MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022543	GAA	2	6	161214	161219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718416
3002	NC_022543	GCTTG	2	10	161275	161284	0 %	40 %	40 %	20 %	549718416
3003	NC_022543	ATG	2	6	161311	161316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718416
3004	NC_022543	TCT	2	6	161350	161355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718416
3005	NC_022543	TGT	2	6	161435	161440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718416
3006	NC_022543	ATAA	2	8	161475	161482	75 %	25 %	0 %	0 %	549718416
3007	NC_022543	ATC	2	6	161520	161525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718416
3008	NC_022543	GTT	2	6	161531	161536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718416
3009	NC_022543	GTC	2	6	161722	161727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718417
3010	NC_022543	A	6	6	161732	161737	100 %	0 %	0 %	0 %	549718417
3011	NC_022543	AGC	2	6	161816	161821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718417
3012	NC_022543	CGT	2	6	161912	161917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718417
3013	NC_022543	GGT	2	6	161989	161994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718417
3014	NC_022543	CAG	2	6	162021	162026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718417
3015	NC_022543	T	6	6	162042	162047	0 %	100 %	0 %	0 %	549718417
3016	NC_022543	GTC	2	6	162079	162084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718417
3017	NC_022543	GTA	2	6	162160	162165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718417
3018	NC_022543	T	6	6	162166	162171	0 %	100 %	0 %	0 %	549718417
3019	NC_022543	GAT	2	6	162175	162180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718417
3020	NC_022543	CGA	2	6	162222	162227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718417
3021	NC_022543	TGCTC	2	10	162369	162378	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3022	NC_022543	AAT	2	6	162379	162384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_022543	CTG	2	6	162402	162407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_022543	TGT	2	6	162414	162419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_022543	ATT	2	6	162441	162446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_022543	CA	3	6	162481	162486	50 %	0 %	0 %	50 %	549718418
3027	NC_022543	AATGC	2	10	162779	162788	40 %	20 %	20 %	20 %	549718418
3028	NC_022543	GCC	2	6	162826	162831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718418
3029	NC_022543	ATTTC	2	10	163105	163114	20 %	60 %	0 %	20 %	549718419
3030	NC_022543	CAG	2	6	163247	163252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718419
3031	NC_022543	CAA	2	6	163381	163386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718419
3032	NC_022543	GCTG	2	8	163402	163409	0 %	25 %	50 %	25 %	549718419
3033	NC_022543	CAT	2	6	163418	163423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718419
3034	NC_022543	CTTA	2	8	163501	163508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3035	NC_022543	A	6	6	163508	163513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_022543	CTT	2	6	163649	163654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718420
3037	NC_022543	TTGT	2	8	163676	163683	0 %	75 %	25 %	0 %	549718420
3038	NC_022543	TCA	2	6	163765	163770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718420
3039	NC_022543	GCC	2	6	163846	163851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718420
3040	NC_022543	GCT	2	6	163856	163861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718420
3041	NC_022543	TGA	2	6	163908	163913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718420
3042	NC_022543	CAG	2	6	163922	163927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718420
3043	NC_022543	TCTT	2	8	163939	163946	0 %	75 %	0 %	25 %	549718420
3044	NC_022543	ATC	2	6	163964	163969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718420
3045	NC_022543	TGAT	2	8	164061	164068	25 %	50 %	25 %	0 %	549718420
3046	NC_022543	GCA	2	6	164151	164156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718420
3047	NC_022543	GAA	2	6	164268	164273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718420
3048	NC_022543	TGTGAT	2	12	164311	164322	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549718420
3049	NC_022543	TGT	2	6	164332	164337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718420
3050	NC_022543	GATG	2	8	164371	164378	25 %	25 %	50 %	0 %	549718420
3051	NC_022543	GCCA	2	8	164404	164411	25 %	0 %	25 %	50 %	549718420
3052	NC_022543	CGT	2	6	164712	164717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718421
3053	NC_022543	TTGG	2	8	164720	164727	0 %	50 %	50 %	0 %	549718421
3054	NC_022543	TCT	2	6	164729	164734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718421
3055	NC_022543	GAA	3	9	164793	164801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718421
3056	NC_022543	AGA	2	6	164807	164812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718421
3057	NC_022543	A	7	7	164830	164836	100 %	0 %	0 %	0 %	549718421
3058	NC_022543	GAT	2	6	164868	164873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_022543	TGC	2	6	164972	164977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_022543	TTG	2	6	165022	165027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_022543	CTT	2	6	165139	165144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_022543	CA	3	6	165163	165168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3063	NC_022543	TGT	2	6	165240	165245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718422
3064	NC_022543	GGT	2	6	165330	165335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718422
3065	NC_022543	GGGC	2	8	165353	165360	0 %	0 %	75 %	25 %	549718422
3066	NC_022543	GCG	2	6	165379	165384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718422
3067	NC_022543	ATT	2	6	165442	165447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718422
3068	NC_022543	TGC	2	6	165482	165487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718422
3069	NC_022543	TCT	2	6	165499	165504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718422
3070	NC_022543	A	6	6	165532	165537	100 %	0 %	0 %	0 %	549718422
3071	NC_022543	TTC	2	6	165557	165562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718422
3072	NC_022543	TTC	2	6	165604	165609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718422
3073	NC_022543	CGG	2	6	165635	165640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718422
3074	NC_022543	TGT	2	6	165701	165706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718422
3075	NC_022543	GCT	2	6	165708	165713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718422
3076	NC_022543	CGC	2	6	165789	165794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718422
3077	NC_022543	TGA	2	6	165827	165832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718422
3078	NC_022543	GTT	2	6	165871	165876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718423
3079	NC_022543	AAC	2	6	165905	165910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718423
3080	NC_022543	CCA	2	6	165916	165921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718423
3081	NC_022543	CTA	2	6	165975	165980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718423
3082	NC_022543	CTT	2	6	165990	165995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718423
3083	NC_022543	TCA	2	6	166015	166020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718423
3084	NC_022543	GGAT	2	8	166037	166044	25 %	25 %	50 %	0 %	549718423
3085	NC_022543	TGA	2	6	166096	166101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718423
3086	NC_022543	CAA	2	6	166151	166156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718423
3087	NC_022543	GCGA	2	8	166318	166325	25 %	0 %	50 %	25 %	549718423
3088	NC_022543	CTTC	2	8	166363	166370	0 %	50 %	0 %	50 %	549718423
3089	NC_022543	CGT	2	6	166421	166426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718423
3090	NC_022543	TCT	2	6	166598	166603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_022543	GAT	2	6	166607	166612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_022543	AGG	2	6	166639	166644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_022543	CAC	2	6	166681	166686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718424
3094	NC_022543	TGG	2	6	166689	166694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718424
3095	NC_022543	ACC	2	6	166701	166706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718424
3096	NC_022543	CTA	2	6	166707	166712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718424
3097	NC_022543	GAA	2	6	166727	166732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718424
3098	NC_022543	TCTA	2	8	166772	166779	25 %	50 %	0 %	25 %	549718424
3099	NC_022543	CGA	2	6	166792	166797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718424
3100	NC_022543	GAC	2	6	166820	166825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718424
3101	NC_022543	GCCA	2	8	166835	166842	25 %	0 %	25 %	50 %	549718424
3102	NC_022543	CAAC	2	8	166948	166955	50 %	0 %	0 %	50 %	549718424
3103	NC_022543	CAAT	2	8	167038	167045	50 %	25 %	0 %	25 %	549718424
3104	NC_022543	CAT	2	6	167065	167070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718424
3105	NC_022543	GAATG	2	10	167174	167183	40 %	20 %	40 %	0 %	549718424
3106	NC_022543	CAA	2	6	167185	167190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718424
3107	NC_022543	GAC	2	6	167219	167224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718424
3108	NC_022543	CA	3	6	167350	167355	50 %	0 %	0 %	50 %	549718424
3109	NC_022543	ATA	2	6	167433	167438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_022543	T	7	7	167587	167593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_022543	AAG	2	6	167601	167606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_022543	AAG	2	6	167613	167618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_022543	AGC	2	6	167630	167635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_022543	GTG	2	6	167685	167690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022543	CGA	2	6	167719	167724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_022543	GAAA	2	8	167773	167780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022543	ATAA	2	8	167882	167889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_022543	AGA	2	6	167938	167943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_022543	TTA	2	6	167944	167949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_022543	CAA	2	6	167956	167961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_022543	GGC	2	6	168031	168036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_022543	ACG	2	6	168078	168083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_022543	AG	3	6	168170	168175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022543	TGG	2	6	168195	168200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3126	NC_022543	G	6	6	168625	168630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3153	NC_022543	GA	3	6	170338	170343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_022543	TGGCT	2	10	175060	175069	0 %	40 %	40 %	20 %	549718429
3252	NC_022543	TGG	2	6	175084	175089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718429
3253	NC_022543	TGG	2	6	175120	175125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718429
3254	NC_022543	TGG	2	6	175257	175262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718429
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3359	NC_022543	AATA	2	8	181022	181029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3360	NC_022543	ATAA	2	8	181120	181127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_022543	ATT	2	6	181197	181202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3362	NC_022543	TGTC	2	8	181254	181261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3363	NC_022543	ATTC	2	8	181283	181290	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3364	NC_022543	AAT	2	6	181293	181298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3365	NC_022543	GC	3	6	181351	181356	0 %	0 %	50 %	50 %	549718434
3366	NC_022543	T	7	7	181361	181367	0 %	100 %	0 %	0 %	549718434
3367	NC_022543	TTA	2	6	181405	181410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718434
3368	NC_022543	TTC	2	6	181448	181453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718434
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3370	NC_022543	GAA	2	6	181506	181511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718434
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3372	NC_022543	ATT	2	6	181707	181712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718434
3373	NC_022543	TCC	2	6	181738	181743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718434
3374	NC_022543	AAG	2	6	181858	181863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718434
3375	NC_022543	CGC	2	6	181882	181887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718434
3376	NC_022543	A	6	6	181917	181922	100 %	0 %	0 %	0 %	549718434
3377	NC_022543	TGAG	2	8	182035	182042	25 %	25 %	50 %	0 %	549718434
3378	NC_022543	ACC	2	6	182061	182066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718434
3379	NC_022543	TGGC	2	8	182096	182103	0 %	25 %	50 %	25 %	549718434
3380	NC_022543	CAA	2	6	182115	182120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718434
3381	NC_022543	CAA	2	6	182129	182134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718434
3382	NC_022543	TATC	2	8	182216	182223	25 %	50 %	0 %	25 %	549718434
3383	NC_022543	GAT	2	6	182229	182234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718434
3384	NC_022543	GGCT	2	8	182238	182245	0 %	25 %	50 %	25 %	549718434
3385	NC_022543	TTA	2	6	182284	182289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718434
3386	NC_022543	TAC	2	6	182355	182360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718434
3387	NC_022543	TGG	2	6	182527	182532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718434
3388	NC_022543	TGC	2	6	182600	182605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718434
3389	NC_022543	CG	3	6	182828	182833	0 %	0 %	50 %	50 %	549718434
3390	NC_022543	GATC	2	8	182843	182850	25 %	25 %	25 %	25 %	549718434
3391	NC_022543	CTG	2	6	182985	182990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718434
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3393	NC_022543	TGA	2	6	183039	183044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718435
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3395	NC_022543	GTC	2	6	183085	183090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718435
3396	NC_022543	TGA	2	6	183228	183233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718435
3397	NC_022543	GGAT	2	8	183260	183267	25 %	25 %	50 %	0 %	549718435
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3402	NC_022543	GAC	2	6	183426	183431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718435
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3404	NC_022543	AGC	2	6	183698	183703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718435
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3409	NC_022543	TAAT	2	8	183995	184002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3410	NC_022543	A	6	6	184005	184010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3411	NC_022543	GATA	2	8	184052	184059	50 %	25 %	25 %	0 %	549718436
3412	NC_022543	ACT	2	6	184172	184177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718436
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3420	NC_022543	T	7	7	184924	184930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3421	NC_022543	GTT	2	6	184996	185001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718437
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3439	NC_022543	TG	3	6	185799	185804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3440	NC_022543	G	6	6	185860	185865	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3441	NC_022543	AATGTA	2	12	185876	185887	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549718438
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3452	NC_022543	TCG	2	6	186253	186258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718438
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3458	NC_022543	T	7	7	186577	186583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3459	NC_022543	GAC	2	6	186680	186685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718439
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3471	NC_022543	AAATA	2	10	187626	187635	80 %	20 %	0 %	0 %	549718440
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3487	NC_022543	T	6	6	189278	189283	0 %	100 %	0 %	0 %	549718441
3488	NC_022543	AG	3	6	189330	189335	50 %	0 %	50 %	0 %	549718441
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3494	NC_022543	CGT	2	6	189782	189787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718441
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3496	NC_022543	GGT	2	6	189869	189874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718441
3497	NC_022543	TGA	2	6	189875	189880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718441
3498	NC_022543	CGC	2	6	189930	189935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718441
3499	NC_022543	AGA	2	6	189937	189942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718441
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