MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 40397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022543	T	6	6	299650	299655	0 %	100 %	0 %	0 %	549718534
5502	NC_022543	TTTCTC	2	12	299793	299804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718534
5503	NC_022543	AGCG	2	8	299861	299868	25 %	0 %	50 %	25 %	549718534
5504	NC_022543	CGC	2	6	299879	299884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718534
5505	NC_022543	ATT	2	6	299908	299913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718534
5506	NC_022543	GTC	2	6	299914	299919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718534
5507	NC_022543	GGC	2	6	299990	299995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718534
5508	NC_022543	GGAGC	2	10	300074	300083	20 %	0 %	60 %	20 %	549718534
5509	NC_022543	AGC	2	6	300088	300093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718534
5510	NC_022543	TTG	2	6	300131	300136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718534
5511	NC_022543	GC	3	6	300167	300172	0 %	0 %	50 %	50 %	549718534
5512	NC_022543	GT	3	6	300190	300195	0 %	50 %	50 %	0 %	549718534
5513	NC_022543	GCG	2	6	300239	300244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718534
5514	NC_022543	G	6	6	300261	300266	0 %	0 %	100 %	0 %	549718534
5515	NC_022543	T	6	6	300438	300443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_022543	T	6	6	300472	300477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_022543	A	6	6	300479	300484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_022543	GAC	2	6	300549	300554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_022543	GGC	2	6	300645	300650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_022543	GCC	2	6	300693	300698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_022543	ACG	2	6	300720	300725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_022543	GAT	2	6	300726	300731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_022543	CAA	2	6	300841	300846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718535
5524	NC_022543	TTC	2	6	300902	300907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718535
5525	NC_022543	TGT	2	6	301042	301047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718535
5526	NC_022543	TTCC	2	8	301057	301064	0 %	50 %	0 %	50 %	549718535
5527	NC_022543	TCA	2	6	301078	301083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718535
5528	NC_022543	TGG	2	6	301117	301122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718535
5529	NC_022543	CGTTG	2	10	301163	301172	0 %	40 %	40 %	20 %	549718535
5530	NC_022543	TGGGAA	2	12	301265	301276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549718535
5531	NC_022543	ATC	2	6	301584	301589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718535
5532	NC_022543	TTC	2	6	301593	301598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718535
5533	NC_022543	TTC	2	6	301646	301651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718535
5534	NC_022543	ATG	2	6	301683	301688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718535
5535	NC_022543	CACC	2	8	301690	301697	25 %	0 %	0 %	75 %	549718535
5536	NC_022543	GGC	2	6	301803	301808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718535
5537	NC_022543	CCAT	2	8	301827	301834	25 %	25 %	0 %	50 %	549718535
5538	NC_022543	TGG	2	6	301867	301872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718535
5539	NC_022543	TTG	2	6	301887	301892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718535
5540	NC_022543	AAT	2	6	301898	301903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718535
5541	NC_022543	GAC	2	6	301921	301926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718535
5542	NC_022543	CGGGG	2	10	301937	301946	0 %	0 %	80 %	20 %	549718535
5543	NC_022543	GGT	2	6	302000	302005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718535
5544	NC_022543	TTC	2	6	302006	302011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718535
5545	NC_022543	TGGC	2	8	302049	302056	0 %	25 %	50 %	25 %	549718535
5546	NC_022543	CAGG	2	8	302070	302077	25 %	0 %	50 %	25 %	549718535
5547	NC_022543	TGAT	2	8	302140	302147	25 %	50 %	25 %	0 %	549718535
5548	NC_022543	CTT	2	6	302160	302165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_022543	TTC	2	6	302191	302196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_022543	GAA	2	6	302300	302305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718536
5551	NC_022543	A	7	7	302318	302324	100 %	0 %	0 %	0 %	549718536
5552	NC_022543	A	6	6	302331	302336	100 %	0 %	0 %	0 %	549718536
5553	NC_022543	GCA	2	6	302367	302372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718536
5554	NC_022543	GCG	2	6	302385	302390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718536
5555	NC_022543	CAA	2	6	302391	302396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718536
5556	NC_022543	CAG	3	9	302418	302426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718536
5557	NC_022543	AGC	3	9	302431	302439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718536
5558	NC_022543	AGC	2	6	302467	302472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718536
5559	NC_022543	TTCT	2	8	302593	302600	0 %	75 %	0 %	25 %	549718536
5560	NC_022543	GAA	2	6	302613	302618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718536
5561	NC_022543	GAA	2	6	302648	302653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718536
5562	NC_022543	ATC	2	6	302679	302684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718536
5563	NC_022543	CAG	2	6	302695	302700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718536
5564	NC_022543	AAG	2	6	302701	302706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718536
5565	NC_022543	TCG	2	6	302740	302745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718536
5566	NC_022543	AGC	2	6	302811	302816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_022543	GCT	2	6	302823	302828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_022543	GAT	2	6	302861	302866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718537
5569	NC_022543	GTT	2	6	302903	302908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718537
5570	NC_022543	CCA	2	6	302969	302974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718537
5571	NC_022543	TAA	2	6	303129	303134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_022543	TGT	2	6	303145	303150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_022543	ATG	2	6	303179	303184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_022543	T	6	6	303185	303190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_022543	A	6	6	303289	303294	100 %	0 %	0 %	0 %	549718538
5576	NC_022543	GAA	2	6	303346	303351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718538
5577	NC_022543	CGAT	2	8	303359	303366	25 %	25 %	25 %	25 %	549718538
5578	NC_022543	TGG	2	6	303477	303482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718538
5579	NC_022543	CAT	2	6	303627	303632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718538
5580	NC_022543	AGG	2	6	303711	303716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718538
5581	NC_022543	TGA	2	6	303944	303949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718538
5582	NC_022543	T	6	6	304105	304110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_022543	CTT	2	6	304156	304161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718539
5584	NC_022543	CTT	2	6	304174	304179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718539
5585	NC_022543	ATTTCA	2	12	304248	304259	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549718539
5586	NC_022543	CAAA	2	8	304384	304391	75 %	0 %	0 %	25 %	549718539
5587	NC_022543	CGT	2	6	304402	304407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718539
5588	NC_022543	TTC	2	6	304445	304450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718539
5589	NC_022543	GCA	2	6	304493	304498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718539
5590	NC_022543	CAT	2	6	304714	304719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718539
5591	NC_022543	TCA	2	6	304759	304764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718539
5592	NC_022543	ACC	2	6	304794	304799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718539
5593	NC_022543	TCA	2	6	304837	304842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718539
5594	NC_022543	T	6	6	304847	304852	0 %	100 %	0 %	0 %	549718539
5595	NC_022543	GAC	2	6	304936	304941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718539
5596	NC_022543	CTT	2	6	304963	304968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718539
5597	NC_022543	CGG	2	6	304969	304974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718539
5598	NC_022543	GAT	2	6	304993	304998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718539
5599	NC_022543	TAG	2	6	305011	305016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718539
5600	NC_022543	CAT	2	6	305039	305044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_022543	TAT	2	6	305049	305054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_022543	TCC	2	6	305090	305095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5603	NC_022543	TG	3	6	305128	305133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_022543	A	6	6	305187	305192	100 %	0 %	0 %	0 %	549718540
5605	NC_022543	CAG	2	6	305206	305211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718540
5606	NC_022543	ATG	2	6	305223	305228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718540
5607	NC_022543	AAC	2	6	305263	305268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718540
5608	NC_022543	TGA	2	6	305479	305484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718540
5609	NC_022543	TTG	2	6	305494	305499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718540
5610	NC_022543	TCA	2	6	305548	305553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718540
5611	NC_022543	CCG	2	6	305557	305562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718540
5612	NC_022543	ACAA	2	8	305614	305621	75 %	0 %	0 %	25 %	549718540
5613	NC_022543	ACC	2	6	305680	305685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718540
5614	NC_022543	AGA	2	6	305735	305740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718540
5615	NC_022543	GCTGG	2	10	305807	305816	0 %	20 %	60 %	20 %	549718540
5616	NC_022543	ACTGG	2	10	305858	305867	20 %	20 %	40 %	20 %	549718540
5617	NC_022543	CGG	2	6	305891	305896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718540
5618	NC_022543	CTT	2	6	305942	305947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718540
5619	NC_022543	ATG	2	6	306067	306072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718540
5620	NC_022543	ACT	2	6	306085	306090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718540
5621	NC_022543	GAA	2	6	306183	306188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718540
5622	NC_022543	CAGC	2	8	306248	306255	25 %	0 %	25 %	50 %	549718540
5623	NC_022543	AGA	2	6	306314	306319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718540
5624	NC_022543	GAC	2	6	306351	306356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718540
5625	NC_022543	GTG	2	6	306363	306368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718540
5626	NC_022543	GTA	2	6	306411	306416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718540
5627	NC_022543	ACC	2	6	306448	306453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718540
5628	NC_022543	AAAG	2	8	306588	306595	75 %	0 %	25 %	0 %	549718540
5629	NC_022543	GAA	2	6	306600	306605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718540
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5631	NC_022543	TGG	2	6	306635	306640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718540
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5642	NC_022543	AC	3	6	307226	307231	50 %	0 %	0 %	50 %	549718541
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5649	NC_022543	AGC	2	6	307773	307778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718541
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5651	NC_022543	CAT	2	6	307964	307969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718541
5652	NC_022543	TATG	2	8	308136	308143	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5653	NC_022543	TTA	2	6	308155	308160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5654	NC_022543	TTA	2	6	308211	308216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718542
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5688	NC_022543	TAT	2	6	311012	311017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5689	NC_022543	CTAAA	2	10	311026	311035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5690	NC_022543	CA	4	8	311057	311064	50 %	0 %	0 %	50 %	549718544
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5865	NC_022543	A	6	6	321477	321482	100 %	0 %	0 %	0 %	549718552
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5992	NC_022543	TCG	2	6	329167	329172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718559
5993	NC_022543	GTA	2	6	329271	329276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718559
5994	NC_022543	GCA	2	6	329285	329290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718559
5995	NC_022543	TGA	2	6	329534	329539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718560
5996	NC_022543	CTGGAA	2	12	329571	329582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549718560
5997	NC_022543	CACT	2	8	329597	329604	25 %	25 %	0 %	50 %	549718560
5998	NC_022543	AGG	2	6	329654	329659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718560
5999	NC_022543	TGG	2	6	329732	329737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718560
6000	NC_022543	GCAT	2	8	329811	329818	25 %	25 %	25 %	25 %	549718560

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