MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 1802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	GGCAA	2	10	1637	1646	40 %	0 %	40 %	20 %	147675529
2	NC_009457	GTTGA	2	10	6757	6766	20 %	40 %	40 %	0 %	147673975
3	NC_009457	TGGCT	2	10	6949	6958	0 %	40 %	40 %	20 %	147674564
4	NC_009457	CGCTT	2	10	8209	8218	0 %	40 %	20 %	40 %	147673294
5	NC_009457	GCAAG	2	10	10643	10652	40 %	0 %	40 %	20 %	147675116
6	NC_009457	AGCCA	2	10	12237	12246	40 %	0 %	20 %	40 %	147675703
7	NC_009457	TGGCA	2	10	14954	14963	20 %	20 %	40 %	20 %	147674877
8	NC_009457	ATTCC	2	10	17136	17145	20 %	40 %	0 %	40 %	147675504
9	NC_009457	AACGA	2	10	17540	17549	60 %	0 %	20 %	20 %	147675504
10	NC_009457	AACGT	2	10	18598	18607	40 %	20 %	20 %	20 %	147673542
11	NC_009457	GGTTG	2	10	18760	18769	0 %	40 %	60 %	0 %	147673542
12	NC_009457	CACTT	2	10	20249	20258	20 %	40 %	0 %	40 %	147675757
13	NC_009457	TTGGG	2	10	20639	20648	0 %	40 %	60 %	0 %	147675757
14	NC_009457	CATCG	2	10	20872	20881	20 %	20 %	20 %	40 %	147675757
15	NC_009457	CGCAG	2	10	21395	21404	20 %	0 %	40 %	40 %	147675757
16	NC_009457	TACGA	2	10	25175	25184	40 %	20 %	20 %	20 %	229259769
17	NC_009457	TGAAC	2	10	26501	26510	40 %	20 %	20 %	20 %	147673541
18	NC_009457	GAAAA	2	10	26556	26565	80 %	0 %	20 %	0 %	147673541
19	NC_009457	CAAAA	2	10	27597	27606	80 %	0 %	0 %	20 %	147674645
20	NC_009457	TCTGA	2	10	28571	28580	20 %	40 %	20 %	20 %	147674645
21	NC_009457	TCACG	2	10	29448	29457	20 %	20 %	20 %	40 %	147673216
22	NC_009457	ATTCC	2	10	29715	29724	20 %	40 %	0 %	40 %	147673216
23	NC_009457	ACTTC	2	10	33834	33843	20 %	40 %	0 %	40 %	147674848
24	NC_009457	CGAAA	2	10	34695	34704	60 %	0 %	20 %	20 %	147674087
25	NC_009457	AGGTG	2	10	34750	34759	20 %	20 %	60 %	0 %	147674087
26	NC_009457	TGAAT	2	10	34897	34906	40 %	40 %	20 %	0 %	147674087
27	NC_009457	AGCTG	2	10	35349	35358	20 %	20 %	40 %	20 %	147674087
28	NC_009457	AGTGG	2	10	35916	35925	20 %	20 %	60 %	0 %	147675377
29	NC_009457	TGCAT	2	10	36834	36843	20 %	40 %	20 %	20 %	147675377
30	NC_009457	CATGC	2	10	37779	37788	20 %	20 %	20 %	40 %	147675633
31	NC_009457	ATTTT	2	10	38688	38697	20 %	80 %	0 %	0 %	147675186
32	NC_009457	TCGAG	2	10	44877	44886	20 %	20 %	40 %	20 %	147674914
33	NC_009457	GGATT	2	10	46467	46476	20 %	40 %	40 %	0 %	147675246
34	NC_009457	TGGTG	2	10	51431	51440	0 %	40 %	60 %	0 %	147673316
35	NC_009457	TGATC	2	10	54711	54720	20 %	40 %	20 %	20 %	147673872
36	NC_009457	GGCTT	2	10	56754	56763	0 %	40 %	40 %	20 %	147675773
37	NC_009457	CATGG	2	10	58069	58078	20 %	20 %	40 %	20 %	147675773
38	NC_009457	ATTGA	2	10	59929	59938	40 %	40 %	20 %	0 %	147673090
39	NC_009457	TACCT	2	10	59944	59953	20 %	40 %	0 %	40 %	147673090
40	NC_009457	TCAGC	2	10	60024	60033	20 %	20 %	20 %	40 %	147673090
41	NC_009457	GTTTG	2	10	62067	62076	0 %	60 %	40 %	0 %	147674327
42	NC_009457	CAACC	2	10	63999	64008	40 %	0 %	0 %	60 %	147674663
43	NC_009457	TAGTG	2	10	79278	79287	20 %	40 %	40 %	0 %	147673676
44	NC_009457	AGATG	2	10	82320	82329	40 %	20 %	40 %	0 %	147675148
45	NC_009457	CTCAA	2	10	82347	82356	40 %	20 %	0 %	40 %	147675148
46	NC_009457	ATTTG	2	10	82596	82605	20 %	60 %	20 %	0 %	147674316
47	NC_009457	CTTAA	2	10	83074	83083	40 %	40 %	0 %	20 %	147673693
48	NC_009457	TGTGC	2	10	83163	83172	0 %	40 %	40 %	20 %	147673693
49	NC_009457	TTCAC	2	10	90997	91006	20 %	40 %	0 %	40 %	147673156
50	NC_009457	GATGG	2	10	91048	91057	20 %	20 %	60 %	0 %	147673156
51	NC_009457	GCTAG	2	10	91669	91678	20 %	20 %	40 %	20 %	147673156
52	NC_009457	CGATG	2	10	92944	92953	20 %	20 %	40 %	20 %	147674809
53	NC_009457	CTTTG	2	10	96148	96157	0 %	60 %	20 %	20 %	147674128
54	NC_009457	TCGAT	2	10	96339	96348	20 %	40 %	20 %	20 %	147674128
55	NC_009457	AGTTG	2	10	97806	97815	20 %	40 %	40 %	0 %	147675668
56	NC_009457	TATCG	2	10	98005	98014	20 %	40 %	20 %	20 %	147675668
57	NC_009457	TGATG	2	10	102253	102262	20 %	40 %	40 %	0 %	147674614
58	NC_009457	TTTGC	2	10	102457	102466	0 %	60 %	20 %	20 %	147673119
59	NC_009457	AAAGC	2	10	102713	102722	60 %	0 %	20 %	20 %	147673119
60	NC_009457	CACTC	2	10	103605	103614	20 %	20 %	0 %	60 %	147673716
61	NC_009457	CACTG	2	10	104931	104940	20 %	20 %	20 %	40 %	147673800
62	NC_009457	CAGCA	2	10	107064	107073	40 %	0 %	20 %	40 %	147673337
63	NC_009457	TTGGC	2	10	107137	107146	0 %	40 %	40 %	20 %	147673337
64	NC_009457	GTTCA	2	10	111876	111885	20 %	40 %	20 %	20 %	147673822
65	NC_009457	GACTC	2	10	112667	112676	20 %	20 %	20 %	40 %	147673822
66	NC_009457	TGAGT	2	10	115750	115759	20 %	40 %	40 %	0 %	147675683
67	NC_009457	CTGCG	2	10	117518	117527	0 %	20 %	40 %	40 %	147673788
68	NC_009457	CGCTG	2	10	119026	119035	0 %	20 %	40 %	40 %	147673788
69	NC_009457	TCGAT	2	10	119707	119716	20 %	40 %	20 %	20 %	147674464
70	NC_009457	CGACA	2	10	123836	123845	40 %	0 %	20 %	40 %	147675227
71	NC_009457	GTCTG	2	10	124247	124256	0 %	40 %	40 %	20 %	147675227
72	NC_009457	TCTGG	2	10	126209	126218	0 %	40 %	40 %	20 %	147673282
73	NC_009457	GGACG	2	10	127606	127615	20 %	0 %	60 %	20 %	147673206
74	NC_009457	ATCGA	2	10	132247	132256	40 %	20 %	20 %	20 %	147674017
75	NC_009457	GATGC	2	10	132753	132762	20 %	20 %	40 %	20 %	147674471
76	NC_009457	ACCAC	2	10	136547	136556	40 %	0 %	0 %	60 %	147673254
77	NC_009457	CGCGG	2	10	138457	138466	0 %	0 %	60 %	40 %	147674312
78	NC_009457	AATTC	2	10	139553	139562	40 %	40 %	0 %	20 %	147674312
79	NC_009457	AACGC	2	10	140318	140327	40 %	0 %	20 %	40 %	147673675
80	NC_009457	GTTTT	2	10	143454	143463	0 %	80 %	20 %	0 %	147675188
81	NC_009457	ACCGA	2	10	144583	144592	40 %	0 %	20 %	40 %	147673375
82	NC_009457	ACAGT	2	10	145423	145432	40 %	20 %	20 %	20 %	147674805
83	NC_009457	TTTCA	2	10	147897	147906	20 %	60 %	0 %	20 %	147675513
84	NC_009457	GTGAG	2	10	149891	149900	20 %	20 %	60 %	0 %	147675649
85	NC_009457	TTGCT	2	10	150269	150278	0 %	60 %	20 %	20 %	147675649
86	NC_009457	CATGC	2	10	150976	150985	20 %	20 %	20 %	40 %	147675649
87	NC_009457	ATGTG	2	10	151003	151012	20 %	40 %	40 %	0 %	147675649
88	NC_009457	GCCAA	2	10	151699	151708	40 %	0 %	20 %	40 %	147675649
89	NC_009457	GAATG	2	10	152810	152819	40 %	20 %	40 %	0 %	147673438
90	NC_009457	TTACC	2	10	153027	153036	20 %	40 %	0 %	40 %	147673438
91	NC_009457	ATCAG	2	10	153401	153410	40 %	20 %	20 %	20 %	147673438
92	NC_009457	CACAA	2	10	154585	154594	60 %	0 %	0 %	40 %	147673733
93	NC_009457	AGTTG	2	10	157914	157923	20 %	40 %	40 %	0 %	147674168
94	NC_009457	ACTCA	2	10	158149	158158	40 %	20 %	0 %	40 %	147674168
95	NC_009457	CAACA	2	10	167973	167982	60 %	0 %	0 %	40 %	147673609
96	NC_009457	AGATC	2	10	174893	174902	40 %	20 %	20 %	20 %	147674353
97	NC_009457	TTGGT	2	10	176078	176087	0 %	60 %	40 %	0 %	147674353
98	NC_009457	AAGCG	2	10	176599	176608	40 %	0 %	40 %	20 %	147675225
99	NC_009457	AACTG	2	10	177680	177689	40 %	20 %	20 %	20 %	147675225
100	NC_009457	GCTGA	2	10	178206	178215	20 %	20 %	40 %	20 %	147675225
101	NC_009457	GCTCT	2	10	182050	182059	0 %	40 %	20 %	40 %	147674727
102	NC_009457	ACTGC	2	10	182541	182550	20 %	20 %	20 %	40 %	147674727
103	NC_009457	GGCTC	2	10	183537	183546	0 %	20 %	40 %	40 %	147674411
104	NC_009457	TTCGA	2	10	183652	183661	20 %	40 %	20 %	20 %	147674411
105	NC_009457	GCTCA	2	10	184374	184383	20 %	20 %	20 %	40 %	147674022
106	NC_009457	TTTCT	2	10	185369	185378	0 %	80 %	0 %	20 %	147673240
107	NC_009457	TTTCA	2	10	186880	186889	20 %	60 %	0 %	20 %	147674830
108	NC_009457	CAAAC	2	10	189194	189203	60 %	0 %	0 %	40 %	147673182
109	NC_009457	TGCAA	2	10	191983	191992	40 %	20 %	20 %	20 %	147674031
110	NC_009457	TGCTC	2	10	194332	194341	0 %	40 %	20 %	40 %	147673612
111	NC_009457	GGTGC	2	10	195937	195946	0 %	20 %	60 %	20 %	147674859
112	NC_009457	TTGGG	2	10	197553	197562	0 %	40 %	60 %	0 %	147674594
113	NC_009457	TTGAT	2	10	199188	199197	20 %	60 %	20 %	0 %	147673070
114	NC_009457	GTGCT	2	10	199872	199881	0 %	40 %	40 %	20 %	147673070
115	NC_009457	GAAGC	2	10	200557	200566	40 %	0 %	40 %	20 %	147673826
116	NC_009457	GTGAT	2	10	202859	202868	20 %	40 %	40 %	0 %	147674731
117	NC_009457	GATCA	2	10	203644	203653	40 %	20 %	20 %	20 %	147675556
118	NC_009457	TTTCA	2	10	203763	203772	20 %	60 %	0 %	20 %	147675556
119	NC_009457	GCAGC	2	10	208877	208886	20 %	0 %	40 %	40 %	147673679
120	NC_009457	CGAAT	2	10	209741	209750	40 %	20 %	20 %	20 %	147673679
121	NC_009457	TGAAA	2	10	211216	211225	60 %	20 %	20 %	0 %	147675364
122	NC_009457	GTTCT	2	10	212079	212088	0 %	60 %	20 %	20 %	147674969
123	NC_009457	ATGTG	2	10	212888	212897	20 %	40 %	40 %	0 %	147673512
124	NC_009457	AGCAG	2	10	213531	213540	40 %	0 %	40 %	20 %	147673742
125	NC_009457	TTGGC	2	10	218083	218092	0 %	40 %	40 %	20 %	147674115
126	NC_009457	CTGAT	2	10	220947	220956	20 %	40 %	20 %	20 %	147675239
127	NC_009457	AAAGC	2	10	221223	221232	60 %	0 %	20 %	20 %	147675239
128	NC_009457	CAACC	2	10	221488	221497	40 %	0 %	0 %	60 %	147675239
129	NC_009457	CAGCA	2	10	221817	221826	40 %	0 %	20 %	40 %	147675239
130	NC_009457	GTTTG	2	10	221884	221893	0 %	60 %	40 %	0 %	147675239
131	NC_009457	ACTCG	2	10	224173	224182	20 %	20 %	20 %	40 %	147673232
132	NC_009457	GAACG	2	10	225011	225020	40 %	0 %	40 %	20 %	147673650
133	NC_009457	ACACC	2	10	225636	225645	40 %	0 %	0 %	60 %	147673650
134	NC_009457	TCTCT	2	10	227702	227711	0 %	60 %	0 %	40 %	147674441
135	NC_009457	TTTTG	2	10	228342	228351	0 %	80 %	20 %	0 %	147674441
136	NC_009457	GATCT	2	10	231979	231988	20 %	40 %	20 %	20 %	147674462
137	NC_009457	ATTGC	2	10	232274	232283	20 %	40 %	20 %	20 %	147674462
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142	NC_009457	GGTGA	2	10	243365	243374	20 %	20 %	60 %	0 %	147674861
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145	NC_009457	GCGCA	2	10	251108	251117	20 %	0 %	40 %	40 %	147675005
146	NC_009457	ATCGC	2	10	251578	251587	20 %	20 %	20 %	40 %	147675005
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152	NC_009457	AGTTT	2	10	271085	271094	20 %	60 %	20 %	0 %	147675548
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167	NC_009457	CGCCA	2	10	297548	297557	20 %	0 %	20 %	60 %	147675760
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177	NC_009457	TGGCT	2	10	319154	319163	0 %	40 %	40 %	20 %	147673711
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244	NC_009457	TCAAC	2	10	417059	417068	40 %	20 %	0 %	40 %	147675549
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246	NC_009457	TTCTT	2	10	418228	418237	0 %	80 %	0 %	20 %	147674543
247	NC_009457	TTTGA	2	10	418290	418299	20 %	60 %	20 %	0 %	147674543
248	NC_009457	CTGCG	2	10	419002	419011	0 %	20 %	40 %	40 %	147674543
249	NC_009457	TTTGT	2	10	419744	419753	0 %	80 %	20 %	0 %	147675155
250	NC_009457	CCACC	2	10	421178	421187	20 %	0 %	0 %	80 %	147674227
251	NC_009457	AATCC	2	10	422081	422090	40 %	20 %	0 %	40 %	147674227
252	NC_009457	AAGCC	2	10	423651	423660	40 %	0 %	20 %	40 %	147673351
253	NC_009457	TTCGT	2	10	426253	426262	0 %	60 %	20 %	20 %	147673351
254	NC_009457	ATATC	2	10	426701	426710	40 %	40 %	0 %	20 %	147675515
255	NC_009457	GTTCA	2	10	429395	429404	20 %	40 %	20 %	20 %	147673158
256	NC_009457	CAAAT	2	10	431708	431717	60 %	20 %	0 %	20 %	147674880
257	NC_009457	GTGAT	2	10	432987	432996	20 %	40 %	40 %	0 %	147673146
258	NC_009457	TATCG	2	10	433298	433307	20 %	40 %	20 %	20 %	147673146
259	NC_009457	CGGTG	2	10	435697	435706	0 %	20 %	60 %	20 %	147675591
260	NC_009457	ATCGC	2	10	436258	436267	20 %	20 %	20 %	40 %	147674808
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262	NC_009457	TTGCT	2	10	442187	442196	0 %	60 %	20 %	20 %	147674601
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389	NC_009457	CGCGG	2	10	693285	693294	0 %	0 %	60 %	40 %	147675492
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