MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 1461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022543	CTTCC	2	10	726	735	0 %	40 %	0 %	60 %	549718282
2	NC_022543	GGTTT	2	10	983	992	0 %	60 %	40 %	0 %	549718282
3	NC_022543	TTAAT	2	10	3350	3359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022543	AGTTG	2	10	3484	3493	20 %	40 %	40 %	0 %	549718283
5	NC_022543	GACTG	2	10	4299	4308	20 %	20 %	40 %	20 %	549718283
6	NC_022543	GGCAG	2	10	4804	4813	20 %	0 %	60 %	20 %	549718284
7	NC_022543	AAGAT	2	10	6179	6188	60 %	20 %	20 %	0 %	549718285
8	NC_022543	ATGGC	2	10	6991	7000	20 %	20 %	40 %	20 %	549718285
9	NC_022543	AGTGA	2	10	7255	7264	40 %	20 %	40 %	0 %	549718285
10	NC_022543	CTTCA	2	10	8085	8094	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_022543	TCTTT	2	10	8384	8393	0 %	80 %	0 %	20 %	549718286
12	NC_022543	TTTTA	2	10	11566	11575	20 %	80 %	0 %	0 %	549718290
13	NC_022543	CAGAG	2	10	12857	12866	40 %	0 %	40 %	20 %	549718291
14	NC_022543	TGGAA	2	10	13220	13229	40 %	20 %	40 %	0 %	549718291
15	NC_022543	TAACC	2	10	13539	13548	40 %	20 %	0 %	40 %	549718291
16	NC_022543	AGCCG	2	10	14524	14533	20 %	0 %	40 %	40 %	549718291
17	NC_022543	GATGA	2	10	14545	14554	40 %	20 %	40 %	0 %	549718291
18	NC_022543	GCCAA	2	10	14757	14766	40 %	0 %	20 %	40 %	549718291
19	NC_022543	ATCGC	2	10	19250	19259	20 %	20 %	20 %	40 %	549718297
20	NC_022543	CACTC	2	10	21329	21338	20 %	20 %	0 %	60 %	549718298
21	NC_022543	CCTAT	2	10	22509	22518	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_022543	TTTCT	2	10	22667	22676	0 %	80 %	0 %	20 %	549718299
23	NC_022543	AGTTA	2	10	22901	22910	40 %	40 %	20 %	0 %	549718299
24	NC_022543	ATGTC	2	10	24221	24230	20 %	40 %	20 %	20 %	549718301
25	NC_022543	ACCAT	2	10	24409	24418	40 %	20 %	0 %	40 %	549718301
26	NC_022543	TACCC	2	10	26253	26262	20 %	20 %	0 %	60 %	549718303
27	NC_022543	AAAAG	2	10	28231	28240	80 %	0 %	20 %	0 %	549718303
28	NC_022543	CGATG	2	10	28452	28461	20 %	20 %	40 %	20 %	549718304
29	NC_022543	CCTTG	2	10	32252	32261	0 %	40 %	20 %	40 %	549718306
30	NC_022543	TAAAA	2	10	34684	34693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022543	GTCCA	2	10	38623	38632	20 %	20 %	20 %	40 %	549718312
32	NC_022543	GTCTG	2	10	39368	39377	0 %	40 %	40 %	20 %	549718313
33	NC_022543	TGCTA	2	10	39758	39767	20 %	40 %	20 %	20 %	549718313
34	NC_022543	CCAGC	2	10	45429	45438	20 %	0 %	20 %	60 %	549718318
35	NC_022543	AAAAG	2	10	47509	47518	80 %	0 %	20 %	0 %	549718318
36	NC_022543	TCGTT	2	10	48362	48371	0 %	60 %	20 %	20 %	549718319
37	NC_022543	TTAAT	2	10	48549	48558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022543	TGGTC	2	10	49443	49452	0 %	40 %	40 %	20 %	549718320
39	NC_022543	GTTCT	2	10	49786	49795	0 %	60 %	20 %	20 %	549718320
40	NC_022543	ACCAC	2	10	50456	50465	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
41	NC_022543	AGGCA	2	10	53588	53597	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_022543	AGGTG	2	10	55657	55666	20 %	20 %	60 %	0 %	549718324
43	NC_022543	TGAAT	2	10	55798	55807	40 %	40 %	20 %	0 %	549718324
44	NC_022543	GCTTG	2	10	57394	57403	0 %	40 %	40 %	20 %	549718324
45	NC_022543	AACTG	2	10	58948	58957	40 %	20 %	20 %	20 %	549718324
46	NC_022543	GCGAA	2	10	59967	59976	40 %	0 %	40 %	20 %	549718324
47	NC_022543	GCAGG	2	10	67064	67073	20 %	0 %	60 %	20 %	549718330
48	NC_022543	CATAA	2	10	68114	68123	60 %	20 %	0 %	20 %	549718331
49	NC_022543	CGACC	2	10	71163	71172	20 %	0 %	20 %	60 %	549718336
50	NC_022543	AAGTT	2	10	72221	72230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022543	AATCC	2	10	73395	73404	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_022543	AATTG	2	10	76226	76235	40 %	40 %	20 %	0 %	549718340
53	NC_022543	GATGC	2	10	76906	76915	20 %	20 %	40 %	20 %	549718341
54	NC_022543	CGTAG	2	10	77210	77219	20 %	20 %	40 %	20 %	549718341
55	NC_022543	TGAAG	2	10	81160	81169	40 %	20 %	40 %	0 %	549718345
56	NC_022543	TTCTC	2	10	81506	81515	0 %	60 %	0 %	40 %	549718345
57	NC_022543	GACAA	2	10	83720	83729	60 %	0 %	20 %	20 %	549718346
58	NC_022543	TAACT	2	10	86938	86947	40 %	40 %	0 %	20 %	549718348
59	NC_022543	GCATT	2	10	88284	88293	20 %	40 %	20 %	20 %	549718349
60	NC_022543	AGAAT	2	10	89846	89855	60 %	20 %	20 %	0 %	549718351
61	NC_022543	GGCTT	2	10	89973	89982	0 %	40 %	40 %	20 %	549718351
62	NC_022543	GACAT	2	10	93050	93059	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_022543	ATCGC	2	10	94981	94990	20 %	20 %	20 %	40 %	549718356
64	NC_022543	TAATG	2	10	100388	100397	40 %	40 %	20 %	0 %	549718360
65	NC_022543	CGATT	2	10	102537	102546	20 %	40 %	20 %	20 %	549718362
66	NC_022543	GAACG	2	10	103158	103167	40 %	0 %	40 %	20 %	549718362
67	NC_022543	GGCTT	2	10	104181	104190	0 %	40 %	40 %	20 %	549718362
68	NC_022543	CCAAA	2	10	105403	105412	60 %	0 %	0 %	40 %	549718363
69	NC_022543	TTCAT	2	10	106072	106081	20 %	60 %	0 %	20 %	549718364
70	NC_022543	TGTAT	2	10	107061	107070	20 %	60 %	20 %	0 %	549718364
71	NC_022543	TTGGC	2	10	107312	107321	0 %	40 %	40 %	20 %	549718364
72	NC_022543	TGAGT	2	10	107617	107626	20 %	40 %	40 %	0 %	549718365
73	NC_022543	GCACC	2	10	108966	108975	20 %	0 %	20 %	60 %	549718366
74	NC_022543	AAACG	2	10	114553	114562	60 %	0 %	20 %	20 %	549718373
75	NC_022543	AGGCA	2	10	114783	114792	40 %	0 %	40 %	20 %	549718373
76	NC_022543	ATTAT	2	10	118256	118265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022543	GTTTT	2	10	119437	119446	0 %	80 %	20 %	0 %	549718376
78	NC_022543	TGTTA	2	10	121013	121022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022543	AAATT	2	10	121127	121136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022543	AGGAC	2	10	121801	121810	40 %	0 %	40 %	20 %	549718378
81	NC_022543	GACAA	2	10	124451	124460	60 %	0 %	20 %	20 %	549718381
82	NC_022543	TGACG	2	10	124556	124565	20 %	20 %	40 %	20 %	549718381
83	NC_022543	CTTTT	2	10	125180	125189	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022543	CAACC	2	10	127828	127837	40 %	0 %	0 %	60 %	549718385
85	NC_022543	ATAAG	2	10	131803	131812	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022543	ATTAA	2	10	135088	135097	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022543	ATTTA	2	10	135202	135211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022543	TTTTA	2	10	135242	135251	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022543	GTGAA	2	10	136724	136733	40 %	20 %	40 %	0 %	549718394
90	NC_022543	GCAGA	2	10	137029	137038	40 %	0 %	40 %	20 %	549718394
91	NC_022543	ATGGA	2	10	138349	138358	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022543	AAAAG	2	10	140692	140701	80 %	0 %	20 %	0 %	549718395
93	NC_022543	CATGG	2	10	140912	140921	20 %	20 %	40 %	20 %	549718395
94	NC_022543	ACAAT	2	10	141271	141280	60 %	20 %	0 %	20 %	549718395
95	NC_022543	TACGA	2	10	141518	141527	40 %	20 %	20 %	20 %	549718395
96	NC_022543	AGCAG	2	10	142538	142547	40 %	0 %	40 %	20 %	549718396
97	NC_022543	GAATG	2	10	146699	146708	40 %	20 %	40 %	0 %	549718402
98	NC_022543	GATCA	2	10	147532	147541	40 %	20 %	20 %	20 %	549718403
99	NC_022543	ATCAC	2	10	148190	148199	40 %	20 %	0 %	40 %	549718404
100	NC_022543	AGCGA	2	10	148300	148309	40 %	0 %	40 %	20 %	549718404
101	NC_022543	AGAGT	2	10	152687	152696	40 %	20 %	40 %	0 %	549718408
102	NC_022543	ATGTG	2	10	152803	152812	20 %	40 %	40 %	0 %	549718408
103	NC_022543	GTCGG	2	10	153691	153700	0 %	20 %	60 %	20 %	549718409
104	NC_022543	TCTCA	2	10	155225	155234	20 %	40 %	0 %	40 %	549718410
105	NC_022543	TTTTC	2	10	155821	155830	0 %	80 %	0 %	20 %	549718410
106	NC_022543	TGCCA	2	10	155843	155852	20 %	20 %	20 %	40 %	549718410
107	NC_022543	GCTTT	2	10	156191	156200	0 %	60 %	20 %	20 %	549718410
108	NC_022543	TGAAC	2	10	159915	159924	40 %	20 %	20 %	20 %	549718414
109	NC_022543	GCTTG	2	10	161275	161284	0 %	40 %	40 %	20 %	549718416
110	NC_022543	TGCTC	2	10	162369	162378	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_022543	AATGC	2	10	162779	162788	40 %	20 %	20 %	20 %	549718418
112	NC_022543	ATTTC	2	10	163105	163114	20 %	60 %	0 %	20 %	549718419
113	NC_022543	GAATG	2	10	167174	167183	40 %	20 %	40 %	0 %	549718424
114	NC_022543	GGGTG	2	10	168946	168955	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022543	CTACT	2	10	169826	169835	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_022543	TCAAA	2	10	170193	170202	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_022543	GAACA	2	10	170308	170317	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_022543	GTGAA	2	10	170481	170490	40 %	20 %	40 %	0 %	549718425
119	NC_022543	TTCGA	2	10	172843	172852	20 %	40 %	20 %	20 %	549718427
120	NC_022543	AGCTC	2	10	172996	173005	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_022543	TGGCT	2	10	175060	175069	0 %	40 %	40 %	20 %	549718429
122	NC_022543	GCAAG	2	10	177162	177171	40 %	0 %	40 %	20 %	549718431
123	NC_022543	CAAAA	2	10	177270	177279	80 %	0 %	0 %	20 %	549718431
124	NC_022543	GCAAA	2	10	178457	178466	60 %	0 %	20 %	20 %	549718431
125	NC_022543	CCACG	2	10	180734	180743	20 %	0 %	20 %	60 %	549718433
126	NC_022543	CAAAG	2	10	183377	183386	60 %	0 %	20 %	20 %	549718435
127	NC_022543	CGTTA	2	10	185680	185689	20 %	40 %	20 %	20 %	549718437
128	NC_022543	AAATA	2	10	187626	187635	80 %	20 %	0 %	0 %	549718440
129	NC_022543	CAAAC	2	10	191277	191286	60 %	0 %	0 %	40 %	549718443
130	NC_022543	GTGTA	2	10	195775	195784	20 %	40 %	40 %	0 %	549718448
131	NC_022543	ACGTT	2	10	199481	199490	20 %	40 %	20 %	20 %	549718450
132	NC_022543	TGGTC	2	10	201454	201463	0 %	40 %	40 %	20 %	549718451
133	NC_022543	TTTTC	2	10	202248	202257	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_022543	AATAA	2	10	202353	202362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022543	ATTTC	2	10	202371	202380	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_022543	TTCTT	2	10	207902	207911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_022543	CCGAG	2	10	208589	208598	20 %	0 %	40 %	40 %	549718459
138	NC_022543	ATAGC	2	10	210207	210216	40 %	20 %	20 %	20 %	549718460
139	NC_022543	ATTGT	2	10	210306	210315	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022543	TCCAG	2	10	211474	211483	20 %	20 %	20 %	40 %	549718462
141	NC_022543	GACAT	2	10	211524	211533	40 %	20 %	20 %	20 %	549718462
142	NC_022543	GCTTC	2	10	212593	212602	0 %	40 %	20 %	40 %	549718462
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151	NC_022543	ACCCG	2	10	229589	229598	20 %	0 %	20 %	60 %	549718477
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158	NC_022543	TATTT	2	10	237138	237147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_022543	ATTTC	2	10	237157	237166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_022543	AACTA	2	10	237306	237315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_022543	TATTT	2	10	241782	241791	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_022543	TTTGA	2	10	242094	242103	20 %	60 %	20 %	0 %	549718487
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266	NC_022543	CCACC	2	10	390552	390561	20 %	0 %	0 %	80 %	549718605
267	NC_022543	TATCT	2	10	390652	390661	20 %	60 %	0 %	20 %	549718605
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