MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 55148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004603	ATCA	2	8	28137	28144	50 %	25 %	0 %	25 %	28896804
502	NC_004603	CAA	2	6	28199	28204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896804
503	NC_004603	CCG	2	6	28243	28248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28896804
504	NC_004603	CTT	2	6	28292	28297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896804
505	NC_004603	AAT	2	6	28308	28313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896804
506	NC_004603	CTT	2	6	28316	28321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896804
507	NC_004603	CAC	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896804
508	NC_004603	ATC	2	6	28345	28350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896804
509	NC_004603	ATC	2	6	28354	28359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896804
510	NC_004603	GAT	2	6	28368	28373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896804
511	NC_004603	T	6	6	28461	28466	0 %	100 %	0 %	0 %	28896804
512	NC_004603	TTC	2	6	28498	28503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896804
513	NC_004603	TTG	2	6	28513	28518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896804
514	NC_004603	GTG	2	6	28599	28604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896804
515	NC_004603	CAAG	2	8	28628	28635	50 %	0 %	25 %	25 %	28896804
516	NC_004603	GCCA	2	8	28652	28659	25 %	0 %	25 %	50 %	28896804
517	NC_004603	AAT	2	6	28741	28746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28896804
518	NC_004603	GAA	2	6	28758	28763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896804
519	NC_004603	ACG	2	6	28780	28785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896804
520	NC_004603	TCA	2	6	28837	28842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896804
521	NC_004603	CAC	2	6	28853	28858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896804
522	NC_004603	GAT	2	6	28860	28865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896804
523	NC_004603	AAG	2	6	28897	28902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896804
524	NC_004603	TCG	2	6	28961	28966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896804
525	NC_004603	CAA	2	6	29060	29065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896804
526	NC_004603	CAG	2	6	29172	29177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896804
527	NC_004603	GA	3	6	29205	29210	50 %	0 %	50 %	0 %	28896804
528	NC_004603	TCA	2	6	29228	29233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896804
529	NC_004603	CCA	2	6	29272	29277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28896804
530	NC_004603	ATG	2	6	29281	29286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896804
531	NC_004603	GCT	2	6	29302	29307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896804
532	NC_004603	TGCT	2	8	29321	29328	0 %	50 %	25 %	25 %	28896804
533	NC_004603	CGC	2	6	29334	29339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28896804
534	NC_004603	T	6	6	29340	29345	0 %	100 %	0 %	0 %	28896804
535	NC_004603	ACCA	2	8	29382	29389	50 %	0 %	0 %	50 %	28896804
536	NC_004603	CTT	2	6	29399	29404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896804
537	NC_004603	CTT	2	6	29474	29479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896804
538	NC_004603	TCA	2	6	29561	29566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896804
539	NC_004603	T	6	6	29600	29605	0 %	100 %	0 %	0 %	28896804
540	NC_004603	ACG	2	6	29610	29615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896804
541	NC_004603	TGA	2	6	29753	29758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896804
542	NC_004603	CA	3	6	29799	29804	50 %	0 %	0 %	50 %	28896804
543	NC_004603	ATG	2	6	29821	29826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896804
544	NC_004603	TGG	2	6	29855	29860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896804
545	NC_004603	GCC	3	9	29904	29912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28896804
546	NC_004603	GT	3	6	29915	29920	0 %	50 %	50 %	0 %	28896804
547	NC_004603	TCT	2	6	29956	29961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896804
548	NC_004603	GA	3	6	30138	30143	50 %	0 %	50 %	0 %	28896804
549	NC_004603	AGCTC	2	10	30191	30200	20 %	20 %	20 %	40 %	28896804
550	NC_004603	ATGA	2	8	30512	30519	50 %	25 %	25 %	0 %	28896805
551	NC_004603	GAA	3	9	30557	30565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896805
552	NC_004603	A	7	7	30569	30575	100 %	0 %	0 %	0 %	28896805
553	NC_004603	TACC	2	8	30586	30593	25 %	25 %	0 %	50 %	28896805
554	NC_004603	GCG	2	6	30617	30622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896805
555	NC_004603	TTG	2	6	30630	30635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896805
556	NC_004603	TGA	2	6	30727	30732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896805
557	NC_004603	CTG	2	6	30750	30755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896805
558	NC_004603	CGG	3	9	30868	30876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28896805
559	NC_004603	GCA	2	6	30880	30885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28896805
560	NC_004603	GCT	2	6	30895	30900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896805
561	NC_004603	A	7	7	30914	30920	100 %	0 %	0 %	0 %	28896805
562	NC_004603	GCT	2	6	31007	31012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896805
563	NC_004603	GTG	2	6	31037	31042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896805
564	NC_004603	ATC	2	6	31082	31087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896805
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570	NC_004603	TGC	2	6	31315	31320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896806
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572	NC_004603	GTT	2	6	31398	31403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896806
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574	NC_004603	T	7	7	31484	31490	0 %	100 %	0 %	0 %	28896806
575	NC_004603	TGG	2	6	31592	31597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896806
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579	NC_004603	TGG	2	6	31967	31972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896806
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591	NC_004603	TTC	2	6	32385	32390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896806
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593	NC_004603	CAA	2	6	32486	32491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896806
594	NC_004603	CACTT	2	10	32518	32527	20 %	40 %	0 %	40 %	28896806
595	NC_004603	GTC	2	6	32581	32586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28896806
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597	NC_004603	ATT	2	6	32660	32665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896807
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599	NC_004603	TA	3	6	32709	32714	50 %	50 %	0 %	0 %	28896807
600	NC_004603	TGG	2	6	32746	32751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28896807
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610	NC_004603	AAG	2	6	33112	33117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896807
611	NC_004603	ATT	2	6	39056	39061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28896808
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613	NC_004603	ACCC	2	8	39234	39241	25 %	0 %	0 %	75 %	28896808
614	NC_004603	T	7	7	39317	39323	0 %	100 %	0 %	0 %	28896808
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619	NC_004603	TTTG	2	8	39486	39493	0 %	75 %	25 %	0 %	28896808
620	NC_004603	T	6	6	39762	39767	0 %	100 %	0 %	0 %	28896808
621	NC_004603	AACA	2	8	39804	39811	75 %	0 %	0 %	25 %	28896808
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625	NC_004603	A	6	6	40205	40210	100 %	0 %	0 %	0 %	28896809
626	NC_004603	CGAT	2	8	40305	40312	25 %	25 %	25 %	25 %	28896809
627	NC_004603	GTT	2	6	40397	40402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896809
628	NC_004603	GTT	2	6	40433	40438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896809
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630	NC_004603	GAA	2	6	40505	40510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896809
631	NC_004603	GAA	2	6	40580	40585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28896809
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