MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 50877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009457	CTT	2	6	948	953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
2	NC_009457	CAT	2	6	1012	1017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674855
3	NC_009457	CTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
4	NC_009457	TGT	2	6	1086	1091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674855
5	NC_009457	CTT	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674855
6	NC_009457	GTT	2	6	1240	1245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
7	NC_009457	GCA	2	6	1342	1347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
8	NC_009457	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
9	NC_009457	TGG	2	6	1450	1455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675529
10	NC_009457	GCT	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
11	NC_009457	TGC	2	6	1629	1634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
12	NC_009457	GGCAA	2	10	1637	1646	40 %	0 %	40 %	20 %	147675529
13	NC_009457	CAT	2	6	1712	1717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675529
14	NC_009457	T	6	6	1792	1797	0 %	100 %	0 %	0 %	147675529
15	NC_009457	AGC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
16	NC_009457	GC	3	6	1826	1831	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
17	NC_009457	T	6	6	1871	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	147675529
18	NC_009457	AGA	2	6	1883	1888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675529
19	NC_009457	CGC	2	6	1960	1965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675529
20	NC_009457	TCAC	2	8	1971	1978	25 %	25 %	0 %	50 %	147675529
21	NC_009457	GCT	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
22	NC_009457	GC	3	6	2006	2011	0 %	0 %	50 %	50 %	147675529
23	NC_009457	GTA	2	6	2018	2023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675529
24	NC_009457	GCA	2	6	2044	2049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675529
25	NC_009457	GCG	2	6	2059	2064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675529
26	NC_009457	CTG	2	6	2141	2146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675529
27	NC_009457	TTG	2	6	2189	2194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675529
28	NC_009457	CAC	2	6	2303	2308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674068
29	NC_009457	TGG	2	6	2313	2318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674068
30	NC_009457	GGC	2	6	2383	2388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674068
31	NC_009457	TAA	2	6	2428	2433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674068
32	NC_009457	TCA	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
33	NC_009457	TGC	2	6	2543	2548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
34	NC_009457	TCG	2	6	2568	2573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674960
35	NC_009457	GATT	2	8	2634	2641	25 %	50 %	25 %	0 %	147674960
36	NC_009457	CCAG	2	8	2643	2650	25 %	0 %	25 %	50 %	147674960
37	NC_009457	CA	3	6	2876	2881	50 %	0 %	0 %	50 %	147674960
38	NC_009457	TTC	2	6	2917	2922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674960
39	NC_009457	AAG	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674960
40	NC_009457	CAC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674960
41	NC_009457	TCA	2	6	3002	3007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674960
42	NC_009457	ACTG	2	8	3034	3041	25 %	25 %	25 %	25 %	147674960
43	NC_009457	TGA	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
44	NC_009457	TGA	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674960
45	NC_009457	AGC	2	6	3158	3163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674960
46	NC_009457	TAA	3	9	3437	3445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674885
47	NC_009457	CAG	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
48	NC_009457	ATT	2	6	3486	3491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
49	NC_009457	GAA	2	6	3492	3497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674885
50	NC_009457	ACCA	2	8	3588	3595	50 %	0 %	0 %	50 %	147674885
51	NC_009457	TGC	2	6	3826	3831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674885
52	NC_009457	CT	3	6	3840	3845	0 %	50 %	0 %	50 %	147674885
53	NC_009457	GCA	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674885
54	NC_009457	GAT	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
55	NC_009457	CAA	2	6	4088	4093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674885
56	NC_009457	CAAA	2	8	4142	4149	75 %	0 %	0 %	25 %	147674885
57	NC_009457	ATG	2	6	4180	4185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674885
58	NC_009457	ATT	2	6	4245	4250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674885
59	NC_009457	CTCG	2	8	4313	4320	0 %	25 %	25 %	50 %	147674885
60	NC_009457	CG	3	6	4329	4334	0 %	0 %	50 %	50 %	147674885
61	NC_009457	TTC	3	9	4600	4608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
62	NC_009457	ATC	2	6	4678	4683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675539
63	NC_009457	GTG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
64	NC_009457	TCAA	2	8	4784	4791	50 %	25 %	0 %	25 %	147675539
65	NC_009457	A	6	6	4807	4812	100 %	0 %	0 %	0 %	147675539
66	NC_009457	CAAC	2	8	4836	4843	50 %	0 %	0 %	50 %	147675539
67	NC_009457	CG	3	6	4896	4901	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
68	NC_009457	TGG	2	6	4914	4919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
69	NC_009457	GC	3	6	4959	4964	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
70	NC_009457	AG	3	6	5185	5190	50 %	0 %	50 %	0 %	147675539
71	NC_009457	GCG	2	6	5193	5198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
72	NC_009457	TGCT	2	8	5233	5240	0 %	50 %	25 %	25 %	147675539
73	NC_009457	TGG	2	6	5300	5305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675539
74	NC_009457	GCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675539
75	NC_009457	CTT	2	6	5328	5333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675539
76	NC_009457	GCA	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
77	NC_009457	CG	3	6	5525	5530	0 %	0 %	50 %	50 %	147675539
78	NC_009457	ACC	2	6	5560	5565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675539
79	NC_009457	GCA	2	6	5583	5588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
80	NC_009457	CAG	2	6	5641	5646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675539
81	NC_009457	GCAC	2	8	5721	5728	25 %	0 %	25 %	50 %	147675539
82	NC_009457	GCT	2	6	5777	5782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
83	NC_009457	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
84	NC_009457	CAG	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
85	NC_009457	TTC	2	6	5874	5879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673291
86	NC_009457	TGC	2	6	5915	5920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673291
87	NC_009457	GTG	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
88	NC_009457	ATC	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
89	NC_009457	CA	3	6	6006	6011	50 %	0 %	0 %	50 %	147673291
90	NC_009457	CG	3	6	6019	6024	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
91	NC_009457	CGC	2	6	6054	6059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673291
92	NC_009457	AGC	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
93	NC_009457	GC	3	6	6108	6113	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
94	NC_009457	GC	3	6	6128	6133	0 %	0 %	50 %	50 %	147673291
95	NC_009457	ATC	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673291
96	NC_009457	TGA	2	6	6212	6217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673291
97	NC_009457	GTG	2	6	6235	6240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673291
98	NC_009457	CGA	2	6	6281	6286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673291
99	NC_009457	AGT	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
100	NC_009457	CTT	2	6	6572	6577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673975
101	NC_009457	CG	3	6	6669	6674	0 %	0 %	50 %	50 %	147673975
102	NC_009457	GTTGA	2	10	6757	6766	20 %	40 %	40 %	0 %	147673975
103	NC_009457	T	6	6	6800	6805	0 %	100 %	0 %	0 %	147673975
104	NC_009457	GCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673975
105	NC_009457	AGT	2	6	6844	6849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673975
106	NC_009457	CAT	2	6	6852	6857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673975
107	NC_009457	ATT	2	6	6914	6919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674564
108	NC_009457	TGGCT	2	10	6949	6958	0 %	40 %	40 %	20 %	147674564
109	NC_009457	TTGT	2	8	6972	6979	0 %	75 %	25 %	0 %	147674564
110	NC_009457	CAC	2	6	7005	7010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147674564
111	NC_009457	CGG	2	6	7080	7085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674564
112	NC_009457	TTC	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674564
113	NC_009457	CAA	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674564
114	NC_009457	GCA	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674564
115	NC_009457	GCA	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675181
116	NC_009457	GCC	2	6	7298	7303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675181
117	NC_009457	AAT	2	6	7313	7318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675181
118	NC_009457	CAA	2	6	7415	7420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675181
119	NC_009457	AAC	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147675181
120	NC_009457	GCC	2	6	7436	7441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675181
121	NC_009457	AG	4	8	7455	7462	50 %	0 %	50 %	0 %	147675181
122	NC_009457	GAGGAA	2	12	7469	7480	50 %	0 %	50 %	0 %	147675181
123	NC_009457	TGG	2	6	7567	7572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675181
124	NC_009457	TGC	2	6	7582	7587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675181
125	NC_009457	GC	4	8	7674	7681	0 %	0 %	50 %	50 %	147675181
126	NC_009457	ACC	2	6	7707	7712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675181
127	NC_009457	ATG	2	6	7713	7718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675181
128	NC_009457	TGA	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675181
129	NC_009457	GTT	2	6	7824	7829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
130	NC_009457	GC	3	6	7839	7844	0 %	0 %	50 %	50 %	147673294
131	NC_009457	CCG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673294
132	NC_009457	GTG	2	6	7922	7927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673294
133	NC_009457	GGC	2	6	7993	7998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673294
134	NC_009457	TTG	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147673294
135	NC_009457	TAA	2	6	8023	8028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147673294
136	NC_009457	TCA	2	6	8042	8047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673294
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141	NC_009457	CGCTT	2	10	8209	8218	0 %	40 %	20 %	40 %	147673294
142	NC_009457	TGAC	2	8	8328	8335	25 %	25 %	25 %	25 %	147673294
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263	NC_009457	TGGT	2	8	15413	15420	0 %	50 %	50 %	0 %	147673886
264	NC_009457	GAT	2	6	15430	15435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673886
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388	NC_009457	CCAG	2	8	23068	23075	25 %	0 %	25 %	50 %	147674899
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