MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 48731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	TTGA	2	8	269	276	25 %	50 %	25 %	0 %	227080238
2	NC_012578	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	227080238
3	NC_012578	T	6	6	292	297	0 %	100 %	0 %	0 %	227080238
4	NC_012578	A	8	8	325	332	100 %	0 %	0 %	0 %	227080238
5	NC_012578	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080238
6	NC_012578	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080238
7	NC_012578	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080239
8	NC_012578	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080239
9	NC_012578	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080239
10	NC_012578	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080239
11	NC_012578	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080239
12	NC_012578	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
13	NC_012578	A	6	6	839	844	100 %	0 %	0 %	0 %	227080240
14	NC_012578	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080240
15	NC_012578	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080240
16	NC_012578	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	227080240
17	NC_012578	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080240
18	NC_012578	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080240
19	NC_012578	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080240
20	NC_012578	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080240
21	NC_012578	GC	3	6	1315	1320	0 %	0 %	50 %	50 %	227080240
22	NC_012578	T	6	6	1331	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	227080240
23	NC_012578	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
24	NC_012578	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080240
25	NC_012578	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
26	NC_012578	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	227080240
27	NC_012578	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
28	NC_012578	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080240
29	NC_012578	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
30	NC_012578	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	227080240
31	NC_012578	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080240
32	NC_012578	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080240
33	NC_012578	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	227080240
34	NC_012578	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	227080240
35	NC_012578	AAT	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080240
36	NC_012578	ACC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
37	NC_012578	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080240
38	NC_012578	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	227080241
39	NC_012578	T	6	6	2289	2294	0 %	100 %	0 %	0 %	227080241
40	NC_012578	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
41	NC_012578	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080241
42	NC_012578	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
43	NC_012578	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
44	NC_012578	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
45	NC_012578	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
46	NC_012578	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
47	NC_012578	CTTTCT	2	12	2654	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
48	NC_012578	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
49	NC_012578	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
50	NC_012578	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
51	NC_012578	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
52	NC_012578	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
53	NC_012578	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080241
54	NC_012578	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	227080241
55	NC_012578	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
56	NC_012578	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
57	NC_012578	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	227080241
58	NC_012578	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
59	NC_012578	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
60	NC_012578	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
61	NC_012578	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
62	NC_012578	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080241
63	NC_012578	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
64	NC_012578	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
65	NC_012578	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
66	NC_012578	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
67	NC_012578	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	227080241
68	NC_012578	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
69	NC_012578	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	227080241
70	NC_012578	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
71	NC_012578	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080241
72	NC_012578	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080241
73	NC_012578	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080241
74	NC_012578	AGGAGC	2	12	3759	3770	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	227080241
75	NC_012578	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080241
76	NC_012578	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
77	NC_012578	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080241
78	NC_012578	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	227080241
79	NC_012578	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	227080242
80	NC_012578	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080242
81	NC_012578	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080242
82	NC_012578	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080242
83	NC_012578	GA	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	227080242
84	NC_012578	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	227080243
85	NC_012578	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080243
86	NC_012578	GC	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	227080243
87	NC_012578	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080243
88	NC_012578	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080243
89	NC_012578	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	227080243
90	NC_012578	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080243
91	NC_012578	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	227080243
92	NC_012578	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080244
93	NC_012578	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080244
94	NC_012578	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080244
95	NC_012578	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	227080245
96	NC_012578	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080245
97	NC_012578	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080245
98	NC_012578	T	6	6	5057	5062	0 %	100 %	0 %	0 %	227080245
99	NC_012578	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	227080245
100	NC_012578	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080245
101	NC_012578	CG	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	227080245
102	NC_012578	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080245
103	NC_012578	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080245
104	NC_012578	AG	3	6	5186	5191	50 %	0 %	50 %	0 %	227080245
105	NC_012578	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080245
106	NC_012578	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
107	NC_012578	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	227080245
108	NC_012578	CG	3	6	5316	5321	0 %	0 %	50 %	50 %	227080245
109	NC_012578	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
110	NC_012578	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	227080245
111	NC_012578	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080245
112	NC_012578	TC	3	6	5524	5529	0 %	50 %	0 %	50 %	227080245
113	NC_012578	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
114	NC_012578	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	227080246
115	NC_012578	ACC	3	9	5669	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080246
116	NC_012578	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080246
117	NC_012578	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	227080246
118	NC_012578	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	227080246
119	NC_012578	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	227080246
120	NC_012578	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080246
121	NC_012578	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080246
122	NC_012578	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	227080246
123	NC_012578	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080246
124	NC_012578	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080246
125	NC_012578	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	227080246
126	NC_012578	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080246
127	NC_012578	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080247
128	NC_012578	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080247
129	NC_012578	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	227080247
130	NC_012578	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	227080247
131	NC_012578	CA	3	6	6946	6951	50 %	0 %	0 %	50 %	227080247
132	NC_012578	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080247
133	NC_012578	TG	3	6	7264	7269	0 %	50 %	50 %	0 %	227080248
134	NC_012578	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080248
135	NC_012578	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080248
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249	NC_012578	CCGTAA	2	12	12410	12421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227080252
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257	NC_012578	CCA	2	6	12699	12704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080252
258	NC_012578	GAA	2	6	12716	12721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080252
259	NC_012578	GATG	2	8	12785	12792	25 %	25 %	50 %	0 %	227080252
260	NC_012578	CGC	2	6	12869	12874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080252
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264	NC_012578	AAG	2	6	13024	13029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080252
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266	NC_012578	TACT	2	8	13128	13135	25 %	50 %	0 %	25 %	227080252
267	NC_012578	TTGA	2	8	13203	13210	25 %	50 %	25 %	0 %	227080252
268	NC_012578	GTG	2	6	13231	13236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080252
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302	NC_012578	AC	3	6	15995	16000	50 %	0 %	0 %	50 %	227080256
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382	NC_012578	TTGT	2	8	20235	20242	0 %	75 %	25 %	0 %	227080259
383	NC_012578	ATA	2	6	20253	20258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080259
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391	NC_012578	TTG	2	6	20689	20694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080259
392	NC_012578	GAC	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080259
393	NC_012578	TTGC	2	8	20712	20719	0 %	50 %	25 %	25 %	227080259
394	NC_012578	GTG	2	6	20730	20735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080259
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397	NC_012578	TGG	3	9	21052	21060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080260
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497	NC_012578	GC	4	8	26575	26582	0 %	0 %	50 %	50 %	227080265
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