MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 48731

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012578	TTG	3	9	339080	339088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080547
5502	NC_012578	ATAA	2	8	339156	339163	75 %	25 %	0 %	0 %	227080547
5503	NC_012578	CAG	2	6	339173	339178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080547
5504	NC_012578	CTG	2	6	339439	339444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5505	NC_012578	CTT	2	6	339502	339507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080548
5506	NC_012578	TTG	2	6	339522	339527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080548
5507	NC_012578	TG	3	6	339566	339571	0 %	50 %	50 %	0 %	227080548
5508	NC_012578	CGC	2	6	339574	339579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080548
5509	NC_012578	ATC	2	6	339594	339599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080548
5510	NC_012578	CAG	2	6	339629	339634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5511	NC_012578	CTT	2	6	339646	339651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080548
5512	NC_012578	GACC	2	8	339730	339737	25 %	0 %	25 %	50 %	227080548
5513	NC_012578	GAT	2	6	339761	339766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080548
5514	NC_012578	GTCA	2	8	339806	339813	25 %	25 %	25 %	25 %	227080548
5515	NC_012578	CCA	2	6	339868	339873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080548
5516	NC_012578	CGC	2	6	339907	339912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080548
5517	NC_012578	GAA	3	9	339917	339925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080548
5518	NC_012578	CTG	2	6	340048	340053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5519	NC_012578	CG	4	8	340143	340150	0 %	0 %	50 %	50 %	227080548
5520	NC_012578	CAG	2	6	340172	340177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5521	NC_012578	TTC	2	6	340253	340258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080548
5522	NC_012578	CAG	2	6	340325	340330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5523	NC_012578	GTT	2	6	340358	340363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080548
5524	NC_012578	GTA	2	6	340379	340384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080548
5525	NC_012578	GTG	3	9	340468	340476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080548
5526	NC_012578	T	6	6	340510	340515	0 %	100 %	0 %	0 %	227080548
5527	NC_012578	GCC	2	6	340530	340535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080548
5528	NC_012578	CTG	2	6	340543	340548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5529	NC_012578	GCA	2	6	340620	340625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080548
5530	NC_012578	CCA	2	6	340645	340650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080548
5531	NC_012578	TGT	2	6	340657	340662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080548
5532	NC_012578	CCAT	2	8	340674	340681	25 %	25 %	0 %	50 %	227080548
5533	NC_012578	GTT	2	6	340820	340825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080548
5534	NC_012578	ATT	2	6	340859	340864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080548
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5536	NC_012578	CAA	2	6	341094	341099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080549
5537	NC_012578	GTA	2	6	341180	341185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080549
5538	NC_012578	ATG	2	6	341188	341193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080549
5539	NC_012578	GTG	2	6	341197	341202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080549
5540	NC_012578	AG	3	6	341205	341210	50 %	0 %	50 %	0 %	227080549
5541	NC_012578	TGA	2	6	341321	341326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080549
5542	NC_012578	TGCG	2	8	341345	341352	0 %	25 %	50 %	25 %	227080549
5543	NC_012578	ATC	2	6	341392	341397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080549
5544	NC_012578	GCA	2	6	341410	341415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080549
5545	NC_012578	GATC	2	8	341420	341427	25 %	25 %	25 %	25 %	227080549
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5547	NC_012578	GGC	2	6	341478	341483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080549
5548	NC_012578	CA	3	6	341509	341514	50 %	0 %	0 %	50 %	227080549
5549	NC_012578	CGC	2	6	341582	341587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080549
5550	NC_012578	CTTG	2	8	341615	341622	0 %	50 %	25 %	25 %	227080549
5551	NC_012578	GCAA	2	8	341721	341728	50 %	0 %	25 %	25 %	227080549
5552	NC_012578	ACA	2	6	341768	341773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080549
5553	NC_012578	CTG	2	6	341791	341796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080549
5554	NC_012578	TGG	2	6	341831	341836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080549
5555	NC_012578	GCCA	2	8	341953	341960	25 %	0 %	25 %	50 %	227080549
5556	NC_012578	TGA	2	6	341996	342001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080549
5557	NC_012578	C	6	6	342169	342174	0 %	0 %	0 %	100 %	227080550
5558	NC_012578	AAGC	2	8	342228	342235	50 %	0 %	25 %	25 %	227080550
5559	NC_012578	ATC	2	6	342263	342268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080550
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5563	NC_012578	CTT	2	6	342579	342584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080550
5564	NC_012578	ATG	2	6	342590	342595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080550
5565	NC_012578	AAT	2	6	342622	342627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080550
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5578	NC_012578	GAG	2	6	343220	343225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080550
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5588	NC_012578	GA	3	6	344192	344197	50 %	0 %	50 %	0 %	227080551
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5592	NC_012578	CACG	2	8	344329	344336	25 %	0 %	25 %	50 %	227080551
5593	NC_012578	A	6	6	344407	344412	100 %	0 %	0 %	0 %	227080551
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5606	NC_012578	GCG	2	6	345004	345009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080552
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5610	NC_012578	GTG	2	6	345299	345304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080552
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5612	NC_012578	AG	4	8	345352	345359	50 %	0 %	50 %	0 %	227080552
5613	NC_012578	CGA	2	6	345372	345377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080552
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5616	NC_012578	T	6	6	345696	345701	0 %	100 %	0 %	0 %	227080552
5617	NC_012578	GT	3	6	345735	345740	0 %	50 %	50 %	0 %	227080552
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5987	NC_012578	TGA	2	6	369132	369137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080578
5988	NC_012578	GCT	2	6	369199	369204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080578
5989	NC_012578	TGA	2	6	369294	369299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080579
5990	NC_012578	AATCG	2	10	369302	369311	40 %	20 %	20 %	20 %	227080579
5991	NC_012578	GCG	2	6	369318	369323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080579
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5993	NC_012578	TGG	2	6	369450	369455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080579
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5995	NC_012578	TGC	2	6	369567	369572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080579
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5999	NC_012578	CGCT	2	8	369796	369803	0 %	25 %	25 %	50 %	227080580
6000	NC_012578	CGT	2	6	370022	370027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080581

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