MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 33005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002505	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640033
2	NC_002505	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640033
3	NC_002505	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640034
4	NC_002505	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640034
5	NC_002505	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640034
6	NC_002505	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640034
7	NC_002505	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640034
8	NC_002505	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640035
9	NC_002505	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640035
10	NC_002505	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640035
11	NC_002505	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640035
12	NC_002505	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640035
13	NC_002505	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640035
14	NC_002505	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640035
15	NC_002505	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640035
16	NC_002505	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640035
17	NC_002505	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640035
18	NC_002505	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640035
19	NC_002505	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640035
20	NC_002505	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640035
21	NC_002505	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640035
22	NC_002505	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640035
23	NC_002505	AAT	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640035
24	NC_002505	ACC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640035
25	NC_002505	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640035
26	NC_002505	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640036
27	NC_002505	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640036
28	NC_002505	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640036
29	NC_002505	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640036
30	NC_002505	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640036
31	NC_002505	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640036
32	NC_002505	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640036
33	NC_002505	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640036
34	NC_002505	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640036
35	NC_002505	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640036
36	NC_002505	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640036
37	NC_002505	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640036
38	NC_002505	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640036
39	NC_002505	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640036
40	NC_002505	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640036
41	NC_002505	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640036
42	NC_002505	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640036
43	NC_002505	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640036
44	NC_002505	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640036
45	NC_002505	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640036
46	NC_002505	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640036
47	NC_002505	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640036
48	NC_002505	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640036
49	NC_002505	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640036
50	NC_002505	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640036
51	NC_002505	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640036
52	NC_002505	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640036
53	NC_002505	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640036
54	NC_002505	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640036
55	NC_002505	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640037
56	NC_002505	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640037
57	NC_002505	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640037
58	NC_002505	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640038
59	NC_002505	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640038
60	NC_002505	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640038
61	NC_002505	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640038
62	NC_002505	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640039
63	NC_002505	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640039
64	NC_002505	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640039
65	NC_002505	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640040
66	NC_002505	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640040
67	NC_002505	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640040
68	NC_002505	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640040
69	NC_002505	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640040
70	NC_002505	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640040
71	NC_002505	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640040
72	NC_002505	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640040
73	NC_002505	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640040
74	NC_002505	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640040
75	NC_002505	ACC	3	9	5669	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640041
76	NC_002505	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640041
77	NC_002505	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640041
78	NC_002505	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640041
79	NC_002505	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640041
80	NC_002505	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640041
81	NC_002505	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640041
82	NC_002505	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640042
83	NC_002505	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640042
84	NC_002505	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640042
85	NC_002505	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640044
86	NC_002505	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640044
87	NC_002505	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640044
88	NC_002505	TGG	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640044
89	NC_002505	CGG	2	6	7704	7709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640044
90	NC_002505	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640044
91	NC_002505	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640044
92	NC_002505	TGC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640044
93	NC_002505	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640044
94	NC_002505	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640044
95	NC_002505	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640044
96	NC_002505	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640044
97	NC_002505	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640044
98	NC_002505	AAC	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640044
99	NC_002505	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640044
100	NC_002505	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640044
101	NC_002505	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640044
102	NC_002505	CTA	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640044
103	NC_002505	TTG	2	6	8105	8110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640044
104	NC_002505	CGA	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640044
105	NC_002505	CAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640044
106	NC_002505	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640044
107	NC_002505	CTG	2	6	8180	8185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640044
108	NC_002505	ATT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640044
109	NC_002505	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640044
110	NC_002505	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640044
111	NC_002505	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640044
112	NC_002505	TGA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640044
113	NC_002505	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640044
114	NC_002505	ATA	2	6	8541	8546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640044
115	NC_002505	AGA	2	6	8550	8555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640044
116	NC_002505	TAC	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640044
117	NC_002505	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640044
118	NC_002505	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640044
119	NC_002505	GCA	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640045
120	NC_002505	GGT	2	6	8936	8941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640045
121	NC_002505	TTG	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640045
122	NC_002505	TGC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640045
123	NC_002505	CTA	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640045
124	NC_002505	CAC	2	6	9364	9369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640045
125	NC_002505	TGC	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640045
126	NC_002505	GTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640045
127	NC_002505	AAG	3	9	9768	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640045
128	NC_002505	TGG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640045
129	NC_002505	GAT	2	6	9929	9934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640045
130	NC_002505	CAG	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640046
131	NC_002505	TAA	2	6	10260	10265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640046
132	NC_002505	GGC	2	6	10297	10302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640046
133	NC_002505	CTG	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640046
134	NC_002505	TAT	2	6	10663	10668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640046
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137	NC_002505	GCA	2	6	10863	10868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640046
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139	NC_002505	TGA	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237023
140	NC_002505	CAC	2	6	11211	11216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237023
141	NC_002505	GGT	2	6	11228	11233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237023
142	NC_002505	TGA	2	6	11246	11251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237023
143	NC_002505	TCA	2	6	11380	11385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237023
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145	NC_002505	GAC	2	6	11415	11420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471237023
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147	NC_002505	GGT	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237023
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149	NC_002505	GTG	2	6	11509	11514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237023
150	NC_002505	CAT	2	6	11538	11543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237023
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153	NC_002505	AAC	2	6	11916	11921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237023
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156	NC_002505	AAC	2	6	11985	11990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471237023
157	NC_002505	AAG	2	6	12001	12006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237023
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159	NC_002505	TGA	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237023
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161	NC_002505	ATT	2	6	12228	12233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471237023
162	NC_002505	GCG	2	6	12237	12242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237023
163	NC_002505	GCG	2	6	12255	12260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237023
164	NC_002505	TGT	2	6	12487	12492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237023
165	NC_002505	AAG	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237023
166	NC_002505	TCA	2	6	12514	12519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471237023
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219	NC_002505	GAT	2	6	17304	17309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640052
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239	NC_002505	AGC	2	6	18589	18594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640052
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242	NC_002505	TGG	2	6	18888	18893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640052
243	NC_002505	CTT	2	6	18965	18970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237024
244	NC_002505	TAA	2	6	19005	19010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237024
245	NC_002505	TGG	2	6	19266	19271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237024
246	NC_002505	TGT	2	6	19588	19593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237024
247	NC_002505	TGA	2	6	19606	19611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237024
248	NC_002505	GTA	2	6	19625	19630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237024
249	NC_002505	TGC	2	6	19632	19637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237024
250	NC_002505	GCG	2	6	19676	19681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237024
251	NC_002505	TTG	2	6	19799	19804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237024
252	NC_002505	AAT	2	6	19810	19815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471237024
253	NC_002505	ATA	2	6	20253	20258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640054
254	NC_002505	TAC	2	6	20306	20311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640054
255	NC_002505	ATT	2	6	20391	20396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640054
256	NC_002505	GCC	2	6	20397	20402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640054
257	NC_002505	GTG	3	9	20451	20459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640054
258	NC_002505	TGG	2	6	20497	20502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640054
259	NC_002505	CTT	2	6	20603	20608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640054
260	NC_002505	TTG	2	6	20689	20694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640054
261	NC_002505	GAC	2	6	20696	20701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640054
262	NC_002505	GTG	2	6	20730	20735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640054
263	NC_002505	CCG	2	6	20752	20757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640054
264	NC_002505	TGG	3	9	21052	21060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640055
265	NC_002505	TGA	2	6	21070	21075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640055
266	NC_002505	ATT	2	6	21114	21119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640055
267	NC_002505	AAC	2	6	21151	21156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640055
268	NC_002505	GAA	2	6	21189	21194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640055
269	NC_002505	GTG	2	6	21390	21395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640056
270	NC_002505	CAT	2	6	21461	21466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640056
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272	NC_002505	CTG	2	6	21783	21788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640057
273	NC_002505	GTA	2	6	22127	22132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640058
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275	NC_002505	CTT	2	6	22157	22162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640058
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277	NC_002505	ACC	2	6	22265	22270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640058
278	NC_002505	GTT	2	6	22435	22440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640058
279	NC_002505	ATC	2	6	22635	22640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640058
280	NC_002505	AGT	2	6	22897	22902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640058
281	NC_002505	ATC	2	6	22937	22942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640058
282	NC_002505	TTG	2	6	22979	22984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640058
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286	NC_002505	ACC	2	6	23529	23534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640059
287	NC_002505	TCA	2	6	23566	23571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640059
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289	NC_002505	ATC	2	6	23682	23687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640059
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291	NC_002505	GCT	3	9	23891	23899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640059
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367	NC_002505	TGT	2	6	28479	28484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
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379	NC_002505	CAT	2	6	29439	29444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
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382	NC_002505	ATC	2	6	30225	30230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640064
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497	NC_002505	ATG	2	6	40412	40417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640074
498	NC_002505	CCG	2	6	40442	40447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640074
499	NC_002505	GAT	2	6	40516	40521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640074
500	NC_002505	AAG	2	6	40564	40569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640075

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