MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome II

Total Repeats: 16506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002506	GGT	3	9	283112	283120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601034
4502	NC_002506	CT	3	6	283131	283136	0 %	50 %	0 %	50 %	15601034
4503	NC_002506	ATCA	2	8	283169	283176	50 %	25 %	0 %	25 %	15601034
4504	NC_002506	ATG	2	6	283278	283283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601034
4505	NC_002506	CGG	2	6	283325	283330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601034
4506	NC_002506	AGCGA	2	10	283355	283364	40 %	0 %	40 %	20 %	15601034
4507	NC_002506	GAG	2	6	283375	283380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15601034
4508	NC_002506	AAT	2	6	283499	283504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601034
4509	NC_002506	TC	3	6	283627	283632	0 %	50 %	0 %	50 %	15601035
4510	NC_002506	TCG	2	6	283667	283672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601035
4511	NC_002506	GTGA	2	8	283720	283727	25 %	25 %	50 %	0 %	15601035
4512	NC_002506	T	6	6	283758	283763	0 %	100 %	0 %	0 %	15601035
4513	NC_002506	GTG	2	6	283780	283785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601035
4514	NC_002506	CTA	2	6	283823	283828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601035
4515	NC_002506	TGG	2	6	283832	283837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601035
4516	NC_002506	CAGA	2	8	283876	283883	50 %	0 %	25 %	25 %	15601035
4517	NC_002506	TGG	2	6	284055	284060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601035
4518	NC_002506	T	6	6	284107	284112	0 %	100 %	0 %	0 %	15601035
4519	NC_002506	GTT	2	6	284189	284194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601035
4520	NC_002506	TGC	2	6	284225	284230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601035
4521	NC_002506	TTA	2	6	284274	284279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601035
4522	NC_002506	TTGC	2	8	284392	284399	0 %	50 %	25 %	25 %	15601035
4523	NC_002506	GCT	2	6	284421	284426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601035
4524	NC_002506	GCA	2	6	284434	284439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601035
4525	NC_002506	TTA	2	6	284443	284448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601035
4526	NC_002506	TATGG	2	10	284527	284536	20 %	40 %	40 %	0 %	15601035
4527	NC_002506	GCACT	2	10	284555	284564	20 %	20 %	20 %	40 %	15601035
4528	NC_002506	TAT	2	6	284617	284622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601035
4529	NC_002506	TTG	2	6	284704	284709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601035
4530	NC_002506	GCTC	2	8	284719	284726	0 %	25 %	25 %	50 %	15601035
4531	NC_002506	CATG	2	8	285029	285036	25 %	25 %	25 %	25 %	15601036
4532	NC_002506	GAA	2	6	285074	285079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601036
4533	NC_002506	CT	4	8	285142	285149	0 %	50 %	0 %	50 %	15601036
4534	NC_002506	GA	3	6	285155	285160	50 %	0 %	50 %	0 %	15601036
4535	NC_002506	TGAT	2	8	285161	285168	25 %	50 %	25 %	0 %	15601036
4536	NC_002506	GTG	2	6	285257	285262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601036
4537	NC_002506	GCG	2	6	285328	285333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601036
4538	NC_002506	G	6	6	285396	285401	0 %	0 %	100 %	0 %	15601036
4539	NC_002506	GAC	2	6	285405	285410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4540	NC_002506	GTC	2	6	285458	285463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4541	NC_002506	ATCAAG	2	12	285488	285499	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15601036
4542	NC_002506	A	6	6	285508	285513	100 %	0 %	0 %	0 %	15601036
4543	NC_002506	TTC	2	6	285536	285541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601036
4544	NC_002506	TGA	2	6	285585	285590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
4545	NC_002506	CAT	2	6	285591	285596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601036
4546	NC_002506	T	6	6	285661	285666	0 %	100 %	0 %	0 %	15601036
4547	NC_002506	TGA	2	6	285672	285677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
4548	NC_002506	AG	3	6	285753	285758	50 %	0 %	50 %	0 %	15601036
4549	NC_002506	TAC	2	6	285802	285807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601036
4550	NC_002506	GAT	2	6	285826	285831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
4551	NC_002506	TTG	2	6	285854	285859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15601036
4552	NC_002506	GATGTC	2	12	285880	285891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15601036
4553	NC_002506	ATCA	2	8	285961	285968	50 %	25 %	0 %	25 %	15601036
4554	NC_002506	TGC	2	6	285983	285988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4555	NC_002506	TCG	2	6	286038	286043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4556	NC_002506	ATG	2	6	286061	286066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
4557	NC_002506	ATG	2	6	286120	286125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
4558	NC_002506	AGC	2	6	286159	286164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4559	NC_002506	GAAC	2	8	286194	286201	50 %	0 %	25 %	25 %	15601036
4560	NC_002506	GGT	2	6	286236	286241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601036
4561	NC_002506	TGAG	2	8	286259	286266	25 %	25 %	50 %	0 %	15601036
4562	NC_002506	GC	3	6	286270	286275	0 %	0 %	50 %	50 %	15601036
4563	NC_002506	AATCA	2	10	286298	286307	60 %	20 %	0 %	20 %	15601036
4564	NC_002506	GCA	2	6	286335	286340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4565	NC_002506	AAT	2	6	286357	286362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601036
4566	NC_002506	CTT	2	6	286379	286384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601036
4567	NC_002506	CAAA	2	8	286439	286446	75 %	0 %	0 %	25 %	15601036
4568	NC_002506	CTG	2	6	286495	286500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4569	NC_002506	GCG	2	6	286522	286527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601036
4570	NC_002506	GGT	2	6	286557	286562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601036
4571	NC_002506	GTGC	2	8	286573	286580	0 %	25 %	50 %	25 %	15601036
4572	NC_002506	CAC	2	6	286605	286610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601036
4573	NC_002506	CGT	2	6	286656	286661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4574	NC_002506	AGC	2	6	286682	286687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4575	NC_002506	ACG	2	6	286696	286701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
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4577	NC_002506	TGA	2	6	286764	286769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
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4579	NC_002506	GCG	3	9	286786	286794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601036
4580	NC_002506	AGC	2	6	286799	286804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601036
4581	NC_002506	AGAC	2	8	286882	286889	50 %	0 %	25 %	25 %	15601036
4582	NC_002506	TAG	2	6	286940	286945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601036
4583	NC_002506	TTAA	2	8	286962	286969	50 %	50 %	0 %	0 %	15601036
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4585	NC_002506	TCGT	2	8	287109	287116	0 %	50 %	25 %	25 %	15601037
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4588	NC_002506	TGA	2	6	287238	287243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
4589	NC_002506	CTCG	2	8	287288	287295	0 %	25 %	25 %	50 %	15601037
4590	NC_002506	GAT	2	6	287352	287357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
4591	NC_002506	GGC	2	6	287397	287402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15601037
4592	NC_002506	TGG	2	6	287417	287422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601037
4593	NC_002506	G	6	6	287485	287490	0 %	0 %	100 %	0 %	15601037
4594	NC_002506	ACT	2	6	287603	287608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
4595	NC_002506	GCT	2	6	287628	287633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
4596	NC_002506	TTGA	2	8	287695	287702	25 %	50 %	25 %	0 %	15601037
4597	NC_002506	GCT	2	6	287723	287728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
4598	NC_002506	CAT	2	6	287754	287759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
4599	NC_002506	GAT	2	6	287794	287799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
4600	NC_002506	CGT	2	6	287851	287856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601037
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4602	NC_002506	TGA	2	6	288065	288070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
4603	NC_002506	A	6	6	288072	288077	100 %	0 %	0 %	0 %	15601037
4604	NC_002506	CAA	2	6	288142	288147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601037
4605	NC_002506	GCAGT	2	10	288182	288191	20 %	20 %	40 %	20 %	15601037
4606	NC_002506	GCC	2	6	288202	288207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601037
4607	NC_002506	ATG	2	6	288223	288228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
4608	NC_002506	TGCG	2	8	288284	288291	0 %	25 %	50 %	25 %	15601037
4609	NC_002506	C	6	6	288366	288371	0 %	0 %	0 %	100 %	15601037
4610	NC_002506	ATC	2	6	288464	288469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601037
4611	NC_002506	TGA	2	6	288590	288595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601037
4612	NC_002506	CGT	2	6	288899	288904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601038
4613	NC_002506	GCC	2	6	288911	288916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601038
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4615	NC_002506	ATG	2	6	289204	289209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601038
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4618	NC_002506	TTAC	2	8	289432	289439	25 %	50 %	0 %	25 %	15601038
4619	NC_002506	CTG	2	6	289470	289475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601038
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4621	NC_002506	CCA	2	6	289552	289557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15601038
4622	NC_002506	GTG	2	6	289581	289586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15601038
4623	NC_002506	AAC	2	6	289627	289632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15601038
4624	NC_002506	A	6	6	289785	289790	100 %	0 %	0 %	0 %	15601038
4625	NC_002506	GTA	2	6	289848	289853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601038
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4627	NC_002506	TGA	2	6	289874	289879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601038
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4643	NC_002506	GCT	2	6	291699	291704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601042
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4651	NC_002506	TC	3	6	292269	292274	0 %	50 %	0 %	50 %	15601043
4652	NC_002506	CTG	2	6	292286	292291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15601043
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4654	NC_002506	TTC	2	6	292343	292348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601043
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4729	NC_002506	CTCA	2	8	302234	302241	25 %	25 %	0 %	50 %	15601048
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4733	NC_002506	CGA	2	6	302356	302361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601048
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4746	NC_002506	GATG	2	8	303625	303632	25 %	25 %	50 %	0 %	15601049
4747	NC_002506	GTAC	2	8	303672	303679	25 %	25 %	25 %	25 %	15601049
4748	NC_002506	TCT	2	6	303731	303736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601049
4749	NC_002506	ACAAG	2	10	303747	303756	60 %	0 %	20 %	20 %	15601049
4750	NC_002506	ATT	2	6	303825	303830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601049
4751	NC_002506	CCT	2	6	303878	303883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15601049
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4755	NC_002506	GAA	2	6	304101	304106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601049
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4765	NC_002506	A	6	6	305173	305178	100 %	0 %	0 %	0 %	15601050
4766	NC_002506	TGAC	2	8	305201	305208	25 %	25 %	25 %	25 %	15601051
4767	NC_002506	ATC	2	6	305214	305219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601051
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4784	NC_002506	GCTA	2	8	306161	306168	25 %	25 %	25 %	25 %	15601052
4785	NC_002506	GAA	2	6	306176	306181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601052
4786	NC_002506	TAT	2	6	306497	306502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601053
4787	NC_002506	ATC	2	6	306666	306671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15601053
4788	NC_002506	CTTG	2	8	306725	306732	0 %	50 %	25 %	25 %	15601053
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4827	NC_002506	GA	3	6	308833	308838	50 %	0 %	50 %	0 %	15601864
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4843	NC_002506	AGC	2	6	309623	309628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601055
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4849	NC_002506	ATG	2	6	309990	309995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601056
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4851	NC_002506	CTTTT	2	10	310086	310095	0 %	80 %	0 %	20 %	15601056
4852	NC_002506	CCG	2	6	310117	310122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15601056
4853	NC_002506	T	7	7	310126	310132	0 %	100 %	0 %	0 %	15601056
4854	NC_002506	C	6	6	310228	310233	0 %	0 %	0 %	100 %	15601056
4855	NC_002506	ATCTC	2	10	310381	310390	20 %	40 %	0 %	40 %	15601056
4856	NC_002506	TGAG	2	8	310487	310494	25 %	25 %	50 %	0 %	15601056
4857	NC_002506	TTC	2	6	310557	310562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15601056
4858	NC_002506	TAT	2	6	310598	310603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15601056
4859	NC_002506	T	8	8	310649	310656	0 %	100 %	0 %	0 %	15601056
4860	NC_002506	AGA	2	6	311048	311053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601057
4861	NC_002506	CAG	2	6	311112	311117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15601057
4862	NC_002506	TAA	2	6	311126	311131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601057
4863	NC_002506	CTGC	2	8	311158	311165	0 %	25 %	25 %	50 %	15601057
4864	NC_002506	GAA	2	6	311187	311192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15601057
4865	NC_002506	AAT	2	6	311201	311206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15601057
4866	NC_002506	TGTC	2	8	311254	311261	0 %	50 %	25 %	25 %	15601057
4867	NC_002506	ATG	2	6	311471	311476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15601058
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