MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O395 chromosome 1

Total Repeats: 17997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009456	CTG	2	6	354611	354616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672068
6002	NC_009456	CAC	2	6	354620	354625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672068
6003	NC_009456	AG	3	6	354709	354714	50 %	0 %	50 %	0 %	147672068
6004	NC_009456	AAG	2	6	354720	354725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672068
6005	NC_009456	CTC	2	6	354899	354904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	147671953
6006	NC_009456	GGC	2	6	354942	354947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671953
6007	NC_009456	TTCT	2	8	354980	354987	0 %	75 %	0 %	25 %	147671953
6008	NC_009456	TGA	2	6	355033	355038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147671953
6009	NC_009456	ACG	3	9	355093	355101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671953
6010	NC_009456	TTC	2	6	355110	355115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671953
6011	NC_009456	CG	3	6	355129	355134	0 %	0 %	50 %	50 %	147671953
6012	NC_009456	GTGTT	2	10	355144	355153	0 %	60 %	40 %	0 %	147671953
6013	NC_009456	TGAG	2	8	355225	355232	25 %	25 %	50 %	0 %	147671953
6014	NC_009456	CG	3	6	355237	355242	0 %	0 %	50 %	50 %	147671953
6015	NC_009456	GCT	2	6	355253	355258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671953
6016	NC_009456	CTT	2	6	355346	355351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671953
6017	NC_009456	CTT	2	6	355391	355396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671953
6018	NC_009456	CTG	2	6	355425	355430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671953
6019	NC_009456	AAT	2	6	355493	355498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671953
6020	NC_009456	AGC	2	6	355531	355536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671953
6021	NC_009456	CGC	2	6	355578	355583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671953
6022	NC_009456	TTG	2	6	355700	355705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672216
6023	NC_009456	AAG	3	9	355719	355727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672216
6024	NC_009456	GCAACC	2	12	355776	355787	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	147672216
6025	NC_009456	GAT	2	6	355855	355860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672216
6026	NC_009456	CCA	2	6	355867	355872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672216
6027	NC_009456	CAC	2	6	355892	355897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672216
6028	NC_009456	ATC	2	6	355965	355970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672216
6029	NC_009456	TC	3	6	355969	355974	0 %	50 %	0 %	50 %	147672216
6030	NC_009456	GC	3	6	356006	356011	0 %	0 %	50 %	50 %	147672216
6031	NC_009456	GTC	2	6	356112	356117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672216
6032	NC_009456	GCA	2	6	356158	356163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672216
6033	NC_009456	TCGC	2	8	356169	356176	0 %	25 %	25 %	50 %	147672216
6034	NC_009456	CCAG	2	8	356229	356236	25 %	0 %	25 %	50 %	147672216
6035	NC_009456	GC	3	6	356302	356307	0 %	0 %	50 %	50 %	147672216
6036	NC_009456	GCA	2	6	356329	356334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672216
6037	NC_009456	AGGC	2	8	356351	356358	25 %	0 %	50 %	25 %	147672216
6038	NC_009456	AG	3	6	356403	356408	50 %	0 %	50 %	0 %	147672216
6039	NC_009456	GAG	2	6	356415	356420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	147672216
6040	NC_009456	ATG	2	6	356427	356432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672216
6041	NC_009456	CAAC	2	8	356500	356507	50 %	0 %	0 %	50 %	147672216
6042	NC_009456	GCGT	2	8	356518	356525	0 %	25 %	50 %	25 %	147672216
6043	NC_009456	AGA	2	6	356656	356661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	147672216
6044	NC_009456	CAG	2	6	356734	356739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671602
6045	NC_009456	CTT	2	6	356757	356762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671602
6046	NC_009456	GCC	2	6	356782	356787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147671602
6047	NC_009456	CTG	2	6	356832	356837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671602
6048	NC_009456	C	6	6	356882	356887	0 %	0 %	0 %	100 %	147671602
6049	NC_009456	AAT	2	6	357013	357018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671602
6050	NC_009456	TAA	2	6	357073	357078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671602
6051	NC_009456	CTG	3	9	357130	357138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671602
6052	NC_009456	GTT	2	6	357165	357170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671602
6053	NC_009456	GTT	2	6	357270	357275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147671602
6054	NC_009456	TAA	2	6	357334	357339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671602
6055	NC_009456	GCG	2	6	357355	357360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147671602
6056	NC_009456	GGTA	2	8	357373	357380	25 %	25 %	50 %	0 %	147671602
6057	NC_009456	GA	3	6	357385	357390	50 %	0 %	50 %	0 %	147671602
6058	NC_009456	CCA	2	6	357420	357425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671602
6059	NC_009456	TGC	2	6	357428	357433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147671602
6060	NC_009456	TCAGT	2	10	357453	357462	20 %	40 %	20 %	20 %	147671602
6061	NC_009456	GCA	2	6	357517	357522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147671602
6062	NC_009456	TAA	2	6	357529	357534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147671602
6063	NC_009456	TAA	2	6	357590	357595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	147672244
6064	NC_009456	TTG	2	6	357647	357652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	147672244
6065	NC_009456	CGG	2	6	357670	357675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672244
6066	NC_009456	TTCA	2	8	357818	357825	25 %	50 %	0 %	25 %	147672244
6067	NC_009456	CAG	2	6	357887	357892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672244
6068	NC_009456	GAT	2	6	357914	357919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672244
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6070	NC_009456	GGC	2	6	358237	358242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	147672293
6071	NC_009456	CGC	2	6	358375	358380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672293
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6078	NC_009456	TTGAT	2	10	358819	358828	20 %	60 %	20 %	0 %	147671825
6079	NC_009456	CCAA	2	8	358841	358848	50 %	0 %	0 %	50 %	147671825
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6089	NC_009456	TTC	2	6	359917	359922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147672487
6090	NC_009456	TGG	2	6	359945	359950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147672487
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6092	NC_009456	G	6	6	360043	360048	0 %	0 %	100 %	0 %	147672487
6093	NC_009456	CT	3	6	360061	360066	0 %	50 %	0 %	50 %	147672487
6094	NC_009456	TGA	2	6	360165	360170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672487
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6099	NC_009456	GATT	2	8	360417	360424	25 %	50 %	25 %	0 %	147672487
6100	NC_009456	TCG	2	6	360434	360439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	147672487
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6102	NC_009456	CAT	2	6	360553	360558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147672487
6103	NC_009456	GCGG	2	8	360664	360671	0 %	0 %	75 %	25 %	147672487
6104	NC_009456	ATG	2	6	360757	360762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	147672487
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6106	NC_009456	CAC	2	6	360856	360861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147672487
6107	NC_009456	CAA	2	6	360901	360906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147672487
6108	NC_009456	CCG	2	6	360950	360955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	147672487
6109	NC_009456	ATTC	2	8	361003	361010	25 %	50 %	0 %	25 %	147672487
6110	NC_009456	CAG	2	6	361024	361029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	147672487
6111	NC_009456	GCATAA	2	12	361036	361047	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	147672487
6112	NC_009456	ACA	2	6	361076	361081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	147671834
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6114	NC_009456	TTA	2	6	361116	361121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	147671834
6115	NC_009456	GGT	2	6	361196	361201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	147671834
6116	NC_009456	CAC	2	6	361256	361261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	147671834
6117	NC_009456	TAC	2	6	361332	361337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671834
6118	NC_009456	ACT	2	6	361438	361443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	147671834
6119	NC_009456	CTT	2	6	361448	361453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	147671834
6120	NC_009456	ATCT	2	8	361482	361489	25 %	50 %	0 %	25 %	147671834
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