MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022543	CTT	2	6	26391	26396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718303
502	NC_022543	TGGT	2	8	26450	26457	0 %	50 %	50 %	0 %	549718303
503	NC_022543	CATC	2	8	26459	26466	25 %	25 %	0 %	50 %	549718303
504	NC_022543	AGG	2	6	26475	26480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718303
505	NC_022543	CTG	2	6	26580	26585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718303
506	NC_022543	GTC	2	6	26634	26639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718303
507	NC_022543	TCA	2	6	26761	26766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718303
508	NC_022543	GAT	2	6	26847	26852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718303
509	NC_022543	TC	3	6	26861	26866	0 %	50 %	0 %	50 %	549718303
510	NC_022543	GCA	2	6	26899	26904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718303
511	NC_022543	CTT	2	6	26987	26992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718303
512	NC_022543	AAT	2	6	27024	27029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718303
513	NC_022543	ACA	2	6	27065	27070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718303
514	NC_022543	TGG	2	6	27113	27118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718303
515	NC_022543	CTG	2	6	27198	27203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718303
516	NC_022543	CAG	2	6	27212	27217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718303
517	NC_022543	GCG	2	6	27240	27245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718303
518	NC_022543	CTT	2	6	27281	27286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718303
519	NC_022543	GAT	2	6	27438	27443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718303
520	NC_022543	CAGAAT	2	12	27444	27455	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549718303
521	NC_022543	CCA	2	6	27488	27493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718303
522	NC_022543	GAC	2	6	27501	27506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718303
523	NC_022543	ATCA	2	8	27531	27538	50 %	25 %	0 %	25 %	549718303
524	NC_022543	T	6	6	27687	27692	0 %	100 %	0 %	0 %	549718303
525	NC_022543	GGC	2	6	27840	27845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718303
526	NC_022543	TCG	2	6	27967	27972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718303
527	NC_022543	CTG	2	6	28014	28019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718303
528	NC_022543	TCA	2	6	28027	28032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718303
529	NC_022543	GAC	2	6	28071	28076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718303
530	NC_022543	CTT	2	6	28082	28087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718303
531	NC_022543	CCA	2	6	28126	28131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718303
532	NC_022543	GAA	2	6	28133	28138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718303
533	NC_022543	CCG	2	6	28145	28150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718303
534	NC_022543	GGA	2	6	28151	28156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718303
535	NC_022543	GCCC	2	8	28206	28213	0 %	0 %	25 %	75 %	549718303
536	NC_022543	CAG	2	6	28217	28222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718303
537	NC_022543	AAAAG	2	10	28231	28240	80 %	0 %	20 %	0 %	549718303
538	NC_022543	TTAT	2	8	28371	28378	25 %	75 %	0 %	0 %	549718304
539	NC_022543	CAA	2	6	28379	28384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718304
540	NC_022543	CGATG	2	10	28452	28461	20 %	20 %	40 %	20 %	549718304
541	NC_022543	AGTG	2	8	28500	28507	25 %	25 %	50 %	0 %	549718304
542	NC_022543	TCA	2	6	28522	28527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718304
543	NC_022543	TGG	2	6	28681	28686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718304
544	NC_022543	TTC	2	6	28741	28746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718304
545	NC_022543	AGA	2	6	28961	28966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718304
546	NC_022543	AGT	2	6	28989	28994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
547	NC_022543	CTT	2	6	29042	29047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718304
548	NC_022543	CCA	2	6	29048	29053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
549	NC_022543	TTG	2	6	29064	29069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
550	NC_022543	CCA	2	6	29156	29161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
551	NC_022543	AGC	3	9	29217	29225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718304
552	NC_022543	ATG	2	6	29272	29277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
553	NC_022543	CT	3	6	29302	29307	0 %	50 %	0 %	50 %	549718304
554	NC_022543	GAA	2	6	29371	29376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718304
555	NC_022543	CACC	2	8	29420	29427	25 %	0 %	0 %	75 %	549718304
556	NC_022543	TCG	3	9	29437	29445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718304
557	NC_022543	TGA	2	6	29456	29461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
558	NC_022543	CAC	2	6	29483	29488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
559	NC_022543	AAG	2	6	29530	29535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718304
560	NC_022543	CG	3	6	29571	29576	0 %	0 %	50 %	50 %	549718304
561	NC_022543	GTT	2	6	29585	29590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
562	NC_022543	GTT	2	6	29709	29714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
563	NC_022543	CTT	2	6	29720	29725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718304
564	NC_022543	ATG	2	6	29737	29742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
565	NC_022543	ACC	2	6	29770	29775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
566	NC_022543	CAC	3	9	29784	29792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718304
567	NC_022543	AAT	2	6	29796	29801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718304
568	NC_022543	TGA	2	6	29876	29881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718304
569	NC_022543	AGCC	2	8	29902	29909	25 %	0 %	25 %	50 %	549718304
570	NC_022543	CCG	2	6	29922	29927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718304
571	NC_022543	AAAT	2	8	29943	29950	75 %	25 %	0 %	0 %	549718304
572	NC_022543	TAA	2	6	30074	30079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718304
573	NC_022543	TGT	2	6	30169	30174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718304
574	NC_022543	TCA	2	6	30224	30229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718304
575	NC_022543	CAG	2	6	30231	30236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718304
576	NC_022543	TA	3	6	30269	30274	50 %	50 %	0 %	0 %	549718304
577	NC_022543	TCA	2	6	30291	30296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718305
578	NC_022543	TAAT	2	8	30297	30304	50 %	50 %	0 %	0 %	549718305
579	NC_022543	GAC	2	6	30369	30374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718305
580	NC_022543	TCA	2	6	30406	30411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718305
581	NC_022543	TAA	2	6	30446	30451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718305
582	NC_022543	AGC	2	6	30615	30620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718305
583	NC_022543	CAG	2	6	30658	30663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718305
584	NC_022543	AGT	2	6	30694	30699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718305
585	NC_022543	GTC	2	6	30722	30727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718305
586	NC_022543	GAA	2	6	30746	30751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718305
587	NC_022543	CT	3	6	30777	30782	0 %	50 %	0 %	50 %	549718305
588	NC_022543	GCG	2	6	30834	30839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718305
589	NC_022543	GCT	2	6	30877	30882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718305
590	NC_022543	T	6	6	30884	30889	0 %	100 %	0 %	0 %	549718305
591	NC_022543	GC	3	6	30895	30900	0 %	0 %	50 %	50 %	549718305
592	NC_022543	AAAG	2	8	30909	30916	75 %	0 %	25 %	0 %	549718305
593	NC_022543	AGCA	2	8	30921	30928	50 %	0 %	25 %	25 %	549718305
594	NC_022543	GCCT	2	8	30941	30948	0 %	25 %	25 %	50 %	549718305
595	NC_022543	AAAC	2	8	30988	30995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
596	NC_022543	GAA	2	6	31025	31030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_022543	ATT	2	6	31052	31057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718306
598	NC_022543	AATA	2	8	31096	31103	75 %	25 %	0 %	0 %	549718306
599	NC_022543	TAA	2	6	31127	31132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718306
600	NC_022543	GCT	2	6	31169	31174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718306
601	NC_022543	CGAACA	2	12	31204	31215	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	549718306
602	NC_022543	GCAG	2	8	31327	31334	25 %	0 %	50 %	25 %	549718306
603	NC_022543	CTA	2	6	31379	31384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718306
604	NC_022543	CCA	2	6	31441	31446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718306
605	NC_022543	T	6	6	31464	31469	0 %	100 %	0 %	0 %	549718306
606	NC_022543	AGA	2	6	31545	31550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718306
607	NC_022543	AGC	2	6	31605	31610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718306
608	NC_022543	AGC	2	6	31720	31725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718306
609	NC_022543	TTG	2	6	31842	31847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718306
610	NC_022543	CAG	2	6	31869	31874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718306
611	NC_022543	ATT	2	6	31893	31898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718306
612	NC_022543	CAA	2	6	31931	31936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718306
613	NC_022543	GTT	2	6	31958	31963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718306
614	NC_022543	TC	3	6	32002	32007	0 %	50 %	0 %	50 %	549718306
615	NC_022543	AC	3	6	32069	32074	50 %	0 %	0 %	50 %	549718306
616	NC_022543	TGT	2	6	32095	32100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718306
617	NC_022543	GT	3	6	32129	32134	0 %	50 %	50 %	0 %	549718306
618	NC_022543	ATCA	2	8	32136	32143	50 %	25 %	0 %	25 %	549718306
619	NC_022543	AAC	2	6	32223	32228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718306
620	NC_022543	GAA	2	6	32239	32244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718306
621	NC_022543	CCTTG	2	10	32252	32261	0 %	40 %	20 %	40 %	549718306
622	NC_022543	CGATGG	2	12	32303	32314	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549718306
623	NC_022543	A	6	6	32316	32321	100 %	0 %	0 %	0 %	549718306
624	NC_022543	CAA	2	6	32337	32342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718306
625	NC_022543	ACT	2	6	32352	32357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718306
626	NC_022543	TGC	2	6	32376	32381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718306
627	NC_022543	GTC	2	6	32388	32393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718306
628	NC_022543	T	6	6	32421	32426	0 %	100 %	0 %	0 %	549718306
629	NC_022543	TTA	2	6	32558	32563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_022543	TAA	2	6	32570	32575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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654	NC_022543	TTG	3	9	33816	33824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718308
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673	NC_022543	TTA	2	6	34940	34945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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757	NC_022543	TC	3	6	39295	39300	0 %	50 %	0 %	50 %	549718313
758	NC_022543	GTCTG	2	10	39368	39377	0 %	40 %	40 %	20 %	549718313
759	NC_022543	AGA	2	6	39425	39430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718313
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762	NC_022543	ATC	2	6	39573	39578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718313
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