MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 158287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_022247	CGT	2	6	157449	157454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_022247	ATGA	2	8	157455	157462	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_022247	TTC	2	6	157494	157499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_022247	CG	3	6	157566	157571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4505	NC_022247	GCG	2	6	157581	157586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_022247	GCGG	2	8	157599	157606	0 %	0 %	75 %	25 %	538392387
4507	NC_022247	TGG	2	6	157629	157634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392387
4508	NC_022247	AGGC	2	8	157656	157663	25 %	0 %	50 %	25 %	538392387
4509	NC_022247	GACGCT	2	12	157666	157677	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4510	NC_022247	GTC	2	6	157690	157695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4511	NC_022247	TCG	2	6	157697	157702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4512	NC_022247	TCG	2	6	157736	157741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4513	NC_022247	GCGA	2	8	157751	157758	25 %	0 %	50 %	25 %	538392387
4514	NC_022247	GCCG	2	8	157770	157777	0 %	0 %	50 %	50 %	538392387
4515	NC_022247	GTCACG	2	12	157787	157798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4516	NC_022247	TTG	2	6	157802	157807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392387
4517	NC_022247	GCGTG	2	10	157809	157818	0 %	20 %	60 %	20 %	538392387
4518	NC_022247	GCT	3	9	157821	157829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4519	NC_022247	GGC	2	6	157833	157838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392387
4520	NC_022247	CGG	3	9	157848	157856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392387
4521	NC_022247	TTC	2	6	157901	157906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392387
4522	NC_022247	CGT	2	6	157983	157988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4523	NC_022247	TGA	2	6	158001	158006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392387
4524	NC_022247	GTC	2	6	158023	158028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392387
4525	NC_022247	CGCCTG	2	12	158127	158138	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392388
4526	NC_022247	TGC	2	6	158152	158157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4527	NC_022247	GGC	2	6	158181	158186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392388
4528	NC_022247	TGC	2	6	158201	158206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4529	NC_022247	GCA	2	6	158270	158275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4530	NC_022247	GC	3	6	158276	158281	0 %	0 %	50 %	50 %	538392388
4531	NC_022247	GATGCC	2	12	158310	158321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4532	NC_022247	TCG	2	6	158470	158475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4533	NC_022247	GCG	2	6	158483	158488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392388
4534	NC_022247	GCG	2	6	158547	158552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392388
4535	NC_022247	CCA	2	6	158555	158560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392388
4536	NC_022247	GCT	2	6	158561	158566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4537	NC_022247	CGC	2	6	158608	158613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392388
4538	NC_022247	CG	3	6	158680	158685	0 %	0 %	50 %	50 %	538392388
4539	NC_022247	GCA	2	6	158696	158701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4540	NC_022247	CAC	2	6	158736	158741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392388
4541	NC_022247	CGCCCT	2	12	158750	158761	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	538392388
4542	NC_022247	TGG	2	6	158765	158770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392388
4543	NC_022247	GGC	2	6	158787	158792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392388
4544	NC_022247	CAC	2	6	158877	158882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392388
4545	NC_022247	CCG	2	6	158918	158923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392388
4546	NC_022247	GC	3	6	158942	158947	0 %	0 %	50 %	50 %	538392388
4547	NC_022247	GAGC	2	8	158961	158968	25 %	0 %	50 %	25 %	538392388
4548	NC_022247	GCA	2	6	158975	158980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392388
4549	NC_022247	CATC	2	8	159095	159102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_022247	ACA	2	6	159137	159142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392389
4551	NC_022247	GGTTCT	2	12	159144	159155	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	538392389
4552	NC_022247	CGG	2	6	159174	159179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392389
4553	NC_022247	GC	4	8	159219	159226	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4554	NC_022247	GCGCG	2	10	159231	159240	0 %	0 %	60 %	40 %	538392389
4555	NC_022247	GC	3	6	159253	159258	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4556	NC_022247	GCGAT	2	10	159284	159293	20 %	20 %	40 %	20 %	538392389
4557	NC_022247	GCT	2	6	159326	159331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4558	NC_022247	CCG	2	6	159366	159371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4559	NC_022247	TGC	2	6	159386	159391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4560	NC_022247	ACA	2	6	159401	159406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392389
4561	NC_022247	CCG	2	6	159422	159427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4562	NC_022247	CCA	2	6	159434	159439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392389
4563	NC_022247	TGC	2	6	159443	159448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4564	NC_022247	GCT	2	6	159486	159491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4565	NC_022247	CGC	2	6	159503	159508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4566	NC_022247	GGC	2	6	159554	159559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392389
4567	NC_022247	GCC	2	6	159565	159570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4568	NC_022247	GCC	2	6	159572	159577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4569	NC_022247	GCG	2	6	159578	159583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392389
4570	NC_022247	GC	3	6	159600	159605	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4571	NC_022247	TTC	2	6	159613	159618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392389
4572	NC_022247	CAA	2	6	159633	159638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392389
4573	NC_022247	GGC	2	6	159703	159708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392389
4574	NC_022247	CCA	2	6	159714	159719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392389
4575	NC_022247	GC	3	6	159742	159747	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4576	NC_022247	CTG	2	6	159760	159765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4577	NC_022247	GGCC	2	8	159807	159814	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4578	NC_022247	CCG	2	6	159852	159857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4579	NC_022247	GTG	2	6	159859	159864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392389
4580	NC_022247	GC	3	6	159865	159870	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4581	NC_022247	CG	3	6	159887	159892	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4582	NC_022247	GGC	2	6	159894	159899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392389
4583	NC_022247	TGG	2	6	159907	159912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392389
4584	NC_022247	CTG	2	6	159913	159918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4585	NC_022247	CG	3	6	160002	160007	0 %	0 %	50 %	50 %	538392389
4586	NC_022247	CGC	2	6	160040	160045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392389
4587	NC_022247	CGA	2	6	160047	160052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392389
4588	NC_022247	CGCA	2	8	160090	160097	25 %	0 %	25 %	50 %	538392389
4589	NC_022247	CAG	2	6	160137	160142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_022247	AGA	2	6	160149	160154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392390
4591	NC_022247	CGA	2	6	160173	160178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4592	NC_022247	CAC	2	6	160264	160269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392390
4593	NC_022247	GCC	3	9	160279	160287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392390
4594	NC_022247	CGC	2	6	160290	160295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392390
4595	NC_022247	CGT	2	6	160338	160343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4596	NC_022247	GCG	2	6	160375	160380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392390
4597	NC_022247	GC	3	6	160425	160430	0 %	0 %	50 %	50 %	538392390
4598	NC_022247	GCC	2	6	160448	160453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392390
4599	NC_022247	GC	4	8	160454	160461	0 %	0 %	50 %	50 %	538392390
4600	NC_022247	GGC	2	6	160467	160472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392390
4601	NC_022247	GC	3	6	160485	160490	0 %	0 %	50 %	50 %	538392390
4602	NC_022247	CAC	2	6	160513	160518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392390
4603	NC_022247	CGT	2	6	160524	160529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4604	NC_022247	TCG	3	9	160610	160618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4605	NC_022247	CGC	2	6	160632	160637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392390
4606	NC_022247	GCC	2	6	160678	160683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392390
4607	NC_022247	TGA	2	6	160737	160742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392390
4608	NC_022247	CAGCGT	2	12	160858	160869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4609	NC_022247	GCGCA	2	10	160945	160954	20 %	0 %	40 %	40 %	538392390
4610	NC_022247	GC	3	6	160966	160971	0 %	0 %	50 %	50 %	538392390
4611	NC_022247	CGG	2	6	161013	161018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392390
4612	NC_022247	CAG	2	6	161023	161028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4613	NC_022247	CGA	2	6	161043	161048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4614	NC_022247	GTC	2	6	161050	161055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392390
4615	NC_022247	CGCC	2	8	161129	161136	0 %	0 %	25 %	75 %	538392391
4616	NC_022247	AGC	2	6	161173	161178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
4617	NC_022247	GCG	2	6	161204	161209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392391
4618	NC_022247	ACG	2	6	161222	161227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
4619	NC_022247	GCA	2	6	161252	161257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
4620	NC_022247	CAG	2	6	161370	161375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392391
4621	NC_022247	GTG	2	6	161446	161451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392391
4622	NC_022247	C	6	6	161485	161490	0 %	0 %	0 %	100 %	538392391
4623	NC_022247	CATCG	2	10	161499	161508	20 %	20 %	20 %	40 %	538392391
4624	NC_022247	CCG	2	6	161564	161569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392391
4625	NC_022247	GCCCAG	2	12	161580	161591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392391
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4639	NC_022247	GTT	3	9	161989	161997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4640	NC_022247	GCT	3	9	161998	162006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4642	NC_022247	CGG	2	6	162031	162036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392392
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4675	NC_022247	GGCG	2	8	163078	163085	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4723	NC_022247	GCC	3	9	164511	164519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392395
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4730	NC_022247	GAC	2	6	164725	164730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392395
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4734	NC_022247	CGGC	2	8	164813	164820	0 %	0 %	50 %	50 %	538392395
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4984	NC_022247	CGC	2	6	173857	173862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392403
4985	NC_022247	GCG	2	6	173870	173875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392403
4986	NC_022247	CG	3	6	173884	173889	0 %	0 %	50 %	50 %	538392403
4987	NC_022247	GTC	2	6	173903	173908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392403
4988	NC_022247	TGC	3	9	173941	173949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392403
4989	NC_022247	GGCG	2	8	173954	173961	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4990	NC_022247	GGC	2	6	174003	174008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392404
4991	NC_022247	CCT	2	6	174021	174026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392404
4992	NC_022247	CCT	2	6	174045	174050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392404
4993	NC_022247	CGC	2	6	174051	174056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392404
4994	NC_022247	CGG	2	6	174082	174087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392404
4995	NC_022247	GCG	2	6	174110	174115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392404
4996	NC_022247	GC	3	6	174129	174134	0 %	0 %	50 %	50 %	538392404
4997	NC_022247	CGG	2	6	174176	174181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392404
4998	NC_022247	ATG	2	6	174188	174193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392404
4999	NC_022247	TGC	2	6	174204	174209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392404
5000	NC_022247	CG	3	6	174219	174224	0 %	0 %	50 %	50 %	538392404

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