MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 50877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_009457	CGA	2	6	228986	228991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675680
4003	NC_009457	TGC	2	6	229001	229006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675680
4004	NC_009457	CTT	2	6	229061	229066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675680
4005	NC_009457	GCC	2	6	229089	229094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675680
4006	NC_009457	GTGG	2	8	229135	229142	0 %	25 %	75 %	0 %	147675680
4007	NC_009457	GAC	2	6	229169	229174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675680
4008	NC_009457	GGC	2	6	229221	229226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675680
4009	NC_009457	TTGT	2	8	229287	229294	0 %	75 %	25 %	0 %	147675680
4010	NC_009457	TTG	2	6	229296	229301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675680
4011	NC_009457	GCG	2	6	229390	229395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675680
4012	NC_009457	GTA	2	6	229442	229447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673249
4013	NC_009457	CGG	2	6	229486	229491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673249
4014	NC_009457	GCCA	2	8	229527	229534	25 %	0 %	25 %	50 %	147673249
4015	NC_009457	GGT	2	6	229580	229585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673249
4016	NC_009457	GCA	2	6	229606	229611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673249
4017	NC_009457	CCG	2	6	229650	229655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673249
4018	NC_009457	CA	3	6	229657	229662	50 %	0 %	0 %	50 %	147673249
4019	NC_009457	CAA	2	6	229708	229713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147673249
4020	NC_009457	CA	3	6	229732	229737	50 %	0 %	0 %	50 %	147673249
4021	NC_009457	CAC	2	6	229991	229996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147673249
4022	NC_009457	C	6	6	230033	230038	0 %	0 %	0 %	100 %	147673249
4023	NC_009457	GC	3	6	230171	230176	0 %	0 %	50 %	50 %	147673249
4024	NC_009457	TGC	2	6	230295	230300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673249
4025	NC_009457	GGT	2	6	230369	230374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673249
4026	NC_009457	GCT	2	6	230404	230409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673249
4027	NC_009457	GGCA	2	8	230417	230424	25 %	0 %	50 %	25 %	147673249
4028	NC_009457	GTG	2	6	230435	230440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147673249
4029	NC_009457	CAG	2	6	230444	230449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673249
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4031	NC_009457	TTGG	2	8	230662	230669	0 %	50 %	50 %	0 %	147673776
4032	NC_009457	GCA	2	6	230713	230718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673776
4033	NC_009457	GTGG	2	8	230726	230733	0 %	25 %	75 %	0 %	147673776
4034	NC_009457	CAG	2	6	230768	230773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673776
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4037	NC_009457	AAG	2	6	230838	230843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673776
4038	NC_009457	CG	3	6	230902	230907	0 %	0 %	50 %	50 %	147673776
4039	NC_009457	GGTT	2	8	230942	230949	0 %	50 %	50 %	0 %	147673776
4040	NC_009457	GGC	2	6	230953	230958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673776
4041	NC_009457	CAG	2	6	231076	231081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673776
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4044	NC_009457	GAT	2	6	231374	231379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147673776
4045	NC_009457	G	7	7	231406	231412	0 %	0 %	100 %	0 %	147673776
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4048	NC_009457	GCA	2	6	231592	231597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673776
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4051	NC_009457	TGC	2	6	231881	231886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674462
4052	NC_009457	GATCT	2	10	231979	231988	20 %	40 %	20 %	20 %	147674462
4053	NC_009457	GTG	2	6	232005	232010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674462
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4055	NC_009457	GCA	2	6	232035	232040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674462
4056	NC_009457	AACA	2	8	232144	232151	75 %	0 %	0 %	25 %	147674462
4057	NC_009457	AGC	2	6	232187	232192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674462
4058	NC_009457	TGAT	2	8	232250	232257	25 %	50 %	25 %	0 %	147674462
4059	NC_009457	T	7	7	232257	232263	0 %	100 %	0 %	0 %	147674462
4060	NC_009457	ATTGC	2	10	232274	232283	20 %	40 %	20 %	20 %	147674462
4061	NC_009457	AGT	2	6	232367	232372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674462
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4070	NC_009457	TGG	2	6	233067	233072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675427
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4093	NC_009457	A	6	6	234533	234538	100 %	0 %	0 %	0 %	147673285
4094	NC_009457	TAC	2	6	234610	234615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673285
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4102	NC_009457	AGA	2	6	235159	235164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147673285
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4108	NC_009457	GC	3	6	235466	235471	0 %	0 %	50 %	50 %	147674187
4109	NC_009457	TGG	2	6	235482	235487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674187
4110	NC_009457	AGCGGA	2	12	235570	235581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	147674187
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4115	NC_009457	TCAA	2	8	235922	235929	50 %	25 %	0 %	25 %	147674187
4116	NC_009457	CACTT	2	10	236165	236174	20 %	40 %	0 %	40 %	147674187
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4119	NC_009457	TCA	2	6	236321	236326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674187
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4360	NC_009457	TG	3	6	250728	250733	0 %	50 %	50 %	0 %	147675005
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4481	NC_009457	TGG	2	6	263147	263152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674650
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4486	NC_009457	GAT	2	6	263274	263279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674650
4487	NC_009457	GTTG	2	8	263309	263316	0 %	50 %	50 %	0 %	147674650
4488	NC_009457	CCG	2	6	263336	263341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674650
4489	NC_009457	GGA	2	6	263360	263365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147674650
4490	NC_009457	TGAT	2	8	263368	263375	25 %	50 %	25 %	0 %	147674650
4491	NC_009457	CTT	2	6	263468	263473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674650
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