MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002506	TCC	2	6	31083	31088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600796
502	NC_002506	GCG	2	6	31099	31104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600796
503	NC_002506	ACTG	2	8	31126	31133	25 %	25 %	25 %	25 %	15600796
504	NC_002506	GAT	3	9	31158	31166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600796
505	NC_002506	GGT	2	6	31339	31344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
506	NC_002506	TGG	2	6	31364	31369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
507	NC_002506	TGC	2	6	31451	31456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600796
508	NC_002506	TGG	3	9	31461	31469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
509	NC_002506	GTG	2	6	31561	31566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
510	NC_002506	GTG	2	6	31573	31578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600796
511	NC_002506	CTG	2	6	31633	31638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600796
512	NC_002506	ATTG	2	8	31698	31705	25 %	50 %	25 %	0 %	15600796
513	NC_002506	CCT	2	6	31715	31720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15600796
514	NC_002506	TGC	2	6	31730	31735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600796
515	NC_002506	CCG	2	6	31747	31752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600796
516	NC_002506	GAT	2	6	31794	31799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600796
517	NC_002506	TATT	2	8	31965	31972	25 %	75 %	0 %	0 %	15600797
518	NC_002506	GCA	2	6	32036	32041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600797
519	NC_002506	TTC	2	6	32043	32048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600797
520	NC_002506	GCC	2	6	32122	32127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600797
521	NC_002506	TTA	2	6	32140	32145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600797
522	NC_002506	CTT	2	6	32189	32194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600797
523	NC_002506	TTG	2	6	32232	32237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600797
524	NC_002506	AGT	2	6	32242	32247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600797
525	NC_002506	GAG	2	6	32282	32287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15600797
526	NC_002506	TTGG	2	8	32322	32329	0 %	50 %	50 %	0 %	15600797
527	NC_002506	CAC	2	6	32349	32354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600797
528	NC_002506	GAT	3	9	32364	32372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600797
529	NC_002506	A	6	6	32460	32465	100 %	0 %	0 %	0 %	15600797
530	NC_002506	GCC	2	6	32466	32471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600797
531	NC_002506	AGC	2	6	32553	32558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600797
532	NC_002506	GCAA	2	8	32569	32576	50 %	0 %	25 %	25 %	15600797
533	NC_002506	CGC	2	6	33055	33060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600798
534	NC_002506	GCA	2	6	33095	33100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600798
535	NC_002506	ACC	2	6	33173	33178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600798
536	NC_002506	TTG	2	6	33528	33533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15600798
537	NC_002506	GCT	2	6	33728	33733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600798
538	NC_002506	TCA	2	6	33760	33765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600798
539	NC_002506	A	7	7	33812	33818	100 %	0 %	0 %	0 %	15600798
540	NC_002506	ATC	2	6	33836	33841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600798
541	NC_002506	ATCG	2	8	33844	33851	25 %	25 %	25 %	25 %	15600798
542	NC_002506	CT	3	6	33863	33868	0 %	50 %	0 %	50 %	15600798
543	NC_002506	CTT	2	6	33874	33879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600798
544	NC_002506	AAGCG	2	10	33894	33903	40 %	0 %	40 %	20 %	15600798
545	NC_002506	GCG	3	9	33987	33995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600798
546	NC_002506	GC	3	6	34063	34068	0 %	0 %	50 %	50 %	15600798
547	NC_002506	TGA	2	6	34075	34080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600798
548	NC_002506	CGG	2	6	34216	34221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15600798
549	NC_002506	CCA	2	6	34240	34245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600798
550	NC_002506	CTG	2	6	34361	34366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600798
551	NC_002506	TATG	2	8	34411	34418	25 %	50 %	25 %	0 %	15600798
552	NC_002506	TAC	2	6	34648	34653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600798
553	NC_002506	TGA	3	9	34672	34680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600798
554	NC_002506	TACG	2	8	34706	34713	25 %	25 %	25 %	25 %	15600798
555	NC_002506	AATGC	2	10	34775	34784	40 %	20 %	20 %	20 %	15600798
556	NC_002506	GCC	2	6	34874	34879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600798
557	NC_002506	CTG	2	6	34956	34961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600798
558	NC_002506	GACA	2	8	35050	35057	50 %	0 %	25 %	25 %	15600798
559	NC_002506	TGG	2	6	35085	35090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600798
560	NC_002506	CCA	2	6	35109	35114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15600798
561	NC_002506	GTG	2	6	35180	35185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600798
562	NC_002506	GTGA	2	8	35339	35346	25 %	25 %	50 %	0 %	15600798
563	NC_002506	GGT	2	6	35405	35410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600798
564	NC_002506	TGG	2	6	35498	35503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600798
565	NC_002506	G	6	6	35538	35543	0 %	0 %	100 %	0 %	15600798
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569	NC_002506	TGG	2	6	35714	35719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15600799
570	NC_002506	GAC	2	6	35726	35731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600799
571	NC_002506	GCAAA	2	10	35756	35765	60 %	0 %	20 %	20 %	15600799
572	NC_002506	TC	4	8	35841	35848	0 %	50 %	0 %	50 %	15600799
573	NC_002506	CA	3	6	35945	35950	50 %	0 %	0 %	50 %	15600800
574	NC_002506	AAC	2	6	36056	36061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600800
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577	NC_002506	AG	3	6	36126	36131	50 %	0 %	50 %	0 %	15600800
578	NC_002506	ATC	2	6	36151	36156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600800
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581	NC_002506	GTC	2	6	36233	36238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600800
582	NC_002506	CTG	2	6	36407	36412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600800
583	NC_002506	A	6	6	36482	36487	100 %	0 %	0 %	0 %	15600800
584	NC_002506	CGT	2	6	36490	36495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15600800
585	NC_002506	TGA	2	6	36557	36562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600800
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589	NC_002506	GT	3	6	36766	36771	0 %	50 %	50 %	0 %	15600801
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593	NC_002506	CAA	2	6	36922	36927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15600801
594	NC_002506	AATC	2	8	36934	36941	50 %	25 %	0 %	25 %	15600801
595	NC_002506	AAGCT	2	10	37130	37139	40 %	20 %	20 %	20 %	15600801
596	NC_002506	GTCA	2	8	37216	37223	25 %	25 %	25 %	25 %	15600801
597	NC_002506	T	6	6	37236	37241	0 %	100 %	0 %	0 %	15600801
598	NC_002506	ACTCA	2	10	37249	37258	40 %	20 %	0 %	40 %	15600801
599	NC_002506	CTT	2	6	37319	37324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15600801
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601	NC_002506	TGA	2	6	37490	37495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15600801
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603	NC_002506	GCGGA	2	10	37688	37697	20 %	0 %	60 %	20 %	15600802
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609	NC_002506	CGC	2	6	37918	37923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15600802
610	NC_002506	CT	3	6	37931	37936	0 %	50 %	0 %	50 %	15600802
611	NC_002506	T	6	6	38016	38021	0 %	100 %	0 %	0 %	15600802
612	NC_002506	ACG	2	6	38048	38053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15600802
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614	NC_002506	GGTT	2	8	38115	38122	0 %	50 %	50 %	0 %	15600802
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616	NC_002506	GAGCT	2	10	38254	38263	20 %	20 %	40 %	20 %	15600802
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619	NC_002506	CT	3	6	38321	38326	0 %	50 %	0 %	50 %	15600802
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627	NC_002506	TTA	2	6	39026	39031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15600802
628	NC_002506	AACG	2	8	39033	39040	50 %	0 %	25 %	25 %	15600802
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630	NC_002506	TG	3	6	39408	39413	0 %	50 %	50 %	0 %	15600803
631	NC_002506	TCA	2	6	39486	39491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15600803
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633	NC_002506	TG	3	6	39702	39707	0 %	50 %	50 %	0 %	15600803
634	NC_002506	TGAG	2	8	39795	39802	25 %	25 %	50 %	0 %	15600803
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