MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 48731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012578	ATT	2	6	60619	60624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080297
1002	NC_012578	GAA	3	9	60688	60696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080297
1003	NC_012578	AGTT	2	8	60704	60711	25 %	50 %	25 %	0 %	227080297
1004	NC_012578	GGC	2	6	61003	61008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080297
1005	NC_012578	ATT	2	6	61012	61017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080297
1006	NC_012578	ATG	2	6	61097	61102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080297
1007	NC_012578	ATG	2	6	61217	61222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080297
1008	NC_012578	TTAA	2	8	61264	61271	50 %	50 %	0 %	0 %	227080297
1009	NC_012578	AGC	2	6	61286	61291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080297
1010	NC_012578	TTGG	2	8	61394	61401	0 %	50 %	50 %	0 %	227080297
1011	NC_012578	CAAA	2	8	61454	61461	75 %	0 %	0 %	25 %	227080297
1012	NC_012578	GATT	2	8	61478	61485	25 %	50 %	25 %	0 %	227080297
1013	NC_012578	GCA	2	6	61507	61512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080297
1014	NC_012578	ATG	2	6	61637	61642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080297
1015	NC_012578	TG	3	6	61688	61693	0 %	50 %	50 %	0 %	227080297
1016	NC_012578	ACC	2	6	61762	61767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080297
1017	NC_012578	ATC	2	6	61856	61861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080297
1018	NC_012578	GAG	2	6	61882	61887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080297
1019	NC_012578	AGA	2	6	62033	62038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080298
1020	NC_012578	AGT	2	6	62062	62067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080298
1021	NC_012578	AGG	2	6	62081	62086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080298
1022	NC_012578	ACT	2	6	62102	62107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080298
1023	NC_012578	ATG	2	6	62149	62154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080298
1024	NC_012578	CGCT	2	8	62160	62167	0 %	25 %	25 %	50 %	227080298
1025	NC_012578	ATG	2	6	62189	62194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080298
1026	NC_012578	TGC	2	6	62232	62237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080298
1027	NC_012578	CTTG	2	8	62299	62306	0 %	50 %	25 %	25 %	227080298
1028	NC_012578	CT	3	6	62451	62456	0 %	50 %	0 %	50 %	227080298
1029	NC_012578	ACC	2	6	62476	62481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080298
1030	NC_012578	GAT	2	6	62533	62538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080298
1031	NC_012578	TCT	2	6	62556	62561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080298
1032	NC_012578	TTA	2	6	62808	62813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080298
1033	NC_012578	GCC	2	6	62923	62928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080298
1034	NC_012578	GGTT	2	8	62936	62943	0 %	50 %	50 %	0 %	227080298
1035	NC_012578	ACA	2	6	62964	62969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080298
1036	NC_012578	TGG	2	6	62991	62996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080298
1037	NC_012578	ATTG	2	8	62998	63005	25 %	50 %	25 %	0 %	227080298
1038	NC_012578	CGG	2	6	63041	63046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080298
1039	NC_012578	GTG	2	6	63052	63057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080298
1040	NC_012578	GCCA	2	8	63150	63157	25 %	0 %	25 %	50 %	227080298
1041	NC_012578	TTC	2	6	63222	63227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080299
1042	NC_012578	GCA	2	6	63271	63276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080299
1043	NC_012578	GT	3	6	63294	63299	0 %	50 %	50 %	0 %	227080299
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1045	NC_012578	TGG	2	6	63330	63335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080299
1046	NC_012578	TTGG	2	8	63344	63351	0 %	50 %	50 %	0 %	227080299
1047	NC_012578	CTT	2	6	63461	63466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080299
1048	NC_012578	GCAGC	2	10	63626	63635	20 %	0 %	40 %	40 %	227080299
1049	NC_012578	TCA	2	6	63642	63647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080299
1050	NC_012578	TGGG	2	8	63661	63668	0 %	25 %	75 %	0 %	227080299
1051	NC_012578	GT	3	6	63718	63723	0 %	50 %	50 %	0 %	227080299
1052	NC_012578	TGT	2	6	63778	63783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080299
1053	NC_012578	ATT	2	6	64029	64034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080300
1054	NC_012578	GCCT	2	8	64055	64062	0 %	25 %	25 %	50 %	227080300
1055	NC_012578	AAG	2	6	64104	64109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080300
1056	NC_012578	AC	3	6	64119	64124	50 %	0 %	0 %	50 %	227080300
1057	NC_012578	AGG	2	6	64170	64175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080300
1058	NC_012578	GCC	2	6	64275	64280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080301
1059	NC_012578	GATT	2	8	64316	64323	25 %	50 %	25 %	0 %	227080301
1060	NC_012578	CGA	2	6	64334	64339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080301
1061	NC_012578	TGC	2	6	64406	64411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080301
1062	NC_012578	GCC	2	6	64425	64430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080301
1063	NC_012578	GCTGC	2	10	64615	64624	0 %	20 %	40 %	40 %	227080301
1064	NC_012578	GCA	2	6	64651	64656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080301
1065	NC_012578	ATC	2	6	64689	64694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080301
1066	NC_012578	CCAAG	2	10	64700	64709	40 %	0 %	20 %	40 %	227080301
1067	NC_012578	TGC	2	6	64751	64756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080301
1068	NC_012578	CAA	2	6	64973	64978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080302
1069	NC_012578	CAG	2	6	65094	65099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080302
1070	NC_012578	CT	3	6	65189	65194	0 %	50 %	0 %	50 %	227080302
1071	NC_012578	TGAA	2	8	65262	65269	50 %	25 %	25 %	0 %	227080302
1072	NC_012578	GA	3	6	65283	65288	50 %	0 %	50 %	0 %	227080302
1073	NC_012578	ATC	2	6	65387	65392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080302
1074	NC_012578	AAGC	2	8	65393	65400	50 %	0 %	25 %	25 %	227080302
1075	NC_012578	GCA	2	6	65434	65439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080302
1076	NC_012578	AGA	2	6	65440	65445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080302
1077	NC_012578	GCA	2	6	65521	65526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080302
1078	NC_012578	GC	3	6	65616	65621	0 %	0 %	50 %	50 %	227080302
1079	NC_012578	GCG	2	6	65663	65668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080302
1080	NC_012578	TGA	2	6	65766	65771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080302
1081	NC_012578	CTTT	2	8	65831	65838	0 %	75 %	0 %	25 %	227080302
1082	NC_012578	TGA	2	6	65971	65976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080302
1083	NC_012578	TTG	2	6	66316	66321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080303
1084	NC_012578	TGA	2	6	66380	66385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080303
1085	NC_012578	TAA	2	6	66560	66565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080303
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1087	NC_012578	AGCG	2	8	66762	66769	25 %	0 %	50 %	25 %	227080303
1088	NC_012578	TTG	2	6	66808	66813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080303
1089	NC_012578	CCA	2	6	66884	66889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080303
1090	NC_012578	TGG	2	6	66944	66949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080303
1091	NC_012578	GCG	2	6	66965	66970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080303
1092	NC_012578	GCT	2	6	66980	66985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080303
1093	NC_012578	T	6	6	67175	67180	0 %	100 %	0 %	0 %	227080303
1094	NC_012578	AGG	2	6	67193	67198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080303
1095	NC_012578	AG	3	6	67297	67302	50 %	0 %	50 %	0 %	227080303
1096	NC_012578	GAT	2	6	67332	67337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080303
1097	NC_012578	GC	3	6	67384	67389	0 %	0 %	50 %	50 %	227080303
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1099	NC_012578	ACG	2	6	67517	67522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080303
1100	NC_012578	CGAT	2	8	67554	67561	25 %	25 %	25 %	25 %	227080303
1101	NC_012578	GCT	2	6	67576	67581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080303
1102	NC_012578	AATC	2	8	67653	67660	50 %	25 %	0 %	25 %	227080303
1103	NC_012578	CTG	2	6	67667	67672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080303
1104	NC_012578	CA	3	6	67677	67682	50 %	0 %	0 %	50 %	227080303
1105	NC_012578	GTT	2	6	67803	67808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080303
1106	NC_012578	CAA	2	6	67878	67883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080303
1107	NC_012578	GGC	2	6	67912	67917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080303
1108	NC_012578	GT	3	6	68030	68035	0 %	50 %	50 %	0 %	227080303
1109	NC_012578	CAGCG	2	10	68258	68267	20 %	0 %	40 %	40 %	227080304
1110	NC_012578	TC	3	6	68277	68282	0 %	50 %	0 %	50 %	227080304
1111	NC_012578	GT	3	6	68301	68306	0 %	50 %	50 %	0 %	227080304
1112	NC_012578	GGTAAT	2	12	68330	68341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080304
1113	NC_012578	CAG	2	6	68497	68502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080304
1114	NC_012578	CAC	2	6	68599	68604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080304
1115	NC_012578	CAG	2	6	68646	68651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080304
1116	NC_012578	CAT	2	6	68673	68678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080304
1117	NC_012578	CATG	2	8	68753	68760	25 %	25 %	25 %	25 %	227080304
1118	NC_012578	TCG	2	6	68796	68801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080304
1119	NC_012578	CCG	2	6	68841	68846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080304
1120	NC_012578	G	6	6	68874	68879	0 %	0 %	100 %	0 %	227080304
1121	NC_012578	TAG	2	6	68899	68904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080304
1122	NC_012578	AAG	2	6	68942	68947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080304
1123	NC_012578	AACA	2	8	68986	68993	75 %	0 %	0 %	25 %	227080304
1124	NC_012578	GTC	2	6	68998	69003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080304
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1376	NC_012578	ATG	2	6	82324	82329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080319
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1378	NC_012578	CGG	2	6	82371	82376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080319
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1380	NC_012578	TCA	2	6	82489	82494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080320
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1384	NC_012578	TCAG	2	8	82591	82598	25 %	25 %	25 %	25 %	227080320
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1388	NC_012578	TGA	2	6	82765	82770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080320
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1496	NC_012578	CATCA	2	10	89474	89483	40 %	20 %	0 %	40 %	227080327
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