MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022247	GCA	2	6	208952	208957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392435
6002	NC_022247	CAG	2	6	209007	209012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392435
6003	NC_022247	CCTGCA	2	12	209069	209080	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538392435
6004	NC_022247	GCT	2	6	209081	209086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392435
6005	NC_022247	GCC	2	6	209095	209100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392435
6006	NC_022247	GCG	3	9	209131	209139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392435
6007	NC_022247	GC	5	10	209240	209249	0 %	0 %	50 %	50 %	538392435
6008	NC_022247	CTAT	2	8	209327	209334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6009	NC_022247	CGT	2	6	209442	209447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392436
6010	NC_022247	GCC	2	6	209482	209487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392436
6011	NC_022247	TGA	2	6	209504	209509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392436
6012	NC_022247	GCC	2	6	209548	209553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392436
6013	NC_022247	GGGC	2	8	209673	209680	0 %	0 %	75 %	25 %	538392436
6014	NC_022247	TGG	2	6	209759	209764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392436
6015	NC_022247	TTC	2	6	209767	209772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392436
6016	NC_022247	CGCC	2	8	209837	209844	0 %	0 %	25 %	75 %	538392436
6017	NC_022247	CGC	2	6	209850	209855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392436
6018	NC_022247	GGC	2	6	209856	209861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392436
6019	NC_022247	GGC	2	6	209886	209891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_022247	GCG	2	6	209945	209950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_022247	CCG	2	6	209967	209972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6022	NC_022247	GCCG	2	8	209993	210000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_022247	ACG	2	6	210016	210021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_022247	T	6	6	210033	210038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_022247	C	6	6	210084	210089	0 %	0 %	0 %	100 %	538392437
6026	NC_022247	CG	3	6	210186	210191	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6027	NC_022247	GAT	2	6	210192	210197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392437
6028	NC_022247	GC	3	6	210232	210237	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6029	NC_022247	CAG	2	6	210238	210243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6030	NC_022247	GC	3	6	210254	210259	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6031	NC_022247	CG	4	8	210351	210358	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6032	NC_022247	AGGGCA	2	12	210419	210430	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538392437
6033	NC_022247	CTCCAT	2	12	210438	210449	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	538392437
6034	NC_022247	AGG	2	6	210452	210457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392437
6035	NC_022247	GCC	2	6	210505	210510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392437
6036	NC_022247	GGT	2	6	210513	210518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6037	NC_022247	CGA	2	6	210528	210533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6038	NC_022247	GC	3	6	210579	210584	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6039	NC_022247	TGG	2	6	210596	210601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6040	NC_022247	CAT	2	6	210627	210632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392437
6041	NC_022247	GAG	2	6	210670	210675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392437
6042	NC_022247	TCA	2	6	210698	210703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392437
6043	NC_022247	GCG	2	6	210752	210757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6044	NC_022247	AGCTTC	2	12	210769	210780	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538392437
6045	NC_022247	CCAT	2	8	210806	210813	25 %	25 %	0 %	50 %	538392437
6046	NC_022247	TGG	2	6	210875	210880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6047	NC_022247	ACG	2	6	210887	210892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6048	NC_022247	GTG	2	6	210928	210933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6049	NC_022247	CGG	2	6	210940	210945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6050	NC_022247	TCG	2	6	210965	210970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6051	NC_022247	GCG	2	6	210992	210997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6052	NC_022247	GAC	2	6	211003	211008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6053	NC_022247	AAG	2	6	211012	211017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392437
6054	NC_022247	TCG	2	6	211103	211108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6055	NC_022247	GAG	2	6	211117	211122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392437
6056	NC_022247	CAG	2	6	211129	211134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6057	NC_022247	GCC	2	6	211151	211156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392437
6058	NC_022247	GGT	2	6	211242	211247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6059	NC_022247	GC	3	6	211255	211260	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6060	NC_022247	TGA	2	6	211262	211267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392437
6061	NC_022247	GAA	2	6	211303	211308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392437
6062	NC_022247	ATC	3	9	211357	211365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392437
6063	NC_022247	CGT	2	6	211413	211418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6064	NC_022247	CAA	2	6	211428	211433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392437
6065	NC_022247	GGT	2	6	211440	211445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6066	NC_022247	CT	3	6	211519	211524	0 %	50 %	0 %	50 %	538392437
6067	NC_022247	TCA	2	6	211529	211534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392437
6068	NC_022247	GAA	2	6	211546	211551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392437
6069	NC_022247	GAC	2	6	211582	211587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6070	NC_022247	CGG	2	6	211620	211625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6071	NC_022247	CCA	3	9	211628	211636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392437
6072	NC_022247	CGC	2	6	211664	211669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392437
6073	NC_022247	GGT	2	6	211683	211688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392437
6074	NC_022247	AGCGTG	2	12	211711	211722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538392437
6075	NC_022247	GCT	2	6	211731	211736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6076	NC_022247	CGA	2	6	211761	211766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6077	NC_022247	GCA	2	6	211797	211802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6078	NC_022247	CAA	2	6	211806	211811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392437
6079	NC_022247	GC	4	8	211843	211850	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6080	NC_022247	CAA	2	6	211851	211856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392437
6081	NC_022247	CGC	2	6	211883	211888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392437
6082	NC_022247	CGGC	2	8	211905	211912	0 %	0 %	50 %	50 %	538392437
6083	NC_022247	TTC	2	6	211969	211974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392437
6084	NC_022247	TCG	2	6	212024	212029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6085	NC_022247	GCG	2	6	212108	212113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6086	NC_022247	ACG	3	9	212144	212152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6087	NC_022247	CGA	2	6	212169	212174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6088	NC_022247	CAG	2	6	212215	212220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6089	NC_022247	TCG	2	6	212276	212281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6090	NC_022247	CGG	2	6	212330	212335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6091	NC_022247	GAA	2	6	212349	212354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392437
6092	NC_022247	CGA	2	6	212370	212375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6093	NC_022247	CGA	2	6	212379	212384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6094	NC_022247	CAT	2	6	212394	212399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392437
6095	NC_022247	CAC	2	6	212449	212454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392437
6096	NC_022247	CGA	2	6	212487	212492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6097	NC_022247	ATG	2	6	212647	212652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392437
6098	NC_022247	CGC	2	6	212655	212660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392437
6099	NC_022247	GGC	2	6	212745	212750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6100	NC_022247	GCG	2	6	212751	212756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392437
6101	NC_022247	CTG	2	6	212785	212790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392437
6102	NC_022247	GCCG	2	8	212810	212817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_022247	GTT	2	6	212840	212845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_022247	TGC	2	6	212863	212868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_022247	GCT	2	6	212904	212909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6106	NC_022247	GC	4	8	212920	212927	0 %	0 %	50 %	50 %	538392438
6107	NC_022247	GC	3	6	212933	212938	0 %	0 %	50 %	50 %	538392438
6108	NC_022247	CGC	4	12	212943	212954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
6109	NC_022247	GGC	3	9	212983	212991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392438
6110	NC_022247	CTG	2	6	213026	213031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6111	NC_022247	CGC	2	6	213076	213081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
6112	NC_022247	GTG	2	6	213086	213091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392438
6113	NC_022247	TGG	2	6	213116	213121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392438
6114	NC_022247	CGC	2	6	213178	213183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
6115	NC_022247	TGG	2	6	213198	213203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392438
6116	NC_022247	GCCGC	2	10	213218	213227	0 %	0 %	40 %	60 %	538392438
6117	NC_022247	CGC	2	6	213231	213236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
6118	NC_022247	CCG	2	6	213237	213242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
6119	NC_022247	CGA	2	6	213247	213252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6120	NC_022247	ACC	2	6	213261	213266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392438
6121	NC_022247	GCA	2	6	213289	213294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6122	NC_022247	CTACAA	2	12	213340	213351	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	538392438
6123	NC_022247	CTG	2	6	213353	213358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6124	NC_022247	CGA	2	6	213382	213387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6125	NC_022247	TGC	2	6	213390	213395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392438
6126	NC_022247	CGG	2	6	213429	213434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392438
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6128	NC_022247	GGC	2	6	213611	213616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392438
6129	NC_022247	GGC	2	6	213634	213639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392438
6130	NC_022247	TGG	2	6	213696	213701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392438
6131	NC_022247	TCG	2	6	213708	213713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392438
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6134	NC_022247	GC	3	6	213788	213793	0 %	0 %	50 %	50 %	538392438
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6140	NC_022247	GCT	2	6	214069	214074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392438
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6143	NC_022247	GGGC	2	8	214153	214160	0 %	0 %	75 %	25 %	538392438
6144	NC_022247	GCC	2	6	214175	214180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
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6149	NC_022247	GCTG	2	8	214255	214262	0 %	25 %	50 %	25 %	538392438
6150	NC_022247	CCG	2	6	214281	214286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392438
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6153	NC_022247	CTA	2	6	214426	214431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392438
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6229	NC_022247	GCCG	2	8	216940	216947	0 %	0 %	50 %	50 %	538392441
6230	NC_022247	TGG	2	6	216954	216959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392441
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6232	NC_022247	CATG	2	8	216969	216976	25 %	25 %	25 %	25 %	538392441
6233	NC_022247	GCG	2	6	217008	217013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392441
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6235	NC_022247	CAC	2	6	217153	217158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392441
6236	NC_022247	AGC	3	9	217202	217210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392441
6237	NC_022247	TGA	2	6	217221	217226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392441
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6239	NC_022247	TCG	2	6	217279	217284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392442
6240	NC_022247	TGT	3	9	217295	217303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392442
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6242	NC_022247	GCA	2	6	217331	217336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392442
6243	NC_022247	CAG	2	6	217455	217460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392442
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6245	NC_022247	CG	4	8	217542	217549	0 %	0 %	50 %	50 %	538392442
6246	NC_022247	CG	3	6	217559	217564	0 %	0 %	50 %	50 %	538392442
6247	NC_022247	GTA	2	6	217644	217649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392442
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6251	NC_022247	AGT	3	9	217787	217795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392442
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6262	NC_022247	G	6	6	218065	218070	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_022247	CG	3	6	218092	218097	0 %	0 %	50 %	50 %	538392443
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6365	NC_022247	CGG	2	6	221235	221240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6366	NC_022247	CAC	2	6	221247	221252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392445
6367	NC_022247	AGC	2	6	221279	221284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392445
6368	NC_022247	GCG	2	6	221291	221296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6369	NC_022247	CCA	2	6	221300	221305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392445
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6371	NC_022247	CGG	2	6	221369	221374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
6372	NC_022247	GCC	3	9	221386	221394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392445
6373	NC_022247	GCC	2	6	221428	221433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392445
6374	NC_022247	CGG	2	6	221437	221442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392445
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6376	NC_022247	G	6	6	221578	221583	0 %	0 %	100 %	0 %	538392445
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6381	NC_022247	GAT	2	6	221865	221870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392446
6382	NC_022247	GCT	2	6	221874	221879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392446
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6384	NC_022247	TCG	2	6	221969	221974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392446
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6386	NC_022247	GC	3	6	221999	222004	0 %	0 %	50 %	50 %	538392446
6387	NC_022247	CGG	2	6	222018	222023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392446
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6389	NC_022247	A	6	6	222092	222097	100 %	0 %	0 %	0 %	538392446
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6392	NC_022247	GC	3	6	222242	222247	0 %	0 %	50 %	50 %	538392446
6393	NC_022247	CGG	2	6	222248	222253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392446
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6400	NC_022247	CGA	2	6	222538	222543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392447
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6402	NC_022247	GCC	2	6	222641	222646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392447
6403	NC_022247	TCG	2	6	222648	222653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392447
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6412	NC_022247	T	6	6	223010	223015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6413	NC_022247	CT	5	10	223016	223025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6414	NC_022247	TGCCCA	2	12	223113	223124	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538392448
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6418	NC_022247	GAG	2	6	223309	223314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392448
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6420	NC_022247	CG	3	6	223322	223327	0 %	0 %	50 %	50 %	538392448
6421	NC_022247	AGA	2	6	223328	223333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392448
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6428	NC_022247	TCG	2	6	223637	223642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392448
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6433	NC_022247	TCGGT	2	10	223964	223973	0 %	40 %	40 %	20 %	538392448
6434	NC_022247	GGC	2	6	224001	224006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392448
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6437	NC_022247	TCG	2	6	224135	224140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392448
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6440	NC_022247	GAA	2	6	224229	224234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392448
6441	NC_022247	CG	3	6	224237	224242	0 %	0 %	50 %	50 %	538392448
6442	NC_022247	T	6	6	224256	224261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6443	NC_022247	CTG	2	6	224299	224304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6445	NC_022247	TCG	2	6	224335	224340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6450	NC_022247	CGC	2	6	224493	224498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392449
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6452	NC_022247	TGC	3	9	224537	224545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
6453	NC_022247	GCT	2	6	224577	224582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6469	NC_022247	TCG	2	6	225254	225259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6475	NC_022247	GTGC	2	8	225454	225461	0 %	25 %	50 %	25 %	538392449
6476	NC_022247	TCG	2	6	225491	225496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
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6479	NC_022247	CGG	2	6	225633	225638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392449
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6485	NC_022247	GTCG	2	8	225942	225949	0 %	25 %	50 %	25 %	538392449
6486	NC_022247	TGC	2	6	225965	225970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
6487	NC_022247	GGT	2	6	225999	226004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392449
6488	NC_022247	GCTG	2	8	226022	226029	0 %	25 %	50 %	25 %	538392449
6489	NC_022247	GC	3	6	226042	226047	0 %	0 %	50 %	50 %	538392449
6490	NC_022247	ATC	2	6	226081	226086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392449
6491	NC_022247	TGC	2	6	226097	226102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392449
6492	NC_022247	GAGC	2	8	226140	226147	25 %	0 %	50 %	25 %	538392449
6493	NC_022247	GCTG	2	8	226148	226155	0 %	25 %	50 %	25 %	538392449
6494	NC_022247	G	6	6	226233	226238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6495	NC_022247	CTT	2	6	226239	226244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6496	NC_022247	T	6	6	226243	226248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6497	NC_022247	GGAG	2	8	226353	226360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6498	NC_022247	CGG	2	6	226414	226419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392450
6499	NC_022247	GCT	2	6	226465	226470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392450
6500	NC_022247	CCA	2	6	226503	226508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392450

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