MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_012580	AAG	2	6	384334	384339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812032
6002	NC_012580	A	6	6	384347	384352	100 %	0 %	0 %	0 %	227812032
6003	NC_012580	TGCT	2	8	384387	384394	0 %	50 %	25 %	25 %	227812032
6004	NC_012580	CAA	2	6	384416	384421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812032
6005	NC_012580	GA	3	6	384431	384436	50 %	0 %	50 %	0 %	227812032
6006	NC_012580	AAG	2	6	384447	384452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812032
6007	NC_012580	GCT	2	6	384491	384496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812032
6008	NC_012580	AGA	2	6	384532	384537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812032
6009	NC_012580	GGATT	2	10	384538	384547	20 %	40 %	40 %	0 %	227812032
6010	NC_012580	TTG	2	6	384666	384671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812032
6011	NC_012580	AAGA	2	8	384683	384690	75 %	0 %	25 %	0 %	227812032
6012	NC_012580	ATGG	2	8	384724	384731	25 %	25 %	50 %	0 %	227812032
6013	NC_012580	AT	3	6	384773	384778	50 %	50 %	0 %	0 %	227812032
6014	NC_012580	A	6	6	384878	384883	100 %	0 %	0 %	0 %	227812032
6015	NC_012580	TCT	2	6	384891	384896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812032
6016	NC_012580	AAT	2	6	384935	384940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812032
6017	NC_012580	ATC	2	6	385323	385328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812033
6018	NC_012580	ACTGT	2	10	385332	385341	20 %	40 %	20 %	20 %	227812033
6019	NC_012580	GTG	2	6	385361	385366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812033
6020	NC_012580	ACT	2	6	385404	385409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812033
6021	NC_012580	CA	3	6	385470	385475	50 %	0 %	0 %	50 %	227812033
6022	NC_012580	TATC	2	8	385485	385492	25 %	50 %	0 %	25 %	227812033
6023	NC_012580	TGG	2	6	385534	385539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812033
6024	NC_012580	CAG	2	6	385565	385570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812033
6025	NC_012580	GAA	2	6	385578	385583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812033
6026	NC_012580	GTC	2	6	385657	385662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812033
6027	NC_012580	AGC	2	6	385718	385723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227812033
6028	NC_012580	GTA	2	6	385750	385755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812033
6029	NC_012580	GTGA	2	8	385961	385968	25 %	25 %	50 %	0 %	227812034
6030	NC_012580	AAT	2	6	385981	385986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812034
6031	NC_012580	ATT	2	6	386089	386094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812034
6032	NC_012580	GTTT	2	8	386103	386110	0 %	75 %	25 %	0 %	227812034
6033	NC_012580	T	6	6	386126	386131	0 %	100 %	0 %	0 %	227812034
6034	NC_012580	CTGG	2	8	386210	386217	0 %	25 %	50 %	25 %	227812034
6035	NC_012580	T	6	6	386221	386226	0 %	100 %	0 %	0 %	227812034
6036	NC_012580	AGT	2	6	386236	386241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812034
6037	NC_012580	TCGCAA	2	12	386269	386280	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227812034
6038	NC_012580	TGA	2	6	388066	388071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812037
6039	NC_012580	CAA	3	9	388117	388125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812037
6040	NC_012580	AGA	2	6	388204	388209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812037
6041	NC_012580	TCA	2	6	388217	388222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812037
6042	NC_012580	TTA	2	6	388285	388290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812037
6043	NC_012580	TCTG	2	8	388301	388308	0 %	50 %	25 %	25 %	227812037
6044	NC_012580	CAT	2	6	388390	388395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812037
6045	NC_012580	GAA	2	6	388685	388690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227812038
6046	NC_012580	TGA	2	6	388708	388713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812038
6047	NC_012580	AG	3	6	388746	388751	50 %	0 %	50 %	0 %	227812038
6048	NC_012580	T	6	6	388776	388781	0 %	100 %	0 %	0 %	227812038
6049	NC_012580	AGT	2	6	388782	388787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812038
6050	NC_012580	TGG	2	6	388805	388810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812038
6051	NC_012580	AGAT	2	8	388829	388836	50 %	25 %	25 %	0 %	227812038
6052	NC_012580	TGT	2	6	388838	388843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812038
6053	NC_012580	A	6	6	389073	389078	100 %	0 %	0 %	0 %	227812039
6054	NC_012580	TGA	2	6	389083	389088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812039
6055	NC_012580	ATT	2	6	389168	389173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812039
6056	NC_012580	TTC	2	6	389251	389256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227812039
6057	NC_012580	TCG	2	6	389264	389269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812039
6058	NC_012580	TCAG	2	8	389274	389281	25 %	25 %	25 %	25 %	227812039
6059	NC_012580	GTG	2	6	389301	389306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812039
6060	NC_012580	ATT	2	6	389366	389371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227812039
6061	NC_012580	CAC	2	6	389430	389435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812039
6062	NC_012580	TTG	2	6	389700	389705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812040
6063	NC_012580	TGA	2	6	389748	389753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812040
6064	NC_012580	AGT	2	6	389767	389772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812040
6065	NC_012580	CAA	2	6	389774	389779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812040
6066	NC_012580	AT	3	6	389834	389839	50 %	50 %	0 %	0 %	227812040
6067	NC_012580	CAA	2	6	390665	390670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812043
6068	NC_012580	TGA	2	6	390702	390707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812043
6069	NC_012580	GTGAT	2	10	390755	390764	20 %	40 %	40 %	0 %	227812043
6070	NC_012580	GTG	2	6	390821	390826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812043
6071	NC_012580	AAATG	2	10	390894	390903	60 %	20 %	20 %	0 %	227812043
6072	NC_012580	AAC	2	6	390929	390934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812043
6073	NC_012580	ATTT	2	8	390975	390982	25 %	75 %	0 %	0 %	227812043
6074	NC_012580	AGCTC	2	10	390992	391001	20 %	20 %	20 %	40 %	227812044
6075	NC_012580	TTG	2	6	391002	391007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812044
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6080	NC_012580	CA	3	6	391257	391262	50 %	0 %	0 %	50 %	227812044
6081	NC_012580	CTA	2	6	391471	391476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812045
6082	NC_012580	TGGT	2	8	391594	391601	0 %	50 %	50 %	0 %	227812045
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6085	NC_012580	TTGA	2	8	391740	391747	25 %	50 %	25 %	0 %	227812045
6086	NC_012580	TGT	2	6	391751	391756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812045
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6088	NC_012580	ACA	2	6	391819	391824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227812045
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6091	NC_012580	GTG	2	6	392164	392169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227812046
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6093	NC_012580	TCA	2	6	392384	392389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227812047
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6101	NC_012580	GTTG	2	8	392798	392805	0 %	50 %	50 %	0 %	227812047
6102	NC_012580	TCG	2	6	392840	392845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812047
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6105	NC_012580	ATTG	2	8	392894	392901	25 %	50 %	25 %	0 %	227812047
6106	NC_012580	AC	3	6	392912	392917	50 %	0 %	0 %	50 %	227812047
6107	NC_012580	TGC	2	6	392932	392937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812047
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6109	NC_012580	CTG	2	6	393072	393077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812047
6110	NC_012580	GCG	2	6	393117	393122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812047
6111	NC_012580	TGA	2	6	393265	393270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812047
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6113	NC_012580	AGT	2	6	393450	393455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227812048
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6118	NC_012580	TTG	2	6	393976	393981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812049
6119	NC_012580	GATGTT	2	12	394067	394078	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	227812049
6120	NC_012580	AGCTT	2	10	394117	394126	20 %	40 %	20 %	20 %	227812049
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6122	NC_012580	GTT	2	6	394194	394199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812049
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6487	NC_012580	GCTT	2	8	420626	420633	0 %	50 %	25 %	25 %	227812085
6488	NC_012580	T	6	6	420685	420690	0 %	100 %	0 %	0 %	227812085
6489	NC_012580	TGC	2	6	420839	420844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812085
6490	NC_012580	CGC	2	6	420853	420858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227812085
6491	NC_012580	AAT	2	6	420859	420864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812085
6492	NC_012580	TGT	3	9	420971	420979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227812086
6493	NC_012580	CAC	2	6	421141	421146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227812086
6494	NC_012580	TGCA	2	8	421165	421172	25 %	25 %	25 %	25 %	227812086
6495	NC_012580	CGG	3	9	421254	421262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227812086
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6497	NC_012580	T	6	6	421396	421401	0 %	100 %	0 %	0 %	227812086
6498	NC_012580	TGC	2	6	421407	421412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227812086
6499	NC_012580	CAGCG	2	10	421431	421440	20 %	0 %	40 %	40 %	227812086
6500	NC_012580	AAT	2	6	421482	421487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227812086

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