MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004605	TGA	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899856
2	NC_004605	A	6	6	1163	1168	100 %	0 %	0 %	0 %	28899856
3	NC_004605	AAG	2	6	1185	1190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899856
4	NC_004605	CTG	2	6	1229	1234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899856
5	NC_004605	CAG	2	6	1317	1322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899856
6	NC_004605	CAA	2	6	1340	1345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899856
7	NC_004605	TTG	2	6	1352	1357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899856
8	NC_004605	TGC	2	6	1383	1388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899856
9	NC_004605	TGC	2	6	1478	1483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899856
10	NC_004605	CAA	2	6	1526	1531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899856
11	NC_004605	TTG	2	6	1612	1617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899856
12	NC_004605	CCA	2	6	1639	1644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899856
13	NC_004605	ATG	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899856
14	NC_004605	CAC	2	6	1718	1723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899856
15	NC_004605	GAT	2	6	1819	1824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899856
16	NC_004605	TGA	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899856
17	NC_004605	GTT	2	6	1842	1847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899856
18	NC_004605	ATC	2	6	1871	1876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899856
19	NC_004605	CGC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899856
20	NC_004605	A	6	6	1960	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	28899856
21	NC_004605	ATCG	2	8	2002	2009	25 %	25 %	25 %	25 %	28899856
22	NC_004605	CCGCTT	2	12	2091	2102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	28899856
23	NC_004605	AGA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899856
24	NC_004605	CGT	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899856
25	NC_004605	GAA	2	6	2212	2217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899856
26	NC_004605	CTA	2	6	2218	2223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899856
27	NC_004605	ATT	2	6	2231	2236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899856
28	NC_004605	TCT	2	6	2237	2242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899856
29	NC_004605	CCA	2	6	2248	2253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899856
30	NC_004605	AC	3	6	2322	2327	50 %	0 %	0 %	50 %	28899856
31	NC_004605	TGC	2	6	2555	2560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899856
32	NC_004605	CAAC	2	8	2579	2586	50 %	0 %	0 %	50 %	28899856
33	NC_004605	CAG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899856
34	NC_004605	CAT	2	6	2673	2678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899856
35	NC_004605	AAAG	2	8	2750	2757	75 %	0 %	25 %	0 %	28899856
36	NC_004605	TGA	2	6	2778	2783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899856
37	NC_004605	TCAA	2	8	2875	2882	50 %	25 %	0 %	25 %	28899856
38	NC_004605	AGA	2	6	2883	2888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899856
39	NC_004605	TGT	2	6	3500	3505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899857
40	NC_004605	CATC	2	8	3710	3717	25 %	25 %	0 %	50 %	28899857
41	NC_004605	CAG	2	6	3722	3727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899857
42	NC_004605	TTG	2	6	3742	3747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899857
43	NC_004605	AGG	2	6	3861	3866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28899857
44	NC_004605	CAT	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899857
45	NC_004605	TCA	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899858
46	NC_004605	CTG	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899858
47	NC_004605	AGT	2	6	3980	3985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899858
48	NC_004605	CAA	2	6	4044	4049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899858
49	NC_004605	CGTG	2	8	4085	4092	0 %	25 %	50 %	25 %	28899858
50	NC_004605	TTC	2	6	4134	4139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899858
51	NC_004605	ATT	2	6	4279	4284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899858
52	NC_004605	CGCTGA	2	12	4321	4332	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28899858
53	NC_004605	CCG	2	6	4333	4338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28899858
54	NC_004605	TCT	2	6	4369	4374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899858
55	NC_004605	CCA	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899858
56	NC_004605	TCC	2	6	4399	4404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28899858
57	NC_004605	TGC	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899858
58	NC_004605	GAT	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899858
59	NC_004605	TG	3	6	4479	4484	0 %	50 %	50 %	0 %	28899858
60	NC_004605	TCGTG	2	10	4552	4561	0 %	40 %	40 %	20 %	28899858
61	NC_004605	TCGC	2	8	4606	4613	0 %	25 %	25 %	50 %	28899858
62	NC_004605	TCT	2	6	4735	4740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899858
63	NC_004605	TTG	2	6	4820	4825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899859
64	NC_004605	GCT	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899859
65	NC_004605	ATG	2	6	4950	4955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899859
66	NC_004605	TCA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899859
67	NC_004605	TGA	2	6	4999	5004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899859
68	NC_004605	TTC	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899859
69	NC_004605	TC	3	6	5028	5033	0 %	50 %	0 %	50 %	28899859
70	NC_004605	TTG	2	6	5045	5050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899859
71	NC_004605	TC	3	6	5056	5061	0 %	50 %	0 %	50 %	28899859
72	NC_004605	CAC	3	9	5066	5074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899859
73	NC_004605	ATG	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899859
74	NC_004605	TGA	3	9	5265	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899859
75	NC_004605	GC	3	6	5368	5373	0 %	0 %	50 %	50 %	28899859
76	NC_004605	CCA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899859
77	NC_004605	GGC	2	6	5445	5450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899859
78	NC_004605	CCAA	2	8	5669	5676	50 %	0 %	0 %	50 %	28899859
79	NC_004605	ATT	2	6	5688	5693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899859
80	NC_004605	GAA	4	12	6085	6096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899860
81	NC_004605	CAG	2	6	6128	6133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899860
82	NC_004605	GAA	2	6	6190	6195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899860
83	NC_004605	TTG	2	6	6429	6434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899861
84	NC_004605	ATC	2	6	6444	6449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899861
85	NC_004605	CCA	2	6	6564	6569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28899861
86	NC_004605	ACT	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899861
87	NC_004605	TTG	2	6	6597	6602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899861
88	NC_004605	ACA	2	6	6699	6704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899861
89	NC_004605	TCC	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28899861
90	NC_004605	GGA	2	6	6836	6841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28899861
91	NC_004605	TGA	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899861
92	NC_004605	AAGCT	2	10	6939	6948	40 %	20 %	20 %	20 %	28899861
93	NC_004605	ATG	2	6	6971	6976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899861
94	NC_004605	TCG	2	6	7149	7154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899861
95	NC_004605	GCG	2	6	7164	7169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899861
96	NC_004605	TGC	2	6	7170	7175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899861
97	NC_004605	AGG	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28899861
98	NC_004605	CAA	2	6	7213	7218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899861
99	NC_004605	GAT	2	6	7241	7246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899861
100	NC_004605	TGC	2	6	7285	7290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899861
101	NC_004605	TGA	2	6	7356	7361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899861
102	NC_004605	CAA	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28899861
103	NC_004605	CA	3	6	7398	7403	50 %	0 %	0 %	50 %	28899861
104	NC_004605	AAG	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899861
105	NC_004605	CAAC	2	8	7450	7457	50 %	0 %	0 %	50 %	28899861
106	NC_004605	CAAA	2	8	7476	7483	75 %	0 %	0 %	25 %	28899861
107	NC_004605	TTG	2	6	7509	7514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899861
108	NC_004605	TC	3	6	7663	7668	0 %	50 %	0 %	50 %	28899863
109	NC_004605	TAA	2	6	7699	7704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899863
110	NC_004605	AGAT	2	8	7743	7750	50 %	25 %	25 %	0 %	28899863
111	NC_004605	GCG	2	6	7893	7898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899863
112	NC_004605	A	6	6	7940	7945	100 %	0 %	0 %	0 %	28899863
113	NC_004605	AGC	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899863
114	NC_004605	CTG	2	6	8037	8042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899863
115	NC_004605	TTC	2	6	8138	8143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28899863
116	NC_004605	GTT	2	6	8257	8262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899863
117	NC_004605	TTG	2	6	8267	8272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899863
118	NC_004605	CTTG	2	8	8289	8296	0 %	50 %	25 %	25 %	28899863
119	NC_004605	TAA	2	6	8310	8315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28899863
120	NC_004605	GCG	2	6	8328	8333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899863
121	NC_004605	ACTG	2	8	8342	8349	25 %	25 %	25 %	25 %	28899863
122	NC_004605	ATCCT	2	10	8388	8397	20 %	40 %	0 %	40 %	28899863
123	NC_004605	AAG	2	6	8582	8587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899864
124	NC_004605	ATC	2	6	8755	8760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899864
125	NC_004605	A	6	6	8828	8833	100 %	0 %	0 %	0 %	28899864
126	NC_004605	T	6	6	8905	8910	0 %	100 %	0 %	0 %	28899864
127	NC_004605	CGGTG	2	10	9006	9015	0 %	20 %	60 %	20 %	28899864
128	NC_004605	GCG	2	6	9026	9031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28899864
129	NC_004605	TGA	2	6	9075	9080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899864
130	NC_004605	TTG	2	6	9088	9093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28899864
131	NC_004605	ATT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899864
132	NC_004605	GCT	2	6	9258	9263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899864
133	NC_004605	GCA	2	6	9285	9290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899864
134	NC_004605	ATC	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899864
135	NC_004605	ATT	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28899864
136	NC_004605	GAT	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899864
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138	NC_004605	GCA	2	6	9459	9464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28899864
139	NC_004605	ACTT	2	8	9554	9561	25 %	50 %	0 %	25 %	28899864
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144	NC_004605	CAT	2	6	9792	9797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899864
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152	NC_004605	ATC	2	6	10195	10200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28899864
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159	NC_004605	CGT	2	6	10522	10527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28899865
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162	NC_004605	AGA	2	6	10574	10579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28899865
163	NC_004605	TGA	2	6	10604	10609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28899865
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