MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002505	GATT	2	8	61511	61518	25 %	50 %	25 %	0 %	15640093
1002	NC_002505	GCA	2	6	61540	61545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640093
1003	NC_002505	ATG	2	6	61670	61675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640093
1004	NC_002505	TG	3	6	61721	61726	0 %	50 %	50 %	0 %	15640093
1005	NC_002505	ACC	2	6	61795	61800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640093
1006	NC_002505	ATC	2	6	61889	61894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640093
1007	NC_002505	GAG	2	6	61915	61920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640093
1008	NC_002505	AGA	2	6	62066	62071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640094
1009	NC_002505	AGT	2	6	62095	62100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640094
1010	NC_002505	AGG	2	6	62114	62119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640094
1011	NC_002505	ACT	2	6	62135	62140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640094
1012	NC_002505	ATG	2	6	62182	62187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640094
1013	NC_002505	CGCT	2	8	62193	62200	0 %	25 %	25 %	50 %	15640094
1014	NC_002505	ATG	2	6	62222	62227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640094
1015	NC_002505	TGC	2	6	62265	62270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640094
1016	NC_002505	CTTG	2	8	62332	62339	0 %	50 %	25 %	25 %	15640094
1017	NC_002505	CT	3	6	62484	62489	0 %	50 %	0 %	50 %	15640094
1018	NC_002505	ACC	2	6	62509	62514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640094
1019	NC_002505	GAT	2	6	62566	62571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640094
1020	NC_002505	TCT	2	6	62589	62594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640094
1021	NC_002505	TTA	2	6	62841	62846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640094
1022	NC_002505	GCC	2	6	62956	62961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640094
1023	NC_002505	GGTT	2	8	62969	62976	0 %	50 %	50 %	0 %	15640094
1024	NC_002505	ACA	2	6	62997	63002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640094
1025	NC_002505	TGG	2	6	63024	63029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640094
1026	NC_002505	ATTG	2	8	63031	63038	25 %	50 %	25 %	0 %	15640094
1027	NC_002505	CGG	2	6	63074	63079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640094
1028	NC_002505	GTG	2	6	63085	63090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640094
1029	NC_002505	GCCA	2	8	63183	63190	25 %	0 %	25 %	50 %	15640094
1030	NC_002505	TTC	2	6	63255	63260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640095
1031	NC_002505	GCA	2	6	63304	63309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640095
1032	NC_002505	GT	3	6	63327	63332	0 %	50 %	50 %	0 %	15640095
1033	NC_002505	G	6	6	63347	63352	0 %	0 %	100 %	0 %	15640095
1034	NC_002505	TGG	2	6	63363	63368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640095
1035	NC_002505	TTGG	2	8	63377	63384	0 %	50 %	50 %	0 %	15640095
1036	NC_002505	CTT	2	6	63494	63499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640095
1037	NC_002505	GCAGC	2	10	63659	63668	20 %	0 %	40 %	40 %	15640095
1038	NC_002505	TCA	2	6	63675	63680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640095
1039	NC_002505	TGGG	2	8	63694	63701	0 %	25 %	75 %	0 %	15640095
1040	NC_002505	GT	3	6	63751	63756	0 %	50 %	50 %	0 %	15640095
1041	NC_002505	TGT	2	6	63811	63816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640095
1042	NC_002505	ATT	2	6	64062	64067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	533111997
1043	NC_002505	GCCT	2	8	64088	64095	0 %	25 %	25 %	50 %	533111997
1044	NC_002505	AAG	2	6	64137	64142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	533111997
1045	NC_002505	AC	3	6	64152	64157	50 %	0 %	0 %	50 %	533111997
1046	NC_002505	AGG	2	6	64203	64208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	533111997
1047	NC_002505	GCC	2	6	64308	64313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640097
1048	NC_002505	GATT	2	8	64349	64356	25 %	50 %	25 %	0 %	15640097
1049	NC_002505	CGA	2	6	64367	64372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640097
1050	NC_002505	TGC	2	6	64439	64444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640097
1051	NC_002505	GCC	2	6	64458	64463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640097
1052	NC_002505	GCTGC	2	10	64648	64657	0 %	20 %	40 %	40 %	15640097
1053	NC_002505	GCA	2	6	64684	64689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640097
1054	NC_002505	ATC	2	6	64722	64727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640097
1055	NC_002505	CCAAG	2	10	64733	64742	40 %	0 %	20 %	40 %	15640097
1056	NC_002505	TGC	2	6	64784	64789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640097
1057	NC_002505	CAA	2	6	65006	65011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640098
1058	NC_002505	CAG	2	6	65127	65132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640098
1059	NC_002505	CT	3	6	65222	65227	0 %	50 %	0 %	50 %	15640098
1060	NC_002505	TGAA	2	8	65295	65302	50 %	25 %	25 %	0 %	15640098
1061	NC_002505	GA	3	6	65316	65321	50 %	0 %	50 %	0 %	15640098
1062	NC_002505	ATC	2	6	65420	65425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640098
1063	NC_002505	AAGC	2	8	65426	65433	50 %	0 %	25 %	25 %	15640098
1064	NC_002505	GCA	2	6	65467	65472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640098
1065	NC_002505	AGA	2	6	65473	65478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640098
1066	NC_002505	GCA	2	6	65554	65559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640098
1067	NC_002505	GC	3	6	65649	65654	0 %	0 %	50 %	50 %	15640098
1068	NC_002505	GCG	2	6	65696	65701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640098
1069	NC_002505	TGA	2	6	65799	65804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640098
1070	NC_002505	CTTT	2	8	65864	65871	0 %	75 %	0 %	25 %	15640098
1071	NC_002505	TGA	2	6	66004	66009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640098
1072	NC_002505	TTG	2	6	66349	66354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640099
1073	NC_002505	TGA	2	6	66413	66418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640099
1074	NC_002505	TAA	2	6	66593	66598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640099
1075	NC_002505	TGT	2	6	66778	66783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640099
1076	NC_002505	AGCG	2	8	66795	66802	25 %	0 %	50 %	25 %	15640099
1077	NC_002505	TTG	2	6	66841	66846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640099
1078	NC_002505	CCA	2	6	66917	66922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640099
1079	NC_002505	TGG	2	6	66977	66982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640099
1080	NC_002505	GCG	2	6	66998	67003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640099
1081	NC_002505	GCT	2	6	67013	67018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640099
1082	NC_002505	T	6	6	67208	67213	0 %	100 %	0 %	0 %	15640099
1083	NC_002505	AGG	2	6	67226	67231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640099
1084	NC_002505	AG	3	6	67330	67335	50 %	0 %	50 %	0 %	15640099
1085	NC_002505	GAT	2	6	67365	67370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640099
1086	NC_002505	GC	3	6	67417	67422	0 %	0 %	50 %	50 %	15640099
1087	NC_002505	CTG	2	6	67445	67450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640099
1088	NC_002505	ACG	2	6	67550	67555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640099
1089	NC_002505	CGAT	2	8	67587	67594	25 %	25 %	25 %	25 %	15640099
1090	NC_002505	GCT	2	6	67609	67614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640099
1091	NC_002505	AATC	2	8	67686	67693	50 %	25 %	0 %	25 %	15640099
1092	NC_002505	CTG	2	6	67700	67705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640099
1093	NC_002505	CA	3	6	67710	67715	50 %	0 %	0 %	50 %	15640099
1094	NC_002505	GTT	2	6	67836	67841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640099
1095	NC_002505	CAA	2	6	67911	67916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640099
1096	NC_002505	GGC	2	6	67945	67950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640099
1097	NC_002505	GT	3	6	68063	68068	0 %	50 %	50 %	0 %	15640099
1098	NC_002505	CAGCG	2	10	68291	68300	20 %	0 %	40 %	40 %	15640100
1099	NC_002505	TC	3	6	68310	68315	0 %	50 %	0 %	50 %	15640100
1100	NC_002505	GT	3	6	68334	68339	0 %	50 %	50 %	0 %	15640100
1101	NC_002505	GGTAAT	2	12	68363	68374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640100
1102	NC_002505	CAG	2	6	68530	68535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640100
1103	NC_002505	CAC	2	6	68632	68637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640100
1104	NC_002505	CAG	2	6	68679	68684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640100
1105	NC_002505	CAT	2	6	68706	68711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640100
1106	NC_002505	CATG	2	8	68786	68793	25 %	25 %	25 %	25 %	15640100
1107	NC_002505	TCG	2	6	68829	68834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640100
1108	NC_002505	CCG	2	6	68874	68879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640100
1109	NC_002505	G	6	6	68907	68912	0 %	0 %	100 %	0 %	15640100
1110	NC_002505	TAG	2	6	68932	68937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640100
1111	NC_002505	AAG	2	6	68975	68980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640100
1112	NC_002505	AACA	2	8	69019	69026	75 %	0 %	0 %	25 %	15640100
1113	NC_002505	GTC	2	6	69031	69036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640100
1114	NC_002505	CG	4	8	69103	69110	0 %	0 %	50 %	50 %	15640100
1115	NC_002505	TCAA	2	8	69125	69132	50 %	25 %	0 %	25 %	15640100
1116	NC_002505	GTGAA	2	10	69289	69298	40 %	20 %	40 %	0 %	15640101
1117	NC_002505	AGC	2	6	69325	69330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640101
1118	NC_002505	ACT	2	6	69347	69352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640101
1119	NC_002505	CGAT	2	8	69373	69380	25 %	25 %	25 %	25 %	15640101
1120	NC_002505	TTTG	2	8	69461	69468	0 %	75 %	25 %	0 %	15640101
1121	NC_002505	CGA	2	6	69519	69524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640101
1122	NC_002505	AGC	2	6	69650	69655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640101
1123	NC_002505	ATTT	2	8	69673	69680	25 %	75 %	0 %	0 %	15640101
1124	NC_002505	GAT	2	6	69701	69706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640101
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1126	NC_002505	CT	3	6	69900	69905	0 %	50 %	0 %	50 %	15640101
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1128	NC_002505	CTG	2	6	69960	69965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640101
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1256	NC_002505	GCCAC	2	10	77022	77031	20 %	0 %	20 %	60 %	15640110
1257	NC_002505	AGA	2	6	77081	77086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640110
1258	NC_002505	TAA	2	6	77100	77105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640110
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1264	NC_002505	A	7	7	77283	77289	100 %	0 %	0 %	0 %	15640110
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1273	NC_002505	CAT	2	6	77620	77625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640111
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1366	NC_002505	CGG	2	6	82404	82409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640115
1367	NC_002505	TTGC	2	8	82458	82465	0 %	50 %	25 %	25 %	15640116
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1372	NC_002505	TCAG	2	8	82624	82631	25 %	25 %	25 %	25 %	15640116
1373	NC_002505	TGA	2	6	82642	82647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640116
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1375	NC_002505	CAAG	2	8	82739	82746	50 %	0 %	25 %	25 %	15640116
1376	NC_002505	TGA	2	6	82798	82803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640116
1377	NC_002505	TGG	2	6	82855	82860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640116
1378	NC_002505	CA	3	6	82861	82866	50 %	0 %	0 %	50 %	15640116
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1381	NC_002505	GCC	2	6	82970	82975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640116
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