MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022247	CGC	2	6	54289	54294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392284
1502	NC_022247	CG	4	8	54333	54340	0 %	0 %	50 %	50 %	538392284
1503	NC_022247	CTCG	2	8	54343	54350	0 %	25 %	25 %	50 %	538392284
1504	NC_022247	GCG	2	6	54373	54378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392284
1505	NC_022247	ACG	2	6	54423	54428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392284
1506	NC_022247	CG	4	8	54475	54482	0 %	0 %	50 %	50 %	538392284
1507	NC_022247	CGG	2	6	54499	54504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392284
1508	NC_022247	CGA	2	6	54505	54510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392284
1509	NC_022247	GC	4	8	54536	54543	0 %	0 %	50 %	50 %	538392284
1510	NC_022247	GGC	3	9	54544	54552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392284
1511	NC_022247	CGA	2	6	54571	54576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392284
1512	NC_022247	GAAG	2	8	54578	54585	50 %	0 %	50 %	0 %	538392284
1513	NC_022247	CAT	2	6	54588	54593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392284
1514	NC_022247	AGA	2	6	54599	54604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392285
1515	NC_022247	GCG	2	6	54635	54640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392285
1516	NC_022247	CTG	3	9	54649	54657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392285
1517	NC_022247	CCG	4	12	54659	54670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392285
1518	NC_022247	CA	3	6	54713	54718	50 %	0 %	0 %	50 %	538392285
1519	NC_022247	CCG	2	6	54730	54735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392285
1520	NC_022247	GCA	2	6	54740	54745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392285
1521	NC_022247	CGC	2	6	54777	54782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392285
1522	NC_022247	ACGCG	2	10	54809	54818	20 %	0 %	40 %	40 %	538392285
1523	NC_022247	GCG	2	6	54821	54826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392285
1524	NC_022247	CAA	2	6	54828	54833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392285
1525	NC_022247	AGCC	2	8	54846	54853	25 %	0 %	25 %	50 %	538392285
1526	NC_022247	GCC	3	9	54921	54929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392285
1527	NC_022247	GC	3	6	54991	54996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_022247	CCG	2	6	54999	55004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_022247	ACC	2	6	55084	55089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_022247	CGC	2	6	55153	55158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392286
1531	NC_022247	GAC	2	6	55196	55201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392286
1532	NC_022247	TTC	2	6	55205	55210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392286
1533	NC_022247	TCT	2	6	55275	55280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392286
1534	NC_022247	CGC	2	6	55283	55288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392286
1535	NC_022247	CAG	2	6	55294	55299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392286
1536	NC_022247	CAC	3	9	55333	55341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392286
1537	NC_022247	AGC	2	6	55401	55406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392286
1538	NC_022247	CG	3	6	55431	55436	0 %	0 %	50 %	50 %	538392286
1539	NC_022247	GGT	2	6	55483	55488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392286
1540	NC_022247	AAG	2	6	55494	55499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392286
1541	NC_022247	CTG	2	6	55595	55600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392286
1542	NC_022247	GCC	2	6	55604	55609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392286
1543	NC_022247	GCT	2	6	55657	55662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1544	NC_022247	CG	3	6	55669	55674	0 %	0 %	50 %	50 %	538392287
1545	NC_022247	AGC	2	6	55755	55760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1546	NC_022247	CCT	2	6	55780	55785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392287
1547	NC_022247	GC	3	6	55821	55826	0 %	0 %	50 %	50 %	538392287
1548	NC_022247	CAG	2	6	55850	55855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1549	NC_022247	GC	5	10	55873	55882	0 %	0 %	50 %	50 %	538392287
1550	NC_022247	CG	3	6	55909	55914	0 %	0 %	50 %	50 %	538392287
1551	NC_022247	CGC	2	6	55930	55935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392287
1552	NC_022247	GCA	2	6	55936	55941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1553	NC_022247	CGT	2	6	55972	55977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1554	NC_022247	CGG	2	6	55984	55989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392287
1555	NC_022247	CAG	2	6	55991	55996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1556	NC_022247	CGG	2	6	55997	56002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392287
1557	NC_022247	GC	3	6	56014	56019	0 %	0 %	50 %	50 %	538392287
1558	NC_022247	GGC	2	6	56093	56098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392287
1559	NC_022247	GCG	2	6	56104	56109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392287
1560	NC_022247	GCG	3	9	56169	56177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392287
1561	NC_022247	GGC	2	6	56210	56215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392287
1562	NC_022247	CAG	2	6	56231	56236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1563	NC_022247	GGA	2	6	56239	56244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392287
1564	NC_022247	GTC	2	6	56248	56253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1565	NC_022247	TGC	2	6	56260	56265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392287
1566	NC_022247	GAA	2	6	56327	56332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392288
1567	NC_022247	CGG	2	6	56377	56382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392288
1568	NC_022247	GCC	2	6	56387	56392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392288
1569	NC_022247	GCC	2	6	56399	56404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392288
1570	NC_022247	CAG	2	6	56410	56415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392288
1571	NC_022247	GATG	2	8	56498	56505	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_022247	CGC	2	6	56600	56605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_022247	TCA	2	6	56690	56695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_022247	GAT	2	6	56712	56717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392289
1575	NC_022247	GCT	2	6	56743	56748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392289
1576	NC_022247	GCG	2	6	56749	56754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392289
1577	NC_022247	CAG	2	6	56854	56859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392289
1578	NC_022247	CCG	2	6	56862	56867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392289
1579	NC_022247	CCG	2	6	56886	56891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392289
1580	NC_022247	GGCCG	2	10	56921	56930	0 %	0 %	60 %	40 %	538392289
1581	NC_022247	CGG	2	6	56979	56984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392289
1582	NC_022247	GTG	2	6	57019	57024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392289
1583	NC_022247	GC	3	6	57033	57038	0 %	0 %	50 %	50 %	538392289
1584	NC_022247	GCA	2	6	57048	57053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392289
1585	NC_022247	GCC	2	6	57054	57059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392289
1586	NC_022247	GTGG	2	8	57072	57079	0 %	25 %	75 %	0 %	538392289
1587	NC_022247	GTGG	2	8	57082	57089	0 %	25 %	75 %	0 %	538392289
1588	NC_022247	ATC	2	6	57133	57138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392289
1589	NC_022247	GC	3	6	57162	57167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_022247	TCA	2	6	57190	57195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_022247	CCG	2	6	57199	57204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_022247	GCG	2	6	57215	57220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_022247	TTTTTG	2	12	57224	57235	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_022247	GAGC	2	8	57243	57250	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1595	NC_022247	GGC	2	6	57257	57262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392290
1596	NC_022247	GCC	3	9	57317	57325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392290
1597	NC_022247	GTC	2	6	57371	57376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392290
1598	NC_022247	GGC	2	6	57391	57396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392290
1599	NC_022247	GCA	2	6	57400	57405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392290
1600	NC_022247	CGG	2	6	57451	57456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392290
1601	NC_022247	CGG	2	6	57460	57465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392290
1602	NC_022247	GGC	2	6	57473	57478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392290
1603	NC_022247	TGC	3	9	57492	57500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392290
1604	NC_022247	CGCA	2	8	57574	57581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_022247	GCCGC	2	10	57746	57755	0 %	0 %	40 %	60 %	538392291
1606	NC_022247	GC	4	8	57802	57809	0 %	0 %	50 %	50 %	538392291
1607	NC_022247	ACGCC	2	10	57835	57844	20 %	0 %	20 %	60 %	538392291
1608	NC_022247	TCG	2	6	57951	57956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392291
1609	NC_022247	GCG	2	6	58027	58032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392291
1610	NC_022247	CAG	2	6	58037	58042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392291
1611	NC_022247	GCAGG	2	10	58085	58094	20 %	0 %	60 %	20 %	538392291
1612	NC_022247	CCA	2	6	58096	58101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392291
1613	NC_022247	GC	3	6	58222	58227	0 %	0 %	50 %	50 %	538392291
1614	NC_022247	GC	3	6	58259	58264	0 %	0 %	50 %	50 %	538392291
1615	NC_022247	GCC	2	6	58278	58283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392291
1616	NC_022247	CTG	2	6	58301	58306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392291
1617	NC_022247	TGC	2	6	58339	58344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392291
1618	NC_022247	GAT	2	6	58364	58369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392291
1619	NC_022247	GCA	2	6	58372	58377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392291
1620	NC_022247	GCC	2	6	58382	58387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392291
1621	NC_022247	GCAC	2	8	58419	58426	25 %	0 %	25 %	50 %	538392291
1622	NC_022247	TCC	2	6	58449	58454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392291
1623	NC_022247	AACG	2	8	58531	58538	50 %	0 %	25 %	25 %	538392291
1624	NC_022247	GTT	2	6	58558	58563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392291
1625	NC_022247	GGA	2	6	58581	58586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_022247	GA	3	6	58593	58598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_022247	AAAG	2	8	58600	58607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_022247	GCG	2	6	58624	58629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_022247	TTG	2	6	58667	58672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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