MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002506	ATC	2	6	127654	127659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600887
2002	NC_002506	GCTGA	2	10	127669	127678	20 %	20 %	40 %	20 %	15600887
2003	NC_002506	GCAAGA	2	12	127695	127706	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15600887
2004	NC_002506	TGG	2	6	127721	127726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
2005	NC_002506	CGT	2	6	127984	127989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600887
2006	NC_002506	CTG	2	6	128014	128019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600887
2007	NC_002506	AGC	2	6	128069	128074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600887
2008	NC_002506	GGT	2	6	128080	128085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
2009	NC_002506	CAC	2	6	128097	128102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600887
2010	NC_002506	AC	3	6	128130	128135	50 %	0 %	0 %	50 %	15600887
2011	NC_002506	GGT	2	6	128226	128231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
2012	NC_002506	TGA	2	6	128238	128243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600887
2013	NC_002506	TCT	2	6	128276	128281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600887
2014	NC_002506	TTC	2	6	128350	128355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600887
2015	NC_002506	TGA	2	6	128415	128420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600887
2016	NC_002506	CTTT	2	8	128444	128451	0 %	75 %	0 %	25 %	15600887
2017	NC_002506	CTGCT	2	10	128456	128465	0 %	40 %	20 %	40 %	15600887
2018	NC_002506	TACC	2	8	128488	128495	25 %	25 %	0 %	50 %	15600887
2019	NC_002506	AAG	2	6	128504	128509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600887
2020	NC_002506	GTG	2	6	128581	128586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
2021	NC_002506	AG	3	6	128592	128597	50 %	0 %	50 %	0 %	15600887
2022	NC_002506	TGC	2	6	128678	128683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600887
2023	NC_002506	GCT	2	6	128700	128705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600887
2024	NC_002506	GA	3	6	128719	128724	50 %	0 %	50 %	0 %	15600887
2025	NC_002506	TGGC	2	8	128799	128806	0 %	25 %	50 %	25 %	15600888
2026	NC_002506	TGG	2	6	128821	128826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600888
2027	NC_002506	CCA	2	6	128840	128845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600888
2028	NC_002506	CTG	2	6	128868	128873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600888
2029	NC_002506	TGT	2	6	128905	128910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600888
2030	NC_002506	TCG	2	6	128916	128921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600888
2031	NC_002506	CAATC	2	10	129057	129066	40 %	20 %	0 %	40 %	15600888
2032	NC_002506	T	6	6	129232	129237	0 %	100 %	0 %	0 %	15600888
2033	NC_002506	AGC	2	6	129277	129282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600888
2034	NC_002506	CGC	2	6	129479	129484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600888
2035	NC_002506	TTG	2	6	129523	129528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600888
2036	NC_002506	GCG	2	6	129540	129545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600888
2037	NC_002506	TGG	2	6	129644	129649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600888
2038	NC_002506	ATT	2	6	129701	129706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600888
2039	NC_002506	GGT	2	6	129741	129746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600888
2040	NC_002506	CA	3	6	129785	129790	50 %	0 %	0 %	50 %	15600888
2041	NC_002506	CTG	2	6	129798	129803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600888
2042	NC_002506	A	6	6	129816	129821	100 %	0 %	0 %	0 %	15600888
2043	NC_002506	GGC	2	6	129881	129886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600888
2044	NC_002506	GCT	2	6	129905	129910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600888
2045	NC_002506	TTGA	2	8	130035	130042	25 %	50 %	25 %	0 %	15600888
2046	NC_002506	GC	3	6	130051	130056	0 %	0 %	50 %	50 %	15600888
2047	NC_002506	ACCCT	2	10	130110	130119	20 %	20 %	0 %	60 %	15600888
2048	NC_002506	GCTG	2	8	130193	130200	0 %	25 %	50 %	25 %	15600888
2049	NC_002506	GTCA	2	8	130242	130249	25 %	25 %	25 %	25 %	15600888
2050	NC_002506	ATC	2	6	130263	130268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600888
2051	NC_002506	CG	3	6	130299	130304	0 %	0 %	50 %	50 %	15600888
2052	NC_002506	GCG	2	6	130308	130313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600888
2053	NC_002506	AGC	2	6	130441	130446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600889
2054	NC_002506	AGCTG	2	10	130477	130486	20 %	20 %	40 %	20 %	15600889
2055	NC_002506	GGC	2	6	130609	130614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600889
2056	NC_002506	GCA	2	6	130674	130679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600889
2057	NC_002506	TAA	2	6	130756	130761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600889
2058	NC_002506	AAG	2	6	130791	130796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600889
2059	NC_002506	ATG	2	6	130904	130909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600889
2060	NC_002506	GCC	2	6	130916	130921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600889
2061	NC_002506	TGC	2	6	130938	130943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600889
2062	NC_002506	TGGT	2	8	131026	131033	0 %	50 %	50 %	0 %	15600889
2063	NC_002506	GT	3	6	131068	131073	0 %	50 %	50 %	0 %	15600890
2064	NC_002506	CAG	2	6	131086	131091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2065	NC_002506	GAT	2	6	131152	131157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600890
2066	NC_002506	CT	5	10	131167	131176	0 %	50 %	0 %	50 %	15600890
2067	NC_002506	CAGTG	2	10	131184	131193	20 %	20 %	40 %	20 %	15600890
2068	NC_002506	AGCAC	2	10	131205	131214	40 %	0 %	20 %	40 %	15600890
2069	NC_002506	CTG	2	6	131264	131269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2070	NC_002506	TTA	2	6	131304	131309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600890
2071	NC_002506	TGA	2	6	131322	131327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600890
2072	NC_002506	TCAA	2	8	131337	131344	50 %	25 %	0 %	25 %	15600890
2073	NC_002506	TCA	2	6	131455	131460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600890
2074	NC_002506	GCG	2	6	131492	131497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600890
2075	NC_002506	CAA	2	6	131510	131515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600890
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2077	NC_002506	TGG	2	6	131547	131552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600890
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2080	NC_002506	AGC	2	6	131621	131626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2081	NC_002506	TGC	2	6	131647	131652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2082	NC_002506	GCG	2	6	131666	131671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600890
2083	NC_002506	TGG	3	9	131676	131684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600890
2084	NC_002506	AGC	2	6	131701	131706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600890
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2090	NC_002506	CGT	2	6	132050	132055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
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2093	NC_002506	TGC	2	6	132151	132156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600890
2094	NC_002506	TCGG	2	8	132164	132171	0 %	25 %	50 %	25 %	15600890
2095	NC_002506	AAG	2	6	132216	132221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600890
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2102	NC_002506	TTG	2	6	132483	132488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600891
2103	NC_002506	GGC	2	6	132498	132503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600891
2104	NC_002506	GGT	2	6	132514	132519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
2105	NC_002506	GCA	2	6	132521	132526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600891
2106	NC_002506	TGG	2	6	132575	132580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
2107	NC_002506	TGGC	2	8	132600	132607	0 %	25 %	50 %	25 %	15600891
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2109	NC_002506	TAAA	2	8	132825	132832	75 %	25 %	0 %	0 %	15600891
2110	NC_002506	ACT	2	6	132837	132842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600891
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2112	NC_002506	A	6	6	132957	132962	100 %	0 %	0 %	0 %	15600891
2113	NC_002506	TGG	2	6	132986	132991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
2114	NC_002506	TGA	2	6	132997	133002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
2115	NC_002506	TGAT	2	8	133011	133018	25 %	50 %	25 %	0 %	15600891
2116	NC_002506	GAA	2	6	133055	133060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600891
2117	NC_002506	ATG	2	6	133062	133067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
2118	NC_002506	CGC	2	6	133079	133084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600891
2119	NC_002506	GCC	3	9	133125	133133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600891
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2121	NC_002506	TGC	2	6	133215	133220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600891
2122	NC_002506	CTTT	2	8	133314	133321	0 %	75 %	0 %	25 %	15600891
2123	NC_002506	TGC	2	6	133455	133460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600891
2124	NC_002506	GAA	2	6	133490	133495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600891
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2126	NC_002506	GTG	2	6	133608	133613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600891
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2128	NC_002506	TACC	2	8	133644	133651	25 %	25 %	0 %	50 %	15600891
2129	NC_002506	TGA	2	6	133660	133665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600891
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2132	NC_002506	GC	3	6	133714	133719	0 %	0 %	50 %	50 %	15600891
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2239	NC_002506	GGTG	2	8	139997	140004	0 %	25 %	75 %	0 %	15600894
2240	NC_002506	AAT	2	6	140011	140016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600894
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2242	NC_002506	TCA	2	6	140140	140145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600894
2243	NC_002506	AT	3	6	140166	140171	50 %	50 %	0 %	0 %	15600894
2244	NC_002506	TCA	2	6	140176	140181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600894
2245	NC_002506	TGT	2	6	140232	140237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600894
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2247	NC_002506	ACA	2	6	140283	140288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600894
2248	NC_002506	TTA	2	6	140294	140299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600894
2249	NC_002506	TTTG	2	8	140349	140356	0 %	75 %	25 %	0 %	15600894
2250	NC_002506	GCT	2	6	140368	140373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600894
2251	NC_002506	TGG	2	6	140409	140414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600894
2252	NC_002506	CAT	2	6	140478	140483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600894
2253	NC_002506	CAT	2	6	140540	140545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600894
2254	NC_002506	A	7	7	140559	140565	100 %	0 %	0 %	0 %	15600894
2255	NC_002506	A	6	6	140581	140586	100 %	0 %	0 %	0 %	15600894
2256	NC_002506	ATT	2	6	140672	140677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600895
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2259	NC_002506	GT	3	6	140748	140753	0 %	50 %	50 %	0 %	15600895
2260	NC_002506	ATA	2	6	140794	140799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600895
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2262	NC_002506	TGA	2	6	140831	140836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600895
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2264	NC_002506	TA	3	6	140883	140888	50 %	50 %	0 %	0 %	15600895
2265	NC_002506	GTG	2	6	140905	140910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600895
2266	NC_002506	TA	3	6	140973	140978	50 %	50 %	0 %	0 %	15600895
2267	NC_002506	ATA	2	6	140989	140994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600895
2268	NC_002506	CA	3	6	141153	141158	50 %	0 %	0 %	50 %	15600896
2269	NC_002506	CTT	2	6	141179	141184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600896
2270	NC_002506	TTG	2	6	141250	141255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600896
2271	NC_002506	TGC	2	6	141341	141346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600896
2272	NC_002506	AGCGTA	2	12	141367	141378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15600896
2273	NC_002506	ATC	2	6	141385	141390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600896
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2276	NC_002506	CTA	2	6	141706	141711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229220825
2277	NC_002506	CT	3	6	141721	141726	0 %	50 %	0 %	50 %	229220825
2278	NC_002506	TGG	2	6	141731	141736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229220825
2279	NC_002506	TGA	2	6	141792	141797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229220825
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2281	NC_002506	T	6	6	141840	141845	0 %	100 %	0 %	0 %	229220825
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2284	NC_002506	CG	3	6	142039	142044	0 %	0 %	50 %	50 %	229220825
2285	NC_002506	TGA	2	6	142276	142281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600899
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2366	NC_002506	CGAA	2	8	146263	146270	50 %	0 %	25 %	25 %	15600902
2367	NC_002506	ATG	2	6	146305	146310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600902
2368	NC_002506	GC	3	6	146317	146322	0 %	0 %	50 %	50 %	15600902
2369	NC_002506	GCG	2	6	146328	146333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600902
2370	NC_002506	ATT	2	6	146367	146372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600902
2371	NC_002506	GT	3	6	146389	146394	0 %	50 %	50 %	0 %	15600902
2372	NC_002506	ACC	2	6	146454	146459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600902
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2376	NC_002506	TGA	2	6	146733	146738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600903
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2379	NC_002506	ACC	2	6	146845	146850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600903
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2402	NC_002506	TGG	3	9	148896	148904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600904
2403	NC_002506	CAGT	2	8	148928	148935	25 %	25 %	25 %	25 %	15600904
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2472	NC_002506	TAG	2	6	152567	152572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161582044
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2486	NC_002506	A	6	6	154251	154256	100 %	0 %	0 %	0 %	15600910
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2489	NC_002506	GCGAT	2	10	154479	154488	20 %	20 %	40 %	20 %	15600910
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2491	NC_002506	GGC	2	6	154559	154564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600910
2492	NC_002506	CCA	2	6	154574	154579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600910
2493	NC_002506	CCGA	2	8	154592	154599	25 %	0 %	25 %	50 %	15600910
2494	NC_002506	TAC	2	6	154625	154630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600910
2495	NC_002506	TTGCC	2	10	154716	154725	0 %	40 %	20 %	40 %	15600910
2496	NC_002506	CAA	2	6	154735	154740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600910
2497	NC_002506	CCAA	2	8	154863	154870	50 %	0 %	0 %	50 %	15600910
2498	NC_002506	GTG	2	6	155023	155028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600910
2499	NC_002506	GT	3	6	155067	155072	0 %	50 %	50 %	0 %	15600910
2500	NC_002506	ATT	2	6	155243	155248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600911

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