MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 2

Total Repeats: 50877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009457	GCA	2	6	319235	319240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673711
5502	NC_009457	GCA	2	6	319283	319288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673711
5503	NC_009457	GCA	2	6	319330	319335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673711
5504	NC_009457	GCT	2	6	319337	319342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673711
5505	NC_009457	CTG	2	6	319374	319379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673711
5506	NC_009457	AGCGCA	2	12	319393	319404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673711
5507	NC_009457	GTAA	2	8	319430	319437	50 %	25 %	25 %	0 %	147673711
5508	NC_009457	TTC	2	6	319768	319773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675125
5509	NC_009457	CT	3	6	319777	319782	0 %	50 %	0 %	50 %	147675125
5510	NC_009457	CG	3	6	319803	319808	0 %	0 %	50 %	50 %	147675125
5511	NC_009457	CGG	2	6	319842	319847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147675125
5512	NC_009457	GCA	2	6	319908	319913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675125
5513	NC_009457	GGTTTC	2	12	319915	319926	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	147675125
5514	NC_009457	CTT	2	6	319989	319994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147675125
5515	NC_009457	CGA	2	6	319995	320000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675125
5516	NC_009457	AGCC	2	8	320091	320098	25 %	0 %	25 %	50 %	147675125
5517	NC_009457	TGAGA	2	10	320107	320116	40 %	20 %	40 %	0 %	147675125
5518	NC_009457	TGA	2	6	320204	320209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675125
5519	NC_009457	GCA	2	6	320229	320234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147675125
5520	NC_009457	GC	3	6	320276	320281	0 %	0 %	50 %	50 %	147675125
5521	NC_009457	CAC	2	6	320287	320292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147675125
5522	NC_009457	TGA	2	6	320309	320314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147675125
5523	NC_009457	CTTG	2	8	320340	320347	0 %	50 %	25 %	25 %	147675125
5524	NC_009457	GAG	2	6	320366	320371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147675125
5525	NC_009457	GTGAG	2	10	320393	320402	20 %	20 %	60 %	0 %	147675125
5526	NC_009457	TCA	2	6	320516	320521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147675125
5527	NC_009457	CTG	2	6	320530	320535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147675125
5528	NC_009457	GAGT	2	8	320652	320659	25 %	25 %	50 %	0 %	147675125
5529	NC_009457	GTG	2	6	320687	320692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147675125
5530	NC_009457	TGT	2	6	320721	320726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147675125
5531	NC_009457	TTC	2	6	320920	320925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147674539
5532	NC_009457	GGC	2	6	320996	321001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147674539
5533	NC_009457	GTT	2	6	321017	321022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147674539
5534	NC_009457	A	7	7	321074	321080	100 %	0 %	0 %	0 %	147674539
5535	NC_009457	TCAA	2	8	321118	321125	50 %	25 %	0 %	25 %	147674539
5536	NC_009457	ATC	2	6	321151	321156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147674539
5537	NC_009457	CTG	2	6	321161	321166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674539
5538	NC_009457	GT	3	6	321247	321252	0 %	50 %	50 %	0 %	147674539
5539	NC_009457	CAG	2	6	321294	321299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674539
5540	NC_009457	ATT	2	6	321312	321317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147674539
5541	NC_009457	TGC	2	6	321326	321331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674539
5542	NC_009457	CGC	2	6	321337	321342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147674539
5543	NC_009457	GCA	2	6	321473	321478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147674539
5544	NC_009457	TGC	2	6	321527	321532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674539
5545	NC_009457	TGG	2	6	321653	321658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147674539
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5547	NC_009457	A	6	6	321798	321803	100 %	0 %	0 %	0 %	147673852
5548	NC_009457	CGAG	2	8	322126	322133	25 %	0 %	50 %	25 %	147673852
5549	NC_009457	TGC	2	6	322137	322142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673852
5550	NC_009457	GCA	2	6	322153	322158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673852
5551	NC_009457	CAGCCA	2	12	322226	322237	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	147673852
5552	NC_009457	GC	3	6	322270	322275	0 %	0 %	50 %	50 %	147673852
5553	NC_009457	GCCA	2	8	322297	322304	25 %	0 %	25 %	50 %	147673852
5554	NC_009457	GT	3	6	322357	322362	0 %	50 %	50 %	0 %	147673852
5555	NC_009457	AG	3	6	322364	322369	50 %	0 %	50 %	0 %	147673852
5556	NC_009457	GCC	2	6	322491	322496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673852
5557	NC_009457	TCT	2	6	322497	322502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147673852
5558	NC_009457	GCT	2	6	322582	322587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673852
5559	NC_009457	CAT	2	6	322595	322600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147673852
5560	NC_009457	TG	3	6	322654	322659	0 %	50 %	50 %	0 %	147673852
5561	NC_009457	GCC	2	6	322735	322740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673852
5562	NC_009457	ATCT	2	8	322850	322857	25 %	50 %	0 %	25 %	147673852
5563	NC_009457	GC	3	6	322878	322883	0 %	0 %	50 %	50 %	147673852
5564	NC_009457	TTTTA	2	10	323212	323221	20 %	80 %	0 %	0 %	147673071
5565	NC_009457	GC	3	6	323262	323267	0 %	0 %	50 %	50 %	147673071
5566	NC_009457	ACG	2	6	323315	323320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673071
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5570	NC_009457	A	6	6	323471	323476	100 %	0 %	0 %	0 %	147673071
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5575	NC_009457	TGCTCA	2	12	323818	323829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	147673071
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5593	NC_009457	CTGG	2	8	324655	324662	0 %	25 %	50 %	25 %	147673882
5594	NC_009457	GCG	2	6	324664	324669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673882
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5602	NC_009457	TCG	2	6	325035	325040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673882
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5605	NC_009457	GCG	2	6	325280	325285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673105
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5987	NC_009457	CGC	2	6	345738	345743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147673483
5988	NC_009457	GCT	2	6	345818	345823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673483
5989	NC_009457	GCG	2	6	345849	345854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147673483
5990	NC_009457	TGC	2	6	345857	345862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147673483
5991	NC_009457	AGC	2	6	345940	345945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147673483
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5999	NC_009457	CTG	2	6	346285	346290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147674991
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