MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	AATTA	2	10	2949	2958	60 %	40 %	0 %	0 %	197336538
2	NC_011185	TAATA	2	10	3549	3558	60 %	40 %	0 %	0 %	197336538
3	NC_011185	GAATA	2	10	4856	4865	60 %	20 %	20 %	0 %	197336485
4	NC_011185	TTTTG	2	10	5320	5329	0 %	80 %	20 %	0 %	197336485
5	NC_011185	AAGCA	2	10	10921	10930	60 %	0 %	20 %	20 %	197336664
6	NC_011185	AATGT	2	10	10957	10966	40 %	40 %	20 %	0 %	197336664
7	NC_011185	ATTTA	2	10	11474	11483	40 %	60 %	0 %	0 %	197336569
8	NC_011185	TCATT	2	10	12310	12319	20 %	60 %	0 %	20 %	197336569
9	NC_011185	TGCAT	2	10	12720	12729	20 %	40 %	20 %	20 %	197336569
10	NC_011185	GTGTT	2	10	17361	17370	0 %	60 %	40 %	0 %	197336643
11	NC_011185	TGATT	2	10	19978	19987	20 %	60 %	20 %	0 %	197336509
12	NC_011185	GCCAT	2	10	20093	20102	20 %	20 %	20 %	40 %	197336509
13	NC_011185	ATCAA	2	10	20850	20859	60 %	20 %	0 %	20 %	197336637
14	NC_011185	TTAAT	2	10	20878	20887	40 %	60 %	0 %	0 %	197336637
15	NC_011185	ATTTG	2	10	22778	22787	20 %	60 %	20 %	0 %	197336637
16	NC_011185	TTAAC	2	10	22810	22819	40 %	40 %	0 %	20 %	197336637
17	NC_011185	CTTAT	2	10	23707	23716	20 %	60 %	0 %	20 %	197336637
18	NC_011185	TATAT	2	10	24425	24434	40 %	60 %	0 %	0 %	197336600
19	NC_011185	ATAGA	2	10	25011	25020	60 %	20 %	20 %	0 %	197336513
20	NC_011185	TTTAA	2	10	26131	26140	40 %	60 %	0 %	0 %	197336539
21	NC_011185	AAATG	2	10	27003	27012	60 %	20 %	20 %	0 %	197336518
22	NC_011185	ATTGG	2	10	27588	27597	20 %	40 %	40 %	0 %	197336501
23	NC_011185	GAGTT	2	10	27939	27948	20 %	40 %	40 %	0 %	197336505
24	NC_011185	ATTTT	2	10	32048	32057	20 %	80 %	0 %	0 %	197336541
25	NC_011185	TAAAA	3	15	33338	33352	80 %	20 %	0 %	0 %	197336563
26	NC_011185	TATTG	2	10	34291	34300	20 %	60 %	20 %	0 %	197336616
27	NC_011185	AGCAA	2	10	34588	34597	60 %	0 %	20 %	20 %	197336616
28	NC_011185	AATGC	2	10	35733	35742	40 %	20 %	20 %	20 %	197336571
29	NC_011185	CTTGA	2	10	36190	36199	20 %	40 %	20 %	20 %	197336523
30	NC_011185	TCACT	2	10	36730	36739	20 %	40 %	0 %	40 %	197336628
31	NC_011185	GAAGT	2	10	37374	37383	40 %	20 %	40 %	0 %	197336621
32	NC_011185	AAGTT	2	10	37935	37944	40 %	40 %	20 %	0 %	197336577
33	NC_011185	ATAAA	2	10	38937	38946	80 %	20 %	0 %	0 %	197336474
34	NC_011185	CAATA	2	10	40397	40406	60 %	20 %	0 %	20 %	197336606
35	NC_011185	TAAAA	2	10	43614	43623	80 %	20 %	0 %	0 %	197336632
36	NC_011185	TTTTG	2	10	43754	43763	0 %	80 %	20 %	0 %	197336632
37	NC_011185	GGAAC	2	10	45668	45677	40 %	0 %	40 %	20 %	197336572
38	NC_011185	AATCA	2	10	47400	47409	60 %	20 %	0 %	20 %	197336491
39	NC_011185	GAAAA	2	10	51109	51118	80 %	0 %	20 %	0 %	197336542
40	NC_011185	CTTAT	2	10	51846	51855	20 %	60 %	0 %	20 %	197336591
41	NC_011185	CATCA	2	10	54356	54365	40 %	20 %	0 %	40 %	197336591
42	NC_011185	TTTTG	2	10	56870	56879	0 %	80 %	20 %	0 %	197336547
43	NC_011185	TATGA	2	10	58489	58498	40 %	40 %	20 %	0 %	197336661
44	NC_011185	CAAAT	2	10	58976	58985	60 %	20 %	0 %	20 %	197336579
45	NC_011185	AGACA	2	10	62033	62042	60 %	0 %	20 %	20 %	197336649
46	NC_011185	ATTTT	2	10	62333	62342	20 %	80 %	0 %	0 %	197336557
47	NC_011185	CGAGT	2	10	63490	63499	20 %	20 %	40 %	20 %	197336659
48	NC_011185	AAGAT	2	10	65347	65356	60 %	20 %	20 %	0 %	197336476
49	NC_011185	ATGCA	2	10	69232	69241	40 %	20 %	20 %	20 %	197336560
50	NC_011185	AAAAC	2	10	69257	69266	80 %	0 %	0 %	20 %	197336560
51	NC_011185	ACAAA	2	10	69943	69952	80 %	0 %	0 %	20 %	197336578
52	NC_011185	AAACA	2	10	70297	70306	80 %	0 %	0 %	20 %	197336483
53	NC_011185	GGTTT	2	10	70760	70769	0 %	60 %	40 %	0 %	197336544
54	NC_011185	TCGTA	2	10	73965	73974	20 %	40 %	20 %	20 %	197336651
55	NC_011185	TTATT	2	10	74640	74649	20 %	80 %	0 %	0 %	197336504
56	NC_011185	AAGCA	2	10	74728	74737	60 %	0 %	20 %	20 %	197336504
57	NC_011185	AGGGT	2	10	76176	76185	20 %	20 %	60 %	0 %	197336522
58	NC_011185	TTACA	2	10	76261	76270	40 %	40 %	0 %	20 %	197336522
59	NC_011185	GATTT	2	10	77376	77385	20 %	60 %	20 %	0 %	197336522
60	NC_011185	AAAAT	2	10	77874	77883	80 %	20 %	0 %	0 %	197336522
61	NC_011185	TATTG	2	10	78644	78653	20 %	60 %	20 %	0 %	197336641
62	NC_011185	TTTAT	2	10	83653	83662	20 %	80 %	0 %	0 %	197336665
63	NC_011185	AGCTA	2	10	83954	83963	40 %	20 %	20 %	20 %	197336665
64	NC_011185	CTTTG	2	10	85550	85559	0 %	60 %	20 %	20 %	197336532
65	NC_011185	CGTTT	2	10	86074	86083	0 %	60 %	20 %	20 %	197336568
66	NC_011185	GAATT	2	10	86426	86435	40 %	40 %	20 %	0 %	197336568
67	NC_011185	GTTGT	2	10	86588	86597	0 %	60 %	40 %	0 %	197336568
68	NC_011185	TCACT	2	10	87932	87941	20 %	40 %	0 %	40 %	197336598
69	NC_011185	TCAAG	2	10	88725	88734	40 %	20 %	20 %	20 %	197336496
70	NC_011185	GTCCT	2	10	89980	89989	0 %	40 %	20 %	40 %	197336653
71	NC_011185	CTGTT	2	10	90052	90061	0 %	60 %	20 %	20 %	197336653
72	NC_011185	TTATT	2	10	90349	90358	20 %	80 %	0 %	0 %	197336653
73	NC_011185	TACAT	2	10	90389	90398	40 %	40 %	0 %	20 %	197336653
74	NC_011185	TATTG	2	10	91175	91184	20 %	60 %	20 %	0 %	197336567
75	NC_011185	CAAAA	2	10	96002	96011	80 %	0 %	0 %	20 %	197336558
76	NC_011185	TGTTC	2	10	98861	98870	0 %	60 %	20 %	20 %	197336642
77	NC_011185	TTTAA	2	10	102226	102235	40 %	60 %	0 %	0 %	197336611
78	NC_011185	ATTGA	2	10	102752	102761	40 %	40 %	20 %	0 %	197336530
79	NC_011185	TTGAA	2	10	103082	103091	40 %	40 %	20 %	0 %	197336530
80	NC_011185	GTTTT	2	10	104597	104606	0 %	80 %	20 %	0 %	197336612
81	NC_011185	TTACT	2	10	104869	104878	20 %	60 %	0 %	20 %	197336529
82	NC_011185	TTTTC	2	10	105103	105112	0 %	80 %	0 %	20 %	197336529
83	NC_011185	TCCAT	2	10	106324	106333	20 %	40 %	0 %	40 %	197336529
84	NC_011185	TTGAA	2	10	107088	107097	40 %	40 %	20 %	0 %	197336519
85	NC_011185	TAATT	2	10	107116	107125	40 %	60 %	0 %	0 %	197336519
86	NC_011185	TTGAT	2	10	108560	108569	20 %	60 %	20 %	0 %	197336599
87	NC_011185	CAAGC	2	10	109413	109422	40 %	0 %	20 %	40 %	197336623
88	NC_011185	TGGGG	2	10	111195	111204	0 %	20 %	80 %	0 %	197336652
89	NC_011185	AATGT	2	10	112116	112125	40 %	40 %	20 %	0 %	197336521
90	NC_011185	TGAAA	2	10	113594	113603	60 %	20 %	20 %	0 %	197336601
91	NC_011185	ATTTG	2	10	116147	116156	20 %	60 %	20 %	0 %	197336601
92	NC_011185	CCTTT	2	10	116602	116611	0 %	60 %	0 %	40 %	197336536
93	NC_011185	ATTAA	2	10	117478	117487	60 %	40 %	0 %	0 %	197336536
94	NC_011185	TGTAA	2	10	117681	117690	40 %	40 %	20 %	0 %	197336536
95	NC_011185	CCAAC	2	10	118305	118314	40 %	0 %	0 %	60 %	197336512
96	NC_011185	GTTCT	2	10	118640	118649	0 %	60 %	20 %	20 %	197336595
97	NC_011185	CAATA	2	10	119435	119444	60 %	20 %	0 %	20 %	197336500
98	NC_011185	TTTCT	2	10	121544	121553	0 %	80 %	0 %	20 %	197336663
99	NC_011185	GCTTT	2	10	122331	122340	0 %	60 %	20 %	20 %	197336556
100	NC_011185	TTTGT	2	10	122654	122663	0 %	80 %	20 %	0 %	197336556
101	NC_011185	CTTTT	2	10	122819	122828	0 %	80 %	0 %	20 %	197336556
102	NC_011185	ATTCA	2	10	123407	123416	40 %	40 %	0 %	20 %	197336655
103	NC_011185	TTTCT	2	10	123889	123898	0 %	80 %	0 %	20 %	197336655
104	NC_011185	AAAAG	2	10	124312	124321	80 %	0 %	20 %	0 %	197336562
105	NC_011185	AAGAT	2	10	124494	124503	60 %	20 %	20 %	0 %	197336562
106	NC_011185	TGAAA	2	10	125443	125452	60 %	20 %	20 %	0 %	197336583
107	NC_011185	TGTAT	2	10	127942	127951	20 %	60 %	20 %	0 %	197336511
108	NC_011185	TATTT	2	10	127994	128003	20 %	80 %	0 %	0 %	197336511
109	NC_011185	GTCAT	2	10	129930	129939	20 %	40 %	20 %	20 %	197336511
110	NC_011185	ATCAG	2	10	132179	132188	40 %	20 %	20 %	20 %	197336528
111	NC_011185	AAATG	2	10	132254	132263	60 %	20 %	20 %	0 %	197336528
112	NC_011185	AATGA	2	10	134061	134070	60 %	20 %	20 %	0 %	197336488
113	NC_011185	AAATT	2	10	137750	137759	60 %	40 %	0 %	0 %	197336593
114	NC_011185	ATTAT	2	10	138038	138047	40 %	60 %	0 %	0 %	197336593
115	NC_011185	TGGTG	2	10	138415	138424	0 %	40 %	60 %	0 %	197336613
116	NC_011185	GAGCA	2	10	138764	138773	40 %	0 %	40 %	20 %	197336613
117	NC_011185	AGAAC	2	10	139358	139367	60 %	0 %	20 %	20 %	197336604
118	NC_011185	TTTTA	2	10	141212	141221	20 %	80 %	0 %	0 %	197336582
119	NC_011185	ACTCA	2	10	142112	142121	40 %	20 %	0 %	40 %	197336502
120	NC_011185	AAAGA	2	10	142619	142628	80 %	0 %	20 %	0 %	197336553
121	NC_011185	AACAT	2	10	149290	149299	60 %	20 %	0 %	20 %	197336510
122	NC_011185	AAATG	2	10	149927	149936	60 %	20 %	20 %	0 %	197336510
123	NC_011185	CTTAT	2	10	151931	151940	20 %	60 %	0 %	20 %	197336561
124	NC_011185	CCTTT	2	10	153423	153432	0 %	60 %	0 %	40 %	197336603
125	NC_011185	GATCC	2	10	154504	154513	20 %	20 %	20 %	40 %	197336631
126	NC_011185	TCCTA	2	10	154744	154753	20 %	40 %	0 %	40 %	197336631
127	NC_011185	ATCTC	2	10	159316	159325	20 %	40 %	0 %	40 %	197336633
128	NC_011185	ATCTC	2	10	162656	162665	20 %	40 %	0 %	40 %	197336644
129	NC_011185	TTGAT	2	10	167276	167285	20 %	60 %	20 %	0 %	197336608
130	NC_011185	TGGCT	2	10	168116	168125	0 %	40 %	40 %	20 %	197336602
131	NC_011185	TGTTT	2	10	176105	176114	0 %	80 %	20 %	0 %	197336531
132	NC_011185	CCCTG	2	10	178328	178337	0 %	20 %	20 %	60 %	197336589

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.