MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022247	CGGC	2	8	123226	123233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_022247	CGG	2	6	123245	123250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_022247	CCG	2	6	123251	123256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_022247	GCCGC	2	10	123279	123288	0 %	0 %	40 %	60 %	538392353
3505	NC_022247	GC	3	6	123305	123310	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3506	NC_022247	CAC	2	6	123366	123371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392353
3507	NC_022247	CGC	2	6	123374	123379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3508	NC_022247	GC	3	6	123378	123383	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3509	NC_022247	GGCC	2	8	123393	123400	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3510	NC_022247	ATGC	2	8	123411	123418	25 %	25 %	25 %	25 %	538392353
3511	NC_022247	GTG	2	6	123444	123449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392353
3512	NC_022247	CTC	2	6	123480	123485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392353
3513	NC_022247	CGC	2	6	123506	123511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3514	NC_022247	TGG	2	6	123563	123568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392353
3515	NC_022247	CGA	2	6	123578	123583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3516	NC_022247	GCG	2	6	123590	123595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392353
3517	NC_022247	CAG	2	6	123627	123632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3518	NC_022247	CCT	2	6	123686	123691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392353
3519	NC_022247	GCC	2	6	123693	123698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3520	NC_022247	CTT	2	6	123702	123707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392353
3521	NC_022247	GTC	2	6	123717	123722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3522	NC_022247	CTG	2	6	123792	123797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3523	NC_022247	CG	3	6	123809	123814	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3524	NC_022247	GCG	3	9	123812	123820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392353
3525	NC_022247	GTC	2	6	123852	123857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3526	NC_022247	CG	3	6	124017	124022	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3527	NC_022247	CCA	2	6	124040	124045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392353
3528	NC_022247	GCGCG	2	10	124071	124080	0 %	0 %	60 %	40 %	538392353
3529	NC_022247	GGC	2	6	124100	124105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392353
3530	NC_022247	CATGGC	2	12	124146	124157	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3531	NC_022247	GC	5	10	124163	124172	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3532	NC_022247	CGT	2	6	124199	124204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3533	NC_022247	GTC	2	6	124215	124220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3534	NC_022247	CTC	2	6	124275	124280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392353
3535	NC_022247	GCA	2	6	124283	124288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3536	NC_022247	CGGCG	2	10	124349	124358	0 %	0 %	60 %	40 %	538392353
3537	NC_022247	GTC	2	6	124365	124370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392353
3538	NC_022247	CCG	2	6	124373	124378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3539	NC_022247	CG	3	6	124377	124382	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3540	NC_022247	GTG	3	9	124423	124431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392353
3541	NC_022247	CCG	2	6	124432	124437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3542	NC_022247	GGGC	2	8	124487	124494	0 %	0 %	75 %	25 %	538392353
3543	NC_022247	CGC	2	6	124526	124531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3544	NC_022247	CGGC	2	8	124546	124553	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3545	NC_022247	CG	3	6	124565	124570	0 %	0 %	50 %	50 %	538392353
3546	NC_022247	CCG	2	6	124573	124578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392353
3547	NC_022247	T	6	6	124720	124725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_022247	CAA	2	6	124728	124733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_022247	ATC	2	6	124758	124763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_022247	CA	3	6	124813	124818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_022247	GCC	2	6	124905	124910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392354
3552	NC_022247	CGA	2	6	124991	124996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392354
3553	NC_022247	GCC	3	9	125010	125018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392354
3554	NC_022247	TCG	2	6	125067	125072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392354
3555	NC_022247	GGCT	2	8	125073	125080	0 %	25 %	50 %	25 %	538392354
3556	NC_022247	CGC	2	6	125135	125140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392354
3557	NC_022247	CAC	2	6	125141	125146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392354
3558	NC_022247	CTG	2	6	125169	125174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392354
3559	NC_022247	GCG	2	6	125182	125187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392354
3560	NC_022247	CCG	2	6	125218	125223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392354
3561	NC_022247	GCA	2	6	125228	125233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392354
3562	NC_022247	TCG	2	6	125239	125244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392354
3563	NC_022247	CG	3	6	125253	125258	0 %	0 %	50 %	50 %	538392354
3564	NC_022247	GGT	2	6	125270	125275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392354
3565	NC_022247	GGC	2	6	125360	125365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392354
3566	NC_022247	CG	3	6	125366	125371	0 %	0 %	50 %	50 %	538392354
3567	NC_022247	CAC	2	6	125384	125389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392354
3568	NC_022247	CGC	2	6	125408	125413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392354
3569	NC_022247	GCT	2	6	125453	125458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392354
3570	NC_022247	ACC	2	6	125472	125477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392354
3571	NC_022247	GC	3	6	125492	125497	0 %	0 %	50 %	50 %	538392354
3572	NC_022247	GC	3	6	125533	125538	0 %	0 %	50 %	50 %	538392354
3573	NC_022247	TGA	2	6	125553	125558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392354
3574	NC_022247	CCTACA	2	12	125585	125596	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538392355
3575	NC_022247	TGG	3	9	125627	125635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392355
3576	NC_022247	CGC	2	6	125642	125647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392355
3577	NC_022247	CAG	2	6	125676	125681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392355
3578	NC_022247	GAA	2	6	125700	125705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392355
3579	NC_022247	CCA	2	6	125750	125755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392355
3580	NC_022247	ATC	2	6	125761	125766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392355
3581	NC_022247	CAG	2	6	125781	125786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392355
3582	NC_022247	ACG	2	6	125845	125850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392355
3583	NC_022247	CAG	3	9	125865	125873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392355
3584	NC_022247	CCAC	2	8	125933	125940	25 %	0 %	0 %	75 %	538392355
3585	NC_022247	GTT	2	6	125985	125990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392355
3586	NC_022247	CAT	2	6	126032	126037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_022247	GGC	2	6	126053	126058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3588	NC_022247	GCG	2	6	126059	126064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3589	NC_022247	CAG	2	6	126077	126082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3590	NC_022247	GAA	2	6	126092	126097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392356
3591	NC_022247	CAG	2	6	126101	126106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3592	NC_022247	GC	3	6	126120	126125	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3593	NC_022247	GTA	2	6	126140	126145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392356
3594	NC_022247	CG	3	6	126168	126173	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3595	NC_022247	CCA	3	9	126178	126186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392356
3596	NC_022247	CGC	2	6	126190	126195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392356
3597	NC_022247	GC	3	6	126194	126199	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3598	NC_022247	TCG	2	6	126204	126209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3599	NC_022247	CCA	2	6	126211	126216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392356
3600	NC_022247	GGC	2	6	126254	126259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3601	NC_022247	GCC	2	6	126293	126298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392356
3602	NC_022247	GC	3	6	126299	126304	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3603	NC_022247	CTG	2	6	126320	126325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3604	NC_022247	GCCA	2	8	126343	126350	25 %	0 %	25 %	50 %	538392356
3605	NC_022247	CTG	2	6	126365	126370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3606	NC_022247	CAG	2	6	126371	126376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3607	NC_022247	GCC	2	6	126393	126398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392356
3608	NC_022247	CG	3	6	126415	126420	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3609	NC_022247	GCA	2	6	126421	126426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392356
3610	NC_022247	CAC	2	6	126446	126451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392356
3611	NC_022247	GC	3	6	126474	126479	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3612	NC_022247	GCG	2	6	126525	126530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3613	NC_022247	CAC	3	9	126581	126589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392356
3614	NC_022247	CAGC	2	8	126629	126636	25 %	0 %	25 %	50 %	538392356
3615	NC_022247	GCC	2	6	126657	126662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392356
3616	NC_022247	GAGC	2	8	126668	126675	25 %	0 %	50 %	25 %	538392356
3617	NC_022247	GCCGC	2	10	126756	126765	0 %	0 %	40 %	60 %	538392356
3618	NC_022247	GCG	2	6	126794	126799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3619	NC_022247	GCGCG	2	10	126877	126886	0 %	0 %	60 %	40 %	538392356
3620	NC_022247	GC	3	6	126902	126907	0 %	0 %	50 %	50 %	538392356
3621	NC_022247	GGC	2	6	126908	126913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3622	NC_022247	GCG	2	6	126950	126955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392356
3623	NC_022247	GCC	2	6	127138	127143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392357
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3728	NC_022247	AGAA	2	8	130578	130585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3738	NC_022247	CGGC	2	8	131026	131033	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
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3742	NC_022247	GAC	2	6	131091	131096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392361
3743	NC_022247	CGCC	2	8	131102	131109	0 %	0 %	25 %	75 %	538392361
3744	NC_022247	CG	3	6	131164	131169	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3745	NC_022247	CGG	2	6	131179	131184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
3746	NC_022247	CTG	2	6	131217	131222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392361
3747	NC_022247	GCG	2	6	131273	131278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
3748	NC_022247	GCG	2	6	131290	131295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
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3864	NC_022247	GCGG	2	8	135228	135235	0 %	0 %	75 %	25 %	538392364
3865	NC_022247	CAG	3	9	135236	135244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392364
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3992	NC_022247	GGA	2	6	139750	139755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392370
3993	NC_022247	GCC	2	6	139847	139852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392370
3994	NC_022247	GGTCG	2	10	139866	139875	0 %	20 %	60 %	20 %	538392370
3995	NC_022247	GTC	2	6	139890	139895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392370
3996	NC_022247	GCT	2	6	139979	139984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392370
3997	NC_022247	GC	4	8	139985	139992	0 %	0 %	50 %	50 %	538392370
3998	NC_022247	AGC	2	6	139993	139998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392370
3999	NC_022247	CGC	2	6	140000	140005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392370
4000	NC_022247	GTCG	2	8	140013	140020	0 %	25 %	50 %	25 %	538392370

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