MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 48731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012578	CTA	2	6	248651	248656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080473
4002	NC_012578	ATATT	2	10	248748	248757	40 %	60 %	0 %	0 %	227080473
4003	NC_012578	TGA	2	6	248805	248810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080473
4004	NC_012578	ATA	2	6	248821	248826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080473
4005	NC_012578	ATC	2	6	248868	248873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080473
4006	NC_012578	TAA	2	6	248892	248897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080473
4007	NC_012578	AAC	2	6	249158	249163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080474
4008	NC_012578	ACT	2	6	249215	249220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080474
4009	NC_012578	AAT	2	6	249221	249226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080474
4010	NC_012578	CTA	2	6	249352	249357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080474
4011	NC_012578	TGC	2	6	249455	249460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080474
4012	NC_012578	GTA	2	6	249485	249490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080474
4013	NC_012578	CAA	2	6	249502	249507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080474
4014	NC_012578	A	6	6	249513	249518	100 %	0 %	0 %	0 %	227080474
4015	NC_012578	TTA	2	6	249543	249548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080474
4016	NC_012578	GGATA	2	10	249565	249574	40 %	20 %	40 %	0 %	227080474
4017	NC_012578	TCA	2	6	249582	249587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080474
4018	NC_012578	ATT	2	6	249600	249605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080474
4019	NC_012578	TG	4	8	249641	249648	0 %	50 %	50 %	0 %	227080474
4020	NC_012578	A	6	6	249690	249695	100 %	0 %	0 %	0 %	227080474
4021	NC_012578	AAT	2	6	249740	249745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080474
4022	NC_012578	AG	3	6	249791	249796	50 %	0 %	50 %	0 %	227080474
4023	NC_012578	TAATGG	2	12	249819	249830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080474
4024	NC_012578	T	7	7	249911	249917	0 %	100 %	0 %	0 %	227080474
4025	NC_012578	ATT	2	6	249924	249929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080474
4026	NC_012578	AAT	2	6	249943	249948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080474
4027	NC_012578	AAG	3	9	249949	249957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080474
4028	NC_012578	TA	3	6	250072	250077	50 %	50 %	0 %	0 %	227080474
4029	NC_012578	TTC	2	6	250227	250232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080475
4030	NC_012578	TC	3	6	250274	250279	0 %	50 %	0 %	50 %	227080475
4031	NC_012578	TCA	2	6	250348	250353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4032	NC_012578	CTT	2	6	250354	250359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080475
4033	NC_012578	CGA	2	6	250412	250417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080475
4034	NC_012578	T	6	6	250572	250577	0 %	100 %	0 %	0 %	227080475
4035	NC_012578	GTA	2	6	250670	250675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080475
4036	NC_012578	GCTT	2	8	250691	250698	0 %	50 %	25 %	25 %	227080475
4037	NC_012578	T	6	6	250753	250758	0 %	100 %	0 %	0 %	227080475
4038	NC_012578	TTG	2	6	250807	250812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080475
4039	NC_012578	GCA	2	6	250864	250869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080475
4040	NC_012578	TGA	2	6	250888	250893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080475
4041	NC_012578	T	6	6	250905	250910	0 %	100 %	0 %	0 %	227080475
4042	NC_012578	TGC	2	6	250941	250946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080475
4043	NC_012578	T	7	7	251134	251140	0 %	100 %	0 %	0 %	227080475
4044	NC_012578	GCA	2	6	251230	251235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080475
4045	NC_012578	GA	3	6	251279	251284	50 %	0 %	50 %	0 %	227080475
4046	NC_012578	ATT	2	6	251322	251327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080475
4047	NC_012578	ACT	2	6	251382	251387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4048	NC_012578	ATC	3	9	251433	251441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4049	NC_012578	AAG	2	6	251443	251448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080475
4050	NC_012578	TCA	2	6	251464	251469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4051	NC_012578	TAA	2	6	251548	251553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080475
4052	NC_012578	ATAA	2	8	251616	251623	75 %	25 %	0 %	0 %	227080475
4053	NC_012578	GAAA	2	8	251651	251658	75 %	0 %	25 %	0 %	227080475
4054	NC_012578	ATG	2	6	251689	251694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080475
4055	NC_012578	GCAG	2	8	251719	251726	25 %	0 %	50 %	25 %	227080475
4056	NC_012578	CAT	2	6	251727	251732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4057	NC_012578	ATAC	2	8	251751	251758	50 %	25 %	0 %	25 %	227080475
4058	NC_012578	AG	3	6	251777	251782	50 %	0 %	50 %	0 %	227080475
4059	NC_012578	TCA	2	6	251798	251803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4060	NC_012578	GCA	2	6	251863	251868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080475
4061	NC_012578	CAT	2	6	251894	251899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080475
4062	NC_012578	ATG	2	6	251922	251927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080475
4063	NC_012578	ATG	2	6	252075	252080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080476
4064	NC_012578	CAA	2	6	252242	252247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080477
4065	NC_012578	GA	3	6	252299	252304	50 %	0 %	50 %	0 %	227080477
4066	NC_012578	AAGC	2	8	252428	252435	50 %	0 %	25 %	25 %	227080477
4067	NC_012578	CTG	2	6	252441	252446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080477
4068	NC_012578	ATG	2	6	252522	252527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080477
4069	NC_012578	AAC	2	6	252576	252581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080477
4070	NC_012578	TTA	2	6	252584	252589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080477
4071	NC_012578	GCA	2	6	252596	252601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080477
4072	NC_012578	ATG	2	6	252677	252682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080477
4073	NC_012578	TTG	2	6	252778	252783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080477
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4075	NC_012578	ACG	2	6	252831	252836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080477
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4080	NC_012578	ATC	2	6	253078	253083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080477
4081	NC_012578	ATTTT	2	10	253117	253126	20 %	80 %	0 %	0 %	227080478
4082	NC_012578	TGT	2	6	253141	253146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080478
4083	NC_012578	ATTG	2	8	253163	253170	25 %	50 %	25 %	0 %	227080478
4084	NC_012578	TG	3	6	253169	253174	0 %	50 %	50 %	0 %	227080478
4085	NC_012578	A	6	6	253274	253279	100 %	0 %	0 %	0 %	227080478
4086	NC_012578	TGGT	2	8	253303	253310	0 %	50 %	50 %	0 %	227080478
4087	NC_012578	CTT	2	6	253312	253317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080478
4088	NC_012578	TGA	2	6	253358	253363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080478
4089	NC_012578	CTTG	2	8	253420	253427	0 %	50 %	25 %	25 %	227080478
4090	NC_012578	CAA	2	6	253434	253439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080478
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4092	NC_012578	A	6	6	253583	253588	100 %	0 %	0 %	0 %	227080478
4093	NC_012578	ACA	2	6	253841	253846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080479
4094	NC_012578	TCA	2	6	253857	253862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080479
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4101	NC_012578	ACTG	2	8	254175	254182	25 %	25 %	25 %	25 %	227080479
4102	NC_012578	TGC	2	6	254195	254200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080479
4103	NC_012578	TGCAG	2	10	254226	254235	20 %	20 %	40 %	20 %	227080479
4104	NC_012578	GGT	3	9	254328	254336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080479
4105	NC_012578	TTG	2	6	254371	254376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080479
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4107	NC_012578	GC	3	6	254475	254480	0 %	0 %	50 %	50 %	227080479
4108	NC_012578	GAT	2	6	254481	254486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080479
4109	NC_012578	ACTG	2	8	254496	254503	25 %	25 %	25 %	25 %	227080479
4110	NC_012578	CGG	2	6	254505	254510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080479
4111	NC_012578	GTCG	2	8	254536	254543	0 %	25 %	50 %	25 %	227080479
4112	NC_012578	GCT	2	6	254553	254558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080479
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4122	NC_012578	TTA	2	6	255050	255055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080479
4123	NC_012578	CAAG	2	8	255075	255082	50 %	0 %	25 %	25 %	227080479
4124	NC_012578	CAAG	2	8	255111	255118	50 %	0 %	25 %	25 %	227080479
4125	NC_012578	CCAC	2	8	255540	255547	25 %	0 %	0 %	75 %	227080480
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4128	NC_012578	GCT	2	6	255751	255756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080480
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4130	NC_012578	TCT	3	9	255821	255829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080480
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4134	NC_012578	TGC	2	6	255864	255869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080480
4135	NC_012578	TGG	2	6	255948	255953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080480
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4202	NC_012578	A	9	9	259840	259848	100 %	0 %	0 %	0 %	227080484
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4235	NC_012578	TCG	2	6	261739	261744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
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4240	NC_012578	CATCA	2	10	261999	262008	40 %	20 %	0 %	40 %	227080486
4241	NC_012578	TGC	2	6	262036	262041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
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4244	NC_012578	TGC	2	6	262132	262137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080486
4245	NC_012578	TCA	2	6	262147	262152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080486
4246	NC_012578	GCG	2	6	262190	262195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080486
4247	NC_012578	GTT	2	6	262236	262241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080486
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4250	NC_012578	GCA	2	6	262406	262411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080486
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4263	NC_012578	ATCA	2	8	263561	263568	50 %	25 %	0 %	25 %	227080488
4264	NC_012578	TGG	2	6	263575	263580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080488
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4352	NC_012578	TAGAG	2	10	267886	267895	40 %	20 %	40 %	0 %	227080491
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4363	NC_012578	T	6	6	268678	268683	0 %	100 %	0 %	0 %	227080492
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4491	NC_012578	CG	3	6	276271	276276	0 %	0 %	50 %	50 %	227080497
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