MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 31127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004605	A	6	6	244645	244650	100 %	0 %	0 %	0 %	28900094
4002	NC_004605	CAA	2	6	244698	244703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900094
4003	NC_004605	CTTTG	2	10	244717	244726	0 %	60 %	20 %	20 %	28900094
4004	NC_004605	CT	3	6	244785	244790	0 %	50 %	0 %	50 %	28900094
4005	NC_004605	TC	3	6	244882	244887	0 %	50 %	0 %	50 %	28900094
4006	NC_004605	GTG	2	6	245002	245007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900094
4007	NC_004605	TTTGGG	2	12	245031	245042	0 %	50 %	50 %	0 %	28900094
4008	NC_004605	ATG	2	6	245060	245065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900094
4009	NC_004605	AAC	2	6	245068	245073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900094
4010	NC_004605	GCA	2	6	245200	245205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900094
4011	NC_004605	TTC	2	6	245233	245238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900094
4012	NC_004605	CTG	2	6	245264	245269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900094
4013	NC_004605	TTGT	2	8	245290	245297	0 %	75 %	25 %	0 %	28900094
4014	NC_004605	ACC	2	6	245308	245313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28900094
4015	NC_004605	GTA	2	6	245323	245328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900094
4016	NC_004605	GCT	2	6	245404	245409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900094
4017	NC_004605	TGA	2	6	245420	245425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900094
4018	NC_004605	TTG	2	6	245552	245557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900095
4019	NC_004605	CTACG	2	10	245731	245740	20 %	20 %	20 %	40 %	28900095
4020	NC_004605	GC	3	6	245845	245850	0 %	0 %	50 %	50 %	28900095
4021	NC_004605	AGAC	2	8	245910	245917	50 %	0 %	25 %	25 %	28900095
4022	NC_004605	TTTGA	2	10	245974	245983	20 %	60 %	20 %	0 %	28900095
4023	NC_004605	TGGTG	2	10	246018	246027	0 %	40 %	60 %	0 %	28900095
4024	NC_004605	AGA	2	6	246032	246037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900095
4025	NC_004605	CTTG	2	8	246063	246070	0 %	50 %	25 %	25 %	28900095
4026	NC_004605	GTT	2	6	246118	246123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900095
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4028	NC_004605	TCAA	2	8	246218	246225	50 %	25 %	0 %	25 %	28900095
4029	NC_004605	T	6	6	246299	246304	0 %	100 %	0 %	0 %	28900096
4030	NC_004605	GCTG	2	8	246342	246349	0 %	25 %	50 %	25 %	28900096
4031	NC_004605	TCG	2	6	246532	246537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900096
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4033	NC_004605	TGG	2	6	246730	246735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900096
4034	NC_004605	TGG	2	6	246799	246804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900096
4035	NC_004605	AGCA	2	8	246832	246839	50 %	0 %	25 %	25 %	28900096
4036	NC_004605	TCT	2	6	246871	246876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900096
4037	NC_004605	TGGC	2	8	246988	246995	0 %	25 %	50 %	25 %	28900096
4038	NC_004605	ATG	2	6	246999	247004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900096
4039	NC_004605	CGATGA	2	12	247033	247044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28900096
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4041	NC_004605	TGT	2	6	247180	247185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900096
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4043	NC_004605	CTG	2	6	247366	247371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900097
4044	NC_004605	GTA	2	6	247445	247450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900097
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4047	NC_004605	TTGG	2	8	247737	247744	0 %	50 %	50 %	0 %	28900097
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4051	NC_004605	CGT	2	6	248067	248072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900098
4052	NC_004605	TG	3	6	248081	248086	0 %	50 %	50 %	0 %	28900098
4053	NC_004605	T	6	6	248198	248203	0 %	100 %	0 %	0 %	28900098
4054	NC_004605	GTT	2	6	248213	248218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900098
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4056	NC_004605	GT	3	6	248299	248304	0 %	50 %	50 %	0 %	28900098
4057	NC_004605	GCA	2	6	248329	248334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900098
4058	NC_004605	CTT	2	6	248350	248355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900098
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4062	NC_004605	TGT	2	6	248617	248622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900098
4063	NC_004605	GTA	2	6	248648	248653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900098
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4070	NC_004605	T	6	6	249019	249024	0 %	100 %	0 %	0 %	28900099
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4072	NC_004605	AAGC	2	8	249149	249156	50 %	0 %	25 %	25 %	28900100
4073	NC_004605	CTTGAA	2	12	249158	249169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28900100
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4089	NC_004605	TGC	2	6	249664	249669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900100
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4093	NC_004605	TGG	2	6	249882	249887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900100
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4105	NC_004605	CAG	2	6	250497	250502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900100
4106	NC_004605	CT	4	8	250599	250606	0 %	50 %	0 %	50 %	28900101
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4109	NC_004605	AGCAG	2	10	250776	250785	40 %	0 %	40 %	20 %	28900101
4110	NC_004605	CA	3	6	250787	250792	50 %	0 %	0 %	50 %	28900101
4111	NC_004605	ACG	2	6	250847	250852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900101
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4116	NC_004605	GC	3	6	251015	251020	0 %	0 %	50 %	50 %	28900101
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4119	NC_004605	CG	3	6	251124	251129	0 %	0 %	50 %	50 %	28900101
4120	NC_004605	CTG	2	6	251185	251190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900101
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4122	NC_004605	TAAACC	2	12	251306	251317	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	28900101
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4124	NC_004605	TTG	2	6	251441	251446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28900101
4125	NC_004605	GCG	2	6	251485	251490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28900101
4126	NC_004605	AGGCA	2	10	251571	251580	40 %	0 %	40 %	20 %	28900101
4127	NC_004605	GGTT	2	8	251589	251596	0 %	50 %	50 %	0 %	28900101
4128	NC_004605	AAC	2	6	251662	251667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900101
4129	NC_004605	GCA	2	6	251731	251736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900101
4130	NC_004605	TGAC	2	8	251747	251754	25 %	25 %	25 %	25 %	28900101
4131	NC_004605	AGC	2	6	252163	252168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900102
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4133	NC_004605	A	7	7	252221	252227	100 %	0 %	0 %	0 %	28900102
4134	NC_004605	TGG	2	6	252256	252261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28900102
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4141	NC_004605	GAC	2	6	252692	252697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900103
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4233	NC_004605	ATC	3	9	257988	257996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28900108
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4235	NC_004605	A	6	6	258029	258034	100 %	0 %	0 %	0 %	28900108
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4241	NC_004605	GAT	2	6	258505	258510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900109
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4243	NC_004605	TCC	2	6	258697	258702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28900109
4244	NC_004605	GA	3	6	258724	258729	50 %	0 %	50 %	0 %	28900109
4245	NC_004605	TGC	2	6	258771	258776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900109
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4247	NC_004605	AGA	2	6	258811	258816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28900109
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4355	NC_004605	CGA	2	6	265179	265184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900118
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4361	NC_004605	CTT	2	6	265569	265574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28900118
4362	NC_004605	CTC	2	6	265606	265611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28900118
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4373	NC_004605	GCA	2	6	266609	266614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900120
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4493	NC_004605	AC	3	6	272912	272917	50 %	0 %	0 %	50 %	28900128
4494	NC_004605	CAAC	2	8	272934	272941	50 %	0 %	0 %	50 %	28900128
4495	NC_004605	ATGA	2	8	272950	272957	50 %	25 %	25 %	0 %	28900128
4496	NC_004605	CTG	2	6	272966	272971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28900128
4497	NC_004605	AAC	2	6	273120	273125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28900128
4498	NC_004605	GCA	2	6	273140	273145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28900128
4499	NC_004605	TCGG	2	8	273286	273293	0 %	25 %	50 %	25 %	28900128
4500	NC_004605	TGA	2	6	273357	273362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28900128

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