	1005378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812641
16030	NC_012580	GCC	2	6	1005381	1005386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812641
16031	NC_012580	CCAA	2	8	1005835	1005842	50 %	0 %	0 %	50 %	475645795
16032	NC_012580	GC	3	6	1005869	1005874	0 %	0 %	50 %	50 %	475645795
16033	NC_012580	CAG	2	6	1005919	1005924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645795
16034	NC_012580	TGC	2	6	1005929	1005934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645795
16035	NC_012580	TTC	2	6	1006086	1006091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645795
16036	NC_012580	TCCACC	2	12	1006158	1006169	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	475645795
16037	NC_012580	CG	3	6	1006211	1006216	0 %	0 %	50 %	50 %	475645795
16038	NC_012580	A	6	6	1006251	1006256	100 %	0 %	0 %	0 %	475645795
16039	NC_012580	GCA	2	6	1006259	1006264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645795
16040	NC_012580	AAC	2	6	1006417	1006422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645795
16041	NC_012580	A	6	6	1006455	1006460	100 %	0 %	0 %	0 %	475645795
16042	NC_012580	AAG	2	6	1006559	1006564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812643
16043	NC_012580	CAC	2	6	1006584	1006589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812643
16044	NC_012580	TGG	2	6	1006730	1006735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812643
16045	NC_012580	TGC	2	6	1006744	1006749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812643
16046	NC_012580	CT	3	6	1006757	1006762	0 %	50 %	0 %	50 %	227812643
16047	NC_012580	TGC	2	6	1006892	1006897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812643
16048	NC_012580	CAT	2	6	1006938	1006943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812643
16049	NC_012580	TTGC	2	8	1007040	1007047	0 %	50 %	25 %	25 %	227812643
16050	NC_012580	TCT	2	6	1007095	1007100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812643
16051	NC_012580	ACC	2	6	1007104	1007109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812643
16052	NC_012580	ATT	2	6	1007311	1007316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812644
16053	NC_012580	TAA	2	6	1007325	1007330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812644
16054	NC_012580	CCG	2	6	1007397	1007402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812644
16055	NC_012580	CCG	2	6	1007430	1007435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812644
16056	NC_012580	CGC	2	6	1007451	1007456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812644
16057	NC_012580	TGG	2	6	1007484	1007489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812644
16058	NC_012580	T	6	6	1007492	1007497	0 %	100 %	0 %	0 %	227812644
16059	NC_012580	CTC	2	6	1007569	1007574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	227812644
16060	NC_012580	CAAGTG	2	12	1007576	1007587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	227812644
16061	NC_012580	CGA	2	6	1007674	1007679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812644
16062	NC_012580	CGCGAG	2	12	1007702	1007713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	227812644
16063	NC_012580	GAAGA	2	10	1007792	1007801	60 %	0 %	40 %	0 %	227812644
16064	NC_012580	GCTT	2	8	1007836	1007843	0 %	50 %	25 %	25 %	227812644
16065	NC_012580	TCCC	2	8	1007844	1007851	0 %	25 %	0 %	75 %	227812644
16066	NC_012580	AGCC	2	8	1007864	1007871	25 %	0 %	25 %	50 %	227812644
16067	NC_012580	TC	4	8	1007941	1007948	0 %	50 %	0 %	50 %	227812644
16068	NC_012580	TTGA	2	8	1007975	1007982	25 %	50 %	25 %	0 %	227812644
16069	NC_012580	ATC	2	6	1007996	1008001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812644
16070	NC_012580	A	6	6	1008029	1008034	100 %	0 %	0 %	0 %	227812644
16071	NC_012580	CTG	2	6	1008089	1008094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812644
16072	NC_012580	AGC	2	6	1008225	1008230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812644
16073	NC_012580	TC	3	6	1008266	1008271	0 %	50 %	0 %	50 %	227812644
16074	NC_012580	CGG	2	6	1008279	1008284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812644
16075	NC_012580	CAT	2	6	1008394	1008399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812644
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16078	NC_012580	CTG	2	6	1008713	1008718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812644
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16084	NC_012580	T	6	6	1008970	1008975	0 %	100 %	0 %	0 %	227812645
16085	NC_012580	ACT	2	6	1009022	1009027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812645
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16088	NC_012580	TAAA	2	8	1009400	1009407	75 %	25 %	0 %	0 %	227812645
16089	NC_012580	ATG	2	6	1009421	1009426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812645
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16091	NC_012580	GAT	2	6	1009466	1009471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812646
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16100	NC_012580	CT	3	6	1009955	1009960	0 %	50 %	0 %	50 %	227812646
16101	NC_012580	CAA	2	6	1009982	1009987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812646
16102	NC_012580	AAC	2	6	1010004	1010009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812646
16103	NC_012580	GTA	2	6	1010058	1010063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812646
16104	NC_012580	GCA	2	6	1010126	1010131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812646
16105	NC_012580	TAC	2	6	1010184	1010189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812646
16106	NC_012580	TGGC	2	8	1010204	1010211	0 %	25 %	50 %	25 %	227812646
16107	NC_012580	GGT	2	6	1010229	1010234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812646
16108	NC_012580	TCA	2	6	1010257	1010262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812646
16109	NC_012580	CCATCA	2	12	1010338	1010349	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	227812646
16110	NC_012580	ATC	2	6	1010391	1010396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812646
16111	NC_012580	AG	3	6	1010435	1010440	50 %	0 %	50 %	0 %	227812646
16112	NC_012580	CAT	2	6	1010441	1010446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812646
16113	NC_012580	TG	3	6	1010451	1010456	0 %	50 %	50 %	0 %	227812646
16114	NC_012580	GAC	2	6	1010457	1010462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812646
16115	NC_012580	CAC	2	6	1010537	1010542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812646
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16235	NC_012580	CAGG	2	8	1017105	1017112	25 %	0 %	50 %	25 %	227812649
16236	NC_012580	TGC	2	6	1017143	1017148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812649
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16350	NC_012580	AGA	2	6	1022183	1022188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812655
16351	NC_012580	TCA	2	6	1022317	1022322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812655
16352	NC_012580	CCA	2	6	1022347	1022352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812655
16353	NC_012580	GCT	2	6	1022488	1022493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812655
16354	NC_012580	CCA	2	6	1022680	1022685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812655
16355	NC_012580	AAT	2	6	1022774	1022779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812655
16356	NC_012580	CAT	2	6	1022795	1022800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812655
16357	NC_012580	TCG	2	6	1022806	1022811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812655
16358	NC_012580	CCG	2	6	1022824	1022829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812655
16359	NC_012580	ATC	2	6	1022915	1022920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812655
16360	NC_012580	AAT	2	6	1022921	1022926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812655
16361	NC_012580	TGA	2	6	1022965	1022970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812655
16362	NC_012580	GGT	2	6	1022972	1022977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812655
16363	NC_012580	A	6	6	1023060	1023065	100 %	0 %	0 %	0 %	227812655
16364	NC_012580	AAC	2	6	1023102	1023107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812655
16365	NC_012580	GTT	2	6	1023115	1023120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812655
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16368	NC_012580	ATC	3	9	1023174	1023182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812655
16369	NC_012580	TGGC	2	8	1023280	1023287	0 %	25 %	50 %	25 %	227812655
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16371	NC_012580	TGT	2	6	1023309	1023314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812655
16372	NC_012580	GTG	2	6	1023364	1023369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812656
16373	NC_012580	AGCGC	2	10	1023374	1023383	20 %	0 %	40 %	40 %	227812656
16374	NC_012580	ATCAAT	2	12	1023402	1023413	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	227812656
16375	NC_012580	GCT	2	6	1023557	1023562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812656
16376	NC_012580	CGC	2	6	1023567	1023572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812656
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16378	NC_012580	TGG	2	6	1023593	1023598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812656
16379	NC_012580	CTAAGC	2	12	1023617	1023628	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227812656
16380	NC_012580	CAA	2	6	1023672	1023677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812656
16381	NC_012580	TCCA	2	8	1023722	1023729	25 %	25 %	0 %	50 %	227812656
16382	NC_012580	TCA	2	6	1023769	1023774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812656
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16385	NC_012580	CAC	2	6	1023911	1023916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812657
16386	NC_012580	TCAAGA	2	12	1024027	1024038	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	227812657
16387	NC_012580	GTT	2	6	1024044	1024049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812657
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16389	NC_012580	A	6	6	1024242	1024247	100 %	0 %	0 %	0 %	227812657
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16403	NC_012580	GCA	2	6	1025394	1025399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812658
16404	NC_012580	CGG	2	6	1025623	1025628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812658
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16419	NC_012580	TGTGC	2	10	1027021	1027030	0 %	40 %	40 %	20 %	227812660
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16421	NC_012580	ATCA	2	8	1027094	1027101	50 %	25 %	0 %	25 %	227812660
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16428	NC_012580	TTAA	2	8	1027444	1027451	50 %	50 %	0 %	0 %	227812661
16429	NC_012580	TGA	2	6	1027460	1027465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812661
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16439	NC_012580	ACT	2	6	1027913	1027918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812661
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16443	NC_012580	CGAT	2	8	1028606	1028613	25 %	25 %	25 %	25 %	227812661
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16446	NC_012580	TCA	2	6	1028764	1028769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812661
16447	NC_012580	CTG	2	6	1028785	1028790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812661
16448	NC_012580	GCC	2	6	1028836	1028841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812661
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16450	NC_012580	GCA	2	6	1029098	1029103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812662
16451	NC_012580	GCTATG	2	12	1029108	1029119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	227812662
16452	NC_012580	CGC	2	6	1029136	1029141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812662
16453	NC_012580	GTGC	2	8	1029149	1029156	0 %	25 %	50 %	25 %	227812662
16454	NC_012580	CAG	2	6	1029244	1029249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812662
16455	NC_012580	TCAT	2	8	1029258	1029265	25 %	50 %	0 %	25 %	227812662
16456	NC_012580	CTGC	2	8	1029521	1029528	0 %	25 %	25 %	50 %	227812662
16457	NC_012580	CG	3	6	1029619	1029624	0 %	0 %	50 %	50 %	227812662
16458	NC_012580	TAG	2	6	1029723	1029728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812662
16459	NC_012580	TGA	2	6	1029738	1029743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812662
16460	NC_012580	ATT	2	6	1029844	1029849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812662
16461	NC_012580	CTG	2	6	1029984	1029989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812663
16462	NC_012580	CTG	2	6	1030023	1030028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812663
16463	NC_012580	GGC	2	6	1030032	1030037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812663
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16465	NC_012580	GCA	2	6	1030221	1030226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812663
16466	NC_012580	TGG	2	6	1030239	1030244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812663
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16468	NC_012580	GCA	2	6	1030396	1030401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812663
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