MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_002505	CAA	2	6	158466	158471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640192
2502	NC_002505	TGA	2	6	158517	158522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640192
2503	NC_002505	GTGC	2	8	158531	158538	0 %	25 %	50 %	25 %	15640192
2504	NC_002505	CAT	2	6	158578	158583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640192
2505	NC_002505	ATGAA	2	10	158658	158667	60 %	20 %	20 %	0 %	15640192
2506	NC_002505	CTG	2	6	158685	158690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640192
2507	NC_002505	AACGC	2	10	158810	158819	40 %	0 %	20 %	40 %	15640192
2508	NC_002505	CAT	2	6	158836	158841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640192
2509	NC_002505	TTAT	2	8	159050	159057	25 %	75 %	0 %	0 %	15640193
2510	NC_002505	T	6	6	159284	159289	0 %	100 %	0 %	0 %	15640193
2511	NC_002505	TCA	2	6	159445	159450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640194
2512	NC_002505	CAA	2	6	159482	159487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640194
2513	NC_002505	CCAGA	2	10	159569	159578	40 %	0 %	20 %	40 %	15640194
2514	NC_002505	TGC	2	6	159660	159665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640194
2515	NC_002505	GCAT	2	8	159703	159710	25 %	25 %	25 %	25 %	15640194
2516	NC_002505	TGT	2	6	159734	159739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640194
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2519	NC_002505	GA	3	6	159918	159923	50 %	0 %	50 %	0 %	15640194
2520	NC_002505	AAG	2	6	159946	159951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640194
2521	NC_002505	GC	3	6	159986	159991	0 %	0 %	50 %	50 %	15640194
2522	NC_002505	TGC	2	6	160055	160060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640194
2523	NC_002505	GCACC	2	10	160115	160124	20 %	0 %	20 %	60 %	15640194
2524	NC_002505	AGCG	2	8	160159	160166	25 %	0 %	50 %	25 %	15640194
2525	NC_002505	CTG	2	6	160223	160228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640194
2526	NC_002505	GTA	2	6	160236	160241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640194
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2529	NC_002505	CAGATC	2	12	160446	160457	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15640194
2530	NC_002505	GTG	2	6	160540	160545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640194
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2532	NC_002505	TGGCT	2	10	160661	160670	0 %	40 %	40 %	20 %	15640194
2533	NC_002505	GAACT	2	10	160752	160761	40 %	20 %	20 %	20 %	15640194
2534	NC_002505	CAGA	2	8	160772	160779	50 %	0 %	25 %	25 %	15640194
2535	NC_002505	CAT	2	6	160790	160795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640194
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2537	NC_002505	CAA	2	6	161099	161104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640194
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2539	NC_002505	GAT	2	6	161253	161258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640194
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2544	NC_002505	CAT	2	6	161391	161396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640194
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2550	NC_002505	CTGA	2	8	161885	161892	25 %	25 %	25 %	25 %	15640194
2551	NC_002505	GTT	2	6	161895	161900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640194
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2554	NC_002505	AC	3	6	162014	162019	50 %	0 %	0 %	50 %	15640194
2555	NC_002505	TCT	2	6	162154	162159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640194
2556	NC_002505	CTT	2	6	162161	162166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640194
2557	NC_002505	GCGA	2	8	162176	162183	25 %	0 %	50 %	25 %	15640194
2558	NC_002505	TAA	2	6	162338	162343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640194
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2560	NC_002505	CTG	2	6	162556	162561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640195
2561	NC_002505	GTG	2	6	162562	162567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640195
2562	NC_002505	CGA	2	6	162583	162588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640195
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2564	NC_002505	ATG	2	6	162825	162830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640195
2565	NC_002505	CAG	2	6	162919	162924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640195
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2567	NC_002505	TGG	2	6	163165	163170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640195
2568	NC_002505	TAG	2	6	163203	163208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640195
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2570	NC_002505	GCAG	2	8	163293	163300	25 %	0 %	50 %	25 %	15640195
2571	NC_002505	GC	3	6	163301	163306	0 %	0 %	50 %	50 %	15640195
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2585	NC_002505	T	6	6	164047	164052	0 %	100 %	0 %	0 %	15640196
2586	NC_002505	TCAA	2	8	164073	164080	50 %	25 %	0 %	25 %	15640196
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2589	NC_002505	CAAGA	2	10	164419	164428	60 %	0 %	20 %	20 %	15640197
2590	NC_002505	GGCGGG	2	12	164468	164479	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	15640197
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2594	NC_002505	CG	3	6	164632	164637	0 %	0 %	50 %	50 %	15640197
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2605	NC_002505	TGG	2	6	165040	165045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640197
2606	NC_002505	TGG	2	6	165121	165126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640197
2607	NC_002505	GAT	2	6	165129	165134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640197
2608	NC_002505	GTG	2	6	165157	165162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640197
2609	NC_002505	TGCG	2	8	165256	165263	0 %	25 %	50 %	25 %	15640197
2610	NC_002505	AAT	2	6	165357	165362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640197
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2613	NC_002505	T	6	6	165534	165539	0 %	100 %	0 %	0 %	15640197
2614	NC_002505	GC	4	8	165540	165547	0 %	0 %	50 %	50 %	15640197
2615	NC_002505	CAT	2	6	165560	165565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640197
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2619	NC_002505	TGGT	2	8	165780	165787	0 %	50 %	50 %	0 %	15640197
2620	NC_002505	GC	3	6	165833	165838	0 %	0 %	50 %	50 %	15640197
2621	NC_002505	GGT	2	6	165998	166003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640197
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2623	NC_002505	TGA	2	6	166072	166077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640197
2624	NC_002505	TGA	2	6	166163	166168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640197
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2872	NC_002505	GTTG	2	8	182437	182444	0 %	50 %	50 %	0 %	15640210
2873	NC_002505	CT	3	6	182482	182487	0 %	50 %	0 %	50 %	15640210
2874	NC_002505	TTG	2	6	182517	182522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640210
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2876	NC_002505	ATT	2	6	182642	182647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640210
2877	NC_002505	CTA	2	6	182712	182717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640210
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2879	NC_002505	CTG	3	9	182811	182819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640210
2880	NC_002505	GTG	2	6	182824	182829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640210
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2882	NC_002505	GAAG	2	8	182957	182964	50 %	0 %	50 %	0 %	15640210
2883	NC_002505	GACA	2	8	182997	183004	50 %	0 %	25 %	25 %	15640210
2884	NC_002505	GCA	2	6	183087	183092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640210
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2888	NC_002505	ATG	2	6	183207	183212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640210
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2902	NC_002505	CTG	2	6	183740	183745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640211
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2986	NC_002505	ATAC	2	8	187382	187389	50 %	25 %	0 %	25 %	15640214
2987	NC_002505	ACC	2	6	187431	187436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640214
2988	NC_002505	T	6	6	187445	187450	0 %	100 %	0 %	0 %	15640214
2989	NC_002505	ACA	2	6	187505	187510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640214
2990	NC_002505	GGC	2	6	187518	187523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640214
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2992	NC_002505	TTTG	2	8	187637	187644	0 %	75 %	25 %	0 %	15640214
2993	NC_002505	TAA	2	6	187667	187672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640214
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2995	NC_002505	T	7	7	187791	187797	0 %	100 %	0 %	0 %	15640214
2996	NC_002505	TC	3	6	187866	187871	0 %	50 %	0 %	50 %	15640214
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2999	NC_002505	GTTT	2	8	188110	188117	0 %	75 %	25 %	0 %	15640214
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