MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 35007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022234	TGCCCG	2	12	227158	227169	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344416
6002	NC_022234	CCG	3	9	227167	227175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344416
6003	NC_022234	ACC	2	6	227206	227211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344417
6004	NC_022234	CAT	2	6	227220	227225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344417
6005	NC_022234	AC	3	6	227235	227240	50 %	0 %	0 %	50 %	538344417
6006	NC_022234	CGCAG	2	10	227284	227293	20 %	0 %	40 %	40 %	538344417
6007	NC_022234	CGC	2	6	227322	227327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344417
6008	NC_022234	TCG	2	6	227348	227353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6009	NC_022234	GCGG	2	8	227507	227514	0 %	0 %	75 %	25 %	538344417
6010	NC_022234	TGG	2	6	227528	227533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344417
6011	NC_022234	CTG	2	6	227561	227566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6012	NC_022234	GCT	2	6	227583	227588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6013	NC_022234	GCT	2	6	227591	227596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6014	NC_022234	GAAG	2	8	227604	227611	50 %	0 %	50 %	0 %	538344417
6015	NC_022234	CGG	2	6	227624	227629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344417
6016	NC_022234	GCC	2	6	227701	227706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344417
6017	NC_022234	GCG	2	6	227757	227762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344417
6018	NC_022234	GCC	2	6	227783	227788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344417
6019	NC_022234	GAA	2	6	227799	227804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344417
6020	NC_022234	TCG	2	6	227810	227815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6021	NC_022234	CGG	2	6	227909	227914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344417
6022	NC_022234	CGCA	2	8	227929	227936	25 %	0 %	25 %	50 %	538344417
6023	NC_022234	CGC	2	6	227962	227967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344417
6024	NC_022234	GACCC	2	10	227968	227977	20 %	0 %	20 %	60 %	538344417
6025	NC_022234	GCGCG	2	10	227987	227996	0 %	0 %	60 %	40 %	538344417
6026	NC_022234	CGG	2	6	228020	228025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344417
6027	NC_022234	TCG	2	6	228050	228055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6028	NC_022234	GCT	2	6	228084	228089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6029	NC_022234	GC	4	8	228128	228135	0 %	0 %	50 %	50 %	538344417
6030	NC_022234	CG	3	6	228203	228208	0 %	0 %	50 %	50 %	538344417
6031	NC_022234	GCA	2	6	228237	228242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344417
6032	NC_022234	GGCG	2	8	228273	228280	0 %	0 %	75 %	25 %	538344417
6033	NC_022234	GCG	2	6	228326	228331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344417
6034	NC_022234	CTG	2	6	228405	228410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6035	NC_022234	CCG	2	6	228488	228493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6036	NC_022234	GCT	2	6	228548	228553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6037	NC_022234	CAA	2	6	228566	228571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344418
6038	NC_022234	GCT	2	6	228589	228594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6039	NC_022234	GCC	2	6	228597	228602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6040	NC_022234	CGC	2	6	228646	228651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6041	NC_022234	CGT	2	6	228761	228766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6042	NC_022234	CG	4	8	228781	228788	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6043	NC_022234	GCT	2	6	228809	228814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6044	NC_022234	CAC	2	6	228893	228898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344418
6045	NC_022234	GCC	2	6	228901	228906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6046	NC_022234	GCC	2	6	228912	228917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6047	NC_022234	TCG	2	6	228943	228948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6048	NC_022234	ACCA	2	8	228951	228958	50 %	0 %	0 %	50 %	538344418
6049	NC_022234	CAC	2	6	228980	228985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344418
6050	NC_022234	CGC	2	6	229012	229017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6051	NC_022234	GCT	2	6	229043	229048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6052	NC_022234	GC	3	6	229063	229068	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6053	NC_022234	TGC	2	6	229075	229080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6054	NC_022234	TGG	2	6	229120	229125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344418
6055	NC_022234	TGG	2	6	229177	229182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344418
6056	NC_022234	GC	3	6	229240	229245	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6057	NC_022234	CG	3	6	229254	229259	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6058	NC_022234	GC	4	8	229268	229275	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6059	NC_022234	GCC	2	6	229346	229351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6060	NC_022234	CATG	2	8	229355	229362	25 %	25 %	25 %	25 %	538344418
6061	NC_022234	CCG	2	6	229363	229368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6062	NC_022234	ACG	2	6	229369	229374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6063	NC_022234	GCT	2	6	229396	229401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6064	NC_022234	CG	3	6	229442	229447	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6065	NC_022234	CCG	2	6	229462	229467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6066	NC_022234	CTG	2	6	229484	229489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6067	NC_022234	GCCG	2	8	229496	229503	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6068	NC_022234	CAA	2	6	229520	229525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344418
6069	NC_022234	GCG	2	6	229552	229557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344418
6070	NC_022234	CG	4	8	229592	229599	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6071	NC_022234	GCT	2	6	229601	229606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6072	NC_022234	GGC	2	6	229644	229649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344418
6073	NC_022234	CG	3	6	229663	229668	0 %	0 %	50 %	50 %	538344418
6074	NC_022234	GGA	2	6	229673	229678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344418
6075	NC_022234	CTG	2	6	229683	229688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6076	NC_022234	CCG	2	6	229696	229701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344418
6077	NC_022234	GGC	2	6	229709	229714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344418
6078	NC_022234	AGC	2	6	229795	229800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6079	NC_022234	TGC	2	6	229801	229806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6080	NC_022234	ACC	2	6	229807	229812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344418
6081	NC_022234	TCT	3	9	229852	229860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344418
6082	NC_022234	TCG	2	6	229921	229926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344418
6083	NC_022234	AGG	2	6	229942	229947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344418
6084	NC_022234	CA	4	8	229963	229970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_022234	GAC	2	6	229985	229990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_022234	CGC	2	6	230036	230041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344419
6087	NC_022234	TGC	2	6	230046	230051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344419
6088	NC_022234	AAC	2	6	230135	230140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344419
6089	NC_022234	CG	3	6	230195	230200	0 %	0 %	50 %	50 %	538344419
6090	NC_022234	CGG	2	6	230206	230211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344419
6091	NC_022234	GCG	2	6	230286	230291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344419
6092	NC_022234	TTC	2	6	230297	230302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344419
6093	NC_022234	GCG	2	6	230352	230357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344419
6094	NC_022234	CAG	2	6	230429	230434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344419
6095	NC_022234	CGT	2	6	230496	230501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344419
6096	NC_022234	GCCGC	2	10	230516	230525	0 %	0 %	40 %	60 %	538344419
6097	NC_022234	CGC	2	6	230562	230567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344419
6098	NC_022234	CGC	2	6	230596	230601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344419
6099	NC_022234	TCG	2	6	230652	230657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344419
6100	NC_022234	CAT	2	6	230680	230685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344419
6101	NC_022234	CCG	2	6	230767	230772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344419
6102	NC_022234	GCCG	2	8	230788	230795	0 %	0 %	50 %	50 %	538344419
6103	NC_022234	GTG	2	6	230807	230812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344419
6104	NC_022234	CGGC	2	8	230829	230836	0 %	0 %	50 %	50 %	538344419
6105	NC_022234	GCC	2	6	230891	230896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344419
6106	NC_022234	CCG	2	6	230925	230930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344419
6107	NC_022234	CGA	2	6	230989	230994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344419
6108	NC_022234	AGCGC	2	10	231012	231021	20 %	0 %	40 %	40 %	538344419
6109	NC_022234	GGC	2	6	231057	231062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344420
6110	NC_022234	GC	3	6	231065	231070	0 %	0 %	50 %	50 %	538344420
6111	NC_022234	GC	3	6	231113	231118	0 %	0 %	50 %	50 %	538344420
6112	NC_022234	GGC	2	6	231129	231134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344420
6113	NC_022234	CGG	2	6	231135	231140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344420
6114	NC_022234	GC	3	6	231184	231189	0 %	0 %	50 %	50 %	538344420
6115	NC_022234	CTGGT	2	10	231208	231217	0 %	40 %	40 %	20 %	538344420
6116	NC_022234	CGA	2	6	231219	231224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344420
6117	NC_022234	GCG	2	6	231279	231284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344420
6118	NC_022234	GCC	2	6	231324	231329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344420
6119	NC_022234	GTT	2	6	231342	231347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344420
6120	NC_022234	TGG	2	6	231389	231394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344420
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6122	NC_022234	GGA	2	6	231420	231425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344420
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6242	NC_022234	TCC	2	6	235928	235933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6243	NC_022234	TGA	2	6	235990	235995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6244	NC_022234	GCA	2	6	236014	236019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6245	NC_022234	GGC	2	6	236041	236046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_022234	CAG	2	6	236191	236196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344424
6247	NC_022234	CA	3	6	236226	236231	50 %	0 %	0 %	50 %	538344424
6248	NC_022234	CG	3	6	236246	236251	0 %	0 %	50 %	50 %	538344424
6249	NC_022234	GCA	2	6	236352	236357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344424
6250	NC_022234	GCC	2	6	236404	236409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344424
6251	NC_022234	GGCC	3	12	236437	236448	0 %	0 %	50 %	50 %	538344424
6252	NC_022234	CAG	2	6	236554	236559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344424
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6254	NC_022234	GTTC	2	8	236712	236719	0 %	50 %	25 %	25 %	538344424
6255	NC_022234	GC	3	6	236742	236747	0 %	0 %	50 %	50 %	538344424
6256	NC_022234	CAG	2	6	236833	236838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344424
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6258	NC_022234	GA	3	6	236886	236891	50 %	0 %	50 %	0 %	538344424
6259	NC_022234	GCC	2	6	236926	236931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344424
6260	NC_022234	CCA	3	9	236937	236945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344424
6261	NC_022234	GTC	2	6	236962	236967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344424
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6267	NC_022234	GCA	2	6	237148	237153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344425
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6270	NC_022234	CGGC	2	8	237218	237225	0 %	0 %	50 %	50 %	538344425
6271	NC_022234	GCC	2	6	237237	237242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344425
6272	NC_022234	CGT	2	6	237283	237288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344425
6273	NC_022234	GCCA	2	8	237309	237316	25 %	0 %	25 %	50 %	538344425
6274	NC_022234	GCC	2	6	237328	237333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344425
6275	NC_022234	AAG	2	6	237357	237362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344425
6276	NC_022234	CGA	2	6	237364	237369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344425
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6278	NC_022234	GCGG	2	8	237540	237547	0 %	0 %	75 %	25 %	538344425
6279	NC_022234	CAG	2	6	237548	237553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344425
6280	NC_022234	TCC	2	6	237624	237629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344425
6281	NC_022234	CATCCG	2	12	237637	237648	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538344425
6282	NC_022234	CAG	2	6	237650	237655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344425
6283	NC_022234	CGG	2	6	237657	237662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344425
6284	NC_022234	CG	3	6	237666	237671	0 %	0 %	50 %	50 %	538344425
6285	NC_022234	GCC	2	6	237731	237736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344425
6286	NC_022234	GC	4	8	237795	237802	0 %	0 %	50 %	50 %	538344425
6287	NC_022234	AT	3	6	237909	237914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6288	NC_022234	CAC	2	6	237992	237997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344426
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6290	NC_022234	TCCGCA	2	12	238036	238047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538344426
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6292	NC_022234	CTGC	2	8	238121	238128	0 %	25 %	25 %	50 %	538344426
6293	NC_022234	TGC	2	6	238133	238138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344426
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6298	NC_022234	CTG	2	6	238350	238355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344426
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6302	NC_022234	TGC	2	6	238678	238683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344426
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6307	NC_022234	CGA	2	6	238925	238930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6309	NC_022234	CCG	2	6	238979	238984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6310	NC_022234	GCA	2	6	239050	239055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6312	NC_022234	CCCA	2	8	239153	239160	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6313	NC_022234	GCA	2	6	239175	239180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344427
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6315	NC_022234	GC	3	6	239275	239280	0 %	0 %	50 %	50 %	538344427
6316	NC_022234	GCA	2	6	239286	239291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344427
6317	NC_022234	CTG	2	6	239344	239349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344427
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6319	NC_022234	CTG	2	6	239452	239457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344427
6320	NC_022234	GC	3	6	239523	239528	0 %	0 %	50 %	50 %	538344427
6321	NC_022234	TTC	2	6	239533	239538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344427
6322	NC_022234	CG	3	6	239604	239609	0 %	0 %	50 %	50 %	538344427
6323	NC_022234	GGC	2	6	239664	239669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344427
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6325	NC_022234	CGC	2	6	239776	239781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6326	NC_022234	GC	3	6	239780	239785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6327	NC_022234	CG	3	6	239796	239801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6328	NC_022234	CGTGC	2	10	239875	239884	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6329	NC_022234	CGG	2	6	239895	239900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6330	NC_022234	GAA	3	9	239932	239940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344428
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6332	NC_022234	GCCAT	2	10	239952	239961	20 %	20 %	20 %	40 %	538344428
6333	NC_022234	ACG	2	6	239964	239969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344428
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6345	NC_022234	TTGCCA	2	12	240606	240617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538344428
6346	NC_022234	GC	3	6	240706	240711	0 %	0 %	50 %	50 %	538344428
6347	NC_022234	GAC	2	6	240746	240751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344428
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6349	NC_022234	CGGG	2	8	240777	240784	0 %	0 %	75 %	25 %	538344428
6350	NC_022234	ACG	2	6	240795	240800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344428
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6352	NC_022234	GGC	2	6	240835	240840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344428
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6356	NC_022234	CAG	2	6	241106	241111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344428
6357	NC_022234	ATG	2	6	241118	241123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344428
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6359	NC_022234	GGC	2	6	241186	241191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344428
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6361	NC_022234	GCA	2	6	241243	241248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344428
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6363	NC_022234	CG	4	8	241291	241298	0 %	0 %	50 %	50 %	538344428
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6365	NC_022234	GGCG	2	8	241348	241355	0 %	0 %	75 %	25 %	538344428
6366	NC_022234	GTC	2	6	241435	241440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344428
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6369	NC_022234	CGA	2	6	241510	241515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344428
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6397	NC_022234	GGT	2	6	242936	242941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6405	NC_022234	GCG	3	9	243224	243232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6433	NC_022234	CGTGC	2	10	244441	244450	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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6435	NC_022234	GCC	2	6	244512	244517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6490	NC_022234	AGC	2	6	246963	246968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344432
6491	NC_022234	GC	3	6	246967	246972	0 %	0 %	50 %	50 %	538344432
6492	NC_022234	CGC	2	6	247027	247032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344432
6493	NC_022234	GC	3	6	247072	247077	0 %	0 %	50 %	50 %	538344432
6494	NC_022234	GCGT	2	8	247107	247114	0 %	25 %	50 %	25 %	538344432
6495	NC_022234	TTCG	2	8	247145	247152	0 %	50 %	25 %	25 %	538344432
6496	NC_022234	CGGCC	2	10	247153	247162	0 %	0 %	40 %	60 %	538344432
6497	NC_022234	CGG	2	6	247174	247179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344432
6498	NC_022234	CAT	2	6	247205	247210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344432
6499	NC_022234	CAG	2	6	247232	247237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344432
6500	NC_022234	TCG	2	6	247308	247313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344432

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