MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002506	AGC	2	6	95767	95772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600856
1502	NC_002506	AAG	2	6	95880	95885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600856
1503	NC_002506	TTG	2	6	96008	96013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600856
1504	NC_002506	TCG	2	6	96022	96027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600856
1505	NC_002506	ACTC	2	8	96041	96048	25 %	25 %	0 %	50 %	15600856
1506	NC_002506	T	6	6	96055	96060	0 %	100 %	0 %	0 %	15600856
1507	NC_002506	AG	3	6	96073	96078	50 %	0 %	50 %	0 %	15600856
1508	NC_002506	ATC	3	9	96302	96310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600856
1509	NC_002506	ATTG	2	8	96337	96344	25 %	50 %	25 %	0 %	15600856
1510	NC_002506	CGC	2	6	96363	96368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600856
1511	NC_002506	T	6	6	96388	96393	0 %	100 %	0 %	0 %	15600856
1512	NC_002506	TGG	2	6	96481	96486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600856
1513	NC_002506	GGC	2	6	96580	96585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600856
1514	NC_002506	GATGGT	2	12	96586	96597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15600856
1515	NC_002506	TGC	2	6	96598	96603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600856
1516	NC_002506	ATG	2	6	96611	96616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600856
1517	NC_002506	CTAAG	2	10	96658	96667	40 %	20 %	20 %	20 %	15600856
1518	NC_002506	CAT	2	6	96788	96793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600857
1519	NC_002506	TTAA	2	8	96816	96823	50 %	50 %	0 %	0 %	15600857
1520	NC_002506	AGC	2	6	96873	96878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600857
1521	NC_002506	GCG	2	6	96900	96905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600857
1522	NC_002506	GAA	2	6	96993	96998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600857
1523	NC_002506	CAT	2	6	97016	97021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600857
1524	NC_002506	GAC	2	6	97032	97037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600857
1525	NC_002506	GTG	2	6	97038	97043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600857
1526	NC_002506	ACAA	2	8	97120	97127	75 %	0 %	0 %	25 %	15600857
1527	NC_002506	CAA	3	9	97224	97232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600858
1528	NC_002506	AAT	2	6	97249	97254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600858
1529	NC_002506	TTA	2	6	97345	97350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600858
1530	NC_002506	TCA	2	6	97577	97582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600859
1531	NC_002506	CCAT	2	8	97883	97890	25 %	25 %	0 %	50 %	15600859
1532	NC_002506	GAAG	2	8	97918	97925	50 %	0 %	50 %	0 %	15600859
1533	NC_002506	TGG	2	6	97980	97985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600859
1534	NC_002506	CAC	2	6	98125	98130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600859
1535	NC_002506	AGTCCG	2	12	98162	98173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15600859
1536	NC_002506	CAG	2	6	98298	98303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600859
1537	NC_002506	GTTG	2	8	98380	98387	0 %	50 %	50 %	0 %	15600859
1538	NC_002506	CCG	2	6	98427	98432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600859
1539	NC_002506	GGC	2	6	98446	98451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600859
1540	NC_002506	AGTG	2	8	98494	98501	25 %	25 %	50 %	0 %	15600859
1541	NC_002506	GGT	2	6	98521	98526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600859
1542	NC_002506	GA	3	6	98573	98578	50 %	0 %	50 %	0 %	15600859
1543	NC_002506	TGAG	2	8	98583	98590	25 %	25 %	50 %	0 %	15600859
1544	NC_002506	AAAC	2	8	98610	98617	75 %	0 %	0 %	25 %	15600859
1545	NC_002506	GCC	2	6	98662	98667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600859
1546	NC_002506	AT	3	6	98690	98695	50 %	50 %	0 %	0 %	15600859
1547	NC_002506	TACCA	2	10	98758	98767	40 %	20 %	0 %	40 %	15600859
1548	NC_002506	T	6	6	98797	98802	0 %	100 %	0 %	0 %	15600859
1549	NC_002506	TGCGGT	2	12	99080	99091	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15600861
1550	NC_002506	TAAG	2	8	99295	99302	50 %	25 %	25 %	0 %	15600861
1551	NC_002506	TGG	2	6	99474	99479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600861
1552	NC_002506	GCT	2	6	99494	99499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600861
1553	NC_002506	GCG	2	6	99506	99511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600861
1554	NC_002506	CCA	2	6	99546	99551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600861
1555	NC_002506	GA	3	6	99617	99622	50 %	0 %	50 %	0 %	15600861
1556	NC_002506	CGC	2	6	99712	99717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600861
1557	NC_002506	CGG	2	6	99741	99746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600861
1558	NC_002506	A	6	6	99767	99772	100 %	0 %	0 %	0 %	15600861
1559	NC_002506	GCA	2	6	99890	99895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600861
1560	NC_002506	GCA	2	6	99948	99953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600861
1561	NC_002506	GCTC	2	8	100282	100289	0 %	25 %	25 %	50 %	15600862
1562	NC_002506	GCTTG	2	10	100339	100348	0 %	40 %	40 %	20 %	15600862
1563	NC_002506	CAG	2	6	100355	100360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600862
1564	NC_002506	AGC	2	6	100411	100416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600862
1565	NC_002506	GGT	2	6	100426	100431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600862
1566	NC_002506	TCA	2	6	100444	100449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600862
1567	NC_002506	ATA	2	6	100476	100481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600862
1568	NC_002506	T	7	7	100677	100683	0 %	100 %	0 %	0 %	15600863
1569	NC_002506	ATTG	2	8	100692	100699	25 %	50 %	25 %	0 %	15600863
1570	NC_002506	AGT	2	6	100710	100715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600863
1571	NC_002506	AGA	2	6	100772	100777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600863
1572	NC_002506	ACCGTG	2	12	100811	100822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15600863
1573	NC_002506	CA	3	6	100827	100832	50 %	0 %	0 %	50 %	15600863
1574	NC_002506	TGCAA	2	10	100882	100891	40 %	20 %	20 %	20 %	15600863
1575	NC_002506	CTG	2	6	100978	100983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600863
1576	NC_002506	G	6	6	101013	101018	0 %	0 %	100 %	0 %	15600863
1577	NC_002506	ATC	2	6	101084	101089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600863
1578	NC_002506	TCA	2	6	101168	101173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600863
1579	NC_002506	TCTG	2	8	101204	101211	0 %	50 %	25 %	25 %	15600863
1580	NC_002506	AACCA	2	10	101251	101260	60 %	0 %	0 %	40 %	15600863
1581	NC_002506	TCA	2	6	101292	101297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600863
1582	NC_002506	CAG	2	6	101850	101855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600865
1583	NC_002506	AG	3	6	101858	101863	50 %	0 %	50 %	0 %	15600865
1584	NC_002506	AGC	3	9	102019	102027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600865
1585	NC_002506	TTA	2	6	102047	102052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600865
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1589	NC_002506	TGA	2	6	102534	102539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600866
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1592	NC_002506	CTC	2	6	102677	102682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600866
1593	NC_002506	GA	3	6	102863	102868	50 %	0 %	50 %	0 %	15600866
1594	NC_002506	TGAT	2	8	102881	102888	25 %	50 %	25 %	0 %	15600866
1595	NC_002506	CTCAAG	2	12	102899	102910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15600866
1596	NC_002506	CAT	2	6	102987	102992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600866
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1598	NC_002506	AAG	2	6	103379	103384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600867
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1600	NC_002506	GAA	2	6	103410	103415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600867
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1604	NC_002506	TCA	2	6	103764	103769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600867
1605	NC_002506	TAA	2	6	103770	103775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600867
1606	NC_002506	TTATGG	2	12	103794	103805	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15600867
1607	NC_002506	CCA	2	6	103823	103828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600867
1608	NC_002506	TGA	2	6	104001	104006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600867
1609	NC_002506	GACA	2	8	104031	104038	50 %	0 %	25 %	25 %	15600867
1610	NC_002506	GTA	2	6	104110	104115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600867
1611	NC_002506	AAGC	2	8	104224	104231	50 %	0 %	25 %	25 %	15600867
1612	NC_002506	ATG	2	6	104279	104284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600867
1613	NC_002506	CTG	3	9	104294	104302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600867
1614	NC_002506	T	6	6	104394	104399	0 %	100 %	0 %	0 %	15600868
1615	NC_002506	GCAA	2	8	104406	104413	50 %	0 %	25 %	25 %	15600868
1616	NC_002506	GCC	2	6	104467	104472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600868
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1619	NC_002506	CCA	2	6	104598	104603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600868
1620	NC_002506	GC	3	6	104654	104659	0 %	0 %	50 %	50 %	15600868
1621	NC_002506	T	6	6	104662	104667	0 %	100 %	0 %	0 %	15600868
1622	NC_002506	CATG	2	8	104669	104676	25 %	25 %	25 %	25 %	15600868
1623	NC_002506	CCA	2	6	104865	104870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600868
1624	NC_002506	TGA	2	6	104880	104885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600868
1625	NC_002506	GGC	2	6	104910	104915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600868
1626	NC_002506	CG	3	6	104927	104932	0 %	0 %	50 %	50 %	15600868
1627	NC_002506	TCA	2	6	104981	104986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600868
1628	NC_002506	ACC	2	6	104995	105000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600868
1629	NC_002506	TGC	2	6	105039	105044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600868
1630	NC_002506	CAA	2	6	105052	105057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600868
1631	NC_002506	CAT	2	6	105539	105544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600869
1632	NC_002506	ATG	2	6	105582	105587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600869
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1634	NC_002506	CTT	2	6	105666	105671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600869
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1643	NC_002506	ATG	2	6	106369	106374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600869
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1646	NC_002506	TG	3	6	106510	106515	0 %	50 %	50 %	0 %	15600869
1647	NC_002506	TTTC	2	8	106540	106547	0 %	75 %	0 %	25 %	15600869
1648	NC_002506	CGG	2	6	106594	106599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600869
1649	NC_002506	TG	3	6	106693	106698	0 %	50 %	50 %	0 %	15600869
1650	NC_002506	TGGATG	2	12	106747	106758	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15600869
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1654	NC_002506	AAG	2	6	106984	106989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600870
1655	NC_002506	TCA	2	6	107029	107034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600870
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1664	NC_002506	GTT	2	6	107414	107419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600870
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1747	NC_002506	GCG	2	6	112283	112288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600874
1748	NC_002506	TG	3	6	112329	112334	0 %	50 %	50 %	0 %	15600874
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1750	NC_002506	A	6	6	112413	112418	100 %	0 %	0 %	0 %	15600874
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1755	NC_002506	GCT	2	6	112723	112728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193277
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1758	NC_002506	GAT	2	6	112831	112836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193277
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1763	NC_002506	TGTT	2	8	113097	113104	0 %	75 %	25 %	0 %	471193277
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1867	NC_002506	A	6	6	119885	119890	100 %	0 %	0 %	0 %	15600881
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1872	NC_002506	TCA	2	6	120188	120193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600881
1873	NC_002506	ATG	2	6	120206	120211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600881
1874	NC_002506	CCGAT	2	10	120212	120221	20 %	20 %	20 %	40 %	15600881
1875	NC_002506	CGT	2	6	120235	120240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600881
1876	NC_002506	CGTCC	2	10	120255	120264	0 %	20 %	20 %	60 %	15600881
1877	NC_002506	TGGT	2	8	120308	120315	0 %	50 %	50 %	0 %	15600881
1878	NC_002506	GA	3	6	120353	120358	50 %	0 %	50 %	0 %	15600881
1879	NC_002506	CTT	2	6	120371	120376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600881
1880	NC_002506	TCGTCA	2	12	120408	120419	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15600881
1881	NC_002506	AG	3	6	120447	120452	50 %	0 %	50 %	0 %	15600881
1882	NC_002506	G	6	6	120458	120463	0 %	0 %	100 %	0 %	15600881
1883	NC_002506	TGA	2	6	120498	120503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600881
1884	NC_002506	TCAA	2	8	120535	120542	50 %	25 %	0 %	25 %	15600881
1885	NC_002506	TGC	2	6	120563	120568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600881
1886	NC_002506	TGGGG	2	10	120579	120588	0 %	20 %	80 %	0 %	15600881
1887	NC_002506	TG	3	6	120595	120600	0 %	50 %	50 %	0 %	15600881
1888	NC_002506	CGAC	2	8	120602	120609	25 %	0 %	25 %	50 %	15600881
1889	NC_002506	TG	3	6	120754	120759	0 %	50 %	50 %	0 %	15600881
1890	NC_002506	GGTAC	2	10	120955	120964	20 %	20 %	40 %	20 %	15600881
1891	NC_002506	CA	3	6	121056	121061	50 %	0 %	0 %	50 %	15600881
1892	NC_002506	GTGAT	2	10	121264	121273	20 %	40 %	40 %	0 %	15600882
1893	NC_002506	T	6	6	121320	121325	0 %	100 %	0 %	0 %	15600882
1894	NC_002506	AGC	2	6	121402	121407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600882
1895	NC_002506	T	6	6	121418	121423	0 %	100 %	0 %	0 %	15600882
1896	NC_002506	GATT	2	8	121432	121439	25 %	50 %	25 %	0 %	15600882
1897	NC_002506	TAC	2	6	121473	121478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600882
1898	NC_002506	TGG	2	6	121531	121536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600882
1899	NC_002506	ATT	2	6	121647	121652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600882
1900	NC_002506	ATTG	2	8	121791	121798	25 %	50 %	25 %	0 %	15600882
1901	NC_002506	TAT	2	6	121811	121816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600882
1902	NC_002506	T	6	6	121853	121858	0 %	100 %	0 %	0 %	15600882
1903	NC_002506	TGG	2	6	121894	121899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600882
1904	NC_002506	GATG	2	8	121943	121950	25 %	25 %	50 %	0 %	15600882
1905	NC_002506	TGA	2	6	122247	122252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600883
1906	NC_002506	GCA	2	6	122289	122294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600883
1907	NC_002506	AGTG	2	8	122362	122369	25 %	25 %	50 %	0 %	15600883
1908	NC_002506	GAA	2	6	122417	122422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600883
1909	NC_002506	ACCA	2	8	122515	122522	50 %	0 %	0 %	50 %	15600883
1910	NC_002506	GCG	2	6	122561	122566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600883
1911	NC_002506	CCT	2	6	122577	122582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600883
1912	NC_002506	GAT	2	6	122588	122593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600883
1913	NC_002506	AGC	2	6	122604	122609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600883
1914	NC_002506	TGC	2	6	122652	122657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600883
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1917	NC_002506	TG	3	6	123077	123082	0 %	50 %	50 %	0 %	15600883
1918	NC_002506	CAA	2	6	123104	123109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600883
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1920	NC_002506	TC	3	6	123181	123186	0 %	50 %	0 %	50 %	15600883
1921	NC_002506	CGT	2	6	123229	123234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600883
1922	NC_002506	GCG	2	6	123251	123256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600883
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1930	NC_002506	GTC	2	6	123759	123764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600884
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1932	NC_002506	GAG	2	6	123883	123888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600884
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1945	NC_002506	TGC	3	9	124748	124756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600885
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1958	NC_002506	ACT	2	6	125455	125460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600886
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1968	NC_002506	CAGA	2	8	126023	126030	50 %	0 %	25 %	25 %	15600886
1969	NC_002506	TCAA	2	8	126127	126134	50 %	25 %	0 %	25 %	15600886
1970	NC_002506	TCAA	2	8	126136	126143	50 %	25 %	0 %	25 %	15600886
1971	NC_002506	CT	4	8	126252	126259	0 %	50 %	0 %	50 %	15600887
1972	NC_002506	CT	3	6	126325	126330	0 %	50 %	0 %	50 %	15600887
1973	NC_002506	CAAG	2	8	126348	126355	50 %	0 %	25 %	25 %	15600887
1974	NC_002506	CTG	2	6	126445	126450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600887
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1978	NC_002506	A	6	6	126610	126615	100 %	0 %	0 %	0 %	15600887
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1985	NC_002506	TGG	2	6	126842	126847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
1986	NC_002506	GTG	2	6	126898	126903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
1987	NC_002506	CCCA	2	8	126916	126923	25 %	0 %	0 %	75 %	15600887
1988	NC_002506	TGAT	2	8	127016	127023	25 %	50 %	25 %	0 %	15600887
1989	NC_002506	AAG	2	6	127097	127102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600887
1990	NC_002506	GTG	2	6	127145	127150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887
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1992	NC_002506	GAC	2	6	127170	127175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600887
1993	NC_002506	CGAT	2	8	127256	127263	25 %	25 %	25 %	25 %	15600887
1994	NC_002506	CA	3	6	127310	127315	50 %	0 %	0 %	50 %	15600887
1995	NC_002506	TGA	2	6	127329	127334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600887
1996	NC_002506	GTC	2	6	127379	127384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600887
1997	NC_002506	AGCG	2	8	127552	127559	25 %	0 %	50 %	25 %	15600887
1998	NC_002506	GCA	3	9	127626	127634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600887
1999	NC_002506	A	6	6	127634	127639	100 %	0 %	0 %	0 %	15600887
2000	NC_002506	TGG	2	6	127643	127648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600887

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