MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 34577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	CTT	2	6	948	953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
2	NC_009457	CAT	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674855
3	NC_009457	CTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
4	NC_009457	TGT	2	6	1086	1091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674855
5	NC_009457	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
6	NC_009457	GTT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
7	NC_009457	GCA	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
8	NC_009457	TGG	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675529
9	NC_009457	GCT	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
10	NC_009457	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
11	NC_009457	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675529
12	NC_009457	AGC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
13	NC_009457	AGA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675529
14	NC_009457	CGC	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675529
15	NC_009457	GCT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
16	NC_009457	GTA	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675529
17	NC_009457	GCA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
18	NC_009457	GCG	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675529
19	NC_009457	CTG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
20	NC_009457	TTG	2	6	2189	2194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
21	NC_009457	CAC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674068
22	NC_009457	TGG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674068
23	NC_009457	GGC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674068
24	NC_009457	TAA	2	6	2428	2433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674068
25	NC_009457	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
26	NC_009457	TGC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
27	NC_009457	TCG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
28	NC_009457	TTC	2	6	2917	2922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674960
29	NC_009457	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674960
30	NC_009457	CAC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674960
31	NC_009457	TCA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
32	NC_009457	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
33	NC_009457	TGA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
34	NC_009457	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674960
35	NC_009457	TAA	3	9	3437	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674885
36	NC_009457	CAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
37	NC_009457	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
38	NC_009457	GAA	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674885
39	NC_009457	TGC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674885
40	NC_009457	GCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
41	NC_009457	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
42	NC_009457	CAA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674885
43	NC_009457	ATG	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
44	NC_009457	ATT	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
45	NC_009457	TTC	3	9	4600	4608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
46	NC_009457	ATC	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675539
47	NC_009457	GTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
48	NC_009457	TGG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
49	NC_009457	GCG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
50	NC_009457	TGG	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
51	NC_009457	GCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
52	NC_009457	CTT	2	6	5328	5333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
53	NC_009457	GCA	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
54	NC_009457	ACC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675539
55	NC_009457	GCA	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
56	NC_009457	CAG	2	6	5641	5646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
57	NC_009457	GCT	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
58	NC_009457	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
59	NC_009457	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
60	NC_009457	TTC	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673291
61	NC_009457	TGC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
62	NC_009457	GTG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
63	NC_009457	ATC	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
64	NC_009457	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673291
65	NC_009457	AGC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
66	NC_009457	ATC	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
67	NC_009457	TGA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673291
68	NC_009457	GTG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
69	NC_009457	CGA	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
70	NC_009457	AGT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
71	NC_009457	CTT	2	6	6572	6577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673975
72	NC_009457	GCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673975
73	NC_009457	AGT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
74	NC_009457	CAT	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673975
75	NC_009457	ATT	2	6	6914	6919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674564
76	NC_009457	CAC	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674564
77	NC_009457	CGG	2	6	7080	7085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674564
78	NC_009457	TTC	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674564
79	NC_009457	CAA	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674564
80	NC_009457	GCA	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674564
81	NC_009457	GCA	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675181
82	NC_009457	GCC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675181
83	NC_009457	AAT	2	6	7313	7318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675181
84	NC_009457	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675181
85	NC_009457	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675181
86	NC_009457	GCC	2	6	7436	7441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675181
87	NC_009457	TGG	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675181
88	NC_009457	TGC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675181
89	NC_009457	ACC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675181
90	NC_009457	ATG	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675181
91	NC_009457	TGA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675181
92	NC_009457	GTT	2	6	7824	7829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
93	NC_009457	CCG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
94	NC_009457	GTG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673294
95	NC_009457	GGC	2	6	7993	7998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
96	NC_009457	TTG	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
97	NC_009457	TAA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147673294
98	NC_009457	TCA	2	6	8042	8047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673294
99	NC_009457	TGC	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673294
100	NC_009457	AAG	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673294
101	NC_009457	GCG	2	6	8117	8122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
102	NC_009457	CCG	2	6	8340	8345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
103	NC_009457	ACC	2	6	8432	8437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673294
104	NC_009457	TTG	2	6	8446	8451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
105	NC_009457	CGC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
106	NC_009457	TGG	2	6	8472	8477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673294
107	NC_009457	GAT	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673294
108	NC_009457	CGG	2	6	8547	8552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
109	NC_009457	ATG	2	6	8579	8584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673294
110	NC_009457	TGC	2	6	8746	8751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673920
111	NC_009457	GCT	2	6	8763	8768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673920
112	NC_009457	GTT	2	6	8827	8832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673920
113	NC_009457	GCC	2	6	8859	8864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673920
114	NC_009457	TGC	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673920
115	NC_009457	TGT	2	6	9339	9344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673920
116	NC_009457	TAC	2	6	9388	9393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673920
117	NC_009457	TCA	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674559
118	NC_009457	CGG	2	6	9700	9705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674559
119	NC_009457	CGA	2	6	9832	9837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674559
120	NC_009457	GGC	2	6	9842	9847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674559
121	NC_009457	TCA	2	6	9869	9874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674559
122	NC_009457	CAA	2	6	9923	9928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674559
123	NC_009457	TCG	2	6	10024	10029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674559
124	NC_009457	CGG	2	6	10117	10122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674559
125	NC_009457	ATC	2	6	10332	10337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674559
126	NC_009457	GTG	2	6	10399	10404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674559
127	NC_009457	TGG	2	6	10405	10410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674559
128	NC_009457	AAG	2	6	10417	10422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674559
129	NC_009457	GAT	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675116
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500	NC_009457	CCA	2	6	44250	44255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674914

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