MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012580	CCA	2	6	60099	60104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811680
1002	NC_012580	TGCC	2	8	60144	60151	0 %	25 %	25 %	50 %	227811680
1003	NC_012580	CGC	2	6	60222	60227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811680
1004	NC_012580	AGG	2	6	60314	60319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811680
1005	NC_012580	GGC	2	6	60325	60330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811680
1006	NC_012580	AGT	2	6	60563	60568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811680
1007	NC_012580	TG	3	6	60638	60643	0 %	50 %	50 %	0 %	227811680
1008	NC_012580	ATCA	2	8	60705	60712	50 %	25 %	0 %	25 %	227811680
1009	NC_012580	CGA	2	6	60724	60729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811680
1010	NC_012580	GATT	2	8	60773	60780	25 %	50 %	25 %	0 %	227811680
1011	NC_012580	GTTC	2	8	61049	61056	0 %	50 %	25 %	25 %	227811680
1012	NC_012580	TTA	2	6	61069	61074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811680
1013	NC_012580	G	7	7	61080	61086	0 %	0 %	100 %	0 %	227811680
1014	NC_012580	AGTTG	2	10	61199	61208	20 %	40 %	40 %	0 %	227811680
1015	NC_012580	GGT	2	6	61225	61230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811680
1016	NC_012580	TAA	2	6	61297	61302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811680
1017	NC_012580	AGAT	2	8	61305	61312	50 %	25 %	25 %	0 %	227811680
1018	NC_012580	TCA	2	6	61344	61349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811681
1019	NC_012580	TCT	2	6	61373	61378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811681
1020	NC_012580	CGC	2	6	61471	61476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811681
1021	NC_012580	T	6	6	61504	61509	0 %	100 %	0 %	0 %	227811681
1022	NC_012580	CCG	2	6	61608	61613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811681
1023	NC_012580	CAC	2	6	61708	61713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811681
1024	NC_012580	TCA	2	6	61730	61735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811681
1025	NC_012580	CAC	2	6	61743	61748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811681
1026	NC_012580	ATG	2	6	61763	61768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811681
1027	NC_012580	CAAT	2	8	61788	61795	50 %	25 %	0 %	25 %	227811681
1028	NC_012580	TGC	2	6	61809	61814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811681
1029	NC_012580	AAG	2	6	61815	61820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811681
1030	NC_012580	CCATG	2	10	61827	61836	20 %	20 %	20 %	40 %	227811681
1031	NC_012580	T	6	6	61852	61857	0 %	100 %	0 %	0 %	227811681
1032	NC_012580	TAC	2	6	61887	61892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811681
1033	NC_012580	CTTG	2	8	61905	61912	0 %	50 %	25 %	25 %	227811681
1034	NC_012580	AAG	2	6	61922	61927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811681
1035	NC_012580	TG	3	6	62007	62012	0 %	50 %	50 %	0 %	227811681
1036	NC_012580	CAATT	2	10	62033	62042	40 %	40 %	0 %	20 %	227811681
1037	NC_012580	GA	3	6	62133	62138	50 %	0 %	50 %	0 %	227811682
1038	NC_012580	CT	3	6	62153	62158	0 %	50 %	0 %	50 %	227811682
1039	NC_012580	TGGT	2	8	62230	62237	0 %	50 %	50 %	0 %	227811682
1040	NC_012580	A	8	8	62258	62265	100 %	0 %	0 %	0 %	227811682
1041	NC_012580	GTACA	2	10	62271	62280	40 %	20 %	20 %	20 %	227811682
1042	NC_012580	GTTT	2	8	62463	62470	0 %	75 %	25 %	0 %	227811683
1043	NC_012580	AATGGG	2	12	62484	62495	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	227811683
1044	NC_012580	TGG	2	6	62552	62557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811683
1045	NC_012580	AG	3	6	62595	62600	50 %	0 %	50 %	0 %	227811683
1046	NC_012580	CAG	2	6	62608	62613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811683
1047	NC_012580	ACA	2	6	62628	62633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811683
1048	NC_012580	TG	3	6	62642	62647	0 %	50 %	50 %	0 %	227811683
1049	NC_012580	A	6	6	62759	62764	100 %	0 %	0 %	0 %	227811683
1050	NC_012580	GAA	2	6	62782	62787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811683
1051	NC_012580	A	7	7	62887	62893	100 %	0 %	0 %	0 %	227811683
1052	NC_012580	TCG	2	6	62894	62899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811683
1053	NC_012580	CG	3	6	62953	62958	0 %	0 %	50 %	50 %	227811683
1054	NC_012580	GGGT	2	8	63161	63168	0 %	25 %	75 %	0 %	227811683
1055	NC_012580	CAG	2	6	63241	63246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811683
1056	NC_012580	TGA	2	6	63295	63300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811683
1057	NC_012580	CGTG	2	8	63359	63366	0 %	25 %	50 %	25 %	227811684
1058	NC_012580	GAT	2	6	63442	63447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811684
1059	NC_012580	GTTG	2	8	63462	63469	0 %	50 %	50 %	0 %	227811684
1060	NC_012580	TAC	2	6	63504	63509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811684
1061	NC_012580	GAGT	2	8	63526	63533	25 %	25 %	50 %	0 %	227811684
1062	NC_012580	CTT	2	6	63575	63580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811684
1063	NC_012580	ATT	2	6	63620	63625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811684
1064	NC_012580	GCG	2	6	63794	63799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811684
1065	NC_012580	GAT	2	6	63914	63919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811684
1066	NC_012580	CAG	2	6	64028	64033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811684
1067	NC_012580	GT	3	6	64045	64050	0 %	50 %	50 %	0 %	227811684
1068	NC_012580	ACA	2	6	64066	64071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811684
1069	NC_012580	TGGTT	2	10	64101	64110	0 %	60 %	40 %	0 %	227811685
1070	NC_012580	TCG	2	6	64111	64116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811685
1071	NC_012580	ATA	2	6	64134	64139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811685
1072	NC_012580	CCG	2	6	64149	64154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811685
1073	NC_012580	GCG	2	6	64178	64183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811685
1074	NC_012580	GATTT	2	10	64241	64250	20 %	60 %	20 %	0 %	227811685
1075	NC_012580	CAA	2	6	64271	64276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811685
1076	NC_012580	TGC	2	6	64282	64287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811685
1077	NC_012580	T	6	6	64302	64307	0 %	100 %	0 %	0 %	227811685
1078	NC_012580	GCG	2	6	64331	64336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811685
1079	NC_012580	CA	3	6	64375	64380	50 %	0 %	0 %	50 %	227811685
1080	NC_012580	AGC	2	6	64413	64418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811685
1081	NC_012580	ATA	2	6	64460	64465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811685
1082	NC_012580	TGA	2	6	64477	64482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811685
1083	NC_012580	T	6	6	64529	64534	0 %	100 %	0 %	0 %	227811685
1084	NC_012580	GC	3	6	64555	64560	0 %	0 %	50 %	50 %	227811685
1085	NC_012580	GCC	2	6	64579	64584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811685
1086	NC_012580	A	6	6	64594	64599	100 %	0 %	0 %	0 %	227811685
1087	NC_012580	GC	3	6	64720	64725	0 %	0 %	50 %	50 %	227811685
1088	NC_012580	GT	3	6	64830	64835	0 %	50 %	50 %	0 %	227811685
1089	NC_012580	TCA	2	6	64874	64879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811685
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1092	NC_012580	TCG	2	6	65073	65078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811685
1093	NC_012580	GGAT	2	8	65108	65115	25 %	25 %	50 %	0 %	227811685
1094	NC_012580	GAT	2	6	65131	65136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811685
1095	NC_012580	TGAT	2	8	65208	65215	25 %	50 %	25 %	0 %	227811685
1096	NC_012580	CAA	2	6	65230	65235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811685
1097	NC_012580	TGG	2	6	65236	65241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811685
1098	NC_012580	GTG	2	6	65248	65253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811685
1099	NC_012580	GTCA	2	8	65303	65310	25 %	25 %	25 %	25 %	227811685
1100	NC_012580	CCG	2	6	65344	65349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811685
1101	NC_012580	TTC	2	6	65374	65379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811685
1102	NC_012580	TGG	2	6	65515	65520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811686
1103	NC_012580	GCC	2	6	65569	65574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811686
1104	NC_012580	A	7	7	65664	65670	100 %	0 %	0 %	0 %	227811686
1105	NC_012580	AAG	2	6	65732	65737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811686
1106	NC_012580	CAG	2	6	65916	65921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811686
1107	NC_012580	CGC	2	6	65945	65950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811686
1108	NC_012580	GATT	2	8	65985	65992	25 %	50 %	25 %	0 %	227811686
1109	NC_012580	GCC	2	6	65994	65999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811686
1110	NC_012580	CAA	2	6	66087	66092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811686
1111	NC_012580	CAA	2	6	66166	66171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811686
1112	NC_012580	GT	3	6	66239	66244	0 %	50 %	50 %	0 %	227811686
1113	NC_012580	GCA	2	6	66272	66277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811686
1114	NC_012580	GAA	2	6	66285	66290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811686
1115	NC_012580	TGG	2	6	66296	66301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811686
1116	NC_012580	AGA	2	6	66306	66311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811686
1117	NC_012580	TGG	2	6	66319	66324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811686
1118	NC_012580	GC	4	8	66355	66362	0 %	0 %	50 %	50 %	227811686
1119	NC_012580	CCA	2	6	66403	66408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811686
1120	NC_012580	CGTT	2	8	66552	66559	0 %	50 %	25 %	25 %	475645761
1121	NC_012580	CTT	3	9	66571	66579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645761
1122	NC_012580	GCT	2	6	66591	66596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645761
1123	NC_012580	CAG	2	6	66598	66603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645761
1124	NC_012580	GCA	2	6	66627	66632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645761
1125	NC_012580	TCA	2	6	66693	66698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645761
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1127	NC_012580	GCT	3	9	66738	66746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645761
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1253	NC_012580	GCA	2	6	74451	74456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811692
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