MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 chromosome I

Total Repeats: 48567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_002505	CGAG	2	8	307799	307806	25 %	0 %	50 %	25 %	15640327
5003	NC_002505	GC	3	6	307821	307826	0 %	0 %	50 %	50 %	15640327
5004	NC_002505	TAA	2	6	307884	307889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640327
5005	NC_002505	TCA	2	6	307895	307900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640327
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5008	NC_002505	GTT	2	6	308002	308007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640328
5009	NC_002505	GTTG	2	8	308017	308024	0 %	50 %	50 %	0 %	15640328
5010	NC_002505	GTGCT	2	10	308025	308034	0 %	40 %	40 %	20 %	15640328
5011	NC_002505	GCT	2	6	308044	308049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640328
5012	NC_002505	T	6	6	308123	308128	0 %	100 %	0 %	0 %	15640328
5013	NC_002505	GC	3	6	308190	308195	0 %	0 %	50 %	50 %	15640328
5014	NC_002505	CTTG	2	8	308242	308249	0 %	50 %	25 %	25 %	15640328
5015	NC_002505	TGC	2	6	308346	308351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640328
5016	NC_002505	AGC	2	6	308373	308378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640328
5017	NC_002505	TCAG	2	8	308460	308467	25 %	25 %	25 %	25 %	15640328
5018	NC_002505	GCA	2	6	308551	308556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640328
5019	NC_002505	ATG	2	6	308577	308582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640328
5020	NC_002505	ATG	2	6	308616	308621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640328
5021	NC_002505	CCGAG	2	10	308668	308677	20 %	0 %	40 %	40 %	15640328
5022	NC_002505	ACT	2	6	308679	308684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640328
5023	NC_002505	GCA	2	6	308687	308692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640328
5024	NC_002505	GGA	2	6	308709	308714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640328
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5026	NC_002505	TGTT	2	8	308826	308833	0 %	75 %	25 %	0 %	15640328
5027	NC_002505	GGC	2	6	308834	308839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640328
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5030	NC_002505	TCA	3	9	308992	309000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640328
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5033	NC_002505	TGCA	2	8	309101	309108	25 %	25 %	25 %	25 %	15640328
5034	NC_002505	GTT	2	6	309217	309222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640328
5035	NC_002505	GCT	2	6	309241	309246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640328
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5037	NC_002505	CTG	2	6	309320	309325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640328
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5039	NC_002505	TTA	2	6	309363	309368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640328
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5041	NC_002505	A	7	7	309411	309417	100 %	0 %	0 %	0 %	15640328
5042	NC_002505	GCA	2	6	309427	309432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640328
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5048	NC_002505	TGC	2	6	309672	309677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640328
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5057	NC_002505	TTGG	2	8	310122	310129	0 %	50 %	50 %	0 %	15640330
5058	NC_002505	CGC	2	6	310171	310176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640330
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5105	NC_002505	CG	3	6	312780	312785	0 %	0 %	50 %	50 %	15640331
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5112	NC_002505	GATT	2	8	313269	313276	25 %	50 %	25 %	0 %	15640331
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5123	NC_002505	CGC	2	6	313906	313911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15640331
5124	NC_002505	CAT	2	6	313941	313946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640331
5125	NC_002505	TGC	2	6	313974	313979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640331
5126	NC_002505	TG	3	6	314083	314088	0 %	50 %	50 %	0 %	15640331
5127	NC_002505	AGC	2	6	314118	314123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640331
5128	NC_002505	GAG	2	6	314135	314140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15640331
5129	NC_002505	TCA	2	6	314224	314229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640331
5130	NC_002505	GGGCA	2	10	314252	314261	20 %	0 %	60 %	20 %	15640331
5131	NC_002505	CGT	2	6	314301	314306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640331
5132	NC_002505	CACT	2	8	314307	314314	25 %	25 %	0 %	50 %	15640331
5133	NC_002505	TG	3	6	314370	314375	0 %	50 %	50 %	0 %	15640331
5134	NC_002505	TTGG	2	8	314396	314403	0 %	50 %	50 %	0 %	15640331
5135	NC_002505	ACGG	2	8	314529	314536	25 %	0 %	50 %	25 %	15640331
5136	NC_002505	TGC	2	6	314550	314555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640331
5137	NC_002505	ATC	2	6	314597	314602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640331
5138	NC_002505	GTCT	2	8	314706	314713	0 %	50 %	25 %	25 %	15640331
5139	NC_002505	GCCA	2	8	314862	314869	25 %	0 %	25 %	50 %	15640332
5140	NC_002505	TCTAAC	2	12	314891	314902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640332
5141	NC_002505	T	6	6	314921	314926	0 %	100 %	0 %	0 %	15640332
5142	NC_002505	GCCA	2	8	314927	314934	25 %	0 %	25 %	50 %	15640332
5143	NC_002505	GCA	2	6	315036	315041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640332
5144	NC_002505	AAT	2	6	315135	315140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640332
5145	NC_002505	C	7	7	315201	315207	0 %	0 %	0 %	100 %	15640332
5146	NC_002505	T	6	6	315208	315213	0 %	100 %	0 %	0 %	15640332
5147	NC_002505	GCA	2	6	315258	315263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640332
5148	NC_002505	GC	3	6	315394	315399	0 %	0 %	50 %	50 %	15640332
5149	NC_002505	TCT	2	6	315407	315412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640332
5150	NC_002505	CCGC	2	8	315461	315468	0 %	0 %	25 %	75 %	15640332
5151	NC_002505	GAT	2	6	315582	315587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640332
5152	NC_002505	GCTT	2	8	315599	315606	0 %	50 %	25 %	25 %	15640332
5153	NC_002505	GTACC	2	10	315681	315690	20 %	20 %	20 %	40 %	15640332
5154	NC_002505	AC	4	8	315701	315708	50 %	0 %	0 %	50 %	15640332
5155	NC_002505	TGAG	2	8	315731	315738	25 %	25 %	50 %	0 %	15640332
5156	NC_002505	GGC	2	6	315760	315765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640332
5157	NC_002505	TTA	2	6	315776	315781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640332
5158	NC_002505	TGG	2	6	315786	315791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640332
5159	NC_002505	CA	3	6	315832	315837	50 %	0 %	0 %	50 %	15640332
5160	NC_002505	CAC	2	6	315903	315908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640332
5161	NC_002505	ACT	2	6	315917	315922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640332
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5163	NC_002505	TGG	2	6	316053	316058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640332
5164	NC_002505	GCATC	2	10	316155	316164	20 %	20 %	20 %	40 %	15640332
5165	NC_002505	GCA	2	6	316298	316303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640332
5166	NC_002505	GAA	2	6	316313	316318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15640332
5167	NC_002505	GTG	2	6	316360	316365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640333
5168	NC_002505	GCG	2	6	316373	316378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640333
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5170	NC_002505	TATTGC	2	12	316405	316416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15640333
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5172	NC_002505	TGT	2	6	316443	316448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15640333
5173	NC_002505	CGA	2	6	316451	316456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640333
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5176	NC_002505	GTCG	2	8	316715	316722	0 %	25 %	50 %	25 %	15640333
5177	NC_002505	T	6	6	316775	316780	0 %	100 %	0 %	0 %	15640333
5178	NC_002505	CAGT	2	8	316795	316802	25 %	25 %	25 %	25 %	15640333
5179	NC_002505	GGT	2	6	316813	316818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640333
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5182	NC_002505	AGC	2	6	316917	316922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640333
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5184	NC_002505	T	6	6	316978	316983	0 %	100 %	0 %	0 %	15640333
5185	NC_002505	ACC	2	6	316995	317000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640333
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5188	NC_002505	TAA	2	6	317128	317133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15640333
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5192	NC_002505	CAA	2	6	317333	317338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640333
5193	NC_002505	CAT	2	6	317347	317352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640333
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5195	NC_002505	GCCTG	2	10	317499	317508	0 %	20 %	40 %	40 %	15640333
5196	NC_002505	AAAC	2	8	317566	317573	75 %	0 %	0 %	25 %	15640333
5197	NC_002505	T	7	7	317577	317583	0 %	100 %	0 %	0 %	15640333
5198	NC_002505	GTG	2	6	317860	317865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15640334
5199	NC_002505	GAT	2	6	317878	317883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640334
5200	NC_002505	ACC	2	6	317968	317973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15640334
5201	NC_002505	CTG	3	9	318002	318010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640334
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5203	NC_002505	ATT	2	6	318391	318396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640335
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5205	NC_002505	TTC	2	6	318461	318466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640335
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5215	NC_002505	CTG	2	6	318910	318915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640335
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5226	NC_002505	CGT	2	6	319387	319392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15640335
5227	NC_002505	CGATG	2	10	319470	319479	20 %	20 %	40 %	20 %	15640335
5228	NC_002505	TGAT	2	8	319487	319494	25 %	50 %	25 %	0 %	15640335
5229	NC_002505	CAA	2	6	319653	319658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640336
5230	NC_002505	TTC	2	6	319675	319680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640336
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5240	NC_002505	ATG	2	6	320073	320078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640336
5241	NC_002505	TTC	2	6	320132	320137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640336
5242	NC_002505	TTA	2	6	320166	320171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15640336
5243	NC_002505	TAC	2	6	320228	320233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15640336
5244	NC_002505	GCG	2	6	320285	320290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640336
5245	NC_002505	ATG	2	6	320338	320343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640336
5246	NC_002505	TGCT	2	8	320407	320414	0 %	50 %	25 %	25 %	15640336
5247	NC_002505	ATTG	2	8	320453	320460	25 %	50 %	25 %	0 %	15640336
5248	NC_002505	TGCT	2	8	320545	320552	0 %	50 %	25 %	25 %	15640336
5249	NC_002505	CAA	2	6	320644	320649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15640336
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5253	NC_002505	CAG	2	6	320952	320957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640337
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5369	NC_002505	TTTCA	2	10	334069	334078	20 %	60 %	0 %	20 %	15640347
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5373	NC_002505	GAT	2	6	334275	334280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15640347
5374	NC_002505	AG	3	6	334296	334301	50 %	0 %	50 %	0 %	15640347
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5377	NC_002505	AGAT	2	8	334463	334470	50 %	25 %	25 %	0 %	15640347
5378	NC_002505	AG	3	6	334534	334539	50 %	0 %	50 %	0 %	15640347
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5387	NC_002505	GCA	2	6	335606	335611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15640348
5388	NC_002505	CGG	2	6	335620	335625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15640348
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5401	NC_002505	TTC	2	6	336287	336292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15640348
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5494	NC_002505	GTG	2	6	341108	341113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471237035
5495	NC_002505	CGT	2	6	341167	341172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471237035
5496	NC_002505	TGAA	2	8	341273	341280	50 %	25 %	25 %	0 %	471237035
5497	NC_002505	ATG	2	6	341473	341478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471237035
5498	NC_002505	CCA	2	6	341491	341496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471237035
5499	NC_002505	AAG	2	6	341501	341506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471237035
5500	NC_002505	TTC	2	6	341533	341538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471237035

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