MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Vibrio vulnificus YJ016 plasmid pYJ016

Total Repeats: 840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005128	CAC	2	6	25574	25579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	37595847
502	NC_005128	GAA	2	6	25608	25613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	37595847
503	NC_005128	ATG	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595847
504	NC_005128	ACC	2	6	25674	25679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	37595847
505	NC_005128	GTG	2	6	25707	25712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	37595847
506	NC_005128	CTT	2	6	25745	25750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595847
507	NC_005128	CA	3	6	25883	25888	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
508	NC_005128	CAT	2	6	25904	25909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595847
509	NC_005128	GA	3	6	25927	25932	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
510	NC_005128	CGAG	2	8	25948	25955	25 %	0 %	50 %	25 %	37595847
511	NC_005128	CCG	2	6	25993	25998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	37595847
512	NC_005128	CA	3	6	26132	26137	50 %	0 %	0 %	50 %	37595847
513	NC_005128	AAAG	2	8	26160	26167	75 %	0 %	25 %	0 %	37595847
514	NC_005128	ACC	2	6	26217	26222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	37595847
515	NC_005128	GTG	2	6	26275	26280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	37595847
516	NC_005128	TTA	2	6	26355	26360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	37595847
517	NC_005128	ACCAA	2	10	26366	26375	60 %	0 %	0 %	40 %	37595847
518	NC_005128	TTGGCA	2	12	26404	26415	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	37595847
519	NC_005128	CTCA	2	8	26489	26496	25 %	25 %	0 %	50 %	37595847
520	NC_005128	ATG	2	6	26505	26510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595847
521	NC_005128	ATGA	2	8	26541	26548	50 %	25 %	25 %	0 %	37595847
522	NC_005128	GGA	2	6	26588	26593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	37595847
523	NC_005128	CAC	2	6	26621	26626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	37595847
524	NC_005128	GAA	2	6	26649	26654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	37595847
525	NC_005128	AGCC	2	8	26679	26686	25 %	0 %	25 %	50 %	37595847
526	NC_005128	TAA	2	6	26732	26737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595847
527	NC_005128	TAAC	2	8	26812	26819	50 %	25 %	0 %	25 %	37595847
528	NC_005128	CAA	2	6	26825	26830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	37595847
529	NC_005128	GA	3	6	26956	26961	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
530	NC_005128	CAT	2	6	26975	26980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595847
531	NC_005128	ATT	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	37595847
532	NC_005128	AACATC	2	12	27072	27083	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	37595847
533	NC_005128	CAT	2	6	27101	27106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595847
534	NC_005128	ATC	2	6	27159	27164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595847
535	NC_005128	ATTCA	2	10	27186	27195	40 %	40 %	0 %	20 %	37595847
536	NC_005128	GAT	2	6	27201	27206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595847
537	NC_005128	AG	3	6	27245	27250	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
538	NC_005128	ACA	2	6	27253	27258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	37595847
539	NC_005128	TCA	2	6	27296	27301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595847
540	NC_005128	TGA	2	6	27329	27334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595847
541	NC_005128	A	6	6	27336	27341	100 %	0 %	0 %	0 %	37595847
542	NC_005128	AGAA	2	8	27421	27428	75 %	0 %	25 %	0 %	37595847
543	NC_005128	GGA	2	6	27437	27442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	37595847
544	NC_005128	AG	3	6	27456	27461	50 %	0 %	50 %	0 %	37595847
545	NC_005128	ATA	2	6	27470	27475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595847
546	NC_005128	T	8	8	27498	27505	0 %	100 %	0 %	0 %	37595848
547	NC_005128	TCA	2	6	27520	27525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595848
548	NC_005128	TAA	2	6	27589	27594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595848
549	NC_005128	AAATTT	2	12	27619	27630	50 %	50 %	0 %	0 %	37595848
550	NC_005128	ATC	2	6	27696	27701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595848
551	NC_005128	CTT	2	6	27789	27794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595848
552	NC_005128	GTG	2	6	28198	28203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	37595849
553	NC_005128	TG	3	6	28202	28207	0 %	50 %	50 %	0 %	37595849
554	NC_005128	GA	3	6	28268	28273	50 %	0 %	50 %	0 %	37595849
555	NC_005128	A	6	6	28292	28297	100 %	0 %	0 %	0 %	37595849
556	NC_005128	GT	3	6	28404	28409	0 %	50 %	50 %	0 %	37595850
557	NC_005128	AAT	2	6	28426	28431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595850
558	NC_005128	ACT	2	6	28724	28729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595850
559	NC_005128	TAA	2	6	28751	28756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595850
560	NC_005128	TCA	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595850
561	NC_005128	AGA	2	6	28973	28978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	37595851
562	NC_005128	TCA	2	6	29079	29084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595851
563	NC_005128	GAT	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595851
564	NC_005128	TTC	2	6	29186	29191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595851
565	NC_005128	ATT	2	6	29222	29227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	37595851
566	NC_005128	TTGA	2	8	29373	29380	25 %	50 %	25 %	0 %	37595851
567	NC_005128	ATC	2	6	29447	29452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595851
568	NC_005128	ATT	2	6	29477	29482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	37595851
569	NC_005128	ATG	2	6	29582	29587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595851
570	NC_005128	A	6	6	29647	29652	100 %	0 %	0 %	0 %	37595851
571	NC_005128	TTA	2	6	29673	29678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	37595851
572	NC_005128	T	6	6	29699	29704	0 %	100 %	0 %	0 %	37595851
573	NC_005128	ACA	2	6	29739	29744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	37595851
574	NC_005128	ATC	2	6	29753	29758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595851
575	NC_005128	CAT	2	6	29797	29802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595851
576	NC_005128	CTC	2	6	29876	29881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	37595851
577	NC_005128	ATC	2	6	29909	29914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595851
578	NC_005128	GATA	2	8	29923	29930	50 %	25 %	25 %	0 %	37595851
579	NC_005128	CAA	2	6	30060	30065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	37595851
580	NC_005128	TCA	2	6	30066	30071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595851
581	NC_005128	TTC	2	6	30135	30140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595851
582	NC_005128	T	8	8	30186	30193	0 %	100 %	0 %	0 %	37595851
583	NC_005128	GCG	2	6	30256	30261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	37595851
584	NC_005128	TTG	2	6	30308	30313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	37595851
585	NC_005128	GCTC	2	8	30665	30672	0 %	25 %	25 %	50 %	37595852
586	NC_005128	AAT	2	6	30784	30789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595852
587	NC_005128	AAAAT	2	10	30800	30809	80 %	20 %	0 %	0 %	37595852
588	NC_005128	T	6	6	30891	30896	0 %	100 %	0 %	0 %	37595853
589	NC_005128	ATG	2	6	30938	30943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	37595853
590	NC_005128	TA	3	6	30990	30995	50 %	50 %	0 %	0 %	37595853
591	NC_005128	TGTT	2	8	31015	31022	0 %	75 %	25 %	0 %	37595853
592	NC_005128	CAG	2	6	31149	31154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	37595853
593	NC_005128	GCT	2	6	31290	31295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	37595854
594	NC_005128	CA	3	6	31338	31343	50 %	0 %	0 %	50 %	37595854
595	NC_005128	CGCTT	2	10	31365	31374	0 %	40 %	20 %	40 %	37595854
596	NC_005128	CG	3	6	31478	31483	0 %	0 %	50 %	50 %	37595854
597	NC_005128	TA	3	6	31557	31562	50 %	50 %	0 %	0 %	37595854
598	NC_005128	T	6	6	31615	31620	0 %	100 %	0 %	0 %	37595856
599	NC_005128	GA	3	6	31634	31639	50 %	0 %	50 %	0 %	37595856
600	NC_005128	CTC	2	6	31646	31651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	37595856
601	NC_005128	AGTG	2	8	31721	31728	25 %	25 %	50 %	0 %	37595856
602	NC_005128	CGA	2	6	31740	31745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	37595856
603	NC_005128	TCT	2	6	31752	31757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595856
604	NC_005128	GAA	2	6	31782	31787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	37595856
605	NC_005128	CAAT	2	8	31795	31802	50 %	25 %	0 %	25 %	37595856
606	NC_005128	GCA	2	6	31873	31878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	37595857
607	NC_005128	TTC	2	6	31891	31896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595857
608	NC_005128	TCT	3	9	31910	31918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	37595857
609	NC_005128	C	6	6	31954	31959	0 %	0 %	0 %	100 %	37595857
610	NC_005128	TAA	2	6	32088	32093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	37595859
611	NC_005128	TGC	2	6	32165	32170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	37595859
612	NC_005128	ACG	2	6	32279	32284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	37595859
613	NC_005128	AAATCA	2	12	32294	32305	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	37595859
614	NC_005128	GTT	2	6	32325	32330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	37595859
615	NC_005128	TTG	2	6	32401	32406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	37595859
616	NC_005128	T	6	6	32424	32429	0 %	100 %	0 %	0 %	37595860
617	NC_005128	CCTC	2	8	32519	32526	0 %	25 %	0 %	75 %	37595860
618	NC_005128	CTTT	2	8	32547	32554	0 %	75 %	0 %	25 %	37595860
619	NC_005128	CAT	2	6	32563	32568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	37595860
620	NC_005128	AGA	2	6	32644	32649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	37595860
621	NC_005128	T	6	6	32690	32695	0 %	100 %	0 %	0 %	37595860
622	NC_005128	T	6	6	32748	32753	0 %	100 %	0 %	0 %	37595861
623	NC_005128	TGAAA	2	10	32765	32774	60 %	20 %	20 %	0 %	37595861
624	NC_005128	CAC	2	6	32883	32888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	37595861
625	NC_005128	AGAGAT	2	12	32917	32928	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	37595861
626	NC_005128	GCT	2	6	32930	32935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	37595861
627	NC_005128	CCT	2	6	32939	32944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	37595861
628	NC_005128	AGCGAT	2	12	33015	33026	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	37595861
629	NC_005128	T	6	6	33075	33080	0 %	100 %	0 %	0 %	37595861
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631	NC_005128	CAA	2	6	33129	33134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	37595861
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