MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002506	GT	3	6	66247	66252	0 %	50 %	50 %	0 %	15600829
1002	NC_002506	GCA	2	6	66280	66285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600829
1003	NC_002506	GAA	2	6	66293	66298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600829
1004	NC_002506	TGG	2	6	66304	66309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600829
1005	NC_002506	AGA	2	6	66314	66319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600829
1006	NC_002506	TGG	2	6	66327	66332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600829
1007	NC_002506	GC	4	8	66363	66370	0 %	0 %	50 %	50 %	15600829
1008	NC_002506	CCA	2	6	66411	66416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600829
1009	NC_002506	CGTT	2	8	66560	66567	0 %	50 %	25 %	25 %	471193274
1010	NC_002506	CTT	3	9	66579	66587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471193274
1011	NC_002506	GCT	2	6	66599	66604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193274
1012	NC_002506	CAG	2	6	66606	66611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193274
1013	NC_002506	GCA	2	6	66635	66640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471193274
1014	NC_002506	TCA	2	6	66701	66706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471193274
1015	NC_002506	TAG	2	6	66727	66732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471193274
1016	NC_002506	GCT	3	9	66746	66754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471193274
1017	NC_002506	CAA	2	6	67397	67402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600832
1018	NC_002506	TTG	2	6	67436	67441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600832
1019	NC_002506	TGC	2	6	67482	67487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1020	NC_002506	TGC	2	6	67491	67496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1021	NC_002506	GGT	2	6	67607	67612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600832
1022	NC_002506	GTG	2	6	67641	67646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600832
1023	NC_002506	ATC	2	6	67722	67727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600832
1024	NC_002506	ACC	2	6	67731	67736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600832
1025	NC_002506	CGT	2	6	67847	67852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1026	NC_002506	GCT	2	6	67915	67920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1027	NC_002506	GGGT	2	8	67947	67954	0 %	25 %	75 %	0 %	15600832
1028	NC_002506	TG	3	6	67992	67997	0 %	50 %	50 %	0 %	15600832
1029	NC_002506	GCT	2	6	68020	68025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1030	NC_002506	ATC	2	6	68063	68068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600832
1031	NC_002506	CTGA	2	8	68099	68106	25 %	25 %	25 %	25 %	15600832
1032	NC_002506	TCAA	2	8	68112	68119	50 %	25 %	0 %	25 %	15600832
1033	NC_002506	AAC	2	6	68120	68125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600832
1034	NC_002506	TCAA	2	8	68154	68161	50 %	25 %	0 %	25 %	15600832
1035	NC_002506	CAT	2	6	68176	68181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600832
1036	NC_002506	GAC	2	6	68218	68223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1037	NC_002506	TTG	2	6	68361	68366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600832
1038	NC_002506	T	6	6	68404	68409	0 %	100 %	0 %	0 %	15600832
1039	NC_002506	CAA	2	6	68512	68517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600832
1040	NC_002506	A	6	6	68540	68545	100 %	0 %	0 %	0 %	15600832
1041	NC_002506	GCG	2	6	68546	68551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600832
1042	NC_002506	GGTG	2	8	68584	68591	0 %	25 %	75 %	0 %	15600832
1043	NC_002506	AAAG	2	8	68611	68618	75 %	0 %	25 %	0 %	15600832
1044	NC_002506	GAC	2	6	68648	68653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600832
1045	NC_002506	T	6	6	68918	68923	0 %	100 %	0 %	0 %	15600834
1046	NC_002506	AATG	2	8	69064	69071	50 %	25 %	25 %	0 %	15600834
1047	NC_002506	CAA	2	6	69073	69078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600834
1048	NC_002506	CAG	2	6	69124	69129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1049	NC_002506	AATGG	2	10	69143	69152	40 %	20 %	40 %	0 %	15600834
1050	NC_002506	GCT	2	6	69198	69203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1051	NC_002506	GC	3	6	69212	69217	0 %	0 %	50 %	50 %	15600834
1052	NC_002506	ATT	2	6	69233	69238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600834
1053	NC_002506	CTT	2	6	69248	69253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600834
1054	NC_002506	AGA	2	6	69291	69296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600834
1055	NC_002506	ACTT	2	8	69379	69386	25 %	50 %	0 %	25 %	15600834
1056	NC_002506	GGC	2	6	69393	69398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600834
1057	NC_002506	CTA	2	6	69414	69419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600834
1058	NC_002506	TCAA	2	8	69474	69481	50 %	25 %	0 %	25 %	15600834
1059	NC_002506	AAT	2	6	69565	69570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15600834
1060	NC_002506	CAG	2	6	69583	69588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1061	NC_002506	AC	3	6	69735	69740	50 %	0 %	0 %	50 %	15600834
1062	NC_002506	TGG	2	6	69824	69829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600834
1063	NC_002506	TC	3	6	69926	69931	0 %	50 %	0 %	50 %	15600834
1064	NC_002506	GTAC	2	8	69964	69971	25 %	25 %	25 %	25 %	15600834
1065	NC_002506	CAG	2	6	70161	70166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1066	NC_002506	TATGGC	2	12	70177	70188	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15600834
1067	NC_002506	GCTT	2	8	70235	70242	0 %	50 %	25 %	25 %	15600834
1068	NC_002506	GTG	3	9	70277	70285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600834
1069	NC_002506	TGA	2	6	70344	70349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600834
1070	NC_002506	GC	3	6	70395	70400	0 %	0 %	50 %	50 %	15600834
1071	NC_002506	CGG	2	6	70413	70418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600834
1072	NC_002506	CGG	2	6	70425	70430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600834
1073	NC_002506	TGC	2	6	70440	70445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1074	NC_002506	CAG	2	6	70456	70461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1075	NC_002506	TGC	2	6	70484	70489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600834
1076	NC_002506	GCA	2	6	70548	70553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600834
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1081	NC_002506	GAA	2	6	70956	70961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15600835
1082	NC_002506	GTG	3	9	70962	70970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600835
1083	NC_002506	AGC	2	6	70987	70992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600835
1084	NC_002506	GCAAG	2	10	71048	71057	40 %	0 %	40 %	20 %	15600835
1085	NC_002506	GTG	2	6	71271	71276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600835
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1087	NC_002506	CGT	2	6	71321	71326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600835
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1089	NC_002506	ATT	2	6	71353	71358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600835
1090	NC_002506	ACC	2	6	71362	71367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600835
1091	NC_002506	ATT	2	6	71371	71376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600835
1092	NC_002506	GCT	2	6	71465	71470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600835
1093	NC_002506	ACT	2	6	71479	71484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600835
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1096	NC_002506	TGGA	2	8	71754	71761	25 %	25 %	50 %	0 %	15600835
1097	NC_002506	GGAA	2	8	71768	71775	50 %	0 %	50 %	0 %	15600835
1098	NC_002506	CA	3	6	71804	71809	50 %	0 %	0 %	50 %	15600835
1099	NC_002506	TCG	2	6	71861	71866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600835
1100	NC_002506	TGA	2	6	71876	71881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600835
1101	NC_002506	ATG	2	6	71890	71895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600835
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1103	NC_002506	GACAA	2	10	72094	72103	60 %	0 %	20 %	20 %	15600835
1104	NC_002506	GCTG	2	8	72125	72132	0 %	25 %	50 %	25 %	15600835
1105	NC_002506	GTG	2	6	72198	72203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600835
1106	NC_002506	AGTG	2	8	72216	72223	25 %	25 %	50 %	0 %	15600835
1107	NC_002506	TAT	2	6	72362	72367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600835
1108	NC_002506	CAA	2	6	72374	72379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600835
1109	NC_002506	GCA	2	6	72418	72423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600835
1110	NC_002506	CAG	2	6	72534	72539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600835
1111	NC_002506	GAT	2	6	72600	72605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600835
1112	NC_002506	AG	3	6	72714	72719	50 %	0 %	50 %	0 %	15600835
1113	NC_002506	GCC	2	6	72736	72741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600835
1114	NC_002506	CAC	2	6	72779	72784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600835
1115	NC_002506	TCGA	2	8	72901	72908	25 %	25 %	25 %	25 %	15600835
1116	NC_002506	GCG	2	6	73077	73082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600836
1117	NC_002506	CCA	2	6	73099	73104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600836
1118	NC_002506	GCCA	2	8	73168	73175	25 %	0 %	25 %	50 %	15600836
1119	NC_002506	TTGAC	2	10	73222	73231	20 %	40 %	20 %	20 %	15600836
1120	NC_002506	A	6	6	73255	73260	100 %	0 %	0 %	0 %	15600836
1121	NC_002506	GGT	2	6	73262	73267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600836
1122	NC_002506	CGC	2	6	73352	73357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600836
1123	NC_002506	ACG	2	6	73407	73412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600836
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1125	NC_002506	GGC	2	6	73475	73480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600836
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1127	NC_002506	TTG	2	6	73551	73556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600836
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