MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 48731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012578	GGT	2	6	218183	218188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080447
3502	NC_012578	TGG	2	6	218202	218207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080447
3503	NC_012578	TGC	2	6	218262	218267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080447
3504	NC_012578	CTG	2	6	218336	218341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080447
3505	NC_012578	TTGA	2	8	218507	218514	25 %	50 %	25 %	0 %	227080447
3506	NC_012578	ATT	2	6	218534	218539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080447
3507	NC_012578	AAG	2	6	218619	218624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080447
3508	NC_012578	TAT	2	6	218665	218670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080447
3509	NC_012578	TTA	2	6	218853	218858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080448
3510	NC_012578	TAA	2	6	218863	218868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080448
3511	NC_012578	TA	3	6	218892	218897	50 %	50 %	0 %	0 %	227080448
3512	NC_012578	ATG	2	6	218907	218912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080448
3513	NC_012578	ATA	2	6	219003	219008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080448
3514	NC_012578	AAG	2	6	219019	219024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080448
3515	NC_012578	AGG	2	6	219060	219065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080448
3516	NC_012578	TTGT	2	8	219090	219097	0 %	75 %	25 %	0 %	227080448
3517	NC_012578	ATT	2	6	219102	219107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080448
3518	NC_012578	TCT	3	9	219144	219152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080448
3519	NC_012578	T	6	6	219157	219162	0 %	100 %	0 %	0 %	227080448
3520	NC_012578	TA	3	6	219210	219215	50 %	50 %	0 %	0 %	227080448
3521	NC_012578	AAG	2	6	219248	219253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080448
3522	NC_012578	GCA	2	6	219311	219316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080448
3523	NC_012578	CAA	2	6	219371	219376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080448
3524	NC_012578	ATAA	2	8	219392	219399	75 %	25 %	0 %	0 %	227080448
3525	NC_012578	TTG	2	6	219408	219413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080448
3526	NC_012578	T	7	7	219478	219484	0 %	100 %	0 %	0 %	227080448
3527	NC_012578	T	7	7	219557	219563	0 %	100 %	0 %	0 %	227080448
3528	NC_012578	TTA	2	6	219639	219644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080448
3529	NC_012578	AG	3	6	219650	219655	50 %	0 %	50 %	0 %	227080448
3530	NC_012578	TTAA	2	8	219662	219669	50 %	50 %	0 %	0 %	227080449
3531	NC_012578	ATCCA	2	10	219830	219839	40 %	20 %	0 %	40 %	227080449
3532	NC_012578	AGT	2	6	219951	219956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080449
3533	NC_012578	AGA	2	6	220068	220073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080449
3534	NC_012578	A	6	6	220145	220150	100 %	0 %	0 %	0 %	227080449
3535	NC_012578	CTG	2	6	220155	220160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080449
3536	NC_012578	CAA	2	6	220231	220236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080449
3537	NC_012578	TTA	2	6	220332	220337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080449
3538	NC_012578	A	6	6	220363	220368	100 %	0 %	0 %	0 %	227080449
3539	NC_012578	ATC	2	6	220385	220390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080449
3540	NC_012578	ATG	2	6	220452	220457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080449
3541	NC_012578	A	6	6	220469	220474	100 %	0 %	0 %	0 %	227080449
3542	NC_012578	CGT	2	6	220476	220481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080449
3543	NC_012578	GAC	2	6	220522	220527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080449
3544	NC_012578	ACA	2	6	220554	220559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080449
3545	NC_012578	TCA	3	9	220572	220580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080449
3546	NC_012578	A	6	6	220638	220643	100 %	0 %	0 %	0 %	227080450
3547	NC_012578	CTCGC	2	10	220726	220735	0 %	20 %	20 %	60 %	227080450
3548	NC_012578	TAC	2	6	220818	220823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080450
3549	NC_012578	TGC	2	6	220869	220874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080450
3550	NC_012578	CAC	2	6	220908	220913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080450
3551	NC_012578	TTGCT	2	10	221029	221038	0 %	60 %	20 %	20 %	227080450
3552	NC_012578	GGC	2	6	221206	221211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080450
3553	NC_012578	AT	3	6	221261	221266	50 %	50 %	0 %	0 %	227080450
3554	NC_012578	AAG	2	6	221291	221296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080450
3555	NC_012578	GGC	2	6	221390	221395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080451
3556	NC_012578	ATC	2	6	221400	221405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080451
3557	NC_012578	TTG	2	6	221505	221510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080451
3558	NC_012578	ATG	2	6	221520	221525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080451
3559	NC_012578	GTA	2	6	221577	221582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080451
3560	NC_012578	AAT	2	6	221589	221594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080451
3561	NC_012578	TTG	2	6	221710	221715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080451
3562	NC_012578	TCT	2	6	221857	221862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080451
3563	NC_012578	TGCT	2	8	221961	221968	0 %	50 %	25 %	25 %	227080451
3564	NC_012578	GCTA	2	8	221997	222004	25 %	25 %	25 %	25 %	227080451
3565	NC_012578	A	6	6	222038	222043	100 %	0 %	0 %	0 %	227080451
3566	NC_012578	GCG	2	6	222181	222186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080451
3567	NC_012578	T	6	6	222188	222193	0 %	100 %	0 %	0 %	227080451
3568	NC_012578	GC	3	6	222250	222255	0 %	0 %	50 %	50 %	227080451
3569	NC_012578	GTG	2	6	222259	222264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080451
3570	NC_012578	AGTA	2	8	222284	222291	50 %	25 %	25 %	0 %	227080451
3571	NC_012578	TG	3	6	222391	222396	0 %	50 %	50 %	0 %	227080451
3572	NC_012578	GTGG	2	8	222416	222423	0 %	25 %	75 %	0 %	227080451
3573	NC_012578	TCA	2	6	222502	222507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080451
3574	NC_012578	ATC	2	6	222561	222566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080451
3575	NC_012578	GTG	2	6	222614	222619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080451
3576	NC_012578	TGAG	2	8	222623	222630	25 %	25 %	50 %	0 %	227080451
3577	NC_012578	GCC	2	6	222649	222654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080451
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3579	NC_012578	CGA	2	6	222817	222822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080451
3580	NC_012578	GGA	2	6	222844	222849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080451
3581	NC_012578	TGG	2	6	222933	222938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080452
3582	NC_012578	TCT	2	6	222942	222947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080452
3583	NC_012578	ATC	2	6	222986	222991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080452
3584	NC_012578	CTA	2	6	223027	223032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080452
3585	NC_012578	TCA	2	6	223038	223043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080452
3586	NC_012578	CGA	2	6	223264	223269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080452
3587	NC_012578	T	6	6	223274	223279	0 %	100 %	0 %	0 %	227080452
3588	NC_012578	T	6	6	223364	223369	0 %	100 %	0 %	0 %	227080453
3589	NC_012578	TGC	2	6	223376	223381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080453
3590	NC_012578	TGGT	2	8	223432	223439	0 %	50 %	50 %	0 %	227080453
3591	NC_012578	CA	3	6	223447	223452	50 %	0 %	0 %	50 %	227080453
3592	NC_012578	TGA	2	6	223464	223469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080453
3593	NC_012578	GCA	2	6	223532	223537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080453
3594	NC_012578	T	6	6	223564	223569	0 %	100 %	0 %	0 %	227080453
3595	NC_012578	AC	3	6	223594	223599	50 %	0 %	0 %	50 %	227080453
3596	NC_012578	TC	3	6	223626	223631	0 %	50 %	0 %	50 %	227080453
3597	NC_012578	GCT	2	6	223681	223686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080453
3598	NC_012578	A	6	6	223701	223706	100 %	0 %	0 %	0 %	227080453
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3601	NC_012578	TGC	2	6	223781	223786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080453
3602	NC_012578	TG	3	6	223835	223840	0 %	50 %	50 %	0 %	227080453
3603	NC_012578	GGC	2	6	223843	223848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080453
3604	NC_012578	ACG	2	6	224197	224202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080453
3605	NC_012578	AATC	2	8	224229	224236	50 %	25 %	0 %	25 %	227080453
3606	NC_012578	CAG	2	6	224308	224313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080453
3607	NC_012578	CACC	2	8	224376	224383	25 %	0 %	0 %	75 %	227080453
3608	NC_012578	GTG	2	6	224424	224429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080453
3609	NC_012578	AGC	2	6	224552	224557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080453
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3611	NC_012578	T	6	6	224562	224567	0 %	100 %	0 %	0 %	227080453
3612	NC_012578	TG	3	6	224588	224593	0 %	50 %	50 %	0 %	227080453
3613	NC_012578	ATAC	2	8	224653	224660	50 %	25 %	0 %	25 %	227080454
3614	NC_012578	ACC	2	6	224776	224781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080454
3615	NC_012578	TGG	2	6	224789	224794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080454
3616	NC_012578	AGT	2	6	224831	224836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080454
3617	NC_012578	TAT	2	6	224849	224854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080454
3618	NC_012578	AGC	2	6	224890	224895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080454
3619	NC_012578	AC	3	6	224936	224941	50 %	0 %	0 %	50 %	227080454
3620	NC_012578	CAT	2	6	225014	225019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080454
3621	NC_012578	ATGT	2	8	225032	225039	25 %	50 %	25 %	0 %	227080454
3622	NC_012578	TGG	2	6	225182	225187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080454
3623	NC_012578	GC	3	6	225193	225198	0 %	0 %	50 %	50 %	227080454
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3992	NC_012578	ATTA	2	8	248118	248125	50 %	50 %	0 %	0 %	227080473
3993	NC_012578	GCT	2	6	248374	248379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080473
3994	NC_012578	AAT	2	6	248461	248466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080473
3995	NC_012578	TCA	2	6	248481	248486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080473
3996	NC_012578	ATA	2	6	248546	248551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080473
3997	NC_012578	TCA	2	6	248557	248562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080473
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3999	NC_012578	AGT	2	6	248632	248637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080473
4000	NC_012578	AT	3	6	248642	248647	50 %	50 %	0 %	0 %	227080473

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