MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022271	GAACAG	2	12	381	392	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	541872154
2	NC_022271	ATTCTG	2	12	2864	2875	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	541872145
3	NC_022271	TATTCA	2	12	7554	7565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	541872164
4	NC_022271	AGTTCG	2	12	7886	7897	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	541872164
5	NC_022271	TCATGT	2	12	8252	8263	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	541872165
6	NC_022271	ACCGGA	2	12	8910	8921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872165
7	NC_022271	TTACCT	2	12	12791	12802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	541872168
8	NC_022271	GCTTTG	2	12	20974	20985	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	541872180
9	NC_022271	TTGCTC	2	12	27824	27835	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	541872147
10	NC_022271	CCTTTT	2	12	29221	29232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872148
11	NC_022271	ATTGGT	2	12	30246	30257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	541872148
12	NC_022271	TGGTTT	2	12	30688	30699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872148
13	NC_022271	AAAATC	2	12	32571	32582	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	541872188
14	NC_022271	TCTAAG	2	12	34606	34617	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	541872189
15	NC_022271	TAGTTT	2	12	39083	39094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	541872196
16	NC_022271	CTTTCA	2	12	44215	44226	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_022271	AGCGTT	2	12	50684	50695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	541872211
18	NC_022271	TTCATT	2	12	51714	51725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_022271	ATATGG	2	12	54504	54515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872216
20	NC_022271	TTACCT	2	12	55378	55389	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	541872217
21	NC_022271	GAACAG	2	12	56723	56734	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	541872218
22	NC_022271	GGCTTG	2	12	57349	57360	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_022271	GAATTT	2	12	59123	59134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	541872221
24	NC_022271	TCTTTA	2	12	60781	60792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	541872223
25	NC_022271	ATTGGC	2	12	61479	61490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_022271	TAGCTC	2	12	64405	64416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	541872226
27	NC_022271	GTTGAA	2	12	72545	72556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872234
28	NC_022271	TACCTG	2	12	75556	75567	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_022271	TCATCC	2	12	79841	79852	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	541872237
30	NC_022271	GATACA	2	12	84646	84657	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_022271	TTACCT	2	12	88047	88058	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.