MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 1735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	227080241
2	NC_012578	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	227080245
3	NC_012578	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	227080246
4	NC_012578	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	227080246
5	NC_012578	AAGTG	2	10	9241	9250	40 %	20 %	40 %	0 %	227080250
6	NC_012578	AGCTC	2	10	9415	9424	20 %	20 %	20 %	40 %	227080250
7	NC_012578	CTGCG	2	10	9863	9872	0 %	20 %	40 %	40 %	227080250
8	NC_012578	CCAAA	2	10	12107	12116	60 %	0 %	0 %	40 %	227080252
9	NC_012578	AAGCG	2	10	12200	12209	40 %	0 %	40 %	20 %	227080252
10	NC_012578	GCTGA	2	10	13068	13077	20 %	20 %	40 %	20 %	227080252
11	NC_012578	GCTAA	2	10	15712	15721	40 %	20 %	20 %	20 %	227080256
12	NC_012578	CGCAG	2	10	15779	15788	20 %	0 %	40 %	40 %	227080256
13	NC_012578	GGTTG	2	10	15975	15984	0 %	40 %	60 %	0 %	227080256
14	NC_012578	TGGTT	2	10	17271	17280	0 %	60 %	40 %	0 %	227080257
15	NC_012578	TCTGC	2	10	17804	17813	0 %	40 %	20 %	40 %	227080257
16	NC_012578	TCGAT	2	10	18011	18020	20 %	40 %	20 %	20 %	227080257
17	NC_012578	GGCGT	2	10	18782	18791	0 %	20 %	60 %	20 %	227080257
18	NC_012578	TTCTG	2	10	18954	18963	0 %	60 %	20 %	20 %	227080258
19	NC_012578	CCAGA	2	10	19313	19322	40 %	0 %	20 %	40 %	227080258
20	NC_012578	GTACC	2	10	23864	23873	20 %	20 %	20 %	40 %	227080264
21	NC_012578	TGCAT	2	10	27490	27499	20 %	40 %	20 %	20 %	227080266
22	NC_012578	CGCAG	2	10	28007	28016	20 %	0 %	40 %	40 %	227080268
23	NC_012578	ATACA	2	10	28927	28936	60 %	20 %	0 %	20 %	227080268
24	NC_012578	GCACC	2	10	30873	30882	20 %	0 %	20 %	60 %	227080269
25	NC_012578	GTGCT	2	10	31976	31985	0 %	40 %	40 %	20 %	227080270
26	NC_012578	GCCAT	2	10	33422	33431	20 %	20 %	20 %	40 %	227080272
27	NC_012578	TAAAG	2	10	35141	35150	60 %	20 %	20 %	0 %	227080273
28	NC_012578	CTCTG	2	10	38579	38588	0 %	40 %	20 %	40 %	227080278
29	NC_012578	AATCC	2	10	39299	39308	40 %	20 %	0 %	40 %	227080279
30	NC_012578	CGGCG	2	10	40840	40849	0 %	0 %	60 %	40 %	227080280
31	NC_012578	GCAGC	2	10	42520	42529	20 %	0 %	40 %	40 %	227080281
32	NC_012578	AAAAG	2	10	48180	48189	80 %	0 %	20 %	0 %	227080287
33	NC_012578	CAATC	2	10	49073	49082	40 %	20 %	0 %	40 %	227080288
34	NC_012578	GTTTG	2	10	50183	50192	0 %	60 %	40 %	0 %	227080291
35	NC_012578	AATTT	2	10	51433	51442	40 %	60 %	0 %	0 %	227080292
36	NC_012578	AAATG	2	10	52721	52730	60 %	20 %	20 %	0 %	227080294
37	NC_012578	AGCAC	2	10	53231	53240	40 %	0 %	20 %	40 %	227080295
38	NC_012578	GCAGC	2	10	63626	63635	20 %	0 %	40 %	40 %	227080299
39	NC_012578	GCTGC	2	10	64615	64624	0 %	20 %	40 %	40 %	227080301
40	NC_012578	CCAAG	2	10	64700	64709	40 %	0 %	20 %	40 %	227080301
41	NC_012578	CAGCG	2	10	68258	68267	20 %	0 %	40 %	40 %	227080304
42	NC_012578	GTGAA	2	10	69256	69265	40 %	20 %	40 %	0 %	227080305
43	NC_012578	GTTGG	2	10	71537	71546	0 %	40 %	60 %	0 %	227080308
44	NC_012578	TCCGA	2	10	74329	74338	20 %	20 %	20 %	40 %	227080309
45	NC_012578	CAAGC	2	10	75909	75918	40 %	0 %	20 %	40 %	227080311
46	NC_012578	GCCAC	2	10	76989	76998	20 %	0 %	20 %	60 %	227080314
47	NC_012578	GCGCT	2	10	77440	77449	0 %	20 %	40 %	40 %	227080315
48	NC_012578	AAGCC	2	10	79892	79901	40 %	0 %	20 %	40 %	227080317
49	NC_012578	CAAGC	2	10	83348	83357	40 %	0 %	20 %	40 %	227080321
50	NC_012578	GCTTT	2	10	87476	87485	0 %	60 %	20 %	20 %	227080325
51	NC_012578	ATGGC	2	10	87897	87906	20 %	20 %	40 %	20 %	227080326
52	NC_012578	GATCC	2	10	87975	87984	20 %	20 %	20 %	40 %	227080326
53	NC_012578	CATCA	2	10	89474	89483	40 %	20 %	0 %	40 %	227080327
54	NC_012578	GATCA	2	10	90563	90572	40 %	20 %	20 %	20 %	227080328
55	NC_012578	AGCTG	2	10	93101	93110	20 %	20 %	40 %	20 %	227080329
56	NC_012578	GAAGA	2	10	93111	93120	60 %	0 %	40 %	0 %	227080329
57	NC_012578	CCAAA	2	10	94914	94923	60 %	0 %	0 %	40 %	227080332
58	NC_012578	TCATC	2	10	95844	95853	20 %	40 %	0 %	40 %	227080334
59	NC_012578	TCACC	2	10	96528	96537	20 %	20 %	0 %	60 %	227080334
60	NC_012578	AGTTG	2	10	100251	100260	20 %	40 %	40 %	0 %	227080339
61	NC_012578	GCCGA	2	10	100690	100699	20 %	0 %	40 %	40 %	227080340
62	NC_012578	GATCT	2	10	100881	100890	20 %	40 %	20 %	20 %	227080341
63	NC_012578	AAAGC	2	10	104312	104321	60 %	0 %	20 %	20 %	227080344
64	NC_012578	ACAGC	2	10	104475	104484	40 %	0 %	20 %	40 %	227080344
65	NC_012578	AAAGT	2	10	105770	105779	60 %	20 %	20 %	0 %	227080344
66	NC_012578	GTTCC	2	10	107931	107940	0 %	40 %	20 %	40 %	227080348
67	NC_012578	CGCAG	2	10	110831	110840	20 %	0 %	40 %	40 %	227080352
68	NC_012578	GCGAT	2	10	112926	112935	20 %	20 %	40 %	20 %	227080354
69	NC_012578	GCTTG	2	10	113139	113148	0 %	40 %	40 %	20 %	227080354
70	NC_012578	CGATG	2	10	113990	113999	20 %	20 %	40 %	20 %	227080355
71	NC_012578	CCGTA	2	10	118493	118502	20 %	20 %	20 %	40 %	227080358
72	NC_012578	CACTG	2	10	119059	119068	20 %	20 %	20 %	40 %	227080360
73	NC_012578	CGCAG	2	10	119727	119736	20 %	0 %	40 %	40 %	227080361
74	NC_012578	TTTTG	2	10	124565	124574	0 %	80 %	20 %	0 %	227080366
75	NC_012578	CAAGC	2	10	124625	124634	40 %	0 %	20 %	40 %	227080366
76	NC_012578	CTTGC	2	10	124805	124814	0 %	40 %	20 %	40 %	227080366
77	NC_012578	GGCAG	2	10	125185	125194	20 %	0 %	60 %	20 %	227080366
78	NC_012578	GTTGG	2	10	126628	126637	0 %	40 %	60 %	0 %	227080367
79	NC_012578	TTGTA	2	10	126970	126979	20 %	60 %	20 %	0 %	227080368
80	NC_012578	CTTCG	2	10	130539	130548	0 %	40 %	20 %	40 %	227080371
81	NC_012578	TCGGA	2	10	132091	132100	20 %	20 %	40 %	20 %	227080373
82	NC_012578	GGACA	2	10	132145	132154	40 %	0 %	40 %	20 %	227080373
83	NC_012578	TGGTG	2	10	135482	135491	0 %	40 %	60 %	0 %	227080379
84	NC_012578	AAGCC	2	10	137023	137032	40 %	0 %	20 %	40 %	227080382
85	NC_012578	GCAAG	2	10	137563	137572	40 %	0 %	40 %	20 %	227080382
86	NC_012578	CAAAA	2	10	137768	137777	80 %	0 %	0 %	20 %	227080382
87	NC_012578	TGGTT	2	10	139578	139587	0 %	60 %	40 %	0 %	227080384
88	NC_012578	ATTAC	2	10	140094	140103	40 %	40 %	0 %	20 %	227080385
89	NC_012578	GATGG	2	10	142280	142289	20 %	20 %	60 %	0 %	227080386
90	NC_012578	AAAGA	2	10	142775	142784	80 %	0 %	20 %	0 %	227080387
91	NC_012578	TGCTT	2	10	143509	143518	0 %	60 %	20 %	20 %	227080388
92	NC_012578	CTCAG	2	10	143578	143587	20 %	20 %	20 %	40 %	227080388
93	NC_012578	GAGTT	2	10	146782	146791	20 %	40 %	40 %	0 %	227080390
94	NC_012578	TGATT	2	10	147698	147707	20 %	60 %	20 %	0 %	227080391
95	NC_012578	TTGGG	2	10	148780	148789	0 %	40 %	60 %	0 %	227080391
96	NC_012578	GCAAA	2	10	149930	149939	60 %	0 %	20 %	20 %	227080392
97	NC_012578	GCTTG	2	10	150121	150130	0 %	40 %	40 %	20 %	227080393
98	NC_012578	ATGAA	2	10	158912	158921	60 %	20 %	20 %	0 %	227080395
99	NC_012578	AACGC	2	10	159064	159073	40 %	0 %	20 %	40 %	227080395
100	NC_012578	CCAGA	2	10	159823	159832	40 %	0 %	20 %	40 %	227080397
101	NC_012578	GCACC	2	10	160369	160378	20 %	0 %	20 %	60 %	227080397
102	NC_012578	TGGCT	2	10	160915	160924	0 %	40 %	40 %	20 %	227080397
103	NC_012578	GAACT	2	10	161006	161015	40 %	20 %	20 %	20 %	227080397
104	NC_012578	CAAGA	2	10	164673	164682	60 %	0 %	20 %	20 %	227080400
105	NC_012578	TGGTC	2	10	169809	169818	0 %	40 %	40 %	20 %	227080403
106	NC_012578	GCCGA	2	10	170026	170035	20 %	0 %	40 %	40 %	227080403
107	NC_012578	CGCGA	2	10	170190	170199	20 %	0 %	40 %	40 %	227080403
108	NC_012578	CTGGG	2	10	172818	172827	0 %	20 %	60 %	20 %	227080405
109	NC_012578	GCTCA	2	10	176301	176310	20 %	20 %	20 %	40 %	227080408
110	NC_012578	GCCAA	2	10	179516	179525	40 %	0 %	20 %	40 %	227080410
111	NC_012578	TGTGG	2	10	180453	180462	0 %	40 %	60 %	0 %	227080412
112	NC_012578	TGGCG	2	10	180962	180971	0 %	20 %	60 %	20 %	227080412
113	NC_012578	CTTGT	2	10	184712	184721	0 %	60 %	20 %	20 %	227080415
114	NC_012578	ACCAC	2	10	187514	187523	40 %	0 %	0 %	60 %	227080416
115	NC_012578	AGCTC	2	10	191261	191270	20 %	20 %	20 %	40 %	227080420
116	NC_012578	GCGCT	2	10	192734	192743	0 %	20 %	40 %	40 %	227080421
117	NC_012578	GGGTG	2	10	192949	192958	0 %	20 %	80 %	0 %	227080421
118	NC_012578	CTTGG	2	10	194065	194074	0 %	40 %	40 %	20 %	227080421
119	NC_012578	CCAAC	2	10	194106	194115	40 %	0 %	0 %	60 %	227080421
120	NC_012578	GTGCT	2	10	194550	194559	0 %	40 %	40 %	20 %	227080421
121	NC_012578	GCGCT	2	10	195312	195321	0 %	20 %	40 %	40 %	227080422
122	NC_012578	GCTGA	2	10	196031	196040	20 %	20 %	40 %	20 %	227080423
123	NC_012578	CCAAC	2	10	196101	196110	40 %	0 %	0 %	60 %	227080423
124	NC_012578	CTCAC	2	10	196690	196699	20 %	20 %	0 %	60 %	227080424
125	NC_012578	TCGGC	2	10	197079	197088	0 %	20 %	40 %	40 %	227080424
126	NC_012578	GCTTG	2	10	198033	198042	0 %	40 %	40 %	20 %	227080424
127	NC_012578	TGTGA	2	10	203918	203927	20 %	40 %	40 %	0 %	227080431
128	NC_012578	TGTGC	2	10	204082	204091	0 %	40 %	40 %	20 %	227080431
129	NC_012578	TCGGT	2	10	206763	206772	0 %	40 %	40 %	20 %	227080433
130	NC_012578	TGAGT	2	10	213087	213096	20 %	40 %	40 %	0 %	227080440
131	NC_012578	GCGCG	2	10	214665	214674	0 %	0 %	60 %	40 %	227080442
132	NC_012578	GCAGC	3	15	215361	215375	20 %	0 %	40 %	40 %	227080443
133	NC_012578	ATCGC	2	10	216239	216248	20 %	20 %	20 %	40 %	227080444
134	NC_012578	AGTTG	2	10	216323	216332	20 %	40 %	40 %	0 %	227080444
135	NC_012578	GTTTG	2	10	218021	218030	0 %	60 %	40 %	0 %	227080447
136	NC_012578	TGCGT	2	10	218161	218170	0 %	40 %	40 %	20 %	227080447
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139	NC_012578	TTGCT	2	10	221029	221038	0 %	60 %	20 %	20 %	227080450
140	NC_012578	TAGCT	2	10	225204	225213	20 %	40 %	20 %	20 %	227080454
141	NC_012578	ATTTT	2	10	228002	228011	20 %	80 %	0 %	0 %	227080457
142	NC_012578	AGATA	2	10	228162	228171	60 %	20 %	20 %	0 %	227080457
143	NC_012578	TAGAG	2	10	228521	228530	40 %	20 %	40 %	0 %	227080457
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145	NC_012578	GCAAT	2	10	228692	228701	40 %	20 %	20 %	20 %	227080458
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148	NC_012578	GAGCA	2	10	233706	233715	40 %	0 %	40 %	20 %	227080460
149	NC_012578	ATTGA	2	10	234505	234514	40 %	40 %	20 %	0 %	227080461
150	NC_012578	CCTAG	2	10	236283	236292	20 %	20 %	20 %	40 %	227080462
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152	NC_012578	TATAG	2	10	242085	242094	40 %	40 %	20 %	0 %	227080468
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155	NC_012578	ATGGG	2	10	245694	245703	20 %	20 %	60 %	0 %	227080470
156	NC_012578	ATATC	2	10	246587	246596	40 %	40 %	0 %	20 %	227080472
157	NC_012578	ATATT	2	10	248748	248757	40 %	60 %	0 %	0 %	227080473
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166	NC_012578	TTGGG	2	10	265268	265277	0 %	40 %	60 %	0 %	227080489
167	NC_012578	TCAGC	2	10	265961	265970	20 %	20 %	20 %	40 %	227080490
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172	NC_012578	GTGCT	2	10	274179	274188	0 %	40 %	40 %	20 %	227080496
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177	NC_012578	AAGCC	2	10	286519	286528	40 %	0 %	20 %	40 %	227080507
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247	NC_012578	GTAGA	2	10	404869	404878	40 %	20 %	40 %	0 %	227080605
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249	NC_012578	GCCTT	2	10	410302	410311	0 %	40 %	20 %	40 %	227080610
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251	NC_012578	CGCAC	2	10	414192	414201	20 %	0 %	20 %	60 %	227080614
252	NC_012578	TGGTT	2	10	417801	417810	0 %	60 %	40 %	0 %	227080616
253	NC_012578	TACGT	2	10	419570	419579	20 %	40 %	20 %	20 %	227080619
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257	NC_012578	CGAAT	2	10	426702	426711	40 %	20 %	20 %	20 %	227080625
258	NC_012578	AAGCC	2	10	427194	427203	40 %	0 %	20 %	40 %	227080626
259	NC_012578	TGGAG	2	10	429264	429273	20 %	20 %	60 %	0 %	227080628
260	NC_012578	GCGCA	2	10	430578	430587	20 %	0 %	40 %	40 %	227080630
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384	NC_012578	ATCAG	2	10	620064	620073	40 %	20 %	20 %	20 %	227080804
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388	NC_012578	CAACA	2	10	634634	634643	60 %	0 %	0 %	40 %	227080816
389	NC_012578	AGATC	2	10	641554	641563	40 %	20 %	20 %	20 %	227080823
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