MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	GA	3	6	23	28	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022271	GA	3	6	673	678	50 %	0 %	50 %	0 %	541872155
3	NC_022271	GT	3	6	810	815	0 %	50 %	50 %	0 %	541872155
4	NC_022271	TC	3	6	984	989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022271	AT	3	6	1148	1153	50 %	50 %	0 %	0 %	541872156
6	NC_022271	GT	3	6	1210	1215	0 %	50 %	50 %	0 %	541872156
7	NC_022271	TA	3	6	2313	2318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022271	GC	3	6	2325	2330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022271	CT	3	6	3686	3691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_022271	TA	3	6	4479	4484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022271	GC	3	6	4491	4496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022271	CT	3	6	5501	5506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_022271	CA	3	6	6288	6293	50 %	0 %	0 %	50 %	541872162
14	NC_022271	CA	3	6	6338	6343	50 %	0 %	0 %	50 %	541872162
15	NC_022271	TA	3	6	7076	7081	50 %	50 %	0 %	0 %	541872163
16	NC_022271	GA	3	6	9866	9871	50 %	0 %	50 %	0 %	541872165
17	NC_022271	AT	3	6	10504	10509	50 %	50 %	0 %	0 %	541872165
18	NC_022271	GT	3	6	12465	12470	0 %	50 %	50 %	0 %	541872168
19	NC_022271	CG	3	6	12949	12954	0 %	0 %	50 %	50 %	541872168
20	NC_022271	GA	3	6	13770	13775	50 %	0 %	50 %	0 %	541872168
21	NC_022271	GA	3	6	14420	14425	50 %	0 %	50 %	0 %	541872170
22	NC_022271	GT	3	6	14557	14562	0 %	50 %	50 %	0 %	541872170
23	NC_022271	TG	3	6	14752	14757	0 %	50 %	50 %	0 %	541872171
24	NC_022271	TG	3	6	15026	15031	0 %	50 %	50 %	0 %	541872171
25	NC_022271	AG	3	6	15225	15230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022271	TG	3	6	17019	17024	0 %	50 %	50 %	0 %	541872175
27	NC_022271	TG	3	6	17293	17298	0 %	50 %	50 %	0 %	541872175
28	NC_022271	AG	3	6	17492	17497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022271	GA	3	6	19571	19576	50 %	0 %	50 %	0 %	541872178
30	NC_022271	AC	3	6	20004	20009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_022271	GA	3	6	20127	20132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022271	GA	3	6	21258	21263	50 %	0 %	50 %	0 %	541872180
33	NC_022271	GC	3	6	21867	21872	0 %	0 %	50 %	50 %	541872180
34	NC_022271	AT	3	6	22163	22168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022271	AT	3	6	22785	22790	50 %	50 %	0 %	0 %	541872181
36	NC_022271	TA	3	6	24432	24437	50 %	50 %	0 %	0 %	541872182
37	NC_022271	GT	3	6	24700	24705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022271	AG	3	6	25800	25805	50 %	0 %	50 %	0 %	541872184
39	NC_022271	AG	3	6	25954	25959	50 %	0 %	50 %	0 %	541872184
40	NC_022271	TA	3	6	26840	26845	50 %	50 %	0 %	0 %	541872185
41	NC_022271	GA	3	6	26945	26950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022271	CT	3	6	30604	30609	0 %	50 %	0 %	50 %	541872148
43	NC_022271	TC	3	6	32273	32278	0 %	50 %	0 %	50 %	541872188
44	NC_022271	TG	3	6	32992	32997	0 %	50 %	50 %	0 %	541872188
45	NC_022271	CT	3	6	33223	33228	0 %	50 %	0 %	50 %	541872188
46	NC_022271	GT	3	6	33727	33732	0 %	50 %	50 %	0 %	541872189
47	NC_022271	AC	3	6	35047	35052	50 %	0 %	0 %	50 %	541872191
48	NC_022271	AG	3	6	36101	36106	50 %	0 %	50 %	0 %	541872191
49	NC_022271	GA	3	6	38592	38597	50 %	0 %	50 %	0 %	541872195
50	NC_022271	AT	3	6	39518	39523	50 %	50 %	0 %	0 %	541872197
51	NC_022271	CA	3	6	39904	39909	50 %	0 %	0 %	50 %	541872198
52	NC_022271	GT	3	6	40902	40907	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
53	NC_022271	TC	3	6	41304	41309	0 %	50 %	0 %	50 %	541872198
54	NC_022271	TG	3	6	41929	41934	0 %	50 %	50 %	0 %	541872198
55	NC_022271	AG	3	6	42086	42091	50 %	0 %	50 %	0 %	541872198
56	NC_022271	TC	3	6	42996	43001	0 %	50 %	0 %	50 %	541872201
57	NC_022271	GT	3	6	44272	44277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022271	TC	3	6	44290	44295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_022271	CT	3	6	44519	44524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_022271	CT	3	6	44610	44615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022271	TG	3	6	44643	44648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022271	TG	3	6	46335	46340	0 %	50 %	50 %	0 %	541872149
63	NC_022271	CT	3	6	46785	46790	0 %	50 %	0 %	50 %	541872207
64	NC_022271	TA	3	6	47276	47281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022271	CA	3	6	48628	48633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_022271	TA	3	6	48739	48744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022271	AT	3	6	48945	48950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022271	GT	3	6	49055	49060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022271	TG	3	6	49122	49127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022271	GA	3	6	49496	49501	50 %	0 %	50 %	0 %	541872209
71	NC_022271	AG	3	6	50787	50792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022271	TC	3	6	51343	51348	0 %	50 %	0 %	50 %	541872212
73	NC_022271	TC	3	6	51479	51484	0 %	50 %	0 %	50 %	541872213
74	NC_022271	TG	3	6	51624	51629	0 %	50 %	50 %	0 %	541872213
75	NC_022271	TC	3	6	51708	51713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022271	GT	3	6	51899	51904	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022271	TG	3	6	53067	53072	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022271	AG	3	6	53698	53703	50 %	0 %	50 %	0 %	541872215
79	NC_022271	CA	3	6	54267	54272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022271	GT	3	6	55052	55057	0 %	50 %	50 %	0 %	541872217
81	NC_022271	CG	3	6	55536	55541	0 %	0 %	50 %	50 %	541872217
82	NC_022271	GA	3	6	56366	56371	50 %	0 %	50 %	0 %	541872217
83	NC_022271	GA	3	6	57015	57020	50 %	0 %	50 %	0 %	541872219
84	NC_022271	GT	3	6	57152	57157	0 %	50 %	50 %	0 %	541872219
85	NC_022271	TA	3	6	57339	57344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022271	TG	3	6	57504	57509	0 %	50 %	50 %	0 %	541872220
87	NC_022271	TA	4	8	57996	58003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022271	AT	3	6	58219	58224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022271	CT	3	6	60271	60276	0 %	50 %	0 %	50 %	541872223
90	NC_022271	AG	3	6	60282	60287	50 %	0 %	50 %	0 %	541872223
91	NC_022271	GC	3	6	60362	60367	0 %	0 %	50 %	50 %	541872223
92	NC_022271	CT	3	6	61289	61294	0 %	50 %	0 %	50 %	541872223
93	NC_022271	AG	3	6	61392	61397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022271	GC	3	6	61800	61805	0 %	0 %	50 %	50 %	541872150
95	NC_022271	GC	3	6	61988	61993	0 %	0 %	50 %	50 %	541872150
96	NC_022271	CA	3	6	62394	62399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022271	AG	3	6	64291	64296	50 %	0 %	50 %	0 %	541872226
98	NC_022271	TG	3	6	65115	65120	0 %	50 %	50 %	0 %	541872226
99	NC_022271	AG	3	6	65155	65160	50 %	0 %	50 %	0 %	541872226
100	NC_022271	GT	3	6	65346	65351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022271	CT	3	6	65398	65403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022271	CT	4	8	65500	65507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022271	GA	3	6	65720	65725	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022271	GC	3	6	66351	66356	0 %	0 %	50 %	50 %	541872227
105	NC_022271	AG	3	6	66502	66507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022271	AC	3	6	66528	66533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_022271	TG	3	6	66827	66832	0 %	50 %	50 %	0 %	541872228
108	NC_022271	TG	3	6	67564	67569	0 %	50 %	50 %	0 %	541872229
109	NC_022271	AG	3	6	68448	68453	50 %	0 %	50 %	0 %	541872231
110	NC_022271	CT	3	6	69101	69106	0 %	50 %	0 %	50 %	541872232
111	NC_022271	GT	3	6	69435	69440	0 %	50 %	50 %	0 %	541872232
112	NC_022271	CT	3	6	70736	70741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_022271	AT	3	6	72253	72258	50 %	50 %	0 %	0 %	541872234
114	NC_022271	TG	3	6	73652	73657	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022271	AT	3	6	74221	74226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_022271	GA	3	6	74432	74437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022271	AT	3	6	74630	74635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022271	AT	3	6	75622	75627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022271	AT	3	6	76183	76188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022271	AG	3	6	76199	76204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022271	AG	4	8	77256	77263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022271	GA	3	6	77305	77310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022271	TA	3	6	77752	77757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022271	CA	3	6	79208	79213	50 %	0 %	0 %	50 %	541872237
125	NC_022271	AG	3	6	79927	79932	50 %	0 %	50 %	0 %	541872237
126	NC_022271	CA	3	6	81875	81880	50 %	0 %	0 %	50 %	541872239
127	NC_022271	AC	3	6	81939	81944	50 %	0 %	0 %	50 %	541872239
128	NC_022271	AG	3	6	82111	82116	50 %	0 %	50 %	0 %	541872239
129	NC_022271	CA	3	6	82318	82323	50 %	0 %	0 %	50 %	541872239
130	NC_022271	TA	4	8	82849	82856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022271	GT	3	6	83541	83546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022271	AG	3	6	84455	84460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022271	AC	3	6	85756	85761	50 %	0 %	0 %	50 %	541872241
134	NC_022271	AG	3	6	86090	86095	50 %	0 %	50 %	0 %	541872241
135	NC_022271	GT	3	6	86622	86627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022271	CA	3	6	87247	87252	50 %	0 %	0 %	50 %	541872243
137	NC_022271	AG	4	8	87543	87550	50 %	0 %	50 %	0 %	541872243
138	NC_022271	CG	3	6	88205	88210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.