MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 54218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011184	TTC	3	9	53672	53680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334031
1002	NC_011184	TCA	2	6	53723	53728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334101
1003	NC_011184	GTT	2	6	53746	53751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334101
1004	NC_011184	GTTTG	2	10	53825	53834	0 %	60 %	40 %	0 %	197334101
1005	NC_011184	TGG	2	6	53949	53954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334101
1006	NC_011184	TCA	2	6	54039	54044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334101
1007	NC_011184	CAT	2	6	54244	54249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334101
1008	NC_011184	ATT	2	6	54308	54313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334101
1009	NC_011184	TGT	2	6	54325	54330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334101
1010	NC_011184	ATG	2	6	54335	54340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334101
1011	NC_011184	ACC	2	6	54346	54351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334101
1012	NC_011184	ATT	2	6	54356	54361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197334101
1013	NC_011184	TTTG	2	8	54394	54401	0 %	75 %	25 %	0 %	197334101
1014	NC_011184	GA	3	6	54433	54438	50 %	0 %	50 %	0 %	197334101
1015	NC_011184	TAA	2	6	54439	54444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334101
1016	NC_011184	GAT	2	6	54449	54454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334101
1017	NC_011184	CGT	2	6	55873	55878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334168
1018	NC_011184	AACT	2	8	55933	55940	50 %	25 %	0 %	25 %	197334168
1019	NC_011184	GGCT	2	8	55948	55955	0 %	25 %	50 %	25 %	197334168
1020	NC_011184	AAT	2	6	56016	56021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334168
1021	NC_011184	AAT	2	6	56038	56043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334168
1022	NC_011184	CCA	2	6	56054	56059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334168
1023	NC_011184	CCA	2	6	56078	56083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334168
1024	NC_011184	TCA	2	6	56123	56128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334168
1025	NC_011184	CCA	2	6	56135	56140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334168
1026	NC_011184	TTC	2	6	56200	56205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334168
1027	NC_011184	TAA	2	6	56268	56273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334168
1028	NC_011184	ATGA	3	12	56364	56375	50 %	25 %	25 %	0 %	197334168
1029	NC_011184	TTTC	2	8	56385	56392	0 %	75 %	0 %	25 %	197334168
1030	NC_011184	CAT	2	6	56425	56430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334168
1031	NC_011184	GC	3	6	56534	56539	0 %	0 %	50 %	50 %	197334168
1032	NC_011184	AAC	2	6	56542	56547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334168
1033	NC_011184	TCA	2	6	56561	56566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334168
1034	NC_011184	TATC	2	8	56595	56602	25 %	50 %	0 %	25 %	197334168
1035	NC_011184	GT	3	6	56754	56759	0 %	50 %	50 %	0 %	197334052
1036	NC_011184	CCG	2	6	56788	56793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334052
1037	NC_011184	GCC	2	6	56823	56828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334052
1038	NC_011184	TGATT	2	10	56860	56869	20 %	60 %	20 %	0 %	197334052
1039	NC_011184	TGTT	2	8	56877	56884	0 %	75 %	25 %	0 %	197334052
1040	NC_011184	TCG	2	6	56899	56904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334052
1041	NC_011184	TATC	2	8	56940	56947	25 %	50 %	0 %	25 %	197334052
1042	NC_011184	GAA	2	6	56960	56965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334052
1043	NC_011184	TGC	2	6	57043	57048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334052
1044	NC_011184	CAT	2	6	57172	57177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334052
1045	NC_011184	AATG	2	8	57196	57203	50 %	25 %	25 %	0 %	197334052
1046	NC_011184	AAC	2	6	57208	57213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334052
1047	NC_011184	TGG	2	6	57264	57269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334052
1048	NC_011184	ATG	2	6	57281	57286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334052
1049	NC_011184	TAC	2	6	57380	57385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334052
1050	NC_011184	TAA	2	6	57433	57438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334052
1051	NC_011184	TGA	2	6	57469	57474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334052
1052	NC_011184	ATGGTG	2	12	57518	57529	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197334052
1053	NC_011184	TCGT	2	8	57555	57562	0 %	50 %	25 %	25 %	197334052
1054	NC_011184	TGGT	2	8	57646	57653	0 %	50 %	50 %	0 %	197334052
1055	NC_011184	TGAG	2	8	57654	57661	25 %	25 %	50 %	0 %	197334052
1056	NC_011184	GTGCTG	2	12	57699	57710	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	197334052
1057	NC_011184	ACTT	2	8	57722	57729	25 %	50 %	0 %	25 %	197334052
1058	NC_011184	AAG	2	6	57764	57769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334052
1059	NC_011184	CCAA	2	8	58063	58070	50 %	0 %	0 %	50 %	197334158
1060	NC_011184	CGC	2	6	58123	58128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334158
1061	NC_011184	CAT	2	6	58161	58166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334158
1062	NC_011184	T	7	7	58166	58172	0 %	100 %	0 %	0 %	197334158
1063	NC_011184	CAG	2	6	58185	58190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1064	NC_011184	ACG	2	6	58207	58212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1065	NC_011184	TGAG	2	8	58214	58221	25 %	25 %	50 %	0 %	197334158
1066	NC_011184	AAT	2	6	58222	58227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334158
1067	NC_011184	ACG	2	6	58315	58320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1068	NC_011184	TAG	2	6	58321	58326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334158
1069	NC_011184	AAGT	2	8	58333	58340	50 %	25 %	25 %	0 %	197334158
1070	NC_011184	TTAA	2	8	58379	58386	50 %	50 %	0 %	0 %	197334158
1071	NC_011184	CAC	2	6	58401	58406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334158
1072	NC_011184	T	6	6	58408	58413	0 %	100 %	0 %	0 %	197334158
1073	NC_011184	GCAATG	2	12	58461	58472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197334158
1074	NC_011184	TGC	2	6	58505	58510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1075	NC_011184	CTG	2	6	58537	58542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1076	NC_011184	GTT	2	6	58569	58574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334158
1077	NC_011184	CAC	2	6	58656	58661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334158
1078	NC_011184	AAT	2	6	58688	58693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334158
1079	NC_011184	GGAT	2	8	58710	58717	25 %	25 %	50 %	0 %	197334158
1080	NC_011184	ATTGC	2	10	58788	58797	20 %	40 %	20 %	20 %	197334158
1081	NC_011184	GTACC	2	10	58878	58887	20 %	20 %	20 %	40 %	197334158
1082	NC_011184	CTG	2	6	58927	58932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1083	NC_011184	GTGCTT	2	12	59055	59066	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	197334158
1084	NC_011184	CCG	2	6	59102	59107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334158
1085	NC_011184	CAA	2	6	59112	59117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334158
1086	NC_011184	ACG	2	6	59122	59127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334158
1087	NC_011184	ACC	2	6	59134	59139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334158
1088	NC_011184	CTT	3	9	59175	59183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334158
1089	NC_011184	TGT	2	6	59202	59207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334158
1090	NC_011184	AAG	2	6	59234	59239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334158
1091	NC_011184	CCCA	2	8	59340	59347	25 %	0 %	0 %	75 %	197334158
1092	NC_011184	GT	3	6	59370	59375	0 %	50 %	50 %	0 %	197334158
1093	NC_011184	CAA	2	6	59457	59462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334158
1094	NC_011184	GGC	2	6	59494	59499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197334158
1095	NC_011184	GGT	2	6	59507	59512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197334158
1096	NC_011184	TTG	2	6	59514	59519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334158
1097	NC_011184	GCC	2	6	59611	59616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	197334079
1098	NC_011184	TTG	2	6	59630	59635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334079
1099	NC_011184	ACG	2	6	59638	59643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334079
1100	NC_011184	TGC	2	6	59648	59653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334079
1101	NC_011184	GAC	2	6	59655	59660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334079
1102	NC_011184	TCT	2	6	59687	59692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334079
1103	NC_011184	AAT	2	6	59693	59698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334079
1104	NC_011184	TTC	2	6	59773	59778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334079
1105	NC_011184	GT	3	6	59881	59886	0 %	50 %	50 %	0 %	197334079
1106	NC_011184	AGC	2	6	59911	59916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334079
1107	NC_011184	TTC	2	6	59959	59964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334079
1108	NC_011184	T	6	6	59980	59985	0 %	100 %	0 %	0 %	197334079
1109	NC_011184	AAG	2	6	60004	60009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334079
1110	NC_011184	TTC	3	9	60100	60108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334079
1111	NC_011184	TTC	2	6	60160	60165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197334079
1112	NC_011184	T	6	6	60183	60188	0 %	100 %	0 %	0 %	197334079
1113	NC_011184	CAA	3	9	60198	60206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334079
1114	NC_011184	AAGC	2	8	60234	60241	50 %	0 %	25 %	25 %	197334079
1115	NC_011184	ACG	2	6	60307	60312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197334079
1116	NC_011184	TAA	2	6	60333	60338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197334079
1117	NC_011184	TCA	2	6	60365	60370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334079
1118	NC_011184	AAC	2	6	60373	60378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334079
1119	NC_011184	CTTG	2	8	60408	60415	0 %	50 %	25 %	25 %	197334079
1120	NC_011184	TTG	2	6	60475	60480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334079
1121	NC_011184	CAC	2	6	60498	60503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197334079
1122	NC_011184	CAT	2	6	60552	60557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334079
1123	NC_011184	TG	3	6	60611	60616	0 %	50 %	50 %	0 %	197334079
1124	NC_011184	GCCTG	2	10	60704	60713	0 %	20 %	40 %	40 %	197334079
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1126	NC_011184	TAG	2	6	61047	61052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334006
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