MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002506	TGA	2	6	219280	219285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600971
3502	NC_002506	TTA	2	6	219308	219313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600971
3503	NC_002506	TTA	2	6	219340	219345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600971
3504	NC_002506	A	7	7	219368	219374	100 %	0 %	0 %	0 %	15600971
3505	NC_002506	A	6	6	219430	219435	100 %	0 %	0 %	0 %	15600971
3506	NC_002506	GGT	2	6	219521	219526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600971
3507	NC_002506	GAT	2	6	219569	219574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600971
3508	NC_002506	CAA	2	6	219600	219605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600971
3509	NC_002506	A	6	6	219604	219609	100 %	0 %	0 %	0 %	15600971
3510	NC_002506	ATA	2	6	219663	219668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600971
3511	NC_002506	TATT	2	8	219685	219692	25 %	75 %	0 %	0 %	15600971
3512	NC_002506	TGG	2	6	219709	219714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600971
3513	NC_002506	TTG	2	6	219729	219734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600971
3514	NC_002506	TATAAA	2	12	219753	219764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600971
3515	NC_002506	TC	3	6	219829	219834	0 %	50 %	0 %	50 %	15600972
3516	NC_002506	CTG	2	6	219846	219851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600972
3517	NC_002506	T	6	6	219867	219872	0 %	100 %	0 %	0 %	15600972
3518	NC_002506	TTC	2	6	219903	219908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600972
3519	NC_002506	TTG	2	6	219988	219993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600972
3520	NC_002506	GATAT	2	10	220209	220218	40 %	40 %	20 %	0 %	15600972
3521	NC_002506	TGA	2	6	220239	220244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600972
3522	NC_002506	T	6	6	220797	220802	0 %	100 %	0 %	0 %	15600973
3523	NC_002506	GCC	2	6	220818	220823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600973
3524	NC_002506	T	6	6	220824	220829	0 %	100 %	0 %	0 %	15600973
3525	NC_002506	GTTT	2	8	220877	220884	0 %	75 %	25 %	0 %	15600973
3526	NC_002506	GTTG	2	8	220985	220992	0 %	50 %	50 %	0 %	15600973
3527	NC_002506	AAT	2	6	221056	221061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600973
3528	NC_002506	CAC	2	6	221175	221180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600973
3529	NC_002506	CGC	2	6	221211	221216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600973
3530	NC_002506	GTGC	2	8	221275	221282	0 %	25 %	50 %	25 %	15600973
3531	NC_002506	TTG	2	6	221388	221393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600973
3532	NC_002506	CAG	2	6	221447	221452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600973
3533	NC_002506	GGCTG	2	10	221490	221499	0 %	20 %	60 %	20 %	15600973
3534	NC_002506	AAT	2	6	221599	221604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600973
3535	NC_002506	CAC	2	6	221792	221797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600973
3536	NC_002506	GGC	2	6	221828	221833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600973
3537	NC_002506	AGCC	2	8	221960	221967	25 %	0 %	25 %	50 %	15600973
3538	NC_002506	CAGA	2	8	222095	222102	50 %	0 %	25 %	25 %	15600973
3539	NC_002506	CGAG	2	8	222104	222111	25 %	0 %	50 %	25 %	15600973
3540	NC_002506	AT	3	6	222121	222126	50 %	50 %	0 %	0 %	15600973
3541	NC_002506	GAT	3	9	222318	222326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600974
3542	NC_002506	CAG	2	6	222349	222354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
3543	NC_002506	TGG	2	6	222419	222424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600974
3544	NC_002506	AAG	2	6	222478	222483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600974
3545	NC_002506	CAT	2	6	222555	222560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600974
3546	NC_002506	CG	3	6	222562	222567	0 %	0 %	50 %	50 %	15600974
3547	NC_002506	CAC	3	9	222585	222593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600974
3548	NC_002506	GCA	2	6	222727	222732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
3549	NC_002506	ACACC	2	10	222749	222758	40 %	0 %	0 %	60 %	15600974
3550	NC_002506	TGG	2	6	222785	222790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600974
3551	NC_002506	CCG	2	6	222805	222810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600974
3552	NC_002506	ATC	2	6	222823	222828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600974
3553	NC_002506	CTT	2	6	222863	222868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600974
3554	NC_002506	CAC	2	6	222900	222905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600974
3555	NC_002506	GAG	2	6	222919	222924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600974
3556	NC_002506	CAG	2	6	222930	222935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
3557	NC_002506	GGT	2	6	222984	222989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600974
3558	NC_002506	CTTG	2	8	223027	223034	0 %	50 %	25 %	25 %	15600974
3559	NC_002506	AG	3	6	223134	223139	50 %	0 %	50 %	0 %	15600974
3560	NC_002506	TGT	2	6	223148	223153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600974
3561	NC_002506	GTA	2	6	223179	223184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600974
3562	NC_002506	TGC	3	9	223239	223247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600974
3563	NC_002506	GCA	2	6	223397	223402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
3564	NC_002506	GCA	2	6	223418	223423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
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3566	NC_002506	GAC	2	6	223467	223472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
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3570	NC_002506	CCG	2	6	223579	223584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600974
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3572	NC_002506	CAG	2	6	223608	223613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600974
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3582	NC_002506	CTTCAT	2	12	224451	224462	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15600976
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3589	NC_002506	TTC	2	6	224698	224703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600976
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3593	NC_002506	TGG	2	6	224984	224989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600977
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3603	NC_002506	TTCT	2	8	225796	225803	0 %	75 %	0 %	25 %	15600979
3604	NC_002506	GAA	2	6	225915	225920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600979
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3606	NC_002506	GCAGG	2	10	225963	225972	20 %	0 %	60 %	20 %	15600979
3607	NC_002506	TCA	2	6	225988	225993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600979
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3610	NC_002506	GAC	2	6	226034	226039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600979
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3613	NC_002506	CAA	2	6	226291	226296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600979
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3622	NC_002506	GCC	2	6	226890	226895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600979
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3624	NC_002506	GAT	2	6	226947	226952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600979
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3872	NC_002506	GTG	2	6	242547	242552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193282
3873	NC_002506	GTGA	2	8	242570	242577	25 %	25 %	50 %	0 %	471193282
3874	NC_002506	TGG	2	6	242607	242612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471193282
3875	NC_002506	TGAT	2	8	242616	242623	25 %	50 %	25 %	0 %	471193282
3876	NC_002506	CT	3	6	242627	242632	0 %	50 %	0 %	50 %	471193282
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3993	NC_002506	ATC	2	6	250690	250695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600997
3994	NC_002506	GGT	2	6	250705	250710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600997
3995	NC_002506	CTG	3	9	250769	250777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600998
3996	NC_002506	CTG	2	6	250790	250795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600998
3997	NC_002506	GCG	2	6	250799	250804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600998
3998	NC_002506	T	6	6	250846	250851	0 %	100 %	0 %	0 %	15600998
3999	NC_002506	CGT	2	6	250856	250861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600998
4000	NC_002506	ATTGCG	2	12	250895	250906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15600998

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