MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 50877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009457	AAAG	2	8	30193	30200	75 %	0 %	25 %	0 %	147675146
502	NC_009457	CA	3	6	30212	30217	50 %	0 %	0 %	50 %	147675146
503	NC_009457	CAC	2	6	30278	30283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675146
504	NC_009457	GGT	2	6	30339	30344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675146
505	NC_009457	GTG	2	6	30348	30353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675146
506	NC_009457	AAT	2	6	30405	30410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675146
507	NC_009457	CCA	2	6	30447	30452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675146
508	NC_009457	T	6	6	30458	30463	0 %	100 %	0 %	0 %	147675146
509	NC_009457	GTG	2	6	30665	30670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674972
510	NC_009457	AGC	2	6	30699	30704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674972
511	NC_009457	CTG	2	6	30720	30725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674972
512	NC_009457	AGC	2	6	30783	30788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674972
513	NC_009457	TTGG	2	8	30803	30810	0 %	50 %	50 %	0 %	147674972
514	NC_009457	GTT	2	6	30943	30948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674972
515	NC_009457	GCC	2	6	30975	30980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674972
516	NC_009457	TAC	2	6	31260	31265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674972
517	NC_009457	TCA	2	6	31275	31280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674972
518	NC_009457	TCA	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674972
519	NC_009457	T	6	6	31428	31433	0 %	100 %	0 %	0 %	147674972
520	NC_009457	CAT	2	6	31436	31441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674972
521	NC_009457	TAC	2	6	31506	31511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674972
522	NC_009457	AAT	2	6	31515	31520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674972
523	NC_009457	ATT	2	6	31625	31630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674164
524	NC_009457	GGT	2	6	31637	31642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674164
525	NC_009457	CT	3	6	31650	31655	0 %	50 %	0 %	50 %	147674164
526	NC_009457	CTG	2	6	31729	31734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674164
527	NC_009457	GTT	2	6	31764	31769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674164
528	NC_009457	AATG	2	8	31778	31785	50 %	25 %	25 %	0 %	147674164
529	NC_009457	CAG	2	6	31860	31865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674164
530	NC_009457	ATCA	2	8	32025	32032	50 %	25 %	0 %	25 %	147674164
531	NC_009457	CAG	2	6	32076	32081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674164
532	NC_009457	GGC	2	6	32093	32098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674164
533	NC_009457	ACA	2	6	32179	32184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674164
534	NC_009457	ATG	2	6	32205	32210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674164
535	NC_009457	GCG	2	6	32214	32219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674164
536	NC_009457	A	6	6	32230	32235	100 %	0 %	0 %	0 %	147674164
537	NC_009457	TA	3	6	32296	32301	50 %	50 %	0 %	0 %	147674164
538	NC_009457	ATC	2	6	32655	32660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675027
539	NC_009457	TGTT	2	8	32684	32691	0 %	75 %	25 %	0 %	147675027
540	NC_009457	TCA	2	6	32752	32757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675027
541	NC_009457	TAA	2	6	32777	32782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147675027
542	NC_009457	GGT	2	6	32970	32975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674848
543	NC_009457	GCT	2	6	33044	33049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674848
544	NC_009457	TTG	2	6	33056	33061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674848
545	NC_009457	GTG	2	6	33062	33067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674848
546	NC_009457	AAT	2	6	33073	33078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147674848
547	NC_009457	GAT	2	6	33139	33144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674848
548	NC_009457	CCAT	2	8	33350	33357	25 %	25 %	0 %	50 %	147674848
549	NC_009457	ATC	3	9	33473	33481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674848
550	NC_009457	CTT	2	6	33498	33503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674848
551	NC_009457	CTG	2	6	33504	33509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674848
552	NC_009457	ATG	2	6	33542	33547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674848
553	NC_009457	CTT	2	6	33588	33593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674848
554	NC_009457	GAT	2	6	33610	33615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674848
555	NC_009457	CCG	2	6	33629	33634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674848
556	NC_009457	TTTC	2	8	33657	33664	0 %	75 %	0 %	25 %	147674848
557	NC_009457	GCA	2	6	33692	33697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674848
558	NC_009457	GTT	2	6	33817	33822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674848
559	NC_009457	ACTTC	2	10	33834	33843	20 %	40 %	0 %	40 %	147674848
560	NC_009457	CGT	2	6	33882	33887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674848
561	NC_009457	CAA	2	6	33963	33968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674848
562	NC_009457	GTT	2	6	34083	34088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674848
563	NC_009457	GA	3	6	34155	34160	50 %	0 %	50 %	0 %	147674848
564	NC_009457	TCAG	2	8	34199	34206	25 %	25 %	25 %	25 %	147674848
565	NC_009457	CGAAA	2	10	34695	34704	60 %	0 %	20 %	20 %	147674087
566	NC_009457	CA	3	6	34721	34726	50 %	0 %	0 %	50 %	147674087
567	NC_009457	AGGTG	2	10	34750	34759	20 %	20 %	60 %	0 %	147674087
568	NC_009457	CT	4	8	34770	34777	0 %	50 %	0 %	50 %	147674087
569	NC_009457	A	7	7	34830	34836	100 %	0 %	0 %	0 %	147674087
570	NC_009457	TGC	2	6	34845	34850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674087
571	NC_009457	TGG	2	6	34858	34863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674087
572	NC_009457	AAG	2	6	34881	34886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147674087
573	NC_009457	TGAAT	2	10	34897	34906	40 %	40 %	20 %	0 %	147674087
574	NC_009457	TGAT	2	8	34980	34987	25 %	50 %	25 %	0 %	147674087
575	NC_009457	GCA	2	6	34992	34997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674087
576	NC_009457	CGG	2	6	35001	35006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674087
577	NC_009457	TGA	2	6	35046	35051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674087
578	NC_009457	CTG	2	6	35105	35110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674087
579	NC_009457	GAC	2	6	35236	35241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674087
580	NC_009457	TGA	2	6	35304	35309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147674087
581	NC_009457	AGCTG	2	10	35349	35358	20 %	20 %	40 %	20 %	147674087
582	NC_009457	ACA	2	6	35361	35366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147674087
583	NC_009457	CAAA	2	8	35410	35417	75 %	0 %	0 %	25 %	147674087
584	NC_009457	TG	3	6	35525	35530	0 %	50 %	50 %	0 %	147675377
585	NC_009457	TTG	2	6	35534	35539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675377
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589	NC_009457	GGT	2	6	35808	35813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675377
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591	NC_009457	TGC	2	6	35855	35860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675377
592	NC_009457	AGTGG	2	10	35916	35925	20 %	20 %	60 %	0 %	147675377
593	NC_009457	TTA	2	6	35947	35952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147675377
594	NC_009457	ACC	2	6	35965	35970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675377
595	NC_009457	TCGC	2	8	36038	36045	0 %	25 %	25 %	50 %	147675377
596	NC_009457	CGC	2	6	36127	36132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147675377
597	NC_009457	TCG	2	6	36171	36176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675377
598	NC_009457	ATG	2	6	36245	36250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675377
599	NC_009457	AGC	2	6	36299	36304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675377
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601	NC_009457	TCG	2	6	36416	36421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675377
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605	NC_009457	TC	3	6	36664	36669	0 %	50 %	0 %	50 %	147675377
606	NC_009457	TTG	2	6	36760	36765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675377
607	NC_009457	AGC	2	6	36788	36793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675377
608	NC_009457	TGCAT	2	10	36834	36843	20 %	40 %	20 %	20 %	147675377
609	NC_009457	CAT	2	6	36922	36927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675377
610	NC_009457	CTT	2	6	36933	36938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675377
611	NC_009457	TAC	2	6	36952	36957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675377
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613	NC_009457	GAA	2	6	37129	37134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147675377
614	NC_009457	GTGC	2	8	37135	37142	0 %	25 %	50 %	25 %	147675377
615	NC_009457	GC	3	6	37141	37146	0 %	0 %	50 %	50 %	147675377
616	NC_009457	GGT	2	6	37147	37152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675377
617	NC_009457	TTA	2	6	37251	37256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147675377
618	NC_009457	CT	3	6	37276	37281	0 %	50 %	0 %	50 %	147675377
619	NC_009457	TAAG	2	8	37477	37484	50 %	25 %	25 %	0 %	147675633
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623	NC_009457	TGC	2	6	37525	37530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675633
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625	NC_009457	TCG	2	6	37638	37643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675633
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