MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	CA	3	6	2497	2502	50 %	0 %	0 %	50 %	197336538
2	NC_011185	TG	3	6	3814	3819	0 %	50 %	50 %	0 %	197336634
3	NC_011185	AG	3	6	3879	3884	50 %	0 %	50 %	0 %	197336634
4	NC_011185	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	197336485
5	NC_011185	TG	3	6	7453	7458	0 %	50 %	50 %	0 %	197336576
6	NC_011185	TA	3	6	7604	7609	50 %	50 %	0 %	0 %	197336517
7	NC_011185	AG	3	6	7794	7799	50 %	0 %	50 %	0 %	197336517
8	NC_011185	AT	3	6	7984	7989	50 %	50 %	0 %	0 %	197336517
9	NC_011185	CT	3	6	8094	8099	0 %	50 %	0 %	50 %	197336517
10	NC_011185	AG	3	6	9440	9445	50 %	0 %	50 %	0 %	197336573
11	NC_011185	CT	3	6	10599	10604	0 %	50 %	0 %	50 %	197336664
12	NC_011185	TG	3	6	10839	10844	0 %	50 %	50 %	0 %	197336664
13	NC_011185	CT	3	6	11130	11135	0 %	50 %	0 %	50 %	197336569
14	NC_011185	TG	3	6	12820	12825	0 %	50 %	50 %	0 %	197336569
15	NC_011185	TA	3	6	13480	13485	50 %	50 %	0 %	0 %	197336490
16	NC_011185	AG	3	6	13523	13528	50 %	0 %	50 %	0 %	197336490
17	NC_011185	CT	3	6	15411	15416	0 %	50 %	0 %	50 %	197336574
18	NC_011185	TA	4	8	18289	18296	50 %	50 %	0 %	0 %	197336596
19	NC_011185	AT	3	6	18371	18376	50 %	50 %	0 %	0 %	197336596
20	NC_011185	TG	3	6	18380	18385	0 %	50 %	50 %	0 %	197336596
21	NC_011185	AT	3	6	18760	18765	50 %	50 %	0 %	0 %	197336499
22	NC_011185	GA	3	6	19602	19607	50 %	0 %	50 %	0 %	197336509
23	NC_011185	CT	3	6	20576	20581	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
24	NC_011185	CT	3	6	21293	21298	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
25	NC_011185	GT	3	6	21459	21464	0 %	50 %	50 %	0 %	197336637
26	NC_011185	CT	3	6	21492	21497	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
27	NC_011185	GA	3	6	21815	21820	50 %	0 %	50 %	0 %	197336637
28	NC_011185	AC	3	6	22123	22128	50 %	0 %	0 %	50 %	197336637
29	NC_011185	AC	4	8	22286	22293	50 %	0 %	0 %	50 %	197336637
30	NC_011185	TC	4	8	22754	22761	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
31	NC_011185	GT	3	6	23304	23309	0 %	50 %	50 %	0 %	197336637
32	NC_011185	AT	3	6	23539	23544	50 %	50 %	0 %	0 %	197336637
33	NC_011185	AT	3	6	25291	25296	50 %	50 %	0 %	0 %	197336513
34	NC_011185	GT	3	6	25633	25638	0 %	50 %	50 %	0 %	197336513
35	NC_011185	TC	3	6	25842	25847	0 %	50 %	0 %	50 %	197336539
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37	NC_011185	TA	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	197336518
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39	NC_011185	AT	3	6	28578	28583	50 %	50 %	0 %	0 %	197336656
40	NC_011185	AT	3	6	29677	29682	50 %	50 %	0 %	0 %	197336554
41	NC_011185	TA	3	6	30484	30489	50 %	50 %	0 %	0 %	197336487
42	NC_011185	AG	3	6	31222	31227	50 %	0 %	50 %	0 %	197336487
43	NC_011185	AT	3	6	32071	32076	50 %	50 %	0 %	0 %	197336541
44	NC_011185	TA	3	6	32730	32735	50 %	50 %	0 %	0 %	197336484
45	NC_011185	CT	3	6	32759	32764	0 %	50 %	0 %	50 %	197336484
46	NC_011185	AT	3	6	34473	34478	50 %	50 %	0 %	0 %	197336616
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48	NC_011185	AT	3	6	36255	36260	50 %	50 %	0 %	0 %	197336523
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52	NC_011185	AT	3	6	39754	39759	50 %	50 %	0 %	0 %	197336606
53	NC_011185	AT	3	6	40726	40731	50 %	50 %	0 %	0 %	197336606
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70	NC_011185	TA	3	6	53093	53098	50 %	50 %	0 %	0 %	197336591
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72	NC_011185	TA	3	6	53609	53614	50 %	50 %	0 %	0 %	197336591
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113	NC_011185	AT	3	6	87411	87416	50 %	50 %	0 %	0 %	197336494
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.