MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 2367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022269	AAATC	2	10	1135	1144	60 %	20 %	0 %	20 %	541866814
2	NC_022269	ACTTT	2	10	2147	2156	20 %	60 %	0 %	20 %	541869000
3	NC_022269	ACATG	2	10	3483	3492	40 %	20 %	20 %	20 %	541866815
4	NC_022269	AGGGA	2	10	3819	3828	40 %	0 %	60 %	0 %	541866816
5	NC_022269	ATCGA	2	10	4660	4669	40 %	20 %	20 %	20 %	541866816
6	NC_022269	TCTCC	2	10	6317	6326	0 %	40 %	0 %	60 %	541869002
7	NC_022269	TTTCT	2	10	8891	8900	0 %	80 %	0 %	20 %	541866817
8	NC_022269	ACATC	2	10	11402	11411	40 %	20 %	0 %	40 %	541866819
9	NC_022269	TGTTT	2	10	12942	12951	0 %	80 %	20 %	0 %	541866820
10	NC_022269	CCACG	2	10	13176	13185	20 %	0 %	20 %	60 %	541866820
11	NC_022269	CTTGG	2	10	16144	16153	0 %	40 %	40 %	20 %	541866822
12	NC_022269	GCAGA	2	10	16885	16894	40 %	0 %	40 %	20 %	541866822
13	NC_022269	CGCAA	2	10	17603	17612	40 %	0 %	20 %	40 %	541866823
14	NC_022269	AAGAG	2	10	22153	22162	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022269	TCGCA	2	10	23585	23594	20 %	20 %	20 %	40 %	541866826
16	NC_022269	CTGCA	2	10	24828	24837	20 %	20 %	20 %	40 %	541869007
17	NC_022269	CGGTG	2	10	27433	27442	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_022269	GTTCT	2	10	28070	28079	0 %	60 %	20 %	20 %	541866827
19	NC_022269	ACTCA	2	10	31246	31255	40 %	20 %	0 %	40 %	541866829
20	NC_022269	ATTTG	2	10	34059	34068	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022269	AGATG	2	10	34184	34193	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022269	TGGGC	2	10	38482	38491	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_022269	AAGAC	2	10	42490	42499	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_022269	GTACG	2	10	44431	44440	20 %	20 %	40 %	20 %	541866837
25	NC_022269	CTACG	2	10	44483	44492	20 %	20 %	20 %	40 %	541866837
26	NC_022269	GACTC	2	10	48298	48307	20 %	20 %	20 %	40 %	541866841
27	NC_022269	TTCTT	2	10	48425	48434	0 %	80 %	0 %	20 %	541866841
28	NC_022269	CATCT	2	10	50607	50616	20 %	40 %	0 %	40 %	541866843
29	NC_022269	ATAAG	2	10	53971	53980	60 %	20 %	20 %	0 %	541866846
30	NC_022269	TGGTG	2	10	54520	54529	0 %	40 %	60 %	0 %	541866846
31	NC_022269	CTGAA	2	10	58145	58154	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022269	GTTTT	2	10	59848	59857	0 %	80 %	20 %	0 %	541866850
33	NC_022269	TTGGT	2	10	60693	60702	0 %	60 %	40 %	0 %	541866850
34	NC_022269	TATCC	2	10	63949	63958	20 %	40 %	0 %	40 %	541866853
35	NC_022269	AACAG	2	10	66110	66119	60 %	0 %	20 %	20 %	541866854
36	NC_022269	TCCGT	2	10	66452	66461	0 %	40 %	20 %	40 %	541866854
37	NC_022269	AACAG	2	10	67121	67130	60 %	0 %	20 %	20 %	541866854
38	NC_022269	TCATC	2	10	68461	68470	20 %	40 %	0 %	40 %	541866855
39	NC_022269	TAAGT	2	10	71818	71827	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022269	GATCA	2	10	72457	72466	40 %	20 %	20 %	20 %	541869018
41	NC_022269	CAAGC	2	10	73476	73485	40 %	0 %	20 %	40 %	541866856
42	NC_022269	AAAAG	2	10	78952	78961	80 %	0 %	20 %	0 %	541866858
43	NC_022269	AAGGC	2	10	79043	79052	40 %	0 %	40 %	20 %	541866858
44	NC_022269	AAATA	2	10	79149	79158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022269	AAACC	2	10	80300	80309	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_022269	AGGGC	2	10	80809	80818	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_022269	GCATC	2	10	81760	81769	20 %	20 %	20 %	40 %	541866860
48	NC_022269	TGAAA	2	10	84164	84173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022269	TGCCT	2	10	84748	84757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_022269	ACCGA	2	10	88122	88131	40 %	0 %	20 %	40 %	541866865
51	NC_022269	CATTG	2	10	88802	88811	20 %	40 %	20 %	20 %	541866866
52	NC_022269	GCAAA	2	10	92130	92139	60 %	0 %	20 %	20 %	541866868
53	NC_022269	GCTTG	2	10	93433	93442	0 %	40 %	40 %	20 %	541866869
54	NC_022269	GTCTG	2	10	93535	93544	0 %	40 %	40 %	20 %	541866869
55	NC_022269	TTCCA	2	10	93690	93699	20 %	40 %	0 %	40 %	541866869
56	NC_022269	TTGGG	2	10	95284	95293	0 %	40 %	60 %	0 %	541866870
57	NC_022269	TAACT	2	10	95407	95416	40 %	40 %	0 %	20 %	541866870
58	NC_022269	GGTTT	2	10	95681	95690	0 %	60 %	40 %	0 %	541866870
59	NC_022269	TTCAA	2	10	96165	96174	40 %	40 %	0 %	20 %	541866870
60	NC_022269	ATCGA	2	10	97573	97582	40 %	20 %	20 %	20 %	541869022
61	NC_022269	AATCT	2	10	97819	97828	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_022269	ACTTT	2	10	99042	99051	20 %	60 %	0 %	20 %	541866871
63	NC_022269	TTTCT	2	10	100107	100116	0 %	80 %	0 %	20 %	541869024
64	NC_022269	AGGGG	2	10	100350	100359	20 %	0 %	80 %	0 %	541869024
65	NC_022269	GCATA	2	10	102166	102175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_022269	TTGCA	2	10	103167	103176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_022269	ATCGG	2	10	104174	104183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_022269	TGGTT	2	10	105172	105181	0 %	60 %	40 %	0 %	541866872
69	NC_022269	TGTGG	2	10	105930	105939	0 %	40 %	60 %	0 %	541866872
70	NC_022269	AAGAT	2	10	106330	106339	60 %	20 %	20 %	0 %	541866872
71	NC_022269	GTTAG	2	10	107684	107693	20 %	40 %	40 %	0 %	541866873
72	NC_022269	TTACG	2	10	107739	107748	20 %	40 %	20 %	20 %	541866873
73	NC_022269	CCAGT	2	10	107797	107806	20 %	20 %	20 %	40 %	541866873
74	NC_022269	AAGTT	2	10	109365	109374	40 %	40 %	20 %	0 %	541866874
75	NC_022269	TGCGT	2	10	115152	115161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_022269	AAGCA	2	10	117081	117090	60 %	0 %	20 %	20 %	541869036
77	NC_022269	TTTCA	2	10	118633	118642	20 %	60 %	0 %	20 %	541869039
78	NC_022269	AATCG	2	10	118666	118675	40 %	20 %	20 %	20 %	541869039
79	NC_022269	AAGCA	2	10	121015	121024	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_022269	ATTGA	2	10	122494	122503	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022269	CATCA	2	10	123047	123056	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_022269	ATCTT	2	10	123070	123079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_022269	TCACT	2	10	123150	123159	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_022269	GTTGA	2	10	123914	123923	20 %	40 %	40 %	0 %	541869044
85	NC_022269	TGGCG	2	10	124373	124382	0 %	20 %	60 %	20 %	541869045
86	NC_022269	GAGAT	2	10	126745	126754	40 %	20 %	40 %	0 %	541869046
87	NC_022269	TTTGT	2	10	129643	129652	0 %	80 %	20 %	0 %	541869047
88	NC_022269	ATCCA	2	10	131306	131315	40 %	20 %	0 %	40 %	541866877
89	NC_022269	AAAAT	2	10	134038	134047	80 %	20 %	0 %	0 %	541869050
90	NC_022269	ATTGA	2	10	136243	136252	40 %	40 %	20 %	0 %	541869053
91	NC_022269	ACAGA	2	10	139006	139015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_022269	TGTAT	2	10	139434	139443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022269	ATCTT	2	10	142894	142903	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_022269	CATCG	2	10	145723	145732	20 %	20 %	20 %	40 %	541869062
95	NC_022269	ATACC	2	10	148411	148420	40 %	20 %	0 %	40 %	541869064
96	NC_022269	TGGGT	2	10	150049	150058	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022269	AAAAT	2	10	150690	150699	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022269	AAGCC	2	10	151241	151250	40 %	0 %	20 %	40 %	541869066
99	NC_022269	TCGAC	2	10	153203	153212	20 %	20 %	20 %	40 %	541866879
100	NC_022269	GTGCA	2	10	157657	157666	20 %	20 %	40 %	20 %	541869071
101	NC_022269	TAATT	2	10	161193	161202	40 %	60 %	0 %	0 %	541866881
102	NC_022269	GATTT	2	10	162909	162918	20 %	60 %	20 %	0 %	541866882
103	NC_022269	TGCCA	2	10	163004	163013	20 %	20 %	20 %	40 %	541866882
104	NC_022269	GTTTG	2	10	163157	163166	0 %	60 %	40 %	0 %	541866882
105	NC_022269	TGATT	2	10	169827	169836	20 %	60 %	20 %	0 %	541866886
106	NC_022269	ACTCA	2	10	169916	169925	40 %	20 %	0 %	40 %	541866886
107	NC_022269	TGTCG	2	10	170416	170425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_022269	ATTTT	2	10	172491	172500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022269	TGCGA	2	10	173876	173885	20 %	20 %	40 %	20 %	541866889
110	NC_022269	TTGCT	2	10	174459	174468	0 %	60 %	20 %	20 %	541866889
111	NC_022269	ATCCA	2	10	179222	179231	40 %	20 %	0 %	40 %	541866893
112	NC_022269	GATGC	2	10	179524	179533	20 %	20 %	40 %	20 %	541866893
113	NC_022269	TATTT	2	10	182638	182647	20 %	80 %	0 %	0 %	541866895
114	NC_022269	GGTTC	2	10	183199	183208	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_022269	TGACT	2	10	183392	183401	20 %	40 %	20 %	20 %	541866896
116	NC_022269	TTGCT	2	10	184528	184537	0 %	60 %	20 %	20 %	541866898
117	NC_022269	GTCAG	2	10	187027	187036	20 %	20 %	40 %	20 %	541866898
118	NC_022269	CAAAC	2	10	187597	187606	60 %	0 %	0 %	40 %	541866899
119	NC_022269	CTTGG	2	10	187608	187617	0 %	40 %	40 %	20 %	541866899
120	NC_022269	TTGGC	2	10	192419	192428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_022269	TATTG	2	10	195467	195476	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022269	CTGCA	2	10	196166	196175	20 %	20 %	20 %	40 %	541869081
123	NC_022269	CGAAT	2	10	196973	196982	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_022269	AATTG	2	10	202724	202733	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022269	GAAAT	2	10	202777	202786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022269	TTTGT	2	10	202945	202954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022269	TACGG	2	10	203589	203598	20 %	20 %	40 %	20 %	541866907
128	NC_022269	CAAGC	2	10	204748	204757	40 %	0 %	20 %	40 %	541866907
129	NC_022269	AAACA	2	10	204894	204903	80 %	0 %	0 %	20 %	541866907
130	NC_022269	GATGA	2	10	204927	204936	40 %	20 %	40 %	0 %	541866907
131	NC_022269	AATCA	2	10	208582	208591	60 %	20 %	0 %	20 %	541869085
132	NC_022269	CAAAT	2	10	209725	209734	60 %	20 %	0 %	20 %	541866911
133	NC_022269	GAACA	2	10	210208	210217	60 %	0 %	20 %	20 %	541866911
134	NC_022269	GGTTT	2	10	212593	212602	0 %	60 %	40 %	0 %	541866911
135	NC_022269	AAACT	2	10	213541	213550	60 %	20 %	0 %	20 %	541866912
136	NC_022269	AAAAC	2	10	214025	214034	80 %	0 %	0 %	20 %	541866913
137	NC_022269	TGGTT	2	10	215181	215190	0 %	60 %	40 %	0 %	541866915
138	NC_022269	GCTCT	2	10	217897	217906	0 %	40 %	20 %	40 %	541869087
139	NC_022269	GAGCT	2	10	219661	219670	20 %	20 %	40 %	20 %	541866916
140	NC_022269	TGGTT	2	10	220475	220484	0 %	60 %	40 %	0 %	541869088
141	NC_022269	TGATT	2	10	220856	220865	20 %	60 %	20 %	0 %	541869089
142	NC_022269	CTGAA	2	10	223688	223697	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_022269	AAAAG	2	10	225495	225504	80 %	0 %	20 %	0 %	541869091
144	NC_022269	GCGGG	2	10	227570	227579	0 %	0 %	80 %	20 %	541866919
145	NC_022269	TGATT	2	10	230538	230547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022269	TCGAA	2	10	231313	231322	40 %	20 %	20 %	20 %	541866921
147	NC_022269	CTGCA	2	10	232848	232857	20 %	20 %	20 %	40 %	541869095
148	NC_022269	CATTA	2	10	233960	233969	40 %	40 %	0 %	20 %	541866922
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151	NC_022269	CATCG	2	10	238877	238886	20 %	20 %	20 %	40 %	541869097
152	NC_022269	GAAGG	2	10	240151	240160	40 %	0 %	60 %	0 %	541869098
153	NC_022269	GTTGT	2	10	240670	240679	0 %	60 %	40 %	0 %	541869099
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155	NC_022269	CTGGT	2	10	243060	243069	0 %	40 %	40 %	20 %	541869101
156	NC_022269	ACTGA	2	10	243264	243273	40 %	20 %	20 %	20 %	541869101
157	NC_022269	ACTTT	2	10	243811	243820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_022269	CAACG	2	10	244440	244449	40 %	0 %	20 %	40 %	541866926
159	NC_022269	GATTG	2	10	244775	244784	20 %	40 %	40 %	0 %	541866926
160	NC_022269	CAACT	2	10	244852	244861	40 %	20 %	0 %	40 %	541866926
161	NC_022269	ATTTC	2	10	247594	247603	20 %	60 %	0 %	20 %	541866929
162	NC_022269	GATTC	2	10	250166	250175	20 %	40 %	20 %	20 %	541866930
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168	NC_022269	CGTAA	2	10	254776	254785	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_022269	AATGG	2	10	255720	255729	40 %	20 %	40 %	0 %	541866931
170	NC_022269	AAGTG	2	10	258247	258256	40 %	20 %	40 %	0 %	541866932
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172	NC_022269	AGTGC	2	10	259713	259722	20 %	20 %	40 %	20 %	541866933
173	NC_022269	AATGC	2	10	260256	260265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_022269	CTTGG	2	10	261045	261054	0 %	40 %	40 %	20 %	541866934
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176	NC_022269	GTATC	2	10	262956	262965	20 %	40 %	20 %	20 %	541866935
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179	NC_022269	GAGCT	2	10	271501	271510	20 %	20 %	40 %	20 %	541869111
180	NC_022269	AAATC	2	10	272508	272517	60 %	20 %	0 %	20 %	541869112
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183	NC_022269	TGTGA	2	10	285551	285560	20 %	40 %	40 %	0 %	541866945
184	NC_022269	GTTTT	2	10	286079	286088	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_022269	CTGAA	2	10	290842	290851	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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220	NC_022269	GATCT	2	10	349894	349903	20 %	40 %	20 %	20 %	541866975
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229	NC_022269	GTTCA	2	10	360378	360387	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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232	NC_022269	GAACA	2	10	364348	364357	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
233	NC_022269	CCAAT	2	10	364792	364801	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
234	NC_022269	TAAGT	2	10	369393	369402	40 %	40 %	20 %	0 %	541866983
235	NC_022269	AAATC	2	10	379578	379587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
236	NC_022269	CCATA	2	10	381316	381325	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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244	NC_022269	ACTTA	2	10	397625	397634	40 %	40 %	0 %	20 %	541869152
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249	NC_022269	GAAGC	2	10	406866	406875	40 %	0 %	40 %	20 %	541866998
250	NC_022269	ACTTC	2	10	407860	407869	20 %	40 %	0 %	40 %	541866999
251	NC_022269	CAGAG	2	10	408774	408783	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
252	NC_022269	AAGTT	2	10	410648	410657	40 %	40 %	20 %	0 %	541867001
253	NC_022269	CAAAT	2	10	411244	411253	60 %	20 %	0 %	20 %	541869153
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259	NC_022269	ACAAG	2	10	425097	425106	60 %	0 %	20 %	20 %	541867011
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261	NC_022269	ACATC	2	10	428819	428828	40 %	20 %	0 %	40 %	541869162
262	NC_022269	TACCC	2	10	429556	429565	20 %	20 %	0 %	60 %	541867014
263	NC_022269	TTACA	2	10	429998	430007	40 %	40 %	0 %	20 %	541867014
264	NC_022269	TTGGG	2	10	430274	430283	0 %	40 %	60 %	0 %	541867014
265	NC_022269	TCAAA	2	10	431731	431740	60 %	20 %	0 %	20 %	541867017
266	NC_022269	TAACT	2	10	432003	432012	40 %	40 %	0 %	20 %	541867017
267	NC_022269	AGCAC	2	10	434220	434229	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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269	NC_022269	CTTGG	2	10	435224	435233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_022269	AGCCA	2	10	620141	620150	40 %	0 %	20 %	40 %	541869220
400	NC_022269	TTTTC	2	10	622748	622757	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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402	NC_022269	ACTGA	2	10	623117	623126	40 %	20 %	20 %	20 %	541869222
403	NC_022269	AAATC	2	10	624076	624085	60 %	20 %	0 %	20 %	541869222
404	NC_022269	AGCTC	2	10	629752	629761	20 %	20 %	20 %	40 %	541869224
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406	NC_022269	GGACT	2	10	633841	633850	20 %	20 %	40 %	20 %	541869226
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410	NC_022269	AGTTA	2	10	645643	645652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_022269	CAATA	2	10	676075	676084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_022269	TTCTT	2	10	769122	769131	0 %	80 %	0 %	20 %	541867179
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500	NC_022269	CCCTG	2	10	797831	797840	0 %	20 %	20 %	60 %	541867188

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