MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 55148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_004603	TTG	2	6	89178	89183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896852
1503	NC_004603	CAA	2	6	89187	89192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896852
1504	NC_004603	CAC	2	6	89213	89218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896852
1505	NC_004603	ATCACC	2	12	89275	89286	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	28896852
1506	NC_004603	ATG	2	6	89287	89292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896852
1507	NC_004603	GTT	2	6	89327	89332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896852
1508	NC_004603	GGC	2	6	89369	89374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896852
1509	NC_004603	TGT	3	9	89562	89570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896853
1510	NC_004603	TG	3	6	89597	89602	0 %	50 %	50 %	0 %	28896853
1511	NC_004603	TGG	3	9	89682	89690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896853
1512	NC_004603	ACG	2	6	89711	89716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896853
1513	NC_004603	CAGC	2	8	89720	89727	25 %	0 %	25 %	50 %	28896853
1514	NC_004603	TGC	2	6	89891	89896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896853
1515	NC_004603	GAA	2	6	89965	89970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896853
1516	NC_004603	TGG	2	6	90017	90022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896853
1517	NC_004603	GTTTG	2	10	90090	90099	0 %	60 %	40 %	0 %	28896853
1518	NC_004603	CGG	2	6	90116	90121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896853
1519	NC_004603	AGA	2	6	90147	90152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896853
1520	NC_004603	AGA	2	6	90156	90161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896853
1521	NC_004603	CCG	2	6	90203	90208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28896853
1522	NC_004603	AAG	2	6	90227	90232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896853
1523	NC_004603	TGT	2	6	90236	90241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896853
1524	NC_004603	AATC	2	8	90379	90386	50 %	25 %	0 %	25 %	28896853
1525	NC_004603	CGG	2	6	90560	90565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896853
1526	NC_004603	GTG	2	6	90578	90583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896853
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1528	NC_004603	GGTT	2	8	90670	90677	0 %	50 %	50 %	0 %	28896853
1529	NC_004603	TTG	2	6	90849	90854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896854
1530	NC_004603	TTG	2	6	90900	90905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896854
1531	NC_004603	CAG	2	6	90967	90972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896854
1532	NC_004603	TCT	2	6	90981	90986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896854
1533	NC_004603	GGC	2	6	91008	91013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896854
1534	NC_004603	TCG	2	6	91047	91052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896854
1535	NC_004603	CGCT	2	8	91064	91071	0 %	25 %	25 %	50 %	28896854
1536	NC_004603	GT	3	6	91077	91082	0 %	50 %	50 %	0 %	28896854
1537	NC_004603	T	6	6	91123	91128	0 %	100 %	0 %	0 %	28896854
1538	NC_004603	GTTTTG	2	12	91149	91160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896854
1539	NC_004603	CGA	2	6	91204	91209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896854
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1541	NC_004603	TTC	2	6	91292	91297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896854
1542	NC_004603	CGC	2	6	91325	91330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28896854
1543	NC_004603	GCA	2	6	91402	91407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896854
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1545	NC_004603	GCTT	2	8	91470	91477	0 %	50 %	25 %	25 %	28896854
1546	NC_004603	CAC	2	6	91567	91572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896854
1547	NC_004603	TGC	2	6	91593	91598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896854
1548	NC_004603	CGCT	2	8	91602	91609	0 %	25 %	25 %	50 %	28896854
1549	NC_004603	GATG	2	8	91615	91622	25 %	25 %	50 %	0 %	28896854
1550	NC_004603	CAA	2	6	91660	91665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896854
1551	NC_004603	CGG	2	6	91695	91700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896854
1552	NC_004603	TGG	2	6	91768	91773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896854
1553	NC_004603	ATA	2	6	91805	91810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896854
1554	NC_004603	TCA	2	6	91888	91893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896854
1555	NC_004603	GC	3	6	91915	91920	0 %	0 %	50 %	50 %	28896854
1556	NC_004603	TGA	3	9	91927	91935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896854
1557	NC_004603	GTGA	2	8	91988	91995	25 %	25 %	50 %	0 %	28896854
1558	NC_004603	CGA	2	6	92035	92040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896854
1559	NC_004603	CAATC	2	10	92047	92056	40 %	20 %	0 %	40 %	28896854
1560	NC_004603	AAG	2	6	92104	92109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896854
1561	NC_004603	TACT	2	8	92626	92633	25 %	50 %	0 %	25 %	28896855
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1565	NC_004603	A	6	6	92868	92873	100 %	0 %	0 %	0 %	28896855
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1570	NC_004603	A	6	6	93026	93031	100 %	0 %	0 %	0 %	28896855
1571	NC_004603	ATA	2	6	93100	93105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896855
1572	NC_004603	GTT	2	6	93141	93146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896855
1573	NC_004603	TAA	2	6	93150	93155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896855
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1578	NC_004603	ATTT	2	8	93397	93404	25 %	75 %	0 %	0 %	28896857
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1589	NC_004603	CGAT	2	8	93862	93869	25 %	25 %	25 %	25 %	28896858
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1592	NC_004603	GGCA	2	8	94031	94038	25 %	0 %	50 %	25 %	28896858
1593	NC_004603	CAG	2	6	94062	94067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896858
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1595	NC_004603	GTTGC	2	10	94174	94183	0 %	40 %	40 %	20 %	28896859
1596	NC_004603	GCT	2	6	94186	94191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896859
1597	NC_004603	CTG	2	6	94222	94227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896859
1598	NC_004603	CATC	2	8	94283	94290	25 %	25 %	0 %	50 %	28896859
1599	NC_004603	TGG	2	6	94321	94326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896859
1600	NC_004603	CATT	2	8	94337	94344	25 %	50 %	0 %	25 %	28896859
1601	NC_004603	GA	3	6	94381	94386	50 %	0 %	50 %	0 %	28896859
1602	NC_004603	TCCC	2	8	94400	94407	0 %	25 %	0 %	75 %	28896859
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1606	NC_004603	TGAC	2	8	94538	94545	25 %	25 %	25 %	25 %	28896859
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1608	NC_004603	TTAT	2	8	94710	94717	25 %	75 %	0 %	0 %	28896859
1609	NC_004603	AAT	2	6	94792	94797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896859
1610	NC_004603	GC	3	6	94815	94820	0 %	0 %	50 %	50 %	28896859
1611	NC_004603	TGG	2	6	94865	94870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896859
1612	NC_004603	AAC	2	6	94910	94915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896859
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1617	NC_004603	CAT	2	6	95100	95105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896859
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1620	NC_004603	GGC	2	6	95403	95408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896859
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1623	NC_004603	GC	3	6	95504	95509	0 %	0 %	50 %	50 %	28896859
1624	NC_004603	GAT	2	6	95518	95523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896859
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1626	NC_004603	G	7	7	95655	95661	0 %	0 %	100 %	0 %	28896859
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1998	NC_004603	GTC	2	6	115159	115164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896881
1999	NC_004603	GAA	2	6	115202	115207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896881
2000	NC_004603	GTC	2	6	115209	115214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896881

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