MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 48731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012578	GAT	2	6	89921	89926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080327
1502	NC_012578	AAG	2	6	89941	89946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080327
1503	NC_012578	TCT	2	6	90135	90140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080328
1504	NC_012578	CG	3	6	90142	90147	0 %	0 %	50 %	50 %	227080328
1505	NC_012578	CCA	2	6	90148	90153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080328
1506	NC_012578	AAGT	2	8	90194	90201	50 %	25 %	25 %	0 %	227080328
1507	NC_012578	TTC	2	6	90222	90227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080328
1508	NC_012578	GCA	2	6	90247	90252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080328
1509	NC_012578	GCGG	2	8	90265	90272	0 %	0 %	75 %	25 %	227080328
1510	NC_012578	CTT	3	9	90373	90381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080328
1511	NC_012578	GCG	2	6	90387	90392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080328
1512	NC_012578	CGA	2	6	90397	90402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080328
1513	NC_012578	TTC	2	6	90473	90478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080328
1514	NC_012578	CGAA	2	8	90491	90498	50 %	0 %	25 %	25 %	227080328
1515	NC_012578	GATCA	2	10	90563	90572	40 %	20 %	20 %	20 %	227080328
1516	NC_012578	CTT	2	6	90577	90582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080328
1517	NC_012578	TAT	2	6	90943	90948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080329
1518	NC_012578	ACT	2	6	90956	90961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080329
1519	NC_012578	AAG	2	6	91108	91113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080329
1520	NC_012578	GCT	2	6	91196	91201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1521	NC_012578	GCT	2	6	91250	91255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1522	NC_012578	AAG	2	6	91333	91338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080329
1523	NC_012578	AAGA	2	8	91342	91349	75 %	0 %	25 %	0 %	227080329
1524	NC_012578	TC	3	6	91519	91524	0 %	50 %	0 %	50 %	227080329
1525	NC_012578	GGC	2	6	91535	91540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080329
1526	NC_012578	TGA	2	6	91585	91590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080329
1527	NC_012578	GC	3	6	91656	91661	0 %	0 %	50 %	50 %	227080329
1528	NC_012578	AAG	2	6	91663	91668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080329
1529	NC_012578	CGG	2	6	91693	91698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080329
1530	NC_012578	A	6	6	91719	91724	100 %	0 %	0 %	0 %	227080329
1531	NC_012578	GGTT	2	8	91740	91747	0 %	50 %	50 %	0 %	227080329
1532	NC_012578	CGC	2	6	91784	91789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080329
1533	NC_012578	TGC	2	6	91864	91869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1534	NC_012578	CGG	2	6	91942	91947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080329
1535	NC_012578	CCG	2	6	91958	91963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080329
1536	NC_012578	CGG	2	6	91964	91969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080329
1537	NC_012578	TCG	2	6	91982	91987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1538	NC_012578	TTG	2	6	92106	92111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080329
1539	NC_012578	AGAA	2	8	92260	92267	75 %	0 %	25 %	0 %	227080329
1540	NC_012578	TGC	2	6	92281	92286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1541	NC_012578	TGAA	2	8	92362	92369	50 %	25 %	25 %	0 %	227080329
1542	NC_012578	ATG	2	6	92460	92465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080329
1543	NC_012578	TG	3	6	92506	92511	0 %	50 %	50 %	0 %	227080329
1544	NC_012578	GCT	2	6	92519	92524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1545	NC_012578	GCT	2	6	92588	92593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1546	NC_012578	TGG	2	6	92683	92688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080329
1547	NC_012578	ATT	2	6	92709	92714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080329
1548	NC_012578	TGA	2	6	92740	92745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080329
1549	NC_012578	TTA	2	6	92747	92752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080329
1550	NC_012578	CAA	2	6	92756	92761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080329
1551	NC_012578	GTT	2	6	92801	92806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080329
1552	NC_012578	AGA	2	6	92903	92908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080329
1553	NC_012578	TGC	2	6	93016	93021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1554	NC_012578	CTG	2	6	93072	93077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080329
1555	NC_012578	AGCTG	2	10	93101	93110	20 %	20 %	40 %	20 %	227080329
1556	NC_012578	GAAGA	2	10	93111	93120	60 %	0 %	40 %	0 %	227080329
1557	NC_012578	GAT	2	6	93234	93239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080329
1558	NC_012578	CT	3	6	93273	93278	0 %	50 %	0 %	50 %	227080329
1559	NC_012578	GTT	2	6	93477	93482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080330
1560	NC_012578	TGT	2	6	93532	93537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080330
1561	NC_012578	AGT	2	6	93575	93580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080330
1562	NC_012578	ATG	2	6	93652	93657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080330
1563	NC_012578	CAT	3	9	93710	93718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080330
1564	NC_012578	AGC	2	6	93816	93821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080330
1565	NC_012578	GTGA	2	8	93876	93883	25 %	25 %	50 %	0 %	227080330
1566	NC_012578	AG	3	6	93930	93935	50 %	0 %	50 %	0 %	227080330
1567	NC_012578	AAG	2	6	93987	93992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080330
1568	NC_012578	CTT	2	6	94010	94015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080330
1569	NC_012578	CA	3	6	94101	94106	50 %	0 %	0 %	50 %	227080330
1570	NC_012578	A	7	7	94123	94129	100 %	0 %	0 %	0 %	227080330
1571	NC_012578	AGC	2	6	94186	94191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080330
1572	NC_012578	GC	4	8	94261	94268	0 %	0 %	50 %	50 %	227080330
1573	NC_012578	CT	3	6	94289	94294	0 %	50 %	0 %	50 %	227080331
1574	NC_012578	TGT	2	6	94349	94354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080331
1575	NC_012578	GTC	2	6	94385	94390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080331
1576	NC_012578	TTG	2	6	94479	94484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080331
1577	NC_012578	GTT	2	6	94550	94555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080331
1578	NC_012578	ATAA	2	8	94563	94570	75 %	25 %	0 %	0 %	227080331
1579	NC_012578	AGA	2	6	94582	94587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080331
1580	NC_012578	TCA	2	6	94615	94620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080331
1581	NC_012578	TAA	2	6	94656	94661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080331
1582	NC_012578	AG	3	6	94705	94710	50 %	0 %	50 %	0 %	227080331
1583	NC_012578	TCA	2	6	94759	94764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080331
1584	NC_012578	TAT	2	6	94826	94831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080331
1585	NC_012578	ACC	2	6	94873	94878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080332
1586	NC_012578	CCAAA	2	10	94914	94923	60 %	0 %	0 %	40 %	227080332
1587	NC_012578	TTTA	2	8	94945	94952	25 %	75 %	0 %	0 %	227080332
1588	NC_012578	CGT	2	6	95041	95046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080333
1589	NC_012578	AAT	2	6	95050	95055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080333
1590	NC_012578	CTG	2	6	95106	95111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080333
1591	NC_012578	CAC	2	6	95149	95154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080333
1592	NC_012578	T	7	7	95158	95164	0 %	100 %	0 %	0 %	227080333
1593	NC_012578	TGC	2	6	95221	95226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080333
1594	NC_012578	AGC	2	6	95244	95249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080333
1595	NC_012578	GCT	2	6	95281	95286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080333
1596	NC_012578	CAA	2	6	95362	95367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080333
1597	NC_012578	CTG	2	6	95408	95413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080333
1598	NC_012578	AAT	2	6	95433	95438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080333
1599	NC_012578	TTC	2	6	95572	95577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080334
1600	NC_012578	TGGC	2	8	95654	95661	0 %	25 %	50 %	25 %	227080334
1601	NC_012578	GCT	2	6	95772	95777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080334
1602	NC_012578	CGA	2	6	95820	95825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080334
1603	NC_012578	TCATC	2	10	95844	95853	20 %	40 %	0 %	40 %	227080334
1604	NC_012578	TGC	2	6	95973	95978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080334
1605	NC_012578	CCA	2	6	95988	95993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080334
1606	NC_012578	ATTC	2	8	95994	96001	25 %	50 %	0 %	25 %	227080334
1607	NC_012578	GCA	2	6	96146	96151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080334
1608	NC_012578	GGC	2	6	96280	96285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080334
1609	NC_012578	TTG	2	6	96400	96405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080334
1610	NC_012578	AG	3	6	96418	96423	50 %	0 %	50 %	0 %	227080334
1611	NC_012578	GCT	2	6	96452	96457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080334
1612	NC_012578	TCACC	2	10	96528	96537	20 %	20 %	0 %	60 %	227080334
1613	NC_012578	CGC	2	6	96588	96593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080334
1614	NC_012578	ACC	2	6	96629	96634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080334
1615	NC_012578	TGG	2	6	96654	96659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080334
1616	NC_012578	C	6	6	96736	96741	0 %	0 %	0 %	100 %	227080334
1617	NC_012578	TCG	2	6	96761	96766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080334
1618	NC_012578	TCA	2	6	96833	96838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080334
1619	NC_012578	GCC	2	6	96855	96860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080334
1620	NC_012578	CATT	2	8	96969	96976	25 %	50 %	0 %	25 %	227080334
1621	NC_012578	T	6	6	96993	96998	0 %	100 %	0 %	0 %	227080334
1622	NC_012578	ACC	2	6	97031	97036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080334
1623	NC_012578	T	6	6	97144	97149	0 %	100 %	0 %	0 %	227080334
1624	NC_012578	GCA	2	6	97158	97163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080334
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1626	NC_012578	TTGA	2	8	97339	97346	25 %	50 %	25 %	0 %	227080334
1627	NC_012578	GTG	2	6	97373	97378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080334
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1632	NC_012578	GCTG	2	8	97928	97935	0 %	25 %	50 %	25 %	227080335
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1870	NC_012578	GA	4	8	113023	113030	50 %	0 %	50 %	0 %	227080354
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1873	NC_012578	GCTTG	2	10	113139	113148	0 %	40 %	40 %	20 %	227080354
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1881	NC_012578	GCT	2	6	113659	113664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080354
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1885	NC_012578	TTGT	2	8	113822	113829	0 %	75 %	25 %	0 %	227080354
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1893	NC_012578	CTG	2	6	114118	114123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080355
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1899	NC_012578	CTT	2	6	114294	114299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080355
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1987	NC_012578	CGCAG	2	10	119727	119736	20 %	0 %	40 %	40 %	227080361
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1990	NC_012578	GGT	2	6	119919	119924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080361
1991	NC_012578	TGA	2	6	119931	119936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080361
1992	NC_012578	CG	3	6	120025	120030	0 %	0 %	50 %	50 %	227080361
1993	NC_012578	AC	3	6	120078	120083	50 %	0 %	0 %	50 %	227080361
1994	NC_012578	GCG	2	6	120112	120117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080361
1995	NC_012578	CAT	2	6	120162	120167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080361
1996	NC_012578	TTGG	2	8	120208	120215	0 %	50 %	50 %	0 %	227080361
1997	NC_012578	GT	3	6	120220	120225	0 %	50 %	50 %	0 %	227080361
1998	NC_012578	TCT	2	6	120295	120300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080361
1999	NC_012578	GTC	2	6	120321	120326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080361
2000	NC_012578	AGC	2	6	120409	120414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080361

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