MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002505	AG	3	6	27003	27008	50 %	0 %	50 %	0 %	15640061
502	NC_002505	CCA	2	6	27064	27069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640061
503	NC_002505	AGA	2	6	27078	27083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640061
504	NC_002505	CTT	2	6	27179	27184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640061
505	NC_002505	C	6	6	27197	27202	0 %	0 %	0 %	100 %	15640061
506	NC_002505	ATC	2	6	27217	27222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640061
507	NC_002505	TTG	2	6	27310	27315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640061
508	NC_002505	CG	3	6	27329	27334	0 %	0 %	50 %	50 %	15640061
509	NC_002505	ATG	2	6	27343	27348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640061
510	NC_002505	TCGA	2	8	27352	27359	25 %	25 %	25 %	25 %	15640061
511	NC_002505	GAT	2	6	27429	27434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640061
512	NC_002505	AGC	2	6	27455	27460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640061
513	NC_002505	TGCAT	2	10	27490	27499	20 %	40 %	20 %	20 %	15640061
514	NC_002505	ATC	2	6	27535	27540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640061
515	NC_002505	CAG	2	6	27563	27568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640061
516	NC_002505	TTG	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640061
517	NC_002505	CCTT	2	8	27587	27594	0 %	50 %	0 %	50 %	15640061
518	NC_002505	TGT	2	6	27609	27614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640062
519	NC_002505	GTT	2	6	27617	27622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640062
520	NC_002505	CTTG	2	8	27778	27785	0 %	50 %	25 %	25 %	15640062
521	NC_002505	TAA	2	6	27827	27832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640062
522	NC_002505	TCT	2	6	27950	27955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640063
523	NC_002505	TCA	2	6	27956	27961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
524	NC_002505	GCA	2	6	27972	27977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
525	NC_002505	CGCAG	2	10	28007	28016	20 %	0 %	40 %	40 %	15640063
526	NC_002505	CTT	3	9	28023	28031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640063
527	NC_002505	TCA	2	6	28233	28238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
528	NC_002505	CAC	2	6	28251	28256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640063
529	NC_002505	GCA	2	6	28292	28297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
530	NC_002505	GCC	2	6	28304	28309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640063
531	NC_002505	GC	3	6	28364	28369	0 %	0 %	50 %	50 %	15640063
532	NC_002505	TGC	2	6	28379	28384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640063
533	NC_002505	CAT	2	6	28438	28443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
534	NC_002505	AGC	2	6	28460	28465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
535	NC_002505	GTG	2	6	28467	28472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640063
536	NC_002505	TGT	2	6	28479	28484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
537	NC_002505	GAT	2	6	28491	28496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640063
538	NC_002505	ATG	2	6	28534	28539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640063
539	NC_002505	GCA	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
540	NC_002505	TTG	2	6	28628	28633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
541	NC_002505	CGG	2	6	28638	28643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640063
542	NC_002505	TCA	2	6	28709	28714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
543	NC_002505	CCAC	2	8	28919	28926	25 %	0 %	0 %	75 %	15640063
544	NC_002505	ATACA	2	10	28927	28936	60 %	20 %	0 %	20 %	15640063
545	NC_002505	CCA	2	6	29070	29075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640063
546	NC_002505	GAC	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640063
547	NC_002505	AG	3	6	29176	29181	50 %	0 %	50 %	0 %	15640063
548	NC_002505	CATC	2	8	29196	29203	25 %	25 %	0 %	50 %	15640063
549	NC_002505	TG	3	6	29226	29231	0 %	50 %	50 %	0 %	15640063
550	NC_002505	TGG	2	6	29307	29312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640063
551	NC_002505	GC	3	6	29359	29364	0 %	0 %	50 %	50 %	15640063
552	NC_002505	CGC	2	6	29383	29388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640063
553	NC_002505	GGC	2	6	29400	29405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640063
554	NC_002505	CAT	2	6	29439	29444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640063
555	NC_002505	GCC	2	6	29461	29466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640063
556	NC_002505	TGT	2	6	29495	29500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640063
557	NC_002505	TCAT	2	8	30082	30089	25 %	50 %	0 %	25 %	15640064
558	NC_002505	CG	3	6	30202	30207	0 %	0 %	50 %	50 %	15640064
559	NC_002505	ATC	2	6	30225	30230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640064
560	NC_002505	G	6	6	30299	30304	0 %	0 %	100 %	0 %	15640064
561	NC_002505	GGC	2	6	30338	30343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640064
562	NC_002505	TGCC	2	8	30436	30443	0 %	25 %	25 %	50 %	15640064
563	NC_002505	TGG	2	6	30475	30480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640064
564	NC_002505	GGC	2	6	30503	30508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640064
565	NC_002505	TG	3	6	30568	30573	0 %	50 %	50 %	0 %	15640064
566	NC_002505	CAA	2	6	30615	30620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640064
567	NC_002505	CAT	2	6	30647	30652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640064
568	NC_002505	CAG	3	9	30657	30665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640064
569	NC_002505	TGA	2	6	30785	30790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640064
570	NC_002505	CT	3	6	30818	30823	0 %	50 %	0 %	50 %	15640064
571	NC_002505	GCA	2	6	30827	30832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640064
572	NC_002505	GCACC	2	10	30873	30882	20 %	0 %	20 %	60 %	15640064
573	NC_002505	GGC	2	6	30896	30901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640064
574	NC_002505	GGC	2	6	30912	30917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640064
575	NC_002505	TC	3	6	30942	30947	0 %	50 %	0 %	50 %	15640064
576	NC_002505	ACT	2	6	30959	30964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640064
577	NC_002505	CG	4	8	31048	31055	0 %	0 %	50 %	50 %	15640064
578	NC_002505	CTA	2	6	31121	31126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640064
579	NC_002505	TTG	2	6	31194	31199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640064
580	NC_002505	GTG	2	6	31267	31272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640064
581	NC_002505	CGG	2	6	31279	31284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640064
582	NC_002505	TGC	2	6	31351	31356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640064
583	NC_002505	GC	3	6	31417	31422	0 %	0 %	50 %	50 %	15640064
584	NC_002505	CAT	2	6	31460	31465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640064
585	NC_002505	GTG	3	9	31718	31726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640065
586	NC_002505	GCT	2	6	31747	31752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640065
587	NC_002505	TGC	2	6	31782	31787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640065
588	NC_002505	GCG	2	6	31820	31825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640065
589	NC_002505	CTG	2	6	31937	31942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640065
590	NC_002505	AGC	2	6	32028	32033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640065
591	NC_002505	CTG	2	6	32036	32041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640065
592	NC_002505	CTG	2	6	32114	32119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640065
593	NC_002505	CGA	2	6	32151	32156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640065
594	NC_002505	AGC	2	6	32238	32243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640065
595	NC_002505	GCG	2	6	32250	32255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640065
596	NC_002505	GGT	2	6	32288	32293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640065
597	NC_002505	ATT	2	6	32336	32341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640065
598	NC_002505	CAG	2	6	32656	32661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640066
599	NC_002505	TCG	2	6	32684	32689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640066
600	NC_002505	GTT	2	6	32725	32730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640066
601	NC_002505	AAC	3	9	32731	32739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640066
602	NC_002505	CGC	2	6	32836	32841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640066
603	NC_002505	CTTCCA	2	12	32943	32954	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15640066
604	NC_002505	ACC	2	6	33001	33006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640066
605	NC_002505	CTG	2	6	33052	33057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640066
606	NC_002505	ATG	2	6	33071	33076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640066
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608	NC_002505	GAA	2	6	33134	33139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640066
609	NC_002505	CTT	2	6	33174	33179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640066
610	NC_002505	GCCAT	2	10	33423	33432	20 %	20 %	20 %	40 %	161582037
611	NC_002505	TTG	2	6	33478	33483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161582037
612	NC_002505	TGCG	2	8	33597	33604	0 %	25 %	50 %	25 %	161582037
613	NC_002505	TGGG	2	8	33686	33693	0 %	25 %	75 %	0 %	161582037
614	NC_002505	TGC	2	6	33701	33706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161582037
615	NC_002505	A	6	6	33739	33744	100 %	0 %	0 %	0 %	161582037
616	NC_002505	GTG	2	6	33973	33978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161582037
617	NC_002505	GCG	2	6	34002	34007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582037
618	NC_002505	TCT	2	6	34022	34027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161582037
619	NC_002505	CTT	2	6	34056	34061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161582037
620	NC_002505	CAC	2	6	34102	34107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161582037
621	NC_002505	GCG	2	6	34111	34116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161582037
622	NC_002505	TGG	2	6	34354	34359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237025
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624	NC_002505	TTTG	2	8	34472	34479	0 %	75 %	25 %	0 %	471237025
625	NC_002505	GCT	2	6	34532	34537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237025
626	NC_002505	TTG	2	6	34543	34548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471237025
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628	NC_002505	CGG	2	6	34646	34651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471237025
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887	NC_002505	CAATC	2	10	49074	49083	40 %	20 %	0 %	40 %	15640083
888	NC_002505	GTC	2	6	49104	49109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640083
889	NC_002505	ATC	2	6	49120	49125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640083
890	NC_002505	ACG	2	6	49176	49181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640083
891	NC_002505	CGC	2	6	49184	49189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640083
892	NC_002505	GCGA	2	8	49405	49412	25 %	0 %	50 %	25 %	15640083
893	NC_002505	CAT	2	6	49413	49418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640083
894	NC_002505	GC	3	6	49419	49424	0 %	0 %	50 %	50 %	15640083
895	NC_002505	AC	3	6	49448	49453	50 %	0 %	0 %	50 %	15640083
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900	NC_002505	GCG	2	6	49723	49728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640084
901	NC_002505	GCC	2	6	49752	49757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640084
902	NC_002505	GAT	2	6	49767	49772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640084
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926	NC_002505	TTG	2	6	51119	51124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640087
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945	NC_002505	TGG	2	6	52060	52065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640088
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982	NC_002505	AG	3	6	60262	60267	50 %	0 %	50 %	0 %	15640093
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1000	NC_002505	CAAA	2	8	61487	61494	75 %	0 %	0 %	25 %	15640093

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