MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022247	CG	3	6	36301	36306	0 %	0 %	50 %	50 %	538392265
1002	NC_022247	ATG	2	6	36420	36425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392265
1003	NC_022247	CG	3	6	36427	36432	0 %	0 %	50 %	50 %	538392265
1004	NC_022247	GGC	2	6	36458	36463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392265
1005	NC_022247	AGAA	2	8	36490	36497	75 %	0 %	25 %	0 %	538392265
1006	NC_022247	CTTT	2	8	36515	36522	0 %	75 %	0 %	25 %	538392266
1007	NC_022247	GGC	2	6	36525	36530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392266
1008	NC_022247	GC	3	6	36537	36542	0 %	0 %	50 %	50 %	538392266
1009	NC_022247	CAC	2	6	36609	36614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392266
1010	NC_022247	TGG	2	6	36616	36621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392266
1011	NC_022247	CAC	2	6	36663	36668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392266
1012	NC_022247	CG	3	6	36695	36700	0 %	0 %	50 %	50 %	538392266
1013	NC_022247	AGG	2	6	36703	36708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392266
1014	NC_022247	TGCA	2	8	36744	36751	25 %	25 %	25 %	25 %	538392266
1015	NC_022247	GC	3	6	36898	36903	0 %	0 %	50 %	50 %	538392266
1016	NC_022247	CGTT	2	8	36907	36914	0 %	50 %	25 %	25 %	538392266
1017	NC_022247	GGGC	2	8	36927	36934	0 %	0 %	75 %	25 %	538392266
1018	NC_022247	GCG	2	6	36962	36967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392266
1019	NC_022247	GCA	3	9	36983	36991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1020	NC_022247	CGC	2	6	37058	37063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392266
1021	NC_022247	CGA	2	6	37095	37100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1022	NC_022247	CCA	2	6	37115	37120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392266
1023	NC_022247	TGC	2	6	37135	37140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1024	NC_022247	GCA	2	6	37145	37150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1025	NC_022247	CTG	2	6	37200	37205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1026	NC_022247	GCG	2	6	37213	37218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392266
1027	NC_022247	GC	3	6	37270	37275	0 %	0 %	50 %	50 %	538392266
1028	NC_022247	TGC	2	6	37310	37315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1029	NC_022247	GCA	3	9	37325	37333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392266
1030	NC_022247	CAC	2	6	37362	37367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392266
1031	NC_022247	GTT	2	6	37404	37409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_022247	CCT	2	6	37499	37504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1033	NC_022247	CAC	2	6	37531	37536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_022247	AC	4	8	37535	37542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_022247	TGC	2	6	37590	37595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392267
1036	NC_022247	ACC	2	6	37653	37658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392267
1037	NC_022247	TGC	2	6	37686	37691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392267
1038	NC_022247	GGTGCT	2	12	37789	37800	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538392267
1039	NC_022247	GC	3	6	37805	37810	0 %	0 %	50 %	50 %	538392267
1040	NC_022247	GAG	2	6	37820	37825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392267
1041	NC_022247	CGA	2	6	37852	37857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392267
1042	NC_022247	GC	4	8	37903	37910	0 %	0 %	50 %	50 %	538392267
1043	NC_022247	GCG	2	6	37915	37920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392267
1044	NC_022247	TGC	2	6	37944	37949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392267
1045	NC_022247	GC	3	6	37976	37981	0 %	0 %	50 %	50 %	538392267
1046	NC_022247	CG	4	8	38017	38024	0 %	0 %	50 %	50 %	538392267
1047	NC_022247	TGA	2	6	38046	38051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392267
1048	NC_022247	CCG	2	6	38054	38059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392267
1049	NC_022247	CGA	2	6	38107	38112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392267
1050	NC_022247	AAG	2	6	38159	38164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392267
1051	NC_022247	CGCA	2	8	38236	38243	25 %	0 %	25 %	50 %	538392268
1052	NC_022247	TGC	2	6	38294	38299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1053	NC_022247	TGG	2	6	38333	38338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392268
1054	NC_022247	CGA	2	6	38403	38408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1055	NC_022247	GGCG	2	8	38436	38443	0 %	0 %	75 %	25 %	538392268
1056	NC_022247	GCT	3	9	38457	38465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1057	NC_022247	CGC	2	6	38468	38473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392268
1058	NC_022247	G	6	6	38559	38564	0 %	0 %	100 %	0 %	538392268
1059	NC_022247	CGG	2	6	38582	38587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392268
1060	NC_022247	GC	3	6	38637	38642	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1061	NC_022247	GGT	2	6	38643	38648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392268
1062	NC_022247	GTG	2	6	38692	38697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392268
1063	NC_022247	CG	3	6	38719	38724	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1064	NC_022247	GCT	2	6	38739	38744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1065	NC_022247	TGC	3	9	38768	38776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1066	NC_022247	TGGCA	2	10	38800	38809	20 %	20 %	40 %	20 %	538392268
1067	NC_022247	CAG	2	6	38842	38847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1068	NC_022247	CCG	2	6	38856	38861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392268
1069	NC_022247	CT	3	6	38875	38880	0 %	50 %	0 %	50 %	538392268
1070	NC_022247	GGT	2	6	38889	38894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392268
1071	NC_022247	CG	3	6	38903	38908	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1072	NC_022247	GCGT	2	8	38963	38970	0 %	25 %	50 %	25 %	538392268
1073	NC_022247	CGC	2	6	39014	39019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392268
1074	NC_022247	GCA	2	6	39057	39062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1075	NC_022247	AGC	2	6	39083	39088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1076	NC_022247	CG	4	8	39090	39097	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1077	NC_022247	CG	3	6	39115	39120	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1078	NC_022247	GCT	2	6	39138	39143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1079	NC_022247	CGA	2	6	39159	39164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1080	NC_022247	GC	3	6	39166	39171	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1081	NC_022247	CG	4	8	39180	39187	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1082	NC_022247	TGC	2	6	39224	39229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1083	NC_022247	GC	4	8	39269	39276	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1084	NC_022247	CGA	2	6	39282	39287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1085	NC_022247	CGAA	2	8	39305	39312	50 %	0 %	25 %	25 %	538392268
1086	NC_022247	CGG	2	6	39363	39368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392268
1087	NC_022247	CGA	2	6	39414	39419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1088	NC_022247	AGCGC	2	10	39441	39450	20 %	0 %	40 %	40 %	538392268
1089	NC_022247	GGGCCT	2	12	39507	39518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392268
1090	NC_022247	GC	3	6	39529	39534	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1091	NC_022247	CTG	2	6	39544	39549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1092	NC_022247	CGG	3	9	39623	39631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392268
1093	NC_022247	GCC	3	9	39717	39725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
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1095	NC_022247	CGA	2	6	39818	39823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1096	NC_022247	GTC	2	6	39825	39830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1097	NC_022247	CCTT	2	8	39832	39839	0 %	50 %	0 %	50 %	538392269
1098	NC_022247	GTT	2	6	39873	39878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392269
1099	NC_022247	CCAT	2	8	39881	39888	25 %	25 %	0 %	50 %	538392269
1100	NC_022247	GCC	2	6	39897	39902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1101	NC_022247	GGC	2	6	39915	39920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1102	NC_022247	CG	3	6	39959	39964	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1103	NC_022247	GCC	2	6	39966	39971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1104	NC_022247	GAT	2	6	39984	39989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392269
1105	NC_022247	AGGCC	2	10	39998	40007	20 %	0 %	40 %	40 %	538392269
1106	NC_022247	GCT	2	6	40019	40024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1107	NC_022247	CAC	2	6	40026	40031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392269
1108	NC_022247	CGT	2	6	40067	40072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1109	NC_022247	GCC	3	9	40110	40118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1110	NC_022247	GC	3	6	40135	40140	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1111	NC_022247	CAG	3	9	40149	40157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1112	NC_022247	TGC	2	6	40175	40180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1113	NC_022247	GTC	2	6	40188	40193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1114	NC_022247	TTG	2	6	40201	40206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392269
1115	NC_022247	CGG	2	6	40274	40279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1116	NC_022247	GC	3	6	40293	40298	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1117	NC_022247	GGC	2	6	40299	40304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1118	NC_022247	TTC	2	6	40332	40337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392269
1119	NC_022247	GC	3	6	40348	40353	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1120	NC_022247	CGA	2	6	40367	40372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392269
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1122	NC_022247	GCC	2	6	40443	40448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1123	NC_022247	CAC	2	6	40497	40502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392269
1124	NC_022247	GCC	2	6	40509	40514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1125	NC_022247	GCCCTG	2	12	40593	40604	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392269
1126	NC_022247	TGA	2	6	40628	40633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392269
1127	NC_022247	CGG	2	6	40640	40645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1128	NC_022247	GC	3	6	40648	40653	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1129	NC_022247	GTA	2	6	40659	40664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392269
1130	NC_022247	GGC	2	6	40668	40673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1131	NC_022247	GCGA	2	8	40697	40704	25 %	0 %	50 %	25 %	538392269
1132	NC_022247	GCG	2	6	40715	40720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
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1134	NC_022247	CTG	2	6	40841	40846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_022247	TGC	2	6	40864	40869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_022247	GCG	2	6	40882	40887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392270
1137	NC_022247	GCC	4	12	41009	41020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392270
1138	NC_022247	CGA	2	6	41089	41094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
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1140	NC_022247	GCT	2	6	41131	41136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392270
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1156	NC_022247	GC	3	6	41669	41674	0 %	0 %	50 %	50 %	538392270
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1205	NC_022247	GCC	2	6	43391	43396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392271
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1210	NC_022247	A	8	8	43571	43578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1211	NC_022247	GACG	2	8	43630	43637	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1212	NC_022247	CTT	3	9	43667	43675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392272
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1217	NC_022247	CTT	2	6	43922	43927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392272
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1223	NC_022247	GAA	2	6	44285	44290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1224	NC_022247	CG	3	6	44362	44367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1225	NC_022247	CG	3	6	44385	44390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1226	NC_022247	CGG	2	6	44412	44417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1227	NC_022247	CTC	2	6	44427	44432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1228	NC_022247	TGG	2	6	44507	44512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392273
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1232	NC_022247	GCT	2	6	44565	44570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392273
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1235	NC_022247	A	6	6	44637	44642	100 %	0 %	0 %	0 %	538392273
1236	NC_022247	CGAT	2	8	44645	44652	25 %	25 %	25 %	25 %	538392273
1237	NC_022247	CGCC	2	8	44684	44691	0 %	0 %	25 %	75 %	538392274
1238	NC_022247	CTG	3	9	44700	44708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392274
1239	NC_022247	GTG	2	6	44727	44732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392274
1240	NC_022247	TGC	2	6	44737	44742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392274
1241	NC_022247	CGG	2	6	44787	44792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392274
1242	NC_022247	GC	3	6	44803	44808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1243	NC_022247	GCCCGT	2	12	44860	44871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1244	NC_022247	GGC	2	6	44881	44886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1245	NC_022247	CGG	2	6	44889	44894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1246	NC_022247	AT	3	6	44933	44938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_022247	TGG	2	6	44952	44957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_022247	GCGCA	2	10	45050	45059	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1249	NC_022247	GAA	2	6	45095	45100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392275
1250	NC_022247	TCG	3	9	45111	45119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392275
1251	NC_022247	GCT	3	9	45178	45186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392275
1252	NC_022247	CGG	2	6	45235	45240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392275
1253	NC_022247	GGT	2	6	45281	45286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392275
1254	NC_022247	GCCG	2	8	45349	45356	0 %	0 %	50 %	50 %	538392275
1255	NC_022247	TGCG	2	8	45357	45364	0 %	25 %	50 %	25 %	538392275
1256	NC_022247	GGC	2	6	45397	45402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392275
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1262	NC_022247	CCG	2	6	45614	45619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392275
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1380	NC_022247	GCG	2	6	50443	50448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392280
1381	NC_022247	CTG	2	6	50464	50469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392280
1382	NC_022247	GCA	2	6	50487	50492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392280
1383	NC_022247	GGCG	2	8	50502	50509	0 %	0 %	75 %	25 %	538392280
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1400	NC_022247	CGC	2	6	50931	50936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1472	NC_022247	G	6	6	53405	53410	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1473	NC_022247	GAGC	2	8	53437	53444	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1474	NC_022247	CGC	2	6	53496	53501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392283
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1482	NC_022247	ATGGC	2	10	53735	53744	20 %	20 %	40 %	20 %	538392283
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1494	NC_022247	ACC	2	6	54075	54080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392284
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1499	NC_022247	GCT	2	6	54235	54240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392284
1500	NC_022247	CTG	2	6	54254	54259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392284

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