MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 plasmid

Total Repeats: 1592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022271	TGC	2	6	29258	29263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872148
502	NC_022271	ACA	2	6	29287	29292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872148
503	NC_022271	ACCA	2	8	29378	29385	50 %	0 %	0 %	50 %	541872148
504	NC_022271	GCTT	2	8	29551	29558	0 %	50 %	25 %	25 %	541872148
505	NC_022271	TGA	2	6	29588	29593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872148
506	NC_022271	GGC	2	6	29607	29612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872148
507	NC_022271	CTTG	2	8	29627	29634	0 %	50 %	25 %	25 %	541872148
508	NC_022271	TTC	2	6	29667	29672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872148
509	NC_022271	GCA	2	6	29698	29703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872148
510	NC_022271	ATC	2	6	29802	29807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
511	NC_022271	GGC	2	6	29817	29822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872148
512	NC_022271	GGT	2	6	29907	29912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872148
513	NC_022271	CAT	2	6	29948	29953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
514	NC_022271	GCA	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872148
515	NC_022271	TTGCG	2	10	30018	30027	0 %	40 %	40 %	20 %	541872148
516	NC_022271	AAAC	2	8	30090	30097	75 %	0 %	0 %	25 %	541872148
517	NC_022271	CTT	2	6	30137	30142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872148
518	NC_022271	GGCT	2	8	30149	30156	0 %	25 %	50 %	25 %	541872148
519	NC_022271	GTT	2	6	30172	30177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872148
520	NC_022271	ATG	2	6	30181	30186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872148
521	NC_022271	GTG	2	6	30189	30194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872148
522	NC_022271	ATTGGT	2	12	30246	30257	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	541872148
523	NC_022271	CGA	2	6	30296	30301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872148
524	NC_022271	TAG	2	6	30319	30324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872148
525	NC_022271	TCG	2	6	30328	30333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872148
526	NC_022271	T	7	7	30410	30416	0 %	100 %	0 %	0 %	541872148
527	NC_022271	GTT	2	6	30446	30451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872148
528	NC_022271	GTGC	2	8	30479	30486	0 %	25 %	50 %	25 %	541872148
529	NC_022271	GAC	2	6	30504	30509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872148
530	NC_022271	TGAA	2	8	30547	30554	50 %	25 %	25 %	0 %	541872148
531	NC_022271	ATC	2	6	30588	30593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
532	NC_022271	CT	3	6	30604	30609	0 %	50 %	0 %	50 %	541872148
533	NC_022271	TGGTTT	2	12	30688	30699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872148
534	NC_022271	TCA	2	6	30982	30987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
535	NC_022271	CAA	2	6	30990	30995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872148
536	NC_022271	TCG	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872148
537	NC_022271	TGA	2	6	31046	31051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872148
538	NC_022271	CGG	2	6	31104	31109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872148
539	NC_022271	TAGG	2	8	31124	31131	25 %	25 %	50 %	0 %	541872148
540	NC_022271	TCA	2	6	31132	31137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872148
541	NC_022271	GTC	2	6	31167	31172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872148
542	NC_022271	CTC	2	6	31244	31249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872148
543	NC_022271	ACC	2	6	31266	31271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872148
544	NC_022271	AGGG	2	8	31297	31304	25 %	0 %	75 %	0 %	541872148
545	NC_022271	CCT	2	6	31333	31338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872187
546	NC_022271	CTT	2	6	31471	31476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872187
547	NC_022271	GTG	2	6	31585	31590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872187
548	NC_022271	GGC	2	6	31598	31603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872187
549	NC_022271	AAAC	2	8	31667	31674	75 %	0 %	0 %	25 %	541872187
550	NC_022271	CTT	2	6	31706	31711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872187
551	NC_022271	TCG	2	6	31794	31799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872187
552	NC_022271	A	6	6	31830	31835	100 %	0 %	0 %	0 %	541872187
553	NC_022271	GAT	2	6	31968	31973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872188
554	NC_022271	CAT	2	6	32082	32087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541872188
555	NC_022271	GTT	2	6	32116	32121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872188
556	NC_022271	GACT	2	8	32147	32154	25 %	25 %	25 %	25 %	541872188
557	NC_022271	T	6	6	32160	32165	0 %	100 %	0 %	0 %	541872188
558	NC_022271	GGC	2	6	32195	32200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872188
559	NC_022271	GTC	2	6	32208	32213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872188
560	NC_022271	CTT	2	6	32216	32221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872188
561	NC_022271	ACC	2	6	32233	32238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872188
562	NC_022271	T	6	6	32263	32268	0 %	100 %	0 %	0 %	541872188
563	NC_022271	TC	3	6	32273	32278	0 %	50 %	0 %	50 %	541872188
564	NC_022271	CTT	2	6	32288	32293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872188
565	NC_022271	GTC	2	6	32433	32438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872188
566	NC_022271	GCT	2	6	32474	32479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872188
567	NC_022271	GCTG	2	8	32521	32528	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
568	NC_022271	AAAATC	2	12	32571	32582	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	541872188
569	NC_022271	CGG	2	6	32594	32599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872188
570	NC_022271	GCC	2	6	32760	32765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872188
571	NC_022271	CAA	2	6	32839	32844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872188
572	NC_022271	TG	3	6	32992	32997	0 %	50 %	50 %	0 %	541872188
573	NC_022271	CCG	2	6	33088	33093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872188
574	NC_022271	CAA	2	6	33209	33214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872188
575	NC_022271	CT	3	6	33223	33228	0 %	50 %	0 %	50 %	541872188
576	NC_022271	CTT	2	6	33288	33293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872188
577	NC_022271	GTCG	2	8	33342	33349	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
578	NC_022271	TCT	2	6	33373	33378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872188
579	NC_022271	TGGC	2	8	33385	33392	0 %	25 %	50 %	25 %	541872188
580	NC_022271	CTT	2	6	33468	33473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872188
581	NC_022271	GCC	2	6	33570	33575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872188
582	NC_022271	CCA	2	6	33586	33591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872188
583	NC_022271	CAG	2	6	33600	33605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872188
584	NC_022271	A	8	8	33609	33616	100 %	0 %	0 %	0 %	541872188
585	NC_022271	T	6	6	33639	33644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022271	TTC	2	6	33688	33693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872189
587	NC_022271	CGA	2	6	33716	33721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872189
588	NC_022271	GT	3	6	33727	33732	0 %	50 %	50 %	0 %	541872189
589	NC_022271	ATG	2	6	33775	33780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872189
590	NC_022271	TGG	2	6	33869	33874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872189
591	NC_022271	CAA	2	6	33945	33950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872189
592	NC_022271	GAT	2	6	33984	33989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872189
593	NC_022271	GCC	2	6	34005	34010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541872189
594	NC_022271	GAT	2	6	34040	34045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872189
595	NC_022271	CCA	2	6	34109	34114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872189
596	NC_022271	GGT	2	6	34128	34133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872189
597	NC_022271	ACC	2	6	34149	34154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872189
598	NC_022271	TTTG	2	8	34217	34224	0 %	75 %	25 %	0 %	541872189
599	NC_022271	GCT	2	6	34235	34240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872189
600	NC_022271	G	7	7	34383	34389	0 %	0 %	100 %	0 %	541872189
601	NC_022271	TGC	2	6	34499	34504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872189
602	NC_022271	TCTAAG	2	12	34606	34617	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	541872189
603	NC_022271	ATTG	2	8	34646	34653	25 %	50 %	25 %	0 %	541872189
604	NC_022271	CTT	2	6	34709	34714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541872190
605	NC_022271	GAA	2	6	34763	34768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872190
606	NC_022271	G	7	7	34783	34789	0 %	0 %	100 %	0 %	541872190
607	NC_022271	CAA	2	6	34891	34896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_022271	GGT	2	6	34959	34964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022271	ACCA	2	8	35015	35022	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_022271	AC	3	6	35047	35052	50 %	0 %	0 %	50 %	541872191
611	NC_022271	CAA	2	6	35074	35079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872191
612	NC_022271	TGC	2	6	35131	35136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872191
613	NC_022271	TCG	2	6	35241	35246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872191
614	NC_022271	AGGA	2	8	35247	35254	50 %	0 %	50 %	0 %	541872191
615	NC_022271	CCA	2	6	35268	35273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541872191
616	NC_022271	TGT	2	6	35390	35395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872191
617	NC_022271	CAG	2	6	35582	35587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872191
618	NC_022271	TCC	2	6	35597	35602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	541872191
619	NC_022271	TTGC	2	8	35603	35610	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
620	NC_022271	GGC	2	6	35615	35620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872191
621	NC_022271	TGT	2	6	35653	35658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541872191
622	NC_022271	AGT	2	6	35675	35680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541872191
623	NC_022271	GGC	2	6	35693	35698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872191
624	NC_022271	GGT	2	6	35757	35762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541872191
625	NC_022271	TGC	3	9	35847	35855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541872191
626	NC_022271	TTGC	2	8	35857	35864	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
627	NC_022271	GCTT	2	8	35871	35878	0 %	50 %	25 %	25 %	541872191
628	NC_022271	GCG	2	6	35904	35909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541872191
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630	NC_022271	CGA	3	9	36088	36096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541872191
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637	NC_022271	TTA	2	6	36730	36735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541872192
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653	NC_022271	GCTT	2	8	37656	37663	0 %	50 %	25 %	25 %	541872193
654	NC_022271	GGTT	2	8	37676	37683	0 %	50 %	50 %	0 %	541872193
655	NC_022271	T	6	6	37682	37687	0 %	100 %	0 %	0 %	541872193
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661	NC_022271	GCG	2	6	37925	37930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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737	NC_022271	AAGA	2	8	41650	41657	75 %	0 %	25 %	0 %	541872198
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741	NC_022271	T	6	6	41985	41990	0 %	100 %	0 %	0 %	541872198
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744	NC_022271	GTCA	2	8	42128	42135	25 %	25 %	25 %	25 %	541872198
745	NC_022271	TGAA	2	8	42203	42210	50 %	25 %	25 %	0 %	541872199
746	NC_022271	AAG	2	6	42241	42246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541872199
747	NC_022271	CATTT	2	10	42259	42268	20 %	60 %	0 %	20 %	541872199
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750	NC_022271	CAA	2	6	42396	42401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541872199
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754	NC_022271	C	6	6	42589	42594	0 %	0 %	0 %	100 %	541872200
755	NC_022271	T	7	7	42598	42604	0 %	100 %	0 %	0 %	541872200
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